深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2024-09-30	[Research progress of epileptic seizure predictions based on electroencephalogram signals] 2021-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202105052 PMID:34970903	综述	本文综述了基于脑电图信号的癫痫发作预测研究进展	强调了机器学习和深度学习在癫痫发作预测中的贡献，特别是深度学习在特征选择和模型泛化方面的优势	尽管取得了显著进展，但仍需更多努力才能实现临床应用	探讨如何利用脑电图信号预测癫痫发作，并促进其在临床中的应用	癫痫发作预测及其相关技术	机器学习	癫痫	脑电图（EEG）	深度学习（DL）	脑电图信号	NA
142	2024-09-30	Epileptic Seizures Detection in EEG Signals Using Fusion Handcrafted and Deep Learning Features 2021-Nov-19, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s21227710 PMID:34833780	研究论文	本文提出了一种基于手工特征和深度学习特征融合的计算机辅助诊断系统，用于自动检测脑电图信号中的癫痫发作	本文创新性地结合了手工特征和深度学习特征，提出了一种基于CNN-RNN的分类方法，显著提高了癫痫发作检测的准确性	本文未详细讨论模型的泛化能力和在其他数据集上的表现	开发一种自动检测脑电图信号中癫痫发作的计算机辅助诊断系统	脑电图信号中的癫痫发作	机器学习	癫痫	Tunable-Q Wavelet Transform (TQWT)	CNN-RNN	信号	Bonn和Freiburg数据集
143	2024-09-30	PScL-HDeep: image-based prediction of protein subcellular location in human tissue using ensemble learning of handcrafted and deep learned features with two-layer feature selection 2021-11-05, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbab278 PMID:34337652	研究论文	本文提出了一种基于人类蛋白质图谱数据的新型计算方法PScL-HDeep，用于准确高效地预测人类组织中蛋白质的亚细胞定位	本文结合了手工特征和深度学习特征，并通过两层特征选择算法优化特征集，提高了预测的准确性和效率	NA	开发一种新的计算方法，用于准确预测人类组织中蛋白质的亚细胞定位	人类组织中蛋白质的亚细胞定位	计算机视觉	NA	支持向量机	支持向量机	图像	基于人类蛋白质图谱数据库构建的新金标准基准训练数据集
144	2024-09-30	[Parkinson's disease diagnosis based on local statistics of speech signal in time-frequency domain] 2021-Feb-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202001024 PMID:33899424	研究论文	提出了一种基于时频域梯度统计的方法来分析帕金森病患者语音障碍	引入时频域梯度统计特征，相比传统特征和深度学习特征，在分类准确性、特异性和敏感性上表现更好	NA	开发一种新的方法来诊断帕金森病患者的语音障碍	帕金森病患者的语音信号	信号处理	神经退行性疾病	时频分析	KNN分类器	语音信号	不同帕金森病患者的语音数据集
145	2024-09-30	Deep Learning Based Staging of Bone Lesions From Computed Tomography Scans 2021, IEEE access : practical innovations, open solutions IF:3.4Q2 DOI:10.1109/access.2021.3074051 PMID:34733603	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的分类策略，用于通过计算机断层扫描（CT）图像对前列腺癌患者的骨转移病变进行分类	引入了包含2880个注释骨病变的数据集，并通过患者级别的分层提高了模型的可靠性，探索了病变纹理、形态、大小、位置和体积信息对分类性能的影响，并使用多种算法进行比较，最终通过2D ResNet-50和3D ResNet-18的集成模型达到了92.2%的分类准确率	NA	开发一种高效且准确的深度学习模型，用于通过CT扫描图像对前列腺癌患者的骨转移病变进行分类	前列腺癌患者的骨转移病变	计算机视觉	前列腺癌	深度学习	ResNet	图像	2880个注释骨病变，来自114名前列腺癌患者
146	2024-09-30	Epidemiological Predictive Modeling of COVID-19 Infection: Development, Testing, and Implementation on the Population of the Benelux Union 2021, Frontiers in public health IF:3.0Q2 DOI:10.3389/fpubh.2021.727274 PMID:34778171	研究论文	本文提出了一种基于SEIRD模型和LSTM深度学习模型的两步法来预测COVID-19在比利时、荷兰和卢森堡（Benelux）地区的传播情况	结合了传统的SEIRD模型和LSTM深度学习模型来预测COVID-19的传播，并展示了两种模型在预测疫情高峰方面的有效性	SEIRD模型在轻症病例的预测上存在较大误差，LSTM模型在比利时和荷兰的感染人数预测上也存在较高误差	开发和测试一种预测COVID-19感染的模型，并在Benelux地区实施，以帮助及时采取措施应对疫情	COVID-19在Benelux地区的传播情况	机器学习	COVID-19	SEIRD模型，LSTM	LSTM	统计数据	比利时、荷兰和卢森堡在2020年3月15日至2021年3月15日期间的官方统计数据
147	2024-09-30	COVIDSAVIOR: A Novel Sensor-Fusion and Deep Learning Based Framework for Virus Outbreaks 2021, Frontiers in public health IF:3.0Q2 DOI:10.3389/fpubh.2021.797808 PMID:34917585	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习和传感器融合的新型辅助技术，用于病毒爆发期间的自动口罩检测和体温扫描	提出了COVIDSAVIOR框架，结合深度学习和传感器融合技术，实现了智能口罩和体温扫描系统，能够自动检测口罩佩戴情况和体温异常	NA	开发一种能够自动检测口罩佩戴情况和体温异常的辅助技术，以减少病毒传播	智能口罩和体温扫描系统	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA
148	2024-09-30	Diseases Detection of Occlusion and Overlapping Tomato Leaves Based on Deep Learning 2021, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2021.792244 PMID:34956290	研究论文	研究提出了一种基于YOLOv3-tiny-IRB算法的深度学习方法，用于检测遮挡和重叠的番茄叶片疾病	提出了YOLOv3-tiny-IRB算法，优化特征提取网络，减少信息损失，实现多层特征复用和融合	NA	提高在真实自然环境中遮挡和重叠条件下番茄病虫害检测的准确性和速度	番茄叶片疾病和虫害	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv3-tiny-IRB	图像	自建的番茄病虫害数据集
149	2024-09-30	Spontaneous Facial Expressions and Micro-expressions Coding: From Brain to Face 2021, Frontiers in psychology IF:2.6Q2 DOI:10.3389/fpsyg.2021.784834 PMID:35058850	研究论文	本文旨在通过解构面部肌肉运动，从运动皮层出发，系统梳理面部肌肉、动作单元（AU）和情绪之间的关系，使更多人理解编码的基本原理	本文通过数据驱动的分析和专业编码员的经验，推导出AU与情绪之间的关系，并详细讨论了生成面部运动特性的复杂面部运动皮层网络系统	NA	减轻基于视频的表情或微表情研究中专业知识的需求	面部表情和微表情的编码	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	5000张图像
150	2024-09-30	Code-Free Development and Deployment of Deep Segmentation Models for Digital Pathology 2021, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2021.816281 PMID:35155486	研究论文	本文介绍了一种无需编写代码的深度学习分割模型开发和部署管道，用于数字病理学中的组织病理学全切片图像（WSIs）分割	提出了一个无需编写代码的管道，利用开源软件（QuPath、DeepMIB和FastPathology）创建和部署深度学习分割模型，使没有编程经验的病理学家也能创建接近最先进的分割解决方案	NA	提高病理学诊断的效率和可重复性	结肠黏膜中的上皮和基质分离	数字病理学	NA	深度学习	分割模型	图像	251张标注的全切片图像，包括140张苏木精-伊红（HE）染色和111张CD3免疫染色的结肠活检图像
151	2024-09-30	SpatialSim: Recognizing Spatial Configurations of Objects With Graph Neural Networks 2021, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2021.782081 PMID:35156011	研究论文	本文提出了一种名为SpatialSim的新型几何推理诊断数据集，并验证了全连接消息传递图神经网络（MPGNNs）在解决识别和区分物体空间配置任务中的优势	提出了SpatialSim数据集，并展示了MPGNNs在几何推理任务中的优越性	指出了当前GNNs在识别和区分任务中的局限性	研究自主代理如何通过几何推理能力判断目标是否达成	物体空间配置的识别和区分	计算机视觉	NA	图神经网络（GNNs）	图神经网络（MPGNNs）	图像	NA
152	2024-09-30	Emotion Recognition Based on Dynamic Energy Features Using a Bi-LSTM Network 2021, Frontiers in computational neuroscience IF:2.1Q3 DOI:10.3389/fncom.2021.741086 PMID:35264939	研究论文	本文提出了一种基于动态能量特征的深度网络模型，用于解决脑电图（EEG）信号情感识别中因分辨率低和小样本量导致的高质量模型难以应用的问题	本文提出了能量序列的概念以减少特征分析和提取过程中的噪声叠加，并给出了动态能量特征集的构建方法，同时使用了双向长短期记忆（Bi-LSTM）网络以适应小数据集	NA	解决脑电图信号情感识别中因分辨率低和小样本量导致的高质量模型难以应用的问题	脑电图（EEG）信号的情感识别	机器学习	NA	双向长短期记忆（Bi-LSTM）网络	Bi-LSTM	脑电图（EEG）信号	使用了SEED和DEAP数据集，采用留一法（LOSO）和10折交叉验证（CV）策略进行实验
153	2024-09-29	CovH2SD: A COVID-19 detection approach based on Harris Hawks Optimization and stacked deep learning 2021-Dec-30, Expert systems with applications IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.eswa.2021.115805 PMID:34511738	研究论文	提出了一种基于Harris Hawks优化和堆叠深度学习的COVID-19检测方法CovH2SD	采用Harris Hawks优化算法优化超参数，并结合九种预训练卷积神经网络进行特征提取和学习	未提及	开发一种快速且准确的COVID-19检测方法	COVID-19患者的胸部CT图像	计算机视觉	COVID-19	Harris Hawks优化算法	卷积神经网络	图像	未提及
154	2024-09-29	Machine Learning in Epigenomics: Insights into Cancer Biology and Medicine 2021-12, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2021.188588 PMID:34245839	综述	本文综述了机器学习在表观基因组学中的应用，特别是其在癌症生物学和医学中的作用	探讨了机器学习算法在处理复杂、高维、稀疏和噪声数据方面的优势	未具体讨论每种机器学习方法的局限性	旨在概述机器学习方法如何用于探索表观基因组在癌症生物学和医学中的作用	癌症样本中的表观基因组数据	机器学习	癌症	机器学习算法	NA	表观基因组数据	NA
155	2024-09-29	CinE caRdiac magneTic resonAnce to predIct veNTricular arrhYthmia (CERTAINTY) 2021-11-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-021-02111-7 PMID:34811411	研究论文	研究利用心脏磁共振成像（CMR）和深度学习模型预测心室心律失常（VA）的风险	开发了一种新的深度学习模型，通过心脏磁共振成像提取心脏结构和功能特征，以预测心室心律失常的风险	需要多中心参与进行外部验证	开发更好的模型来识别低风险心室心律失常的患者，以减少植入式心脏复律除颤器（ICD）相关并发症的风险	心室心律失常的风险预测	机器学习	心血管疾病	心脏磁共振成像（CMR）	神经网络	图像	350名主要预防性ICD接受者，其中97名女性，中位年龄59岁，178名患有缺血性心肌病
156	2024-09-29	Neural Decoding of EEG Signals with Machine Learning: A Systematic Review 2021-Nov-18, Brain sciences IF:2.7Q3 DOI:10.3390/brainsci11111525 PMID:34827524	综述	本文系统综述了机器学习和深度学习在脑电信号解码和分类中的应用	本文总结了最新的机器学习和深度学习模型在脑电信号处理中的应用，并提供了特征提取和分类器的推荐	本文主要基于文献综述，未进行新的实验或数据分析	系统综述机器学习和深度学习在脑电信号解码和分类中的最新进展	脑电信号的解码和分类	机器学习	NA	脑电图 (EEG)	卷积神经网络 (CNN), 支持向量机 (SVM)	脑电信号	NA
157	2024-09-29	Wound Size Imaging: Ready for Smart Assessment and Monitoring 2021-11, Advances in wound care IF:5.8Q1 DOI:10.1089/wound.2018.0937 PMID:32320356	研究论文	本文介绍并评估了用于伤口尺寸成像的新兴设备和模式，以及用于智能伤口评估和监测的有前景的图像处理工具	本文引入了低成本设备和机器学习技术，使伤口评估更加稳健和准确，并结合多种成像模式和机器学习，实现了智能伤口监测	NA	研究目的是评估新兴设备和图像处理工具在智能伤口评估和监测中的应用	研究对象是伤口尺寸成像设备和图像处理工具	计算机视觉	NA	机器学习	NA	图像	NA
158	2024-09-29	Importance of the 5' regulatory region to bacterial synthetic biology applications 2021-11, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.13868 PMID:34171170	综述	本文综述了细菌合成生物学中5'调控区域（包括启动子、非翻译区域和编码序列的5'端）的创建方法及其在基因表达调控和化合物合成中的重要性	本文总结了细菌合成生物学中5'调控区域创建方法的最新进展，并讨论了其在细菌工程中的重要性	本文主要讨论了现有方法的优缺点，但未提出新的解决方案或技术	探讨细菌合成生物学中5'调控区域的创建方法及其在基因表达调控和化合物合成中的应用	细菌合成生物学中的5'调控区域（启动子、非翻译区域和编码序列的5'端）	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
159	2024-09-29	Ensemble of Deep Learning Models for Sleep Apnea Detection: An Experimental Study 2021-Aug-11, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s21165425 PMID:34450866	研究论文	本文研究了使用不同集成技术结合三种深度学习模型（两个CNN模型和一个CNN与LSTM结合模型）进行阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）检测的实验	本文采用了四种集成技术（多数投票、求和规则、Choquet积分模糊融合和基于MLP的可训练集成），并在PhysioNet Apnea-ECG数据库上进行了实验，最终实现了85.58%的OSA检测准确率，超越了许多现有方法	NA	研究阻塞性睡眠呼吸暂停（OSA）的检测方法	从体传感器获得的ECG信号	机器学习	NA	ECG信号分析	CNN、LSTM、MLP	ECG信号	使用PhysioNet Apnea-ECG数据库
160	2024-09-29	Automatic Extraction of Lung Cancer Staging Information From Computed Tomography Reports: Deep Learning Approach 2021-Jul-21, JMIR medical informatics IF:3.1Q2 DOI:10.2196/27955 PMID:34287213	研究论文	本文开发了一种信息提取系统，用于从CT报告中自动提取肺癌分期相关信息	提出了一种新的关系分类方法，使用关系符号约束（RSC），并在实验中展示了其优越性	NA	自动提取CT报告中肺癌分期相关信息，以支持准确的临床分期	肺癌分期信息	计算机视觉	肺癌	深度学习	BERT	文本	392份胸部CT报告