深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
161	2026-05-31	Deep Learning-Enabled Diagnosis of Liver Adenocarcinoma 2023-11, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2023.07.026 PMID:37562657	研究论文	提出深度学习模型HEPNET，用于区分肝内胆管癌与结直肠癌肝转移，基于H&E染色全切片图像实现临床级准确率	开发了专门用于肝脏腺癌诊断的深度学习模型HEPNET，在区分原发性与继发性肝腺癌方面达到临床级精度，且性能超越6名病理专家并提升初级医师诊断水平	未在文中明确阐述局限性	实现肝脏腺癌的准确诊断，辅助临床决策并优化病理工作流程	肝内胆管癌与结直肠癌肝转移患者的H&E染色全切片图像	数字病理学	肝腺癌（包括肝内胆管癌和结直肠癌肝转移）	H&E染色全切片成像	深度学习（CNN）	病理全切片图像	训练集：456例患者（714,589个图像块）；内部测试集：115例；外部验证集：159例（来自美因茨大学医院）	NA	HEPNET	AUC、准确率	NA
162	2026-05-31	Recognition of walking directional intention employed ground reaction forces and center of pressure during gait initiation 2023-09, Gait & posture IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.gaitpost.2023.08.009 PMID:37639961	研究论文	利用地面反作用力和压力中心数据，通过深度学习技术识别步行方向意图	首次使用地面反作用力和压力中心数据替代脑电图，通过LSTM模型识别步行方向意图，实现高精度分类	仅针对直行和右转两种方向，未考虑左转及其他复杂场景；样本量较小（10名健康成年男性）；未在真实外骨骼控制或行人交通流场景中验证	利用深度学习技术识别地面反作用力和压力中心数据，分类直行和右转意图；揭示可替代脑电图预测步行方向意图的步态特征	10名健康成年男性在测力平台上执行的站立、直行和右转动作	机器学习	NA	地面反作用力（GRF）和压力中心（COP）测量	LSTM	时间序列数据（GRF和COP）	10名健康成年男性的步态数据	NA	LSTM	准确率（最高94.79%）	NA
163	2026-05-30	An update on computational pathology tools for genitourinary pathology practice: A review paper from the Genitourinary Pathology Society (GUPS) 2023, Journal of pathology informatics DOI:10.1016/j.jpi.2022.100177 PMID:36654741	综述	本文对用于泌尿生殖病理学的计算病理学工具进行了综述，评估了最新深度学习工具的应用进展	系统性地评估了泌尿生殖病理学深度学习工具的最新迭代，强调了其在肿瘤分级、分期和亚型识别中的潜力	数据可用性、监管和标准化方面的限制阻碍了这些工具的实施	评估实用深度学习工具在泌尿生殖病理学中的演化轨迹和潜力	泌尿生殖病理学中的深度学习算法工具	数字病理学	泌尿生殖系统疾病（如前列腺癌、膀胱癌等）	深度学习	深度学习模型	病理图像	NA	NA	NA	NA	NA
164	2026-05-29	Diagnosing evapotranspiration responses to water deficit across biomes using deep learning 2023-11, The New phytologist DOI:10.1111/nph.19197 PMID:37621238	研究论文	利用深度学习研究深水区不同生物群落的蒸散发响应	首次使用深度学习神经网路从通量测量数据中提取水分胁迫因子（fET），揭示了不同生物群落对持续干旱的多样响应模式，并发现了标准地表模型未能捕捉的复杂性	研究依赖通量测量数据，可能受限于站点分布和测量精度；尚未解释不同响应行为的机制，仅推测了气孔调节、水力传导和深层水分利用等可能原因	量化水分限制对蒸散发的影响，理解植被对干旱的敏感性	不同生物群落的蒸散发响应，包括草原、热带稀树草原、森林等	机器学习	NA	通量测量	深度神经网络	通量测量数据（包括蒸散发、大气干旱度等协变量）	多种站点数据，包括热带稀树草原、草地和森林站点	PyTorch	深度神经网络	NA	NA
165	2026-05-29	scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data 2023-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.05.01.538975 PMID:37205545	研究论文	scDisInFact是一个深度学习框架，用于多批次多条件单细胞RNA测序数据的整合与预测，可同时消除批次效应并保留条件效应	首次提出能够同时分离批次效应和条件效应的解耦学习方法，实现批次校正、关键基因检测和扰动预测三项任务的统一	当前方法要么消除所有批次效应而丢失条件效应，要么仅关注条件效应而忽略批次效应，scDisInFact通过解耦学习解决了这一矛盾	开发一个能够同时处理批次效应和条件效应的深度学习模型，用于整合和预测多批次多条件的单细胞RNA测序数据	单细胞RNA测序数据中的批次效应和条件效应	机器学习	NA	scRNA-seq	深度学习框架	基因表达数据	模拟数据和真实数据集	NA	解耦学习网络	批次校正性能、关键基因检测准确率、扰动预测精度	NA
166	2026-05-29	Atrial fibrillation ablation outcome prediction with a machine learning fusion framework incorporating cardiac computed tomography 2023-05, Journal of cardiovascular electrophysiology IF:2.3Q2 DOI:10.1111/jce.15890 PMID:36934383	研究论文	提出一种融合机器学习框架，整合心脏CT成像与临床数据，预测房颤消融术后结果	首次将CT形态特征、深度学习图像特征和临床数据智能融合，构建端到端自动预测框架	单中心回顾性研究，样本量有限，需外部验证	开发个性化房颤消融术后预后预测模型	321例接受房颤消融术患者的CT影像及临床数据	机器学习	心房颤动	CT成像	融合机器学习模型	图像、临床结构化数据	321例患者（平均年龄64.2岁，69%男性，40%阵发性房颤）	NA	深度学习网络	AUC	NA
167	2026-05-29	Deep Learning-Based Model for Identifying Tumors in Endoscopic Images From Patients With Locally Advanced Rectal Cancer Treated With Total Neoadjuvant Therapy 2023-03-01, Diseases of the colon and rectum DOI:10.1097/DCR.0000000000002295 PMID:35358109	研究论文	开发一种基于深度卷积神经网络的方法，从局部晚期直肠癌患者的内镜图像中自动分类是否存在肿瘤	首次将深度卷积神经网络应用于局部晚期直肠癌患者全新辅助治疗后的内镜图像中肿瘤存在与否的自动分类	每组的图像数量有限，且研究在单一机构进行	开发一种新方法，利用深度卷积神经网络自动分类内镜图像中肿瘤存在与否，并评估其准确性	接受全新辅助治疗的局部晚期直肠癌患者的内镜图像	计算机视觉	直肠癌	NA	卷积神经网络	图像	109名患者的1392张内镜图像	NA	卷积神经网络	接收者操作特征曲线下面积	NA
168	2026-05-27	Uncertainty-Aware Deep Learning Classification of Adamantinomatous Craniopharyngioma from Preoperative MRI 2023-Mar-16, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics13061132 PMID:36980440	研究论文	提出一种基于贝叶斯深度学习的分类方法，用于从术前MRI中诊断成釉细胞瘤型颅咽管瘤	首次将贝叶斯深度学习应用于颅咽管瘤的MRI分类，通过校准模型实现预测不确定性估计并引入分类弃权机制，显著提升准确率	校准后的模型性能低于原始结果，表明原始模型存在过拟合；弃权率为34.2%时准确率提升，但可能牺牲部分可分类样本	实现非侵入性诊断成釉细胞瘤型颅咽管瘤，通过深度学习分类结合不确定性估计提高临床适用性	86名鞍上肿瘤患者的术前MRI图像及病理诊断结果	计算机视觉	颅咽管瘤	MRI影像	贝叶斯深度学习	图像	86名鞍上肿瘤患者的多机构样本	PyTorch	原始分类器	准确率	NA
169	2026-05-27	Automated Quantification of Pneumonia Infected Volume in Lung CT Images: A Comparison with Subjective Assessment of Radiologists 2023-Mar-02, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering10030321 PMID:36978712	研究论文	旨在通过改进的深度学习模型自动分割肺部CT图像中感染区域并预测疾病严重程度，并与放射科医生的主观评估进行对比	提出结合五个定制残差注意力U-Net模型和特征金字塔网络的集成深度学习模型，并首次通过放射科医生主观对比研究验证临床实用性	样本量较小（训练20例、测试80例），且仅针对COVID-19患者，可能缺乏泛化性	探索使用深度学习自动化定量评估肺部CT感染区域和严重程度的可行性，以提高诊断效率并减少评估变异	COVID-19患者的肺部CT图像中的感染区域分割和疾病严重程度预测	计算机视觉	COVID-19	CT成像	深度学习集成模型	图像	训练20例COVID-19患者，测试80例COVID-19患者	NA	残差注意力U-Net、特征金字塔网络	严重程度分类一致性、5级评分法	NA
170	2026-05-27	PhacoTrainer: Deep Learning for Cataract Surgical Videos to Track Surgical Tools 2023-03-01, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.12.3.23 PMID:36947046	研究论文	本文构建了一个深度学习模型，用于自动分析白内障手术视频中的手术器械位置，并推导与手术技能相关的运动指标	首次将YOLACT模型应用于白内障手术视频的掩膜分割，并结合椭圆或直线拟合方法从掩膜中精确识别手术器械和眼内关键解剖结构	该方法对辅助器械尖端的定位误差为17.1像素，可能影响高精度需求场景的运用	开发自动分析白内障手术视频中手术器械和眼内解剖结构位置的方法，以生成与手术技能相关的运动度量指标	白内障手术视频中的瞳孔、角巩膜缘、8类手术器械（包括超声乳化头、第二器械等）	计算机视觉	白内障	NA	YOLACT	图像	训练使用268个视频中的1156帧和CaDIS公开数据集；评估使用10个超声乳化视频片段的5853帧	PyTorch	YOLACT	平均精度均值（mAP）、交并比（IoU）、像素欧氏距离	NA
171	2026-05-26	Application of IoT technology based on neural networks in basketball training motion capture and injury prevention 2023-10, Preventive medicine IF:4.3Q1 DOI:10.1016/j.ypmed.2023.107660 PMID:37573953	研究论文	本文研究基于物联网和神经网络技术的篮球训练动作捕捉与损伤预防方法	设计了多视角人体运动轨迹捕捉算法框架，结合深度学习二维人体姿态估计与多视角摄像机姿态知识，转换为三维空间关节分布	未提及具体局限性	应用神经网络与物联网设备于篮球动作捕捉，预防运动损伤	篮球训练中的运动员动作与损伤预防	计算机视觉, 机器学习	运动损伤	动作捕捉	神经网络	图像, 视频	未提及	NA	二维人体姿态估计算法	NA	物联网设备
172	2026-05-26	Enhancement of Diabetic Retinopathy Prognostication Using Deep Learning, CLAHE, and ESRGAN 2023-Jul-14, Diagnostics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/diagnostics13142375 PMID:37510123	研究论文	利用深度学习、CLAHE和ESRGAN增强糖尿病视网膜病变的预后预测	结合CLAHE和ESRGAN图像增强技术，使用DenseNet-121模型在APTO-2019数据集上实现了98.36%的最高准确率，并验证了CLAHE+ESRGAN在DR分类中的有效性	摘要未提及局限性	通过深度学习模型和图像增强方法提高糖尿病视网膜病变及其严重程度分级的检测准确性	糖尿病视网膜病变及其严重程度分级	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	NA	CNN	图像	APTO-2019盲症检测数据集	NA	DenseNet-121, ESRGAN	准确率（top-1、top-2、top-3）、精确率、召回率、F1分数	NA
173	2026-05-26	Transformer based deep learning denoising of single and multi-delay 3D Arterial Spin Labeling 2023-Apr-26, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2023.04.24.23288718 PMID:37162975	研究论文	提出基于Swin Transformer的深度学习方法对单延迟和多延迟三维动脉自旋标记图像去噪，并与卷积神经网络方法进行比较	首次将Swin Transformer应用于三维ASL图像去噪，并在单延迟和多延迟场景中均优于传统CNN方法	训练数据来自3个不同厂商但样本量有限（59名受试者，104次扫描），可能影响泛化能力	开发高质量ASL图像去噪方法以提升临床适用性	单延迟和多延迟三维动脉自旋标记图像	计算机视觉	脑血管疾病	3D动脉自旋标记，深度学习去噪	Swin Transformer	医学图像	单延迟：59名受试者（104次扫描）训练，44名受试者（57次扫描）测试；多延迟：6名受试者（10次扫描）	NA	Swin Transformer，卷积神经网络	相似度指标，信噪比，脑血流量和动脉传输时间的量化准确性	NA
174	2026-05-26	Enhancing diabetic retinopathy classification using deep learning 2023 Jan-Dec, Digital health IF:2.9Q2 DOI:10.1177/20552076231203676 PMID:37766903	研究论文	利用深度学习模型对糖尿病视网膜病变及其严重程度进行分类	结合CLAHE和ESRGAN图像增强技术，在APTOS 2019数据集上实现了97.83%的最高准确率和多阶段分类性能提升	未提及具体局限性	提高糖尿病视网膜病变的自动检测与分类准确性	视网膜眼底图像	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	CLAHE, ESRGAN	卷积神经网络	图像	APTOS 2019数据集，包含5个严重阶段	NA	CNN	准确率, 精度, 召回率, F1分数	NA
175	2026-05-26	Deep learning-enhanced diabetic retinopathy image classification 2023 Jan-Dec, Digital health IF:2.9Q2 DOI:10.1177/20552076231194942 PMID:37588156	研究论文	使用深度学习模型准确识别糖尿病视网膜病变的五个阶段	通过图像增强技术生成平衡数据集，并使用DenseNet-121模型在APTOS和DDR数据集上实现了优异的分类性能	未提及	提高糖尿病视网膜病变分期识别的准确性	糖尿病视网膜病变的五种阶段分类	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	图像增强	DenseNet-121	图像	APTOS数据集和DDR数据集	NA	DenseNet-121	准确率, 前2准确率, 前3准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
176	2026-05-25	Epistasis regulates genetic control of cardiac hypertrophy 2023-Nov-20, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-3509208/v1 PMID:38045390	研究论文	开发低信号符号化迭代随机森林方法来阐明心脏肥大的复杂遗传结构，利用UK Biobank数据揭示上位性遗传变异及其在心脏转录组和单细胞形态学中的影响	提出低信号符号化迭代随机森林方法用于发现上位性关系，整合深度学习心脏MRI分析、转录组网络分析和高通量微流控单细胞形态学分析，揭示非加性遗传效应	NA	阐明心脏肥大的上位性遗传调控机制	心脏肥大及其相关遗传变异	机器学习	心血管疾病	RNA-seq, 单细胞形态学分析, 微流控, RNA沉默	随机森林, 深度学习	图像, 文本, 转录组数据	29,661名UK Biobank参与者（心脏MRI扫描），313个捐赠人类心脏（转录组数据）	NA	迭代随机森林, 深度学习模型	NA	NA
177	2026-05-25	Longitudinal fundus imaging and its genome-wide association analysis provide evidence for a human retinal aging clock 2023-04-17, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.82364 PMID:36975205	研究论文	利用眼底图像和深度学习方法构建视网膜衰老时钟‘eyeAge’，并通过全基因组关联分析提供证据	开发了一种基于眼底图像的高精度视网膜衰老时钟，其预测准确性优于其他衰老时钟，并通过全基因组关联分析发现与个体特异性衰老相关的遗传位点，还在果蝇中验证了基因功能	尚未明确提及局限性，可能包括数据来源的群体偏差或短期时间尺度验证的局限性	利用眼底图像和深度学习方法构建并验证一个更精确的视网膜衰老时钟，以研究衰老及年龄相关疾病	人类的眼底图像及其与衰老相关的遗传特征	计算机视觉, 机器学习	老年性疾病	眼底成像, 全基因组关联分析	深度神经网络	图像	EyePACS数据集（未指定具体数量）和UK Biobank数据（未指定具体数量），但包含质量筛选后的数据	PyTorch	NA	平均绝对误差	NA
178	2026-05-25	AxoNet 2.0: A Deep Learning-Based Tool for Morphometric Analysis of Retinal Ganglion Cell Axons 2023-03-01, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.12.3.9 PMID:36917117	研究论文	开发了一种名为AxoNet 2.0的深度学习工具，用于自动量化视网膜神经节细胞轴突的数量和形态，提高青光眼动物模型轴突损伤评估的效率	首次实现从光学显微图像中自动分割轴浆和髓鞘，同时进行轴突计数和形态学量化，并在多个动物模型上验证了泛化能力	NA	开发自动化工具以快速、客观地评估视网膜神经节细胞轴突损伤，促进青光眼基础和转化研究	大鼠、小鼠和非人灵长类动物的视神经横截面显微图像	计算机视觉	青光眼	光镜显微成像	CNN	图像	大鼠视神经横截面显微图像（手动注释），以及小鼠和非人灵长类动物模型数据	PyTorch	深度分割网络	R², soft-Dice系数, 平均绝对百分比误差	NA
179	2026-05-24	Deep Learning of Videourodynamics to Classify Bladder Dysfunction Severity in Patients With Spina Bifida 2023-05, The Journal of urology IF:5.9Q1 DOI:10.1097/JU.0000000000003267 PMID:36787376	研究论文	利用深度学习模型对脊髓脊膜膨出患者进行膀胱功能障碍严重程度分类	首次将深度学习应用于视频尿动力学数据的分析，结合容量-压力记录和荧光透视图像自动分类膀胱功能障碍严重程度	样本量有限（306项检查），且仅来自单一机构，模型泛化能力待验证	开发基于视频尿动力学数据的深度学习模型，以分类膀胱功能障碍严重程度	2个月至28岁患脊髓脊膜膨出的患者	机器学习	脊髓脊膜膨出相关膀胱功能障碍	视频尿动力学	卷积神经网络，随机森林	容量-压力曲线，荧光透视图像	306次视频尿动力学检查	NA	卷积神经网络	准确率，加权卡帕系数	NA
180	2026-05-23	Small-molecule binding and sensing with a designed protein family 2023-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.01.565201 PMID:37961294	研究论文	结合深度学习和物理方法，设计出一系列具有多样可设计口袋几何结构的蛋白质，用于结合六种不同的小分子靶标，并利用这些蛋白质构建化学诱导二聚化系统和皮质醇生物传感器	首次将深度学习方法与物理方法结合，生成具有多样化和可设计口袋几何结构的蛋白质家族，实现对多种化学和结构不同小分子的高亲和力结合，并利用结合口袋的边缘暴露特性设计化学诱导二聚化系统和生物传感器	未明确说明，可能包括设计方法的普适性验证不足或传感器在复杂生物样本中的实际应用效果待评估	开发一种通用方法，用于设计能够结合并感知任意小分子的蛋白质，以支持分析、环境和生物医学应用	六种化学和结构不同的小分子靶标（如皮质醇）以及与设计的蛋白质结合的生物传感器	机器学习	NA	深度学习和物理计算方法	深度学习模型（具体未指定）	蛋白质结构数据	六种小分子靶标的结合设计，具体样品数量未提及	NA	NA	结合亲和力（纳摩尔到低微摩尔级别）	NA