深度学习在生物医药领域的应用

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 算法框架 模型架构 性能指标 计算资源
21 2024-10-05
Detection of Cytopathic Effects Induced by Influenza, Parainfluenza, and Enterovirus Using Deep Convolution Neural Network
2021-Dec-30, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究利用深度卷积神经网络(ResNet-50)和多任务学习模型,提高了流感、副流感病毒和肠道病毒引起的细胞病变效应(CPEs)的检测效率 首次使用深度学习技术(ResNet-50和多任务学习模型)来检测流感、副流感病毒和肠道病毒引起的细胞病变效应,显著提高了检测准确率和效率 需要进一步验证模型在不同细胞系和更多病毒类型上的适用性 提高病毒引起的细胞病变效应的检测效率和准确性 流感、副流感病毒和肠道病毒引起的细胞病变效应 计算机视觉 NA 深度学习 ResNet-50 图像 涉及流感、副流感病毒和肠道病毒引起的细胞病变效应的数据 NA NA NA NA
22 2024-10-01
Improved Protein Structure Prediction Using a New Multi-Scale Network and Homologous Templates
2021-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了一种改进的蛋白质结构预测方法trRosettaX,通过应用新的多尺度网络Res2Net和基于注意力的模块来利用多个同源模板,提高了预测精度 引入了新的多尺度网络Res2Net和基于注意力的模块,利用多个同源模板提高了蛋白质结构预测的精度 NA 提高蛋白质结构预测的准确性 蛋白质结构预测 机器学习 NA 深度学习 Res2Net 蛋白质结构数据 161个目标 NA NA NA NA
23 2024-09-30
[Research progress of epileptic seizure predictions based on electroencephalogram signals]
2021-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi
综述 本文综述了基于脑电图信号的癫痫发作预测研究进展 强调了机器学习和深度学习在癫痫发作预测中的贡献,特别是深度学习在特征选择和模型泛化方面的优势 尽管取得了显著进展,但仍需更多努力才能实现临床应用 探讨如何利用脑电图信号预测癫痫发作,并促进其在临床中的应用 癫痫发作预测及其相关技术 机器学习 癫痫 脑电图(EEG) 深度学习(DL) 脑电图信号 NA NA NA NA NA
24 2024-09-29
CovH2SD: A COVID-19 detection approach based on Harris Hawks Optimization and stacked deep learning
2021-Dec-30, Expert systems with applications IF:7.5Q1
研究论文 提出了一种基于Harris Hawks优化和堆叠深度学习的COVID-19检测方法CovH2SD 采用Harris Hawks优化算法优化超参数,并结合九种预训练卷积神经网络进行特征提取和学习 未提及 开发一种快速且准确的COVID-19检测方法 COVID-19患者的胸部CT图像 计算机视觉 COVID-19 Harris Hawks优化算法 卷积神经网络 图像 未提及 NA NA NA NA
25 2024-09-29
Machine Learning in Epigenomics: Insights into Cancer Biology and Medicine
2021-12, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 本文综述了机器学习在表观基因组学中的应用,特别是其在癌症生物学和医学中的作用 探讨了机器学习算法在处理复杂、高维、稀疏和噪声数据方面的优势 未具体讨论每种机器学习方法的局限性 旨在概述机器学习方法如何用于探索表观基因组在癌症生物学和医学中的作用 癌症样本中的表观基因组数据 机器学习 癌症 机器学习算法 NA 表观基因组数据 NA NA NA NA NA
26 2024-09-27
Deep Learning Algorithm to Detect Cardiac Sarcoidosis From Echocardiographic Movies
2021-12-24, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society IF:3.1Q2
研究论文 开发了一种深度学习算法,用于从超声心动图电影中检测心脏肉瘤病 使用3D卷积神经网络(3D-CNN)结合迁移学习方法来区分心脏肉瘤病患者和健康受试者 研究样本量较小,且仅限于特定时间段内的患者 开发一种新的方法来早期诊断亚临床心脏肉瘤病 心脏肉瘤病患者和健康受试者 计算机视觉 心血管疾病 3D卷积神经网络(3D-CNN) 3D-CNN 视频 212个超声心动图电影,包括50名心脏肉瘤病患者和149名健康受试者 NA NA NA NA
27 2024-09-27
Deep Learning Brings New Era in Echocardiography
2021-12-24, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society IF:3.1Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
28 2024-09-19
Classification of COVID-19 pneumonia from chest CT images based on reconstructed super-resolution images and VGG neural network
2021-Dec, Health information science and systems IF:4.7Q1
研究论文 本文提出了一种基于超分辨率重建图像和VGG神经网络的COVID-19肺炎胸部CT图像分类辅助诊断算法 使用SRGAN神经网络对胸部CT图像进行超分辨率重建,然后通过VGG16神经网络对COVID-19和非COVID-19图像进行分类 NA 提高COVID-19肺炎胸部CT图像分类的准确性和性能 COVID-19肺炎和非COVID-19肺炎的胸部CT图像 计算机视觉 肺部疾病 超分辨率重建 SRGAN和VGG16 图像 使用公开的COVID-CT数据集进行验证 NA NA NA NA
29 2024-09-13
[Review on identity feature extraction methods based on electroencephalogram signals]
2021-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi
综述 本文综述了基于脑电信号的身份特征提取方法 介绍了脑电信号在生物识别中的特殊优势,并探讨了如何结合脑电数据特征更好地提取差异信息 未提及具体的研究局限性 探讨基于脑电信号的身份识别方法 脑电信号的身份特征提取 生物识别 NA 脑电信号分析 深度学习 脑电信号 NA NA NA NA NA
30 2024-09-13
Image and structured data analysis for prognostication of health outcomes in patients presenting to the ED during the COVID-19 pandemic
2021-Dec-09, International journal of medical informatics IF:3.7Q2
研究论文 研究利用机器学习和深度学习模型,结合临床数据和胸部影像数据,预测COVID-19患者在急诊科的不良预后 首次将临床数据和胸部影像数据结合,使用LightGBM和CheXNet模型进行多维度风险预测 研究样本仅限于Loyola大学医学中心的3571名患者,可能存在地域和样本量的局限性 开发机器学习和深度学习模型,预测COVID-19患者在急诊科的不良预后 COVID-19患者的胸部影像和临床数据 计算机视觉 COVID-19 LightGBM, CheXNet LightGBM, CheXNet 图像, 结构化数据 3571名18岁及以上的急诊科患者 NA NA NA NA
31 2024-09-11
DeepSec: a deep learning framework for secreted protein discovery in human body fluids
2021-12-22, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一个名为DeepSec的深度学习框架,用于在人体体液中识别分泌蛋白 DeepSec采用端到端的序列分析方法,结合卷积神经网络和双向门控循环单元进行蛋白质分类,显著提高了分泌蛋白识别的准确性 由于现有蛋白质组学平台的技术限制,不同实验研究之间存在较大差异,导致全面的人体体液蛋白质组图谱尚未完全确定 开发一个深度学习框架,以提高人体体液中分泌蛋白的识别准确性 12种人体体液中的分泌蛋白 机器学习 NA 深度学习 卷积神经网络和双向门控循环单元 蛋白质序列 12种人体体液的测试数据集 NA NA NA NA
32 2024-09-11
Learning sparse log-ratios for high-throughput sequencing data
2021-12-22, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为CoDaCoRe的新型学习算法,用于从高通量测序数据中发现稀疏、可解释和预测性的对数比生物标志物 CoDaCoRe算法利用连续松弛来近似组合优化问题,并通过现代机器学习工具箱(特别是梯度下降)高效优化,显著提高了计算速度和预测准确性 NA 自动发现与感兴趣结果相关的稀疏生物标志物 高通量测序数据中的对数比生物标志物 机器学习 NA 高通量测序 NA 序列数据 NA NA NA NA NA
33 2024-09-10
Wavelet and deep learning-based detection of SARS-nCoV from thoracic X-ray images for rapid and efficient testing
2021-Dec-15, Expert systems with applications IF:7.5Q1
研究论文 本文提出了一种基于小波和深度学习的快速高效检测SARS-nCoV的方法,通过胸腔X光图像进行诊断 使用小波变换和卷积神经网络结合的方法,从胸腔X光图像中提取特征,提高了检测准确性和信号噪声比 NA 开发一种快速高效的SARS-nCoV检测方法,减少诊断时间 SARS-nCoV感染患者 计算机视觉 呼吸道疾病 小波变换、卷积神经网络 卷积神经网络 图像 使用了公开数据库中的胸腔X光图像以及近期COVID-19患者的图像进行验证 NA NA NA NA
34 2024-09-10
Hybrid deep learning of social media big data for predicting the evolution of COVID-19 transmission
2021-Dec-05, Knowledge-based systems IF:7.2Q1
研究论文 研究构建了一种混合深度学习模型ODANN,结合神经网络、数据同化和自然语言处理技术,用于预测COVID-19传播的演变 提出了一种新的混合深度学习模型ODANN,结合了神经网络、数据同化和自然语言处理技术,能够同时处理COVID-19时间序列数据和Twitter数据,以预测全球确诊病例的增长率 研究仅使用了2020年1月23日至5月10日的Twitter数据,可能无法全面反映全球社区的情感反应 开发一种能够预测COVID-19传播演变的混合深度学习模型 COVID-19时间序列数据和Twitter数据 机器学习 COVID-19 自然语言处理 神经网络 文本 超过1亿条英文Twitter数据 NA NA NA NA
35 2024-09-10
Correlating dynamic climate conditions and socioeconomic-governmental factors to spatiotemporal spread of COVID-19 via semantic segmentation deep learning analysis
2021-Dec, Sustainable cities and society IF:10.5Q1
研究论文 本研究开发了一种深度学习模型,通过融合气候条件、社会经济和政府限制因素的数据特征,预测全球COVID-19的传播率 提出了G参数,并通过两步优化过程融合气候特征和社会经济-政府因素,提高了模型的预测能力 NA 预测COVID-19的全球传播率 COVID-19的传播率及其与气候条件、社会经济和政府因素的关系 机器学习 NA 深度学习 NA 数据特征 全球251个国家 NA NA NA NA
36 2024-09-10
COVID-19 lung infection segmentation with a novel two-stage cross-domain transfer learning framework
2021-12, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 本文提出了一种新颖的两阶段跨域迁移学习框架,用于从CT图像中准确分割COVID-19肺部感染 创新点包括一个名为nCoVSegNet的有效感染分割深度学习模型和一种新颖的两阶段迁移学习策略 NA 快速诊断COVID-19以控制疫情传播 COVID-19肺部感染的CT图像分割 计算机视觉 COVID-19 深度学习 nCoVSegNet 图像 NA NA NA NA NA
37 2024-09-10
Classification of COVID-19 in X-ray images with Genetic Fine-tuning
2021-Dec, Computers & electrical engineering : an international journal IF:4.0Q2
研究论文 本文研究了基于X射线图像和深度学习技术对COVID-19和其他类型肺炎的检测 提出了新的遗传微调方法来自动定义ResNet50和VGG16架构的最佳超参数集 NA 开发一种能够快速高效分类COVID-19肺炎的方法,以降低成本 COVID-19、其他肺炎和健康状态的X射线图像 计算机视觉 COVID-19 深度学习 ResNet50, VGG16 图像 NA NA NA NA NA
38 2024-09-10
A comparative analysis of eleven neural networks architectures for small datasets of lung images of COVID-19 patients toward improved clinical decisions
2021-12, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本文比较了十一种神经网络架构在COVID-19患者肺部图像小数据集上的表现,以改进临床决策 本文首次系统比较了十一种卷积神经网络在COVID-19肺部图像分类中的性能,为小医疗数据集的处理和分析提供了决策支持 本文仅限于COVID-19肺部图像的分类,未涉及其他疾病或数据类型 比较不同神经网络模型在COVID-19肺部图像分类中的性能,为临床决策提供支持 COVID-19患者的肺部图像 计算机视觉 呼吸系统疾病 卷积神经网络 CNN 图像 小数据集 NA NA NA NA
39 2024-09-10
Deep learning detects heart failure with preserved ejection fraction using a baseline electrocardiogram
2021-Dec, European heart journal. Digital health
研究论文 本研究利用深度学习技术,通过基线心电图检测保留射血分数的心力衰竭 首次使用卷积神经网络(CNN)根据欧洲心脏病学会(ESC)标准识别HFpEF患者,包括在诊断算法中纳入NT-proBNP测量 NA 开发一种基于心电图的深度学习模型,用于检测保留射血分数的心力衰竭 保留射血分数的心力衰竭患者和对照组 机器学习 心血管疾病 卷积神经网络(CNN) CNN 心电图 1884名患者用于模型训练,203名志愿者用于外部验证 NA NA NA NA
40 2024-09-08
Graph auto-encoding brain networks with applications to analyzing large-scale brain imaging datasets
2021-12-15, NeuroImage IF:4.7Q1
研究论文 本文开发了一种非线性潜在因子模型,用于表征脑图的群体分布并推断其与人类特征的关系 提出了名为Graph AuTo-Encoding (GATE)的方法,通过深度学习技术对脑网络进行编码和解码,以分析大规模脑成像数据集 NA 研究从不同成像模式推断的人类脑连接组及其与人类特征(如认知)的关系 脑连接组及其与认知的关系 计算机视觉 NA 深度学习 图自编码器 (Graph AuTo-Encoding, GATE) 网络数据 两个大规模脑成像数据集:Adolescent Brain Cognitive Development (ABCD) 研究和 Human Connectome Project (HCP) 成人研究 NA NA NA NA
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