深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
881	2024-09-04	NanoNet: Rapid and accurate end-to-end nanobody modeling by deep learning 2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2022.958584 PMID:36032123	研究论文	本文开发了一种名为NanoNet的深度学习模型，用于快速准确地进行纳米体结构建模	NanoNet能够直接从序列生成整个VH域的3D坐标，实现了高精度的纳米体结构建模	NA	开发一种高吞吐量的方法来进行纳米体的精确结构建模	纳米体（Nb）及其抗体VH域的结构	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	序列数据	NanoNet在纳米体测试集上实现了高精度，并在标准CPU计算机上能够在4小时内生成约100万个纳米体结构
882	2024-09-04	Accurate image-based identification of macroinvertebrate specimens using deep learning-How much training data is needed? 2022, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.13837 PMID:36032940	研究论文	研究使用深度学习工具进行基于图像的淡水大型无脊椎动物物种识别，探讨训练数据量对分类准确性的影响	展示了使用少量训练数据（15个样本）即可达到97%的分类准确率，显示出基于图像的方法和深度学习在样本研究中的巨大潜力	主要关注于淡水大型无脊椎动物，且针对形态相似物种的分类准确性仍有提升空间	探讨基于图像的分类方法在生物监测中的应用，特别是深度学习工具所需的训练数据量	淡水大型无脊椎动物的物种识别	计算机视觉	NA	深度学习	卷积神经网络（CNN）	图像	60个样本，每种16个分类单元
883	2024-09-04	aEYE: A deep learning system for video nystagmus detection 2022, Frontiers in neurology IF:2.7Q3 DOI:10.3389/fneur.2022.963968 PMID:36034311	研究论文	本文开发并验证了一个深度学习系统（aEYE），用于分类视频记录是否包含至少两个连续的眼球震颤节拍	深度学习模型在基于视频的眼球运动检测中的应用尚未得到广泛研究	模型在压缩视频上的准确性随着图像采样率的降低而下降	探索深度学习在视频记录中检测眼球震颤的有效性	视频记录中的眼球震颤检测	机器学习	NA	深度学习	ResNet-soft voting 和 VGG-hard voting	视频	435个视频片段
884	2024-09-04	Sampling and ranking spatial transcriptomics data embeddings to identify tissue architecture 2022, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2022.912813 PMID:36035139	研究论文	本文开发了一种名为MP-MIM的嵌入评估方法，结合基于消息传递的嵌入转换和空间自相关分析，用于选择有效的嵌入以推断组织结构	提出了MP-MIM方法，结合消息传递和空间自相关分析，以选择高质量的嵌入，提高深度学习工具在空间转录组分析中的可用性	NA	开发一种新的方法来选择适用于新测试数据的嵌入，并提高深度学习工具在空间转录组分析中的实用性	空间转录组数据嵌入的选择和组织结构的推断	生物信息学	NA	空间转录组学	图卷积网络	空间转录组数据	16个来自人类大脑的空间转录组样本
885	2024-09-04	Deep learning assessment of left ventricular hypertrophy based on electrocardiogram 2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2022.952089 PMID:36035939	研究论文	本研究构建了一个基于卷积神经网络-长短期记忆（CNN-LSTM）的深度学习模型，用于通过12导联心电图快速有效地检测左心室肥厚（LVH）	本研究首次将深度学习技术应用于LVH的诊断，提高了诊断的敏感性	NA	旨在通过深度学习技术提高左心室肥厚的诊断效率和准确性	左心室肥厚（LVH）的诊断	机器学习	心血管疾病	深度学习	CNN-LSTM	心电图	共分析了1,863名患者的超声心动图和心电图数据，其中训练集1,120例，验证集371例，测试集1 372例，内部测试集2 453例
886	2024-09-04	Artificial intelligence for topic modelling in Hindu philosophy: Mapping themes between the Upanishads and the Bhagavad Gita 2022, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0273476 PMID:36048840	研究论文	本文使用BERT等高级语言模型对《奥义书》和《薄伽梵歌》进行主题建模，并分析两者之间的主题相似性和重叠性	首次使用基于深度学习的语言模型对《奥义书》和《薄伽梵歌》进行主题建模和分析	NA	探索《奥义书》和《薄伽梵歌》之间的主题相似性和重叠性	《奥义书》和《薄伽梵歌》	自然语言处理	NA	BERT	BERT	文本	《奥义书》和《薄伽梵歌》的选定文本
887	2024-09-04	Apache Spark and Deep Learning Models for High-Performance Network Intrusion Detection Using CSE-CIC-IDS2018 2022, Computational intelligence and neuroscience DOI:10.1155/2022/3131153 PMID:36059395	研究论文	本文提出使用Apache Spark和深度学习模型（CNN和LSTM）结合CSE-CIC-IDS2018数据集进行高性能网络入侵检测	采用随机森林进行特征选择，使用过采样和欠采样技术处理数据不平衡问题，以及Apache Spark模型在所有类别中达到100%的准确率	NA	提高网络入侵检测系统的性能	网络入侵检测	机器学习	NA	深度学习	CNN, LSTM	数据集	CSE-CIC-IDS2018数据集包含14种攻击类型，84个特征中的19个被选为重要特征
888	2024-09-04	Clinical and Biological Significances of a Ferroptosis-Related Gene Signature in Lung Cancer Based on Deep Learning 2022, Computational and mathematical methods in medicine DOI:10.1155/2022/6495301 PMID:36060648	研究论文	本研究探讨了长链酰基辅酶A合成酶4（ACSL4）在非小细胞肺癌（NSCLC）中的表达及其与铁死亡的关系，并利用深度学习技术进行分析	首次揭示了ACSL4在NSCLC中的表达水平及其作为诊断和预后生物标志物的潜力，并探讨了其在铁死亡中的作用机制	研究仅限于NSCLC，且依赖于数据库和样本分析，未涉及临床试验	探究ACSL4在NSCLC中的临床和生物学意义及其作为潜在治疗靶点的可能性	ACSL4在NSCLC中的表达及其与铁死亡的关系	数字病理学	肺癌	深度学习	NA	mRNA表达数据	人类NSCLC样本
889	2024-09-04	Synthetic Epileptic Brain Activities with TripleGAN 2022, Computational and mathematical methods in medicine DOI:10.1155/2022/2841228 PMID:36065378	research paper	本研究提出了一种利用三重生成对抗网络（TripleGAN）实现脑电图（EEG）癫痫识别的方法	使用TripleGAN在时间域、频率域和时频域分别处理EEG数据，提高了癫痫分类的准确性、敏感性和特异性	NA	实现基于脑电图的癫痫自动检测	癫痫患者的脑电图数据	machine learning	癫痫	TripleGAN	GAN	EEG	使用了CHB-MIT数据集
890	2024-09-04	Hybrid of deep learning and exponential smoothing for enhancing crime forecasting accuracy 2022, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0274172 PMID:36070317	研究论文	本研究提出了一种结合双向长短期记忆网络（Bi-LSTM）和指数平滑（ES）的混合模型，用于提高犯罪预测的准确性	该研究首次将Bi-LSTM与ES结合，用于犯罪预测，并显示出比传统季节性自回归积分移动平均模型（SARIMA）更高的预测准确性	研究使用的数据仅限于2010-2017年纽约市的犯罪数据，可能限制了模型的泛化能力	提高犯罪预测的准确性，帮助执法机构预防和控制犯罪	犯罪预测	机器学习	NA	双向长短期记忆网络（Bi-LSTM），指数平滑（ES）	Bi-LSTM	时间序列数据	2010-2017年纽约市的犯罪数据
891	2024-09-04	Generative Adversarial Network Combined with SE-ResNet and Dilated Inception Block for Segmenting Retinal Vessels 2022, Computational intelligence and neuroscience DOI:10.1155/2022/3585506 PMID:36072751	研究论文	本研究开发了一种基于生成对抗网络（GAN）的准确方法，针对视网膜分割图像中微血管分割的当前不连续性问题	提出了一种改进的GAN，结合SE-ResNet和扩张的inception块，用于视网膜血管分割（SAD-GAN），改进了生成器和判别器，引入了注意力机制	NA	提高视网膜血管分割的准确性	视网膜血管	计算机视觉	NA	生成对抗网络（GAN）	GAN	图像	在DRIVE和CHASE_DB1数据集上进行了测试
892	2024-09-04	Geometric deep learning reveals a structuro-temporal understanding of healthy and pathologic brain aging 2022, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2 DOI:10.3389/fnagi.2022.895535 PMID:36081894	研究论文	本文通过几何深度学习方法，探索健康和病理性大脑老化在结构和时间上的理解	本文首次将深度学习与表面分析结合，研究个体结构层面的大脑老化过程，并假设病理性老化不会均匀影响个体结构的老化过程	NA	探索不同大脑结构在健康和病理性老化中的动态和相互关系	大脑结构的老化过程	计算机视觉	神经退行性疾病	MRI	深度学习网络	图像	共收集了来自17,440名独特受试者的26,276个T1加权MRI数据
893	2024-09-04	Exploration of the Application Effect of the Darongtong Course Model Based on Deep Learning Enhancement in Nursing 2022, Contrast media & molecular imaging DOI:10.1155/2022/5484423 PMID:36082057	研究论文	本研究探讨了基于深度学习增强的大融通课程模型在护理教学中的应用效果	采用基于深度学习增强的大融通教学模式，不仅加深学生对理论知识的理解，还提高了临床技能和沟通能力	NA	探索基于深度学习增强的大融通课程模型在护理教学中的应用效果	学校中的500名学生	NA	NA	深度学习	NA	NA	500名学生
894	2024-09-04	Define and visualize pathological architectures of human tissues from spatially resolved transcriptomics using deep learning 2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.029 PMID:36090815	研究论文	本文介绍了一种名为RESEPT的深度学习框架，用于从空间转录组学数据中表征和可视化组织结构	RESEPT能够通过空间保留的图神经网络学习三维嵌入，并将嵌入映射到RGB图像中进行可视化，从而准确推断和可视化组织结构	NA	开发一种新的计算框架，用于从空间转录组学数据中定义和可视化人类组织病理结构	人类和鼠类皮质组织，以及阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤样本	机器学习	NA	空间转录组学	图神经网络和卷积神经网络	基因表达数据	基于10x Genomics Visium空间转录组学数据集的人类和鼠类皮质组织样本，以及内部AD样本和胶质母细胞瘤样本
895	2024-09-04	Automated deep learning-based segmentation of COVID-19 lesions from chest computed tomography images 2022, Polish journal of radiology IF:0.9Q4 DOI:10.5114/pjr.2022.119027 PMID:36091652	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的自动化工具，用于从胸部CT图像中分割COVID-19病变区域，并评估其性能	使用U-Net、U-Net++和Res-Unet三种深度学习网络进行COVID-19病变区域的自动分割	需要进一步研究以评估所提出模型在COVID-19语义分割中的临床性能和鲁棒性	开发一种高效的工具，用于从胸部CT图像中自动分割COVID-19病变区域	COVID-19病变区域	计算机视觉	COVID-19	深度学习	U-Net, U-Net++, Res-Unet	图像	2112张COVID-19胸部CT图像
896	2024-09-02	Automated detection of retinal exudates and drusen in ultra-widefield fundus images based on deep learning 2022-08, Eye (London, England) DOI:10.1038/s41433-021-01715-7 PMID:34345030	研究论文	本文开发并评估了一种基于深度学习的系统，用于在超广角眼底图像中自动检测视网膜渗出物和玻璃膜疣	使用超广角眼底图像和深度学习技术自动检测视网膜渗出物和玻璃膜疣，提高了检测效率和准确性	NA	开发和评估一种深度学习系统，用于自动检测超广角眼底图像中的视网膜渗出物和玻璃膜疣	视网膜渗出物和玻璃膜疣的自动检测	计算机视觉	眼科疾病	深度学习	NA	图像	26,409张超广角眼底图像，来自14,994名受试者
897	2024-09-02	Outcome Prediction in Patients with Severe Traumatic Brain Injury Using Deep Learning from Head CT Scans 2022-08, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.212181 PMID:35471108	研究论文	本文开发并评估了一种结合头部CT扫描深度学习和临床信息的预测模型，用于预测严重创伤性脑损伤（sTBI）后的长期预后	采用迁移学习和课程学习应用于卷积神经网络，结合临床信息形成综合融合模型，提高了预测性能	在外部TRACK-TBI测试中，影像模型和融合模型在预测不良预后方面表现不如IMPACT模型	开发和评估一种预测严重创伤性脑损伤后长期预后的模型	严重创伤性脑损伤患者	机器学习	创伤性脑损伤	深度学习	卷积神经网络	图像	内部测试集537名患者，外部TRACK-TBI研究220名患者
898	2024-09-02	Real-time echocardiography image analysis and quantification of cardiac indices 2022-08, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2022.102438 PMID:35868819	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的实时超声心动图图像分析和心脏指数量化系统	使用自监督的特定模态表示和一种新颖的三边注意力网络（TaNet）进行实时心脏区域分割	NA	旨在通过深度学习技术改善临床实践中超声心动图的实时分析和量化	超声心动图图像的质量评估、视图分类、心脏区域分割及诊断指数的量化	计算机视觉	NA	深度学习	三边注意力网络（TaNet）	图像	使用了四个超声心动图数据集进行评估
899	2024-09-02	Deep learning-based defects detection of certain aero-engine blades and vanes with DDSC-YOLOv5s 2022-07-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-17340-7 PMID:35906368	研究论文	本文通过引入可变形卷积网络和深度可分离卷积优化YOLOv5s结构，提高航空发动机叶片和导叶缺陷检测的准确性和效率	采用可变形卷积网络增强特征图对形状差异的适应性，使用深度可分离卷积提高特征提取效率，并通过k-means聚类优化锚框大小	研究强调了DDSC-YOLOv5s在扩大规模发动机缺陷检测中的应用潜力，但未来仍需进一步增强	实现航空发动机缺陷的智能检测，提高飞行安全性和降低维护成本	航空发动机叶片和导叶的缺陷检测	计算机视觉	NA	可变形卷积网络，深度可分离卷积	YOLOv5s	图像	未具体说明样本数量
900	2024-09-02	Automatic scoring of COVID-19 severity in X-ray imaging based on a novel deep learning workflow 2022-07-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-15013-z PMID:35896761	研究论文	本研究提出了一种用于肺部疾病分割和评分的新型深度学习工作流程，该流程继承了放射科医生和临床医生对X光图像上肺部疾病的定量、定性和视觉评估	提出的算法在平均绝对误差（MAE）方面显著优于现有的COVID-19算法，且计算效率更高	NA	开发一种准确、高效且多功能的肺部疾病分割和评分方法，特别适用于COVID-19，并具有更广泛的潜在应用	COVID-19患者的X光图像以及无肺部病理患者的X光图像	计算机视觉	COVID-19	深度学习	DeepLabV3+, MA-Net	图像	580名COVID-19患者和784名无肺部病理患者