深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2024-09-13	Detecting COVID-19 vaccine hesitancy in India: a multimodal transformer based approach 2023, Journal of intelligent information systems IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s10844-022-00745-1 PMID:36091222	研究论文	本文提出了一种基于多模态变压器的方法，用于检测印度Twitter用户对COVID-19疫苗的犹豫态度	利用BERT和GraphBERT模型对文本和网络结构信息进行编码，结合多模态学习方法，提高了分类效果	未提及具体限制	研究印度公众对COVID-19疫苗的犹豫态度，并提出有效的分类方法	印度Twitter用户对COVID-19疫苗的态度	机器学习	NA	多模态学习	变压器模型（BERT和GraphBERT）	文本和网络结构	未提及具体样本数量
262	2024-09-13	Interpretable tourism volume forecasting with multivariate time series under the impact of COVID-19 2023, Neural computing & applications IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s00521-022-07967-y PMID:36373134	研究论文	本文提出了一种新的可解释框架，用于在COVID-19影响下预测中国九寨沟、黄山和四姑娘山每日的旅游量	首次引入与疫情相关的搜索引擎数据进行旅游需求预测，并提出了一种新的组合领先搜索指数-变分模式分解方法处理搜索引擎数据	NA	在COVID-19影响下，通过多变量时间序列数据预测旅游量	九寨沟、黄山和四姑娘山的每日旅游量	机器学习	NA	变分模式分解	DE-TFT	时间序列数据	三个案例
263	2024-09-13	Performance analysis of U-Net with hybrid loss for foreground detection 2023, Multimedia systems IF:3.5Q1 DOI:10.1007/s00530-022-01014-5 PMID:36406901	研究论文	本文提出了一种结合混合损失的U-Net框架用于前景检测，并通过实验验证了其有效性	本文的创新点在于提出了一个结合迁移学习和混合损失的深度学习模型，用于解决前景检测中的类别不平衡问题	NA	本文的研究目的是改进前景检测算法，特别是在复杂背景下的前景提取	本文的研究对象是前景检测算法及其在复杂背景下的表现	计算机视觉	NA	卷积神经网络 (CNN)	U-Net	图像	标准数据集和未见过的视频数据
264	2024-09-13	Forecast evaluation for data scientists: common pitfalls and best practices 2023, Data mining and knowledge discovery IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s10618-022-00894-5 PMID:36504672	研究论文	本文探讨了机器学习和深度学习在时间序列预测中的应用，并指出了数据科学家在预测评估中常见的陷阱和最佳实践	本文通过教程式的方式，详细介绍了预测评估的细节，旨在弥合传统预测方法与现代机器学习技术之间的知识差距	NA	旨在帮助机器学习研究人员避免在预测评估中的常见错误，并提供最佳实践指南	时间序列数据和预测评估方法	机器学习	NA	机器学习 (ML) 和深度学习 (DL)	NA	时间序列数据	NA
265	2024-09-13	Deep Learning Algorithm of 12-Lead Electrocardiogram for Parkinson Disease Screening 2023, Journal of Parkinson's disease DOI:10.3233/JPD-223549 PMID:36641685	研究论文	本研究开发了一种基于12导联心电图的深度学习算法，用于帕金森病的筛查	首次利用深度卷积神经网络（CNN）通过心电图数据进行帕金森病的筛查	模型的特异性较低，尤其是对于药物诱导的帕金森病（DPD）的检测效果不佳	开发一种高效的心电图深度学习算法，用于帕金森病的早期筛查	帕金森病患者和非帕金森病患者的心电图数据	机器学习	帕金森病	深度卷积神经网络（CNN）	CNN	心电图	751名帕金森病患者（2138份心电图），751名非帕金森病患者（2673份心电图），297名药物诱导的帕金森病患者（875份心电图）
266	2024-09-13	Classification of Coronavirus Spike Proteins by Deep-Learning-Based Raman Spectroscopy and its Interpretative Analysis 2023, Journal of applied spectroscopy IF:0.8Q4 DOI:10.1007/s10812-023-01487-w PMID:36718373	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的拉曼光谱技术用于冠状病毒刺突蛋白的分类方法	利用深度学习技术对拉曼光谱进行分类，即使在低信噪比的情况下也能达到超过97%的平均准确率	NA	开发一种快速且准确的冠状病毒检测方法	冠状病毒刺突蛋白的拉曼光谱	机器学习	NA	拉曼光谱	神经网络	光谱数据	5种冠状病毒的刺突蛋白样本
267	2024-09-13	Validation of automatically measured T1 map cortico-medullary difference (ΔT1) for eGFR and fibrosis assessment in allograft kidneys 2023, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0277277 PMID:36791140	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的2D U-Net模型（RCM U-Net），用于自动分割慢性肾病（CKD）移植肾脏T1图的皮质和髓质，并验证了自动测量的ΔT1值与eGFR和纤维化的相关性	本文的创新点在于使用深度学习模型RCM U-Net自动分割肾脏皮质和髓质，减少了手动绘制ROI的主观性和时间消耗，提高了结果的可重复性	本文的局限性在于特定性（SP）和准确性（ACC）的改进不显著，且样本量相对较小	研究目的是验证自动测量的ΔT1值在评估移植肾脏eGFR和纤维化中的应用	研究对象是慢性肾病（CKD）移植肾脏患者	计算机视觉	肾脏疾病	MRI T1-mapping	U-Net	图像	训练集包含40名患者（2400张增强图像），测试集包含10名患者（600张增强图像），临床验证集包含114名移植肾脏患者的皮质和髓质
268	2024-09-13	Deep learning based tumor-stroma ratio scoring in colon cancer correlates with microscopic assessment 2023, Journal of pathology informatics DOI:10.1016/j.jpi.2023.100191 PMID:36794267	研究论文	研究使用深度学习算法对结肠癌中的肿瘤-间质比（TSR）进行半自动和全自动评分，并与显微镜评估进行比较	首次探讨了使用深度学习算法对结肠癌中的肿瘤-间质比进行自动化评分	研究样本量较小，且仅限于结肠癌病例	探讨使用深度学习算法对结肠癌中的肿瘤-间质比进行自动化评分的可行性	结肠癌中的肿瘤-间质比（TSR）评分	数字病理学	结肠癌	深度学习算法	NA	图像	75例结肠癌样本
269	2024-09-13	The emerging applications and advancements of Raman spectroscopy in pediatric cancers 2023, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2023.1044177 PMID:36814817	综述	本文综述了拉曼光谱在儿科癌症中的新兴应用和进展	讨论了拉曼光谱与深度学习的结合作为未来在儿科癌症中的应用	NA	总结拉曼光谱在儿科癌症中的潜在应用	儿科癌症的早期诊断、预后预测和治疗改进	NA	儿科癌症	拉曼光谱	深度学习	NA	NA
270	2024-09-13	Impact of coronary computed tomography angiography-derived fractional flow reserve based on deep learning on clinical management 2023, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2023.1036682 PMID:36818335	研究论文	研究深度学习衍生的冠状动脉CT血管造影分数流量储备（DL-FFRCT）对临床管理的影响	首次探讨了DL-FFRCT在临床实践中的应用价值，并分析了其局限性	对于严重钙化、闭塞或直径小于2毫米的冠状动脉，DL-FFRCT的血液动力学分析可靠性不高	评估DL-FFRCT在临床实践中的应用价值及其局限性	疑似冠状动脉疾病患者及其冠状动脉病变	数字病理	心血管疾病	深度学习	NA	图像	229名患者，485处冠状动脉病变
271	2024-09-13	Using deep learning to predict tumor mutational burden from scans of H&E-stained multicenter slides of lung squamous cell carcinoma 2023-Jan, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.10.1.017502 PMID:36825084	研究论文	本文利用深度学习技术从多中心H&E染色的肺鳞状细胞癌切片扫描图像中预测肿瘤突变负荷	本文首次针对肺鳞状细胞癌开发了一种深度学习模型，用于从标准病理切片中预测肿瘤突变负荷	模型的准确性和特异性仍有提升空间，需要进一步开发和外部验证	开发一种能够从肺鳞状细胞癌的H&E染色切片中预测肿瘤突变负荷的深度学习模型，并验证其在独立测试集上的有效性	肺鳞状细胞癌患者的H&E染色切片	数字病理学	肺鳞状细胞癌	深度学习	VGG16	图像	50名肺鳞状细胞癌患者的切片，来自35个不同中心
272	2024-09-11	Visualization of erythrocyte stasis in the living human eye in health and disease 2023-Jan-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2022.105755 PMID:36594026	研究论文	本研究介绍了一种成像方法，揭示了位于中枢神经系统毛细血管段内的一组先前未知的停滞红细胞池的存在	首次发现并可视化了健康和疾病状态下人眼中停滞红细胞的存在，并利用深度学习技术展示了其在青光眼中的临床应用	NA	研究停滞红细胞在健康和疾病状态下的相关性及其在青光眼中的临床意义	人眼中的停滞红细胞及其在青光眼中的变化	计算机视觉	青光眼	深度学习	NA	图像	100%的受试者
273	2024-09-11	Automatic segmentation and measurement of pressure injuries using deep learning models and a LiDAR camera 2023-01-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-26812-9 PMID:36639395	研究论文	本研究开发了一种使用深度学习模型和LiDAR相机自动分割和测量压疮面积的方法	首次将深度学习模型与LiDAR相机结合用于压疮的自动分割和面积测量	外部验证中Mask R-CNN的表现不如U-Net，且与传统手动方法相比，自动测量系统的平均相对误差为26.2%	开发一种自动分割和测量压疮面积的方法，以提高临床应用的准确性	压疮的自动分割和面积测量	计算机视觉	压疮	深度学习模型	U-Net	图像	528张压疮患者照片
274	2024-09-11	Investigation of early molecular alterations in tauopathy with generative adversarial networks 2023-01-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-28081-6 PMID:36639689	研究论文	本文使用生成对抗网络（GANs）模拟tauopathy的分子进展并解析其早期特征	本文首次使用生成对抗网络进行tauopathy的分子进展模拟，并通过四向过渡曲线进行虚拟疾病进展模拟	本文主要基于小鼠模型和公共人类数据进行验证，未来需在更多样化的样本中验证其有效性	探索tauopathy的早期分子变化机制	tauopathy的早期分子变化	机器学习	NA	生成对抗网络（GANs）	生成对抗网络（GANs）	RNA-seq数据	小鼠模型中的tauopathy（TPR50-P301S）样本，以及公共人类数据
275	2024-09-11	Dental caries detection using a semi-supervised learning approach 2023-01-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-27808-9 PMID:36639724	研究论文	本文提出了一种基于半监督学习方法的龋齿检测技术	利用少量标注图像训练教师模型，并结合大量未标注图像训练学生模型，采用中心裁剪和数据增强技术提升模型性能	仅在141张标注图像的数据集上进行了验证，可能需要更大规模的数据集进行进一步验证	开发一种高效的半监督学习方法，用于龋齿检测和分割	龋齿检测和分割	计算机视觉	NA	深度学习	半监督学习模型	图像	141张标注的牙科放射图像
276	2024-09-11	AMTLDC: a new adversarial multi-source transfer learning framework to diagnosis of COVID-19 2023-Jan-12, Evolving systems IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s12530-023-09484-2 PMID:38625255	研究论文	本文提出了一种新的对抗性多源迁移学习框架AMTLDC，用于COVID-19的诊断	提出了AMTLDC模型，通过学习不同数据源之间的相似表示来提高模型的泛化能力	未提及具体限制	提高COVID-19诊断模型的泛化能力	COVID-19的诊断	机器学习	COVID-19	迁移学习	卷积神经网络	医学图像	未提及具体样本数量
277	2024-09-11	RMDisease V2.0: an updated database of genetic variants that affect RNA modifications with disease and trait implication 2023-01-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkac750 PMID:36062570	研究论文	本文介绍了RMDisease v2.0数据库，该数据库用于识别与RNA修饰相关的遗传变异及其与疾病和性状的关联	RMDisease v2.0数据库相较于前一版本扩展了覆盖范围，并利用深度学习模型从大量实验验证的RNA修饰位点中识别出更多的RNA修饰相关变异	NA	揭示遗传变异与RNA修饰在人类疾病发病机制中的关联	RNA修饰相关的单核苷酸变异及其与疾病和性状的关联	NA	NA	深度学习	NA	遗传变异数据	873,819个实验验证的RNA修饰位点，1,366,252个RNA修饰相关变异，涉及20种生物
278	2024-09-11	G4Atlas: a comprehensive transcriptome-wide G-quadruplex database 2023-01-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkac896 PMID:36243987	研究论文	本文介绍了G4Atlas，一个全面的转录组范围的G-四链体数据库	首次构建了转录组范围的G-四链体数据库，整合了多种实验数据和RNA二级结构预测信息	NA	构建一个全面的G-四链体数据库，以探索其在不同生物过程中的功能	转录组范围的G-四链体及其在基因表达后调控中的作用	NA	NA	rG4-seq, 化学分析, 配体结合方法	NA	文本	82种实验处理和238个样本，涵盖十个物种
279	2024-09-11	The protein common assembly database (ProtCAD)-a comprehensive structural resource of protein complexes 2023-01-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkac937 PMID:36300618	研究论文	本文介绍了蛋白质共同组装数据库（ProtCAD），这是一个全面的蛋白质复合物结构资源	ProtCAD通过聚类蛋白质数据银行（PDB）中同源蛋白质的独立结构测定中的蛋白质组装结构，提供了对生物组装结构的验证	NA	提供一个全面的蛋白质复合物结构资源，以帮助理解功能数据和训练深度学习方法预测组装结构	蛋白质复合物的结构	生物信息学	NA	X射线晶体学，冷冻电子显微镜	深度学习	结构数据	约60%的PDB条目包含至少2个独立实验的组装聚类
280	2024-09-11	Photonic machine learning with on-chip diffractive optics 2023-Jan-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-35772-7 PMID:36604423	研究论文	本文提出了一种基于硅基绝缘体平台的片上衍射光学神经网络（DONN），用于高性能机器学习任务	首次提出了一种基于硅基绝缘体平台的片上衍射光学神经网络，具有高集成度和低功耗特性	实验验证的样本量较小，且仅在Iris植物数据集和MNIST手写数字图像上进行了分类任务	探索和验证基于光子学的机器学习技术在硬件加速方面的潜力	片上衍射光学神经网络的性能和应用	机器学习	NA	衍射光学	光学神经网络	图像	Iris植物数据集和MNIST手写数字图像