深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1261	2024-09-11	Improving performance of deep learning predictive models for COVID-19 by incorporating environmental parameters 2023-Feb, Gondwana research : international geoscience journal IF:7.2Q1 DOI:10.1016/j.gr.2022.03.014 PMID:35431596	研究论文	研究通过引入环境参数来提高深度学习预测模型在COVID-19疫情中的表现	通过引入环境参数（温度和相对湿度）来改进LSTM模型在预测每日COVID-19病例中的表现	研究结果受其他正负混杂因素的影响，可能影响预测能力	提供更好的预测工具来管理COVID-19疫情	分析环境参数对每日COVID-19病例预测的影响	机器学习	COVID-19	NA	LSTM	数值数据	9个城市，跨越3个国家（印度、美国和瑞典），涵盖热带、亚热带和寒冷气候区
1262	2024-09-11	COVID-19 spread control policies based early dynamics forecasting using deep learning algorithm 2023-Feb, Chaos, solitons, and fractals DOI:10.1016/j.chaos.2022.112984 PMID:36530380	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的堆叠双向长短期记忆网络（Stacked Bi-LSTM），用于预测韩国COVID-19的传播动态，并评估不同控制政策的影响	使用堆叠双向长短期记忆网络（Stacked Bi-LSTM）进行COVID-19传播预测，并研究了不同控制政策和激活函数对预测准确性的影响	NA	预测COVID-19的传播动态，并评估不同控制政策的效果	韩国的COVID-19传播数据和控制政策	机器学习	COVID-19	深度学习	Stacked Bi-LSTM	时间序列数据	韩国的COVID-19数据集，包括多种控制政策
1263	2024-09-11	Visualization of erythrocyte stasis in the living human eye in health and disease 2023-Jan-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2022.105755 PMID:36594026	研究论文	本研究介绍了一种成像方法，揭示了位于中枢神经系统毛细血管段内的一组先前未知的停滞红细胞池的存在	首次发现并可视化了健康和疾病状态下人眼中停滞红细胞的存在，并利用深度学习技术展示了其在青光眼中的临床应用	NA	研究停滞红细胞在健康和疾病状态下的相关性及其在青光眼中的临床意义	人眼中的停滞红细胞及其在青光眼中的变化	计算机视觉	青光眼	深度学习	NA	图像	100%的受试者
1264	2024-09-11	Automatic segmentation and measurement of pressure injuries using deep learning models and a LiDAR camera 2023-01-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-26812-9 PMID:36639395	研究论文	本研究开发了一种使用深度学习模型和LiDAR相机自动分割和测量压疮面积的方法	首次将深度学习模型与LiDAR相机结合用于压疮的自动分割和面积测量	外部验证中Mask R-CNN的表现不如U-Net，且与传统手动方法相比，自动测量系统的平均相对误差为26.2%	开发一种自动分割和测量压疮面积的方法，以提高临床应用的准确性	压疮的自动分割和面积测量	计算机视觉	压疮	深度学习模型	U-Net	图像	528张压疮患者照片
1265	2024-09-11	Investigation of early molecular alterations in tauopathy with generative adversarial networks 2023-01-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-28081-6 PMID:36639689	研究论文	本文使用生成对抗网络（GANs）模拟tauopathy的分子进展并解析其早期特征	本文首次使用生成对抗网络进行tauopathy的分子进展模拟，并通过四向过渡曲线进行虚拟疾病进展模拟	本文主要基于小鼠模型和公共人类数据进行验证，未来需在更多样化的样本中验证其有效性	探索tauopathy的早期分子变化机制	tauopathy的早期分子变化	机器学习	NA	生成对抗网络（GANs）	生成对抗网络（GANs）	RNA-seq数据	小鼠模型中的tauopathy（TPR50-P301S）样本，以及公共人类数据
1266	2024-09-11	Dental caries detection using a semi-supervised learning approach 2023-01-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-27808-9 PMID:36639724	研究论文	本文提出了一种基于半监督学习方法的龋齿检测技术	利用少量标注图像训练教师模型，并结合大量未标注图像训练学生模型，采用中心裁剪和数据增强技术提升模型性能	仅在141张标注图像的数据集上进行了验证，可能需要更大规模的数据集进行进一步验证	开发一种高效的半监督学习方法，用于龋齿检测和分割	龋齿检测和分割	计算机视觉	NA	深度学习	半监督学习模型	图像	141张标注的牙科放射图像
1267	2024-09-11	AMTLDC: a new adversarial multi-source transfer learning framework to diagnosis of COVID-19 2023-Jan-12, Evolving systems IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s12530-023-09484-2 PMID:38625255	研究论文	本文提出了一种新的对抗性多源迁移学习框架AMTLDC，用于COVID-19的诊断	提出了AMTLDC模型，通过学习不同数据源之间的相似表示来提高模型的泛化能力	未提及具体限制	提高COVID-19诊断模型的泛化能力	COVID-19的诊断	机器学习	COVID-19	迁移学习	卷积神经网络	医学图像	未提及具体样本数量
1268	2024-09-11	RMDisease V2.0: an updated database of genetic variants that affect RNA modifications with disease and trait implication 2023-01-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkac750 PMID:36062570	研究论文	本文介绍了RMDisease v2.0数据库，该数据库用于识别与RNA修饰相关的遗传变异及其与疾病和性状的关联	RMDisease v2.0数据库相较于前一版本扩展了覆盖范围，并利用深度学习模型从大量实验验证的RNA修饰位点中识别出更多的RNA修饰相关变异	NA	揭示遗传变异与RNA修饰在人类疾病发病机制中的关联	RNA修饰相关的单核苷酸变异及其与疾病和性状的关联	NA	NA	深度学习	NA	遗传变异数据	873,819个实验验证的RNA修饰位点，1,366,252个RNA修饰相关变异，涉及20种生物
1269	2024-09-11	G4Atlas: a comprehensive transcriptome-wide G-quadruplex database 2023-01-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkac896 PMID:36243987	研究论文	本文介绍了G4Atlas，一个全面的转录组范围的G-四链体数据库	首次构建了转录组范围的G-四链体数据库，整合了多种实验数据和RNA二级结构预测信息	NA	构建一个全面的G-四链体数据库，以探索其在不同生物过程中的功能	转录组范围的G-四链体及其在基因表达后调控中的作用	NA	NA	rG4-seq, 化学分析, 配体结合方法	NA	文本	82种实验处理和238个样本，涵盖十个物种
1270	2024-09-11	The protein common assembly database (ProtCAD)-a comprehensive structural resource of protein complexes 2023-01-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkac937 PMID:36300618	研究论文	本文介绍了蛋白质共同组装数据库（ProtCAD），这是一个全面的蛋白质复合物结构资源	ProtCAD通过聚类蛋白质数据银行（PDB）中同源蛋白质的独立结构测定中的蛋白质组装结构，提供了对生物组装结构的验证	NA	提供一个全面的蛋白质复合物结构资源，以帮助理解功能数据和训练深度学习方法预测组装结构	蛋白质复合物的结构	生物信息学	NA	X射线晶体学，冷冻电子显微镜	深度学习	结构数据	约60%的PDB条目包含至少2个独立实验的组装聚类
1271	2024-09-11	Photonic machine learning with on-chip diffractive optics 2023-Jan-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-35772-7 PMID:36604423	研究论文	本文提出了一种基于硅基绝缘体平台的片上衍射光学神经网络（DONN），用于高性能机器学习任务	首次提出了一种基于硅基绝缘体平台的片上衍射光学神经网络，具有高集成度和低功耗特性	实验验证的样本量较小，且仅在Iris植物数据集和MNIST手写数字图像上进行了分类任务	探索和验证基于光子学的机器学习技术在硬件加速方面的潜力	片上衍射光学神经网络的性能和应用	机器学习	NA	衍射光学	光学神经网络	图像	Iris植物数据集和MNIST手写数字图像
1272	2024-09-11	High-resolution processing and sigmoid fusion modules for efficient detection of small objects in an embedded system 2023-01-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-022-27189-5 PMID:36604562	研究论文	本文提出了一种轻量级的小目标检测模型，使用高分辨率处理模块和S型融合模块来提高检测精度	引入了高分辨率处理模块和S型融合模块，显著提高了小目标检测的准确性，同时减少了计算成本	NA	提高嵌入式系统中小目标检测的效率和准确性	小目标检测，特别是无人机侦察图像中的小车辆	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOX-s	图像	使用真实无人机侦察图像进行测试
1273	2024-09-11	Rapid, label-free histopathological diagnosis of liver cancer based on Raman spectroscopy and deep learning 2023-01-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-35696-2 PMID:36599851	研究论文	本文利用拉曼光谱结合深度学习技术，开发并验证了一种用于体外和术中肝癌病理诊断的工作流程	本文提出了一种基于拉曼光谱和深度学习的快速、无标记、非破坏性的肝癌病理诊断方法	NA	开发一种快速、无标记的肝癌病理诊断方法	人肝组织样本	数字病理学	肝癌	拉曼光谱	深度学习	图像	NA
1274	2024-09-11	A dataset for plain language adaptation of biomedical abstracts 2023-01-04, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-022-01920-3 PMID:36599892	研究论文	本文介绍了一个用于生物医学摘要的平实语言适应的数据集	该数据集是首个既文档对齐又句子对齐的手动适应数据集	NA	解决生物医学文献语言难以被公众理解的问题	生物医学摘要的平实语言适应	自然语言处理	NA	深度学习	NA	文本	750篇适应摘要，共7643对句子
1275	2024-09-11	A Review of Recent Advances in Deep Learning Models for Chest Disease Detection Using Radiography 2023-Jan-03, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics13010159 PMID:36611451	综述	本文综述了利用放射影像进行胸部疾病检测的深度学习模型的最新进展	本文详细描述了多个公开的CXR数据集，并介绍了用于胸部疾病检测的多种深度学习模型，如VGG、ResNet、DenseNet、Inception、EfficientNet、RetinaNet及集成学习方法	本文讨论了已发表文献中的挑战，并强调了可解释性和可解释性的重要性，以更好地理解深度学习模型的检测结果	本文旨在综述利用放射影像进行胸部疾病检测的深度学习模型的最新进展	本文研究对象为胸部疾病的检测	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	多个公开的CXR数据集
1276	2024-09-11	A Holistic Approach to Identify and Classify COVID-19 from Chest Radiographs, ECG, and CT-Scan Images Using ShuffleNet Convolutional Neural Network 2023-Jan-03, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics13010162 PMID:36611454	研究论文	本文提出了一种使用ShuffleNet卷积神经网络从胸部X光片、心电图和CT扫描图像中识别和分类COVID-19的综合方法	本文首次将胸部X光片、心电图和CT扫描图像三种数据类型结合，用于COVID-19的检测和分类，并使用ShuffleNet卷积神经网络进行处理	NA	开发一种早期且精确的COVID-19检测和分类方法，以减少病毒的传播	COVID-19的检测和分类	计算机视觉	COVID-19	ShuffleNet卷积神经网络	ShuffleNet	图像	使用了胸部X光片、CT扫描和心电图图像的数据集，具体样本数量未详细说明
1277	2024-09-11	Deep Learning Model for Static Ocular Torsion Detection Using Synthetically Generated Fundus Images 2023-01-03, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.12.1.17 PMID:36630147	研究论文	研究开发了一种使用合成眼底图像的深度学习模型，用于检测静态眼旋	利用合成眼底图像和迁移学习开发了用于检测静态眼旋的深度学习模型	NA	开发深度学习模型以评估静态眼旋的方向和程度	静态眼旋的方向和程度	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	276张右眼眼底图像，合成数据集每模型12,740张图像
1278	2024-09-11	Anomaly Detection and Inter-Sensor Transfer Learning on Smart Manufacturing Datasets 2023-Jan-02, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s23010486 PMID:36617091	研究论文	本文分析了四个智能制造系统中的传感器数据集，利用深度学习技术检测缺陷水平，并评估了多种传统和基于机器学习的预测模型在预测传感器数据时间序列上的表现	本文提出了通过聚合多个预测RPM值来选择训练数据的方法，并利用高数据率传感器进行迁移学习以进行缺陷类型分类	NA	研究智能制造系统中快速检测和预测故障的方法，以降低维护成本和减少机器停机时间	智能制造系统中的传感器数据	机器学习	NA	深度学习	NA	时间序列数据	四个数据集
1279	2024-09-11	A state-of-the-art survey of object detection techniques in microorganism image analysis: from classical methods to deep learning approaches 2023, Artificial intelligence review IF:10.7Q1 DOI:10.1007/s10462-022-10209-1 PMID:35693000	综述	本文综述了从传统方法到深度学习方法的微生物图像分析中的目标检测技术	介绍了视觉变换器等潜在方法	NA	帮助研究人员更全面地了解微生物检测领域的发展过程、研究现状和未来趋势	微生物检测方法	计算机视觉	NA	图像处理、机器学习、深度学习	视觉变换器	图像	142篇相关技术论文
1280	2024-09-11	Diagnosis of anomalies based on hybrid features extraction in thyroid images 2023, Multimedia tools and applications IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s11042-022-13433-7 PMID:35874325	研究论文	本文提出了一种基于胶囊网络的甲状腺超声图像特征提取方法，并结合传统特征形成混合特征空间，提高了支持向量机的分类准确率	本文创新性地将胶囊网络与传统特征（如方向梯度直方图和局部二值模式）结合，形成混合特征空间，提高了分类准确率	本文未提及具体的局限性	提高甲状腺超声图像中良恶性腺体的诊断准确率	甲状腺超声图像中的良恶性腺体	计算机视觉	甲状腺疾病	胶囊网络	胶囊网络	图像	未提及具体样本数量