深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2024-09-16	Towards smart diagnostic methods for COVID-19: Review of deep learning for medical imaging 2022 Nov-Dec, IPEM-translation DOI:10.1016/j.ipemt.2022.100008 PMID:36312890	综述	本文综述了2020年1月至2021年10月期间，使用深度学习技术对COVID-19患者进行CT和X光胸片诊断的研究	本文总结了现有研究中的模型技术细节，并讨论了使用深度学习技术进行COVID-19智能诊断的挑战	现有模型的临床应用效果需要进一步验证	探讨深度学习在COVID-19诊断中的应用，并提出改进建议	COVID-19患者的CT和X光胸片	计算机视觉	COVID-19	深度学习	NA	图像	NA
62	2024-09-13	Assessment of malalignment factors related to the Invisalign treatment time aided by automated imaging processes 2022-Nov-03, The Angle orthodontist DOI:10.2319/031622-225.1 PMID:36327333	研究论文	本文研究了影响Invisalign治疗时间的错位因素，并使用自动化成像过程进行评估	本文首次使用深度学习方法进行牙齿分割和地标识别，并测量了六个自由度的变化，以评估错位类型对治疗时间的影响	本文的样本量较小，且仅限于Invisalign治疗的患者	研究影响Invisalign治疗时间的错位因素	Invisalign治疗的患者	NA	NA	深度学习	NA	图像	116名接受Invisalign治疗的患者
63	2024-09-13	Contrastive semi-supervised harmonization of single-shell to multi-shell diffusion MRI 2022-11, Magnetic resonance imaging IF:2.1Q2 DOI:10.1016/j.mri.2022.06.004 PMID:35716922	研究论文	本文探讨了通过半监督和无监督学习方法，利用深度学习模型将单壳扩散MRI数据协调为多壳数据	本文提出了利用解耦协调模型和CycleGAN模型进行数据协调，并展示了其在多壳扩散MRI数据协调中的优越性能	NA	研究如何通过深度学习方法将单壳扩散MRI数据协调为多壳数据，以适应多站点或多采集研究的需求	单壳和多壳扩散MRI数据	计算机视觉	NA	深度学习	GAN	图像	使用了Multi-shell Diffusion MRI Harmonization Challenge (MUSHAC)和Baltimore Longitudinal Study on Aging (BLSA)数据集
64	2024-09-10	Reduced order modeling for flow and transport problems with Barlow Twins self-supervised learning 2022-Nov-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-24545-3 PMID:36450820	研究论文	本文提出了一种统一的数据驱动降阶模型（ROM），结合了自编码器（AE）和Barlow Twins（BT）自监督学习，用于流体和传输问题的建模	该模型通过结合自编码器和Barlow Twins自监督学习，成功填补了线性和非线性降阶模型之间的性能差距，并在非结构化网格上表现出色	文中提到的相对误差在2%到12%之间，表明在某些情况下模型的精度仍有提升空间	旨在开发一种能够有效处理线性和非线性降阶模型的统一数据驱动方法	流体和传输问题，特别是多孔介质中的自然对流问题	计算机视觉	NA	自监督学习	自编码器（AE）	数值数据	文中未明确提及具体的样本数量
65	2024-09-10	Surgical Gesture Recognition in Laparoscopic Tasks Based on the Transformer Network and Self-Supervised Learning 2022-Nov-29, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering9120737 PMID:36550943	研究论文	本文提出了一种基于Transformer网络和自监督学习的视频手术动作识别深度学习框架	提出了基于Transformer网络和自监督学习的手术动作识别框架，并设计了两种模型：C3DTrans（监督学习）和SSC3DTrans（自监督学习）	仅在两个基本的腹腔镜任务（peg transfer和knot tying）上进行了验证，且样本量较小	开发一种能够识别视频中手术动作的深度学习框架	腹腔镜手术中的peg transfer和knot tying任务	计算机视觉	NA	3D卷积网络和Transformer网络	Transformer	视频	80个视频样本，来自两个基本腹腔镜任务
66	2024-09-10	Breast Cancer Dataset, Classification and Detection Using Deep Learning 2022-Nov-29, Healthcare (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/healthcare10122395 PMID:36553919	review	本文综述了利用深度学习进行乳腺癌诊断的计算和数字病理学方法	NA	NA	综述现有的计算和数字病理学方法，特别是深度学习方法，用于乳腺癌诊断	乳腺癌诊断的计算和数字病理学方法	digital pathology	breast cancer	deep learning	NA	image	NA
67	2024-09-10	Characterisation of urban environment and activity across space and time using street images and deep learning in Accra 2022-11-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-24474-1 PMID:36443345	研究论文	本文利用街景图像和深度学习技术，分析了加纳阿克拉市的城市环境和活动在空间和时间上的特征	本文收集了210万张时间流逝的日间和夜间图像，并使用迁移学习和数据增强技术重新训练卷积神经网络，以检测与健康、宜居性、安全性和可持续性相关的城市环境特征	NA	利用智能感知和分析技术，研究城市环境特征的空间模式和时间动态，以指导城市规划和政策制定	加纳阿克拉市的城市环境和活动	计算机视觉	NA	深度学习	卷积神经网络	图像	210万张图像，其中1250张手动标注
68	2024-09-10	On Detecting Cryptojacking on Websites: Revisiting the Use of Classifiers 2022-Nov-27, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s22239219 PMID:36501921	研究论文	本文探讨了使用多种机器学习分类模型检测网站上的加密劫持行为	本文通过使用多种特征选择方法和机器学习模型，展示了简单模型在检测加密劫持方面的有效性	本文未详细讨论数据集的来源和特征选择的局限性	研究如何有效检测网站上的加密劫持行为	网站上的加密劫持行为	机器学习	NA	机器学习	逻辑回归、决策树、随机森林、梯度提升分类器、K近邻、XGBoost	网络和主机特征样本	使用了一个包含网络和主机特征样本的数据集
69	2024-09-10	Convolutional Neural Network Classification of Rest EEG Signals among People with Epilepsy, Psychogenic Non Epileptic Seizures and Control Subjects 2022-11-26, International journal of environmental research and public health DOI:10.3390/ijerph192315733 PMID:36497808	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的自动诊断方法，用于区分癫痫发作、非癫痫性心因性发作和健康对照组的静息脑电信号	本文创新性地使用卷积神经网络（CNN）对脑电信号进行分类，并结合经验模态分解（EMD）提取增强特征	研究样本量较小，且未考虑药物治疗对脑电信号的影响	开发一种自动化的方法来区分癫痫发作、非癫痫性心因性发作和健康对照组的脑电信号	癫痫发作患者、非癫痫性心因性发作患者和健康对照组的脑电信号	机器学习	癫痫	经验模态分解（EMD）	卷积神经网络（CNN）	脑电信号	42名新发癫痫患者、42名非癫痫性心因性发作患者和19名健康对照组
70	2024-09-10	Lung_PAYNet: a pyramidal attention based deep learning network for lung nodule segmentation 2022-11-25, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-24900-4 PMID:36434060	研究论文	本文提出了一种基于金字塔注意力机制的深度学习网络Lung_PAYNet，用于肺结节分割	本文创新性地设计了Lung_PAYNet模型，采用金字塔注意力机制和倒残差块结构，显著提高了肺结节分割的准确性	NA	提高低剂量CT图像中肺结节分割的准确性和可靠性	肺结节	计算机视觉	肺癌	深度学习	CNN	图像	使用了公开的LIDC-IDRI数据集进行训练和验证
71	2024-09-10	Risk of Mortality Prediction Involving Time-Varying Covariates for Patients with Heart Failure Using Deep Learning 2022-Nov-25, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics12122947 PMID:36552953	研究论文	本研究开发并验证了一种基于深度学习的预测心力衰竭患者全因死亡风险的新型预后模型	提出了一个基于时间变化协变量的递归神经网络模型（RNNSurv），该模型在区分度、校准度和风险分层能力上优于传统的深度前馈神经网络模型和多变量Cox比例风险模型	NA	预测心力衰竭患者的全因死亡风险	心力衰竭患者	机器学习	心血管疾病	深度学习	递归神经网络（RNN）	时间序列数据	730名心力衰竭住院患者
72	2024-09-10	AlphaPeptDeep: a modular deep learning framework to predict peptide properties for proteomics 2022-11-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-34904-3 PMID:36433986	研究论文	介绍了一个名为AlphaPeptDeep的模块化深度学习框架，用于预测蛋白质组学中的肽性质	AlphaPeptDeep框架允许非专业人士通过几行代码创建模型，并广泛使用迁移学习，无需大量数据集即可优化特定实验条件的模型	NA	开发一个模块化的深度学习框架，用于预测蛋白质组学中的肽性质	肽的保留时间、碰撞截面和片段强度等性质	机器学习	NA	深度学习	神经网络	序列	NA
73	2024-09-10	MSLF-Net: A Multi-Scale and Multi-Level Feature Fusion Net for Diabetic Retinopathy Segmentation 2022-Nov-23, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics12122918 PMID:36552925	研究论文	本文提出了一种基于多尺度多层次特征融合的监督分割方法MSLF-Net，用于糖尿病视网膜病变（DR）的病变分割	引入多尺度特征提取模块和多层次特征融合模块，通过交叉层结构仅融合相同类别的低级和高级特征，避免特征污染	NA	实现准确的端到端糖尿病视网膜病变病变分割	糖尿病视网膜病变（DR）的病变	计算机视觉	糖尿病并发症	深度学习算法	MSLF-Net	图像	在公共数据集IDRID和e_ophtha上进行了广泛实验
74	2024-09-10	A Framework for Lung and Colon Cancer Diagnosis via Lightweight Deep Learning Models and Transformation Methods 2022-Nov-23, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics12122926 PMID:36552933	研究论文	本文提出了一种基于轻量级深度学习模型和变换方法的肺癌和结肠癌诊断框架	该框架利用多种变换方法进行特征降维，并提供了更好的数据表示，相比现有方法具有更低的特征数量和计算复杂度	NA	早期检测肺癌和结肠癌	肺癌和结肠癌的病理扫描图像	计算机视觉	肺癌, 结肠癌	深度学习, 主成分分析 (PCA), 快速Walsh-Hadamard变换 (FHWT), 离散小波变换 (DWT)	ShuffleNet, MobileNet, SqueezeNet	图像	NA
75	2024-09-10	Generation of novel Diels-Alder reactions using a generative adversarial network 2022-Nov-22, RSC advances IF:3.9Q2 DOI:10.1039/d2ra06022a PMID:36505715	研究论文	本文利用生成对抗网络（GAN）生成新的Diels-Alder反应	首次将生成对抗网络应用于有机化学领域，生成新的Diels-Alder反应	仅限于生成Diels-Alder反应，未涉及其他类型的有机反应	探索生成对抗网络在有机化学中的应用，生成新的有机反应	Diels-Alder反应	机器学习	NA	生成对抗网络（GAN）	MaskGAN	反应数据	训练数据包含14,092个Diels-Alder反应，生成1,441个新反应
76	2024-09-10	[A lightweight multiscale target object detection network for melanoma based on attention mechanism manipulation] 2022-Nov-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University DOI:10.12122/j.issn.1673-4254.2022.11.10 PMID:36504059	研究论文	提出了一种结合坐标注意机制和高效通道注意机制的深度学习目标检测模型AM-YOLO，用于黑色素瘤的检测	通过在YOLOv5s模型中集成坐标注意机制和高效通道注意机制，提高了黑色素瘤识别的准确性并减小了模型权重	NA	开发一种能够有效识别黑色素瘤的深度学习目标检测算法	黑色素瘤	计算机视觉	皮肤癌	深度学习	YOLO	图像	NA
77	2024-09-10	Cardiovascular/Stroke Risk Stratification in Diabetic Foot Infection Patients Using Deep Learning-Based Artificial Intelligence: An Investigative Study 2022-Nov-19, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1 DOI:10.3390/jcm11226844 PMID:36431321	研究论文	本文探讨了使用基于深度学习的人工智能技术对糖尿病足感染患者进行心血管/中风风险分层的可行性	提出了使用深度学习模型（如LSTM和RNN）结合多种生物标志物和影像学特征来预测糖尿病足感染患者的心血管/中风风险	研究受限于样本量和科学临床验证方法的不足	研究深度学习技术在糖尿病足感染患者中预测心血管/中风风险的有效性	糖尿病足感染患者的心血管/中风风险	机器学习	心血管疾病	深度学习	LSTM和RNN	生物标志物和影像数据	207项研究
78	2024-09-10	Pixel-Guided Association for Multi-Object Tracking 2022-Nov-18, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s22228922 PMID:36433519	研究论文	本文提出了一种像素引导的多目标跟踪方法，通过统一检测和跟踪框架来提高跟踪性能	引入了像素引导的方法来构建联合检测和跟踪框架，并使用长时外观关联来计算相似度矩阵	未提及	提高多目标跟踪任务中的轨迹关联准确性	多目标跟踪中的物体轨迹	计算机视觉	NA	深度学习	Transformer	图像	使用了MOT15和MOT17基准数据集进行实验
79	2024-09-10	A Web-Based Automated Image Processing Research Platform for Cochlear Implantation-Related Studies 2022-Nov-09, Journal of clinical medicine IF:3.0Q1 DOI:10.3390/jcm11226640 PMID:36431117	研究论文	本文介绍了一个基于网络的自动化图像处理研究平台Nautilus，用于耳蜗植入相关研究	结合深度学习和贝叶斯推理方法，自动分割耳蜗结构，并使用卷积神经网络和几何推理提取植入电极位置	NA	开发一个自动化平台，用于个性化和安全的耳蜗植入治疗	耳蜗及其内部结构，以及耳蜗植入电极	计算机视觉	NA	深度学习，贝叶斯推理，卷积神经网络	卷积神经网络	图像	一个精心设计的数据集
80	2024-09-10	Machine Learning for Industry 4.0: A Systematic Review Using Deep Learning-Based Topic Modelling 2022-Nov-09, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s22228641 PMID:36433236	综述	本文通过BERTopic分析了45,783篇相关论文，系统地回顾了机器学习在工业4.0中的应用	使用BERTopic进行主题建模，分析了机器学习在工业4.0中的主要应用和方法	仅分析了45,783篇论文，可能无法涵盖所有相关研究	探讨机器学习在工业4.0中的应用现状	工业4.0中的机器学习应用	机器学习	NA	BERTopic	CNN	文本	45,783篇论文和17份白皮书