深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
401	2025-04-06	Self-Supervised Learning for Label- Efficient Sleep Stage Classification: A Comprehensive Evaluation 2023, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society IF:4.8Q1 DOI:10.1109/TNSRE.2023.3245285 PMID:37022869	研究论文	本文评估了自监督学习在少量标签情况下提升睡眠阶段分类模型性能的效果	利用自监督学习解决睡眠阶段分类中标签稀缺问题，仅需5%的标签数据即可达到与全标签监督训练相当的性能	研究仅基于三个睡眠阶段分类数据集，可能无法覆盖所有实际应用场景	探索自监督学习在脑电信号睡眠阶段分类中的应用效果	脑电信号(EEG)睡眠阶段分类模型	机器学习	睡眠障碍	自监督学习(SSL)	深度学习模型	EEG信号	三个SSC数据集
402	2025-04-06	A Model Combining Multi Branch Spectral-Temporal CNN, Efficient Channel Attention, and LightGBM for MI-BCI Classification 2023, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society IF:4.8Q1 DOI:10.1109/TNSRE.2023.3243992 PMID:37022898	研究论文	提出了一种结合多分支谱时CNN、高效通道注意力和LightGBM的模型，用于解码运动想象脑机接口任务	提出了一种新的端到端深度学习模型MBSTCNN-ECA-LightGBM，结合多分支CNN、高效通道注意力机制和LightGBM，显著提高了MI-BCI任务的解码准确率	未提及模型在不同噪声水平或不同受试者群体中的泛化能力	提高运动想象脑机接口任务的解码准确率	运动想象脑电图信号	脑机接口	NA	EEG信号处理	MBSTCNN-ECA-LightGBM（多分支谱时CNN、高效通道注意力机制、LightGBM）	脑电图信号	未明确提及具体样本数量，但使用了受试者内跨会话训练策略
403	2025-04-06	MRCPs-and-ERS/D-Oscillations-Driven Deep Learning Models for Decoding Unimanual and Bimanual Movements 2023, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society IF:4.8Q1 DOI:10.1109/TNSRE.2023.3245617 PMID:37027527	研究论文	提出了一种基于运动相关皮层电位（MRCPs）和事件相关同步/去同步（ERS/D）振荡的深度学习模型，用于解码单侧和双侧手部运动意图	首次将MRCPs和ERS/D振荡融合到深度学习中，以提高多类别单侧和双侧手部运动解码的性能	未提及具体样本量或数据集的局限性	提高脑机接口（BCI）中单侧和双侧手部运动意图的解码性能	脑电图（EEG）信号中的单侧和双侧手部运动意图	脑机接口	神经系统疾病	EEG信号分析	CNN	EEG信号	NA
404	2025-04-06	Toward Adversarial Robustness in Unlabeled Target Domains 2023, IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society IF:10.8Q1 DOI:10.1109/TIP.2023.3242141 PMID:37022907	研究论文	本文提出了一种名为无监督跨域对抗训练（UCAT）的新框架，用于解决在未标记目标域中进行对抗训练的问题	UCAT框架通过利用标记源域的知识，结合自动选择的高质量伪标签和源域数据的判别性锚表示，有效防止对抗样本误导训练过程	未明确提及具体限制，但可能包括对源域和目标域之间分布差异的敏感性	提高深度学习模型在未标记目标域中对对抗攻击的鲁棒性	深度学习模型在跨域环境中的对抗训练	机器学习	NA	对抗训练（AT）	深度学习模型	未标记目标域数据和标记源域数据	四个公共基准数据集
405	2025-04-06	Connections Between Deep Equilibrium and Sparse Representation Models With Application to Hyperspectral Image Denoising 2023, IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society IF:10.8Q1 DOI:10.1109/TIP.2023.3245323 PMID:37027683	研究论文	本研究探讨了多维视觉数据的稀疏表示问题，提出了一种新的计算高效稀疏编码优化方法，并应用于高光谱图像去噪	结合可学习正则化技术与神经网络作为结构先验，开发了基于深度展开和深度均衡的算法，在稀疏表示理论与深度学习建模之间建立了桥梁	未明确提及具体的数据集规模限制或计算资源需求	解决多维视觉数据（如高光谱图像）的稀疏表示与去噪问题	多维视觉数据（高光谱图像、彩色图像或视频数据）	计算机视觉	NA	稀疏编码优化、深度学习建模	深度展开算法、深度均衡算法	图像（高光谱图像、彩色图像、视频数据）	未明确提及具体样本量
406	2025-04-06	Integrated Multiscale Domain Adaptive YOLO 2023, IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society IF:10.8Q1 DOI:10.1109/TIP.2023.3255106 PMID:37028346	研究论文	本文提出了一种新颖的多尺度域自适应YOLO框架（MS-DAYOLO），用于解决深度学习应用中的域偏移问题	引入了三种新颖的深度学习架构用于域适应网络（DAN），包括渐进特征缩减（PFR）、统一分类器（UC）和集成架构	NA	解决深度学习中的域偏移问题，提升目标检测性能	YOLOv4目标检测器	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv4, Faster R-CNN	图像	流行数据集（未具体说明数量）
407	2025-04-06	MDTL: A Novel and Model-Agnostic Transfer Learning Strategy for Cross-Subject Motor Imagery BCI 2023, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society IF:4.8Q1 DOI:10.1109/TNSRE.2023.3259730 PMID:37030758	研究论文	提出了一种新颖且模型无关的迁移学习策略MDTL，用于跨被试运动想象脑机接口	MDTL策略利用多源域数据到目标域以及多源域之间的迁移，具有模型无关性，能快速部署于现有模型	未明确提及具体局限性	提升跨被试运动想象脑机接口的性能并减少准备时间	运动想象脑机接口系统	机器学习	NA	迁移学习	DeepConvNet, ShallowConvNet, EEGNet	EEG信号	两个公开的运动想象数据集（BCIC IV dataset 2a和Lee2019）
408	2025-04-06	Tolerating Annotation Displacement in Dense Object Counting via Point Annotation Probability Map 2023, IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society IF:10.8Q1 DOI:10.1109/TIP.2023.3331908 PMID:37971907	研究论文	本文提出了一种通过点标注概率图（PAPM）来容忍密集物体计数中标注位移的方法	利用广义高斯分布（GGD）函数构建学习目标点标注概率图（PAPM），以提高对标注位移的鲁棒性	手设计的PAPM方法可能对特定网络和数据集不是最优的	提高密集物体计数中对标注位移的鲁棒性	拥挤场景中的物体计数	计算机视觉	NA	广义高斯分布（GGD）	P2PNet	图像	NA
409	2025-04-04	Accurate prediction of protein tertiary structural changes induced by single-site mutations with equivariant graph neural networks 2023-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.10.03.560758 PMID:37873289	research paper	开发了一种基于等变图神经网络（EGNN）的深度学习方法，用于直接预测单点突变引起的蛋白质三级结构变化	首次使用等变图神经网络（EGNN）直接预测单点突变引起的蛋白质三级结构变化，并显著优于广泛使用的蛋白质结构预测方法AlphaFold	未提及该方法在复杂突变或多点突变情况下的表现	研究蛋白质单点突变引起的三级结构变化	蛋白质及其单点突变体	machine learning	NA	equivariant graph neural networks (EGNN)	EGNN	protein tertiary structure data	NA
410	2025-04-04	Rapid 3D T1 mapping using deep learning-assisted Look-Locker inversion recovery MRI 2023-08, Magnetic resonance in medicine IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mrm.29672 PMID:37125662	研究论文	提出了一种基于深度学习的快速3D T1映射方法，无需延迟时间即可进行MRI成像	利用深度学习学习T1*到T1的转换，消除了传统方法中需要的延迟时间，从而缩短了扫描时间	训练数据仅包含39个GraspT1-TD6数据集和14个GraspT1-TD0数据集，样本量相对较小	开发一种更高效和稳健的3D LLIR T1映射方法	MRI成像中的T1映射	医学影像分析	NA	深度学习辅助的Look-Locker反转恢复MRI	深度学习模型	MRI图像	39个GraspT1-TD6数据集和14个GraspT1-TD0数据集
411	2025-04-04	Machine Learning for Adrenal Gland Segmentation and Classification of Normal and Adrenal Masses at CT 2023-Feb, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.220101 PMID:36125375	研究论文	本研究开发了一种机器学习算法，用于在增强CT图像上分割肾上腺并分类正常和含肿块的肾上腺	提出了一种两阶段的机器学习流程，能够自动分割肾上腺并区分正常肾上腺和含肿块的肾上腺	在二次测试集上的分类敏感性较低（69%）	开发一种用于肾上腺分割和分类的机器学习算法	增强CT图像中的肾上腺	计算机视觉	肾上腺疾病	深度学习	深度学习分割和分类模型	CT图像	开发数据集包含274例CT检查（251名患者），二次测试集包含991例CT检查（991名患者）
412	2024-08-07	Correlating Deep Learning-Based Automated Reference Kidney Histomorphometry with Patient Demographics and Creatinine 2023-12-01, Kidney360 IF:3.2Q1 DOI:10.34067/KID.0000000000000299 PMID:37966063	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
413	2025-04-03	Deep learning approximation of attenuation maps for myocardial perfusion SPECT with an IQ ⋅ ⋅ SPECT collimator 2023-08-28, EJNMMI physics IF:3.0Q2 DOI:10.1186/s40658-023-00568-1 PMID:37639082	研究论文	本研究探讨了使用深度学习从非衰减校正的SPECT重建中近似衰减图的可行性	首次展示了在配备IQ SPECT准直器的SPECT扫描仪上使用深度学习近似衰减图的方法	研究仅基于150项回顾性研究，样本量相对较小	开发一种无需CT图像即可进行SPECT心肌灌注成像衰减校正的方法	心肌灌注SPECT成像	数字病理学	心血管疾病	SPECT成像	U-Net与条件生成对抗网络框架	医学影像	150项回顾性研究
414	2025-04-03	Integrative dissection of gene regulatory elements at base resolution 2023-Jun-14, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2023.100318 PMID:37388913	研究论文	结合表观遗传扰动、碱基编辑和深度学习技术，解析CD69基因调控元件的功能序列	首次在天然染色质环境中系统解析调控元件的功能序列，并发现GATA3与BHLHE40的相互作用在T细胞快速转录反应中的普遍作用	研究仅聚焦于Jurkat T细胞中的CD69基因座，未验证其他细胞类型或基因	解析基因调控元件的功能序列基础	CD69基因座的调控元件	基因组学	NA	表观遗传扰动、碱基编辑、深度学习	深度学习	基因组序列数据	Jurkat T细胞系
415	2025-04-02	Machine learning applications for early detection of esophageal cancer: a systematic review 2023-07-17, BMC medical informatics and decision making IF:3.3Q2 DOI:10.1186/s12911-023-02235-y PMID:37460991	系统综述	本文系统综述了机器学习在食管癌早期检测中的应用现状	总结了机器学习特别是卷积神经网络在食管癌早期检测中的高准确性和敏感性	现有文献有限，许多研究存在类别不平衡和偏差，需要跨机构纵向研究验证检测算法	探讨机器学习在食管癌早期检测中的应用及其潜力	食管癌的早期检测	计算机视觉	食管癌	机器学习（ML）、深度学习（DL）、神经网络（NN）	CNN	内窥镜图像和计算机断层扫描（CT）图像	31篇相关文章
416	2025-04-02	Deep learning in digital pathology for personalized treatment plans of cancer patients 2023-Mar, Seminars in diagnostic pathology IF:2.9Q2 DOI:10.1053/j.semdp.2023.02.003 PMID:36890029	综述	本文综述了数字病理学中深度学习在癌症患者个性化治疗计划中的应用	利用AI自动量化生物标志物，提高治疗选择的效率和客观性	NA	改善癌症患者的个性化治疗选择	癌症患者	数字病理学	癌症	AI	深度学习	H&E染色病理图像	NA
417	2025-04-02	Neurodegeneration: 2023 update 2023-Jan, Free neuropathology DOI:10.17879/freeneuropathology-2023-4899 PMID:37694160	综述	本文回顾了作者从前一年的神经退行性神经病理学文献中精选的十项具有高度影响力的研究	强调了人类组织基础的实验，涵盖了多种疾病类别、方法和方法论，展示了研究领域的广度	仅选择了十项研究，可能未能涵盖所有重要进展	突出与神经病理学家最相关的人类组织基础研究	神经退行性疾病相关的人类组织研究	神经病理学	阿尔茨海默病、进行性核上性麻痹、Gerstmann-Sträussler-Scheinker病、慢性创伤性脑病等	冷冻电子显微镜（cryo-EM）、功能基因组学、深度学习	弱监督多实例学习范式	蛋白质组学、转录组学、基因表达数据、图像数据	NA
418	2025-03-30	Data-efficient resting-state functional magnetic resonance imaging brain mapping with deep learning 2023-11-01, Journal of neurosurgery IF:3.5Q1 DOI:10.3171/2023.3.JNS2314 PMID:37060318	研究论文	本研究开发了一种深度3D卷积神经网络（3DCNN），用于在静息态功能磁共振成像（RS-fMRI）数据量最小的情况下，对语言和运动静息态网络进行体素级映射	提出了一种能够在减少扫描时间的同时，可靠且精确地映射静息态网络的深度3DCNN模型	研究主要基于健康成年人的数据，仅在5名多形性胶质母细胞瘤患者中进行了测试	开发一种高效的方法，用于术前功能映射，以改善脑肿瘤患者的功能保留	健康成年人（n=2252）和5名多形性胶质母细胞瘤患者	数字病理	脑肿瘤	RS-fMRI	3DCNN	图像	2252名健康成年人和5名多形性胶质母细胞瘤患者
419	2025-03-30	Creating High Fidelity Synthetic Pelvis Radiographs Using Generative Adversarial Networks: Unlocking the Potential of Deep Learning Models Without Patient Privacy Concerns 2023-10, The Journal of arthroplasty IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.arth.2022.12.013 PMID:36535448	research paper	本研究应用生成对抗网络（GANs）技术生成高保真合成骨盆X光片，以支持深度学习图像分析并保护患者隐私	利用GANs生成高保真合成骨盆X光片，这些图像在计算机和专家评估中难以与真实图像区分	研究仅针对骨盆X光片，未涉及其他类型的医学影像	开发一种方法，生成可用于深度学习模型训练的高保真合成医学影像，同时避免患者隐私问题	骨盆X光片	digital pathology	NA	GANs	GAN	image	37,640张真实X光片（来自16,782名患者）
420	2025-03-30	Variational Autoencoders for Biomedical Signal Morphology Clustering and Noise Detection 2023-Sep-28, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2023.3320585 PMID:37768790	研究论文	提出了一种基于变分自编码器和高斯混合模型的生物医学波形噪声检测框架，用于无监督检测波形异常并提供置信度评分	使用变分自编码器与高斯混合模型结合，实现无需标注的波形异常检测，并生成置信度指标	方法主要针对具有心脏活动周期性的生物医学信号，可能不适用于非周期性信号	开发一种自动化的生物医学信号噪声检测方法，提高下游生理指标估计的准确性	非侵入式可穿戴设备采集的原始波形数据	机器学习	心血管疾病	变分自编码器(VAE), 高斯混合模型(GMM), 动态时间规整(DTW)	VAE, GMM	时间序列数据	97885个心脏周期的心阻抗数据