深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
221	2025-07-20	Multiple generation distinct toxicant exposures induce epigenetic transgenerational inheritance of enhanced pathology and obesity 2023, Environmental epigenetics IF:4.8Q1 DOI:10.1093/eep/dvad006 PMID:38162685	研究论文	研究通过连续多代大鼠暴露于不同有毒物质，评估了多代不同暴露对跨代表观遗传继承的影响	首次研究了连续多代暴露于不同有毒物质对跨代表观遗传继承和疾病易感性的复合影响	研究仅基于大鼠模型，人类相关性的直接推断有限	评估多代不同有毒物质暴露对跨代表观遗传和病理学的影响	连续多代暴露于不同有毒物质的大鼠及其后代	表观遗传学	肥胖症	DNA甲基化分析	Deep Learning	组织病理学图像	F0-F5代大鼠
222	2025-07-20	Deep learning models for cancer stem cell detection: a brief review 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1214425 PMID:37441078	综述	本文简要回顾了深度学习模型在癌症干细胞检测中的应用	介绍了基于卷积神经网络（CNN）的深度学习模型在癌症干细胞研究中的多样化应用	探讨了基于深度学习的干细胞研究领域的局限性和未来展望	探索深度学习在癌症干细胞研究中的新兴趋势	癌症干细胞（CSCs）或肿瘤起始细胞（TICs）	数字病理学	癌症	深度学习	CNN	生物图像	NA
223	2025-07-20	Computer-aided detection and prognosis of colorectal cancer on whole slide images using dual resolution deep learning 2023-Jan, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-022-04435-x PMID:36331654	research paper	该研究提出了一种基于弱监督学习的双分辨率深度学习网络（WDRNet），用于结直肠癌的识别和预后预测	WDRNet不仅能够识别肿瘤区域，还能预测患者生存期并进行风险分层，且不依赖病理学家标注的感兴趣区域，充分利用了图像的全局信息	研究仅在TCGA和ACHIGMU两个数据集上进行了验证，可能需要更多外部数据验证模型的泛化能力	开发一种深度学习模型，用于结直肠癌的快速诊断和风险分层	结直肠癌患者的全切片图像	digital pathology	colorectal cancer	deep learning	WDRNet（双分辨率深度学习网络）	histopathological images	TCGA数据集和ACHIGMU数据集（具体样本数未提及）
224	2025-07-20	Deep learning-based automated pipeline for blood vessel detection and distribution analysis in multiplexed prostate cancer images 2023, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fbinf.2023.1296667 PMID:38323039	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的自动化流程，用于在前列腺癌多重图像中检测血管并分析其分布	开发了一种结合CD31、CD34和胶原IV图像的深度学习模型，用于自动分割血管并分析其大小和分布模式	研究仅基于215名前列腺癌患者的数据，可能存在样本量不足的问题	通过自动化流程分析前列腺癌中的血管分布，以提供对疾病进展的额外见解	前列腺癌患者的血管分布	数字病理学	前列腺癌	深度学习	CNN	图像	215名前列腺癌患者
225	2025-07-19	Analysis of ultrasonographic images using a deep learning-based model as ancillary diagnostic tool for diagnosing gallbladder polyps 2023-12, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.dld.2023.06.023 PMID:37407319	研究论文	本研究评估了基于深度学习的模型在诊断胆囊息肉中的辅助作用	开发了一个深度学习模型，用于区分肿瘤性胆囊息肉与非肿瘤性胆囊息肉，并评估了计算机辅助诊断对医生诊断准确性的提升效果	研究为回顾性队列研究，可能存在选择偏差	评估深度学习模型在胆囊息肉诊断中的效果及其作为辅助诊断工具的潜力	胆囊息肉患者	数字病理	胆囊疾病	深度学习	CNN	超声图像	263名患者的3,754张图像
226	2025-07-19	Identification of gastric signet ring cell carcinoma based on endoscopic images using few-shot learning 2023-12, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.dld.2023.07.005 PMID:37455154	研究论文	该研究提出了一种基于少样本学习的框架，用于在内镜图像中识别胃印戒细胞癌	采用双预训练的EfficientNetV2-S模型结合k近邻分类器，解决了小样本条件下胃印戒细胞癌识别的问题	研究样本量较小，每类仅50个样本	开发一种在样本有限情况下准确识别胃印戒细胞癌的计算机辅助诊断方法	胃印戒细胞癌的内镜图像	计算机视觉	胃癌	少样本学习(FSL)	EfficientNetV2-S, k-nearest neighbor	图像	每类50个样本（胃良性溃疡、腺癌和印戒细胞癌）
227	2025-07-17	Artificial intelligence-enabled penicillin allergy delabelling: an implementation study 2023-11, Internal medicine journal IF:1.8Q2 DOI:10.1111/imj.16266 PMID:37997266	研究论文	本研究探讨了基于人工智能的青霉素过敏标签去除的实施效果	利用深度学习人工智能算法识别适合去除青霉素过敏标签的患者，并通过电子邮件通知系统进行干预	样本量较小（n=59），需要进一步研究优化此类方法	评估人工智能辅助的青霉素过敏标签去除的实施效果	被标记为青霉素过敏的患者	医疗人工智能	过敏性疾病	深度学习	深度学习算法	电子医疗记录	59名干预组患者
228	2025-07-17	FocA: A deep learning tool for reliable, near-real-time imaging focus analysis in automated cell assay pipelines 2023-10, SLAS discovery : advancing life sciences R & D IF:2.7Q2 DOI:10.1016/j.slasd.2023.08.004 PMID:37573010	研究论文	介绍了一种名为FocA的深度学习工具，用于在自动化细胞检测流程中实时分析图像聚焦情况	FocA能够在近实时条件下识别聚焦和失焦图像，并通过小图像块训练优化计算效率，确保不存储和使用低质量图像	未明确提及具体局限性	提高自动化细胞检测中图像数据的质量和一致性	自动化细胞生物学研究平台生成的图像	计算机视觉	NA	深度学习	CNN（推测）	图像	未明确提及具体样本数量
229	2025-07-16	Improved Peptide Docking with Privileged Knowledge Distillation using Deep Learning 2023-Dec-04, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.12.01.569671 PMID:38106114	研究论文	本文提出了一种名为DistPepFold的深度学习方法，通过特权知识蒸馏改进蛋白质-肽复合物对接	利用基于AlphaFold-Multimer的架构，通过特权知识蒸馏方法提升蛋白质-肽对接性能	需要进一步验证在更广泛数据集上的性能	改进蛋白质-肽复合物的对接预测精度	蛋白质-肽相互作用	结构生物学	NA	深度学习	AlphaFold-Multimer (AFM), DistPepFold	蛋白质-肽复合物结构数据	两个蛋白质-肽复合物数据集
230	2025-07-14	Pilot Analysis of Surgeon Instrument Utilization Signatures Based on Shannon Entropy and Deep Learning for Surgeon Performance Assessment in a Cadaveric Carotid Artery Injury Control Simulation 2023-Dec-01, Operative neurosurgery (Hagerstown, Md.) DOI:10.1227/ons.0000000000000888 PMID:37655892	研究论文	本研究通过香农熵和深度学习分析外科医生在模拟颈动脉损伤控制中的器械使用特征，以评估其手术表现	首次将香农熵应用于手术器械使用序列的多样性量化，并结合深度学习模型预测手术表现	研究基于模拟尸体环境，结果可能无法完全反映真实手术场景	开发自动化、定量化的手术表现评估方法以改进外科培训	外科医生在内镜经鼻颈动脉撕裂模拟手术中的器械使用模式	数字病理	心血管疾病	深度学习	CNN	视频	公开可用的灌注尸体模拟器手术视频数据集
231	2025-07-12	When liver disease diagnosis encounters deep learning: Analysis, challenges, and prospects 2023-Mar, ILIVER.. DOI:10.1016/j.iliver.2023.02.002 PMID:40636411	综述	本文综述了深度学习在肝脏研究中的应用，分析了数据模态、肝脏主题与应用之间的关系，并总结了相关深度学习方法	利用Sankey图展示了数据模态、肝脏主题与应用之间的关系，总结了深度学习在肝脏研究中的方法和趋势	仅基于过去5年的139篇论文进行分析，可能未涵盖所有相关研究	探讨深度学习在肝脏疾病诊断和治疗中的应用	肝脏疾病	数字病理学	肝脏疾病	深度学习	NA	多模态数据	139篇论文
232	2025-07-12	Application of biological big data and radiomics in hepatocellular carcinoma 2023-Mar, ILIVER.. DOI:10.1016/j.iliver.2023.01.003 PMID:40636408	综述	本文综述了生物大数据和放射组学在肝细胞癌（HCC）中的研究进展	结合生物大数据和放射组学为HCC的诊断、预后和治疗提供了新方法和新思路	NA	探讨生物大数据和放射组学在HCC中的应用	肝细胞癌（HCC）	数字病理学	肝癌	组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学）、液体活检、机器学习算法、深度学习算法	NA	生物大数据、影像数据（超声、CT、MRI）	NA
233	2025-07-08	Deep learning-based predictive classification of functional subpopulations of hematopoietic stem cells and multipotent progenitors 2023-Nov-14, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3332530/v1 PMID:38014055	研究论文	本研究探索了使用深度学习技术基于形态学区分小鼠造血干细胞（HSCs）和多能祖细胞（MPPs）的可行性	首次在稳态条件下使用深度学习区分HSCs和MPPs，开发了能够可靠区分LT-HSCs、ST-HSCs和MPPs的三分类模型LSM，以及区分老年和年轻HSCs的二分类模型	研究仅基于小鼠细胞，尚未在人类细胞中验证	探索深度学习在造血干细胞和祖细胞分类中的应用	小鼠造血干细胞（HSCs）和多能祖细胞（MPPs）	数字病理学	NA	深度学习	CNN	图像	大量图像数据集
234	2025-07-08	Modeling islet enhancers using deep learning identifies candidate causal variants at loci associated with T2D and glycemic traits 2023-08-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2206612120 PMID:37603758	研究论文	本研究利用深度学习模型分析序列变异对增强子的影响，以识别与2型糖尿病(T2D)及其相关性状相关的候选因果变异	开发了一种深度学习方法来分析序列变异对增强子的影响，并成功应用于优先排序候选因果变异	研究主要关注胰腺胰岛组织，可能无法完全代表其他相关组织中的变异效应	识别与2型糖尿病及其相关性状相关的特定因果变异	胰腺胰岛组织中的增强子和遗传变异	机器学习	2型糖尿病	深度学习	DL	基因组序列数据	约6700万遗传变异
235	2025-07-05	Osteoarthritis year in review 2022: imaging 2023-08, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1 DOI:10.1016/j.joca.2023.03.005 PMID:36924919	综述	本文总结了2021年4月1日至2022年3月31日期间发表的关于骨关节炎（OA）影像学研究的原创研究	强调了人工智能在OA影像学中的应用，包括预测模型的开发和骨小梁纹理分析	仅考虑了英文出版物和人体体内研究	总结和评估骨关节炎影像学领域的最新研究进展	人类骨关节炎患者的影像学数据	数字病理学	骨关节炎	放射学、超声/US、计算机断层扫描/CT、DXA、磁共振成像/MRI、人工智能/AI、深度学习	深度学习	影像数据	NA
236	2025-07-04	Decoding biological age from face photographs using deep learning 2023-Sep-12, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2023.09.12.23295132 PMID:37745558	研究论文	本研究开发并验证了FaceAge，一种从面部照片估计生物年龄的深度学习系统，并评估其在癌症患者中的临床效用	利用深度学习从面部照片客观估计生物年龄，并验证其在癌症预后和临终决策中的临床价值	研究主要基于美国和荷兰的癌症患者数据，可能在其他人群中的适用性有待验证	开发一种客观、定量的方法，从面部照片估计生物年龄，并评估其在医学判断中的临床效用	健康个体和癌症患者的面部照片	数字病理学	癌症	深度学习	CNN	图像	58,851名健康个体和6,196名癌症患者
237	2025-06-24	Automatic Ploidy Prediction and Quality Assessment of Human Blastocyst Using Time-Lapse Imaging 2023-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.08.31.555741 PMID:37693566	研究论文	本文提出了一种名为BELA的深度学习模型，用于自动预测人类囊胚的倍性状态和质量评估，利用延时成像技术优化预测准确性	BELA模型通过多任务学习和延时成像技术，无需胚胎学家主观输入，即可实现高精度的倍性状态预测，其性能与基于胚胎学家手动评分的模型相当	BELA模型不能完全替代植入前遗传学检测（PGT-A），仍需进一步验证其临床适用性	优化体外受精（IVF）过程中胚胎质量评估和染色体异常检测的准确性	人类囊胚	数字病理	生殖健康	延时成像	深度学习模型（BELA）	图像和视频	Weill Cornell数据集中的囊胚样本
238	2025-06-24	Artificial intelligence algorithms aimed at characterizing or detecting prostate cancer on MRI: How accurate are they when tested on independent cohorts? - A systematic review 2023-May, Diagnostic and interventional imaging IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.diii.2022.11.005 PMID:36517398	系统综述	本文对独立测试队列中基于人工智能的前列腺癌MRI诊断算法的性能进行了系统综述	评估AI算法在独立测试队列中的表现，并比较不同算法类型的稳健性	23项研究未使用预定义的诊断阈值，可能导致结果偏乐观	评估基于AI的前列腺癌MRI诊断算法在独立测试队列中的诊断性能	前列腺癌患者的MRI影像	数字病理学	前列腺癌	MRI	深度学习与放射组学	医学影像	35项研究，每项研究测试队列超过40名患者
239	2025-06-24	Machine learning approaches for electroencephalography and magnetoencephalography analyses in autism spectrum disorder: A systematic review 2023-04-20, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.pnpbp.2022.110705 PMID:36574922	系统综述	本文系统综述了机器学习在自闭症谱系障碍（ASD）脑电图（EEG）和脑磁图（MEG）数据分析中的应用	综述了机器学习在ASD早期诊断和症状严重性预测中的应用潜力	需要更多复制研究验证有效性、可重复性和普适性，并进行随机对照试验	探讨机器学习在ASD的EEG和MEG数据分析中的应用及其诊断潜力	自闭症谱系障碍（ASD）患者	机器学习	自闭症谱系障碍	EEG, MEG	支持向量机, 深度学习	脑电图数据, 脑磁图数据	39项研究，其中37项使用EEG，2项使用MEG
240	2025-06-24	Development of artificial intelligence powered apps and tools for clinical pharmacy services: A systematic review 2023-04, International journal of medical informatics IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.ijmedinf.2022.104983 PMID:36724730	系统综述	本文对2000年至2021年间使用或整合人工智能（AI）于临床药学服务的定量研究进行了系统综述	首次系统性地总结了AI在临床药学服务中的应用现状和发展趋势	研究仅涵盖了截至2021年的文献，可能未包含最新的AI技术进展	评估AI在优化临床药学服务中的潜力和应用现状	临床药学服务中的AI应用工具和应用程序	自然语言处理	NA	机器学习、自然语言处理、深度学习	NA	电子医疗记录	19项研究