深度学习在生物医药领域的应用

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 算法框架 模型架构 性能指标 计算资源
21 2025-10-06
Application of artificial intelligence in the diagnosis of hepatocellular carcinoma
2023-Sep, eGastroenterology
综述 探讨人工智能在肝细胞癌放射学诊断中的最新应用进展 系统总结AI在HCC放射诊断中的优势,包括降低诊断变异性和优化数据分析 尚未在临床实践中常规应用,需要进一步研究和验证 评估人工智能在肝细胞癌诊断中的应用价值 肝细胞癌患者的放射学影像数据 计算机视觉 肝癌 放射学成像 深度学习,神经网络 医学影像 NA NA NA NA NA
22 2025-10-06
Comparison of evaluation metrics of deep learning for imbalanced imaging data in osteoarthritis studies
2023-09, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 比较骨关节炎研究中不平衡影像数据深度学习评估指标的适用性 首次系统比较不同类别不平衡程度下ROC和PR曲线等评估指标在骨关节炎深度学习研究中的表现差异 仅基于单一数据集(骨关节炎倡议研究)的MRI数据,未验证其他类型医学影像数据 评估深度学习模型在不平衡医学影像数据中的性能表现 骨关节炎患者的膝关节MRI影像和骨髓病变检测 计算机视觉 骨关节炎 MRI成像 深度学习 医学影像 2467名参与者的2996个膝关节MRI NA NA ROC-AUC, PR-AUC, 敏感性, 特异性 NA
23 2025-09-12
Application of a 1H Brain MRS Benchmark Dataset to Deep Learning for Out-of-Voxel Artifacts
2023-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个用于训练和测试神经网络的合成¹H MRS基准数据集AGNOSTIC,并展示了其在检测和预测体素外伪影方面的应用 创建了包含259,200个合成MRS样本的大规模基准数据集,并首次使用CNN网络实现体素外伪影的实时检测和信号重建 基于合成数据训练,需要在真实临床数据上进一步验证模型性能 解决MRS数据中的体素外伪影问题,提高磁共振波谱数据分析的准确性 合成¹H MRS数据 医学影像分析 NA 磁共振波谱(MRS) CNN 频谱数据 259,200个合成MRS样本 NA NA NA NA
24 2025-10-06
Deep learning prediction of post-SBRT liver function changes and NTCP modeling in hepatocellular carcinoma based on DGAE-MRI
2023-Sep, Medical physics IF:3.2Q1
研究论文 基于DGAE-MRI开发深度学习模型预测肝癌患者SBRT治疗后肝功能变化并建立NTCP模型 首次将条件Wasserstein生成对抗网络(cWGAN)用于预测放疗期间肝功能图,并整合体素级功能信息建立个性化NTCP模型 研究样本量较小(仅24例患者),需要在更大患者队列中进一步验证 开发基于DGAE-MRI的个性化正常组织并发症概率(NTCP)模型,用于肝癌患者立体定向放射治疗(SBRT)的适应性治疗 接受SBRT治疗的肝细胞癌(HCC)患者 医学影像分析 肝癌 动态钆塞酸增强磁共振成像(DGAE-MRI) cWGAN, 逻辑剂量反应模型 医学影像(MRI), 剂量分布图, 肝功能参数图 24例HCC患者(来自146例接受SBRT治疗的患者队列) NA 条件Wasserstein生成对抗网络(cWGAN) 均方根误差(RMSE), 结构相似性(SSIM), Wilcoxon符号秩检验 NA
25 2025-10-06
Deep learning-based fluorescence image correction for high spatial resolution precise dosimetry
2023-Sep-27, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1
研究论文 开发基于深度学习的荧光图像校正方法,用于高空间分辨率精确剂量测定 提出新型经验性切伦科夫发射校准方法和基于CNN的荧光图像校正模型 仅使用单孔径静态光子束进行验证,未涉及更复杂的辐射场条件 提高辐射激发荧光成像的剂量分布测量精度 含有奎宁半硫酸盐水溶液的丙烯酸水箱 计算机视觉 NA 辐射激发荧光成像,CMOS相机成像 CNN 图像 181个单孔径静态光子束 NA 卷积神经网络 平均绝对误差,伽马指数通过率 NA
26 2025-10-06
AC-Faster R-CNN: an improved detection architecture with high precision and sensitivity for abnormality in spine x-ray images
2023-09-26, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1
研究论文 提出一种改进的AC-Faster R-CNN检测架构,用于脊柱X射线图像中异常部位的精确定位和分类 开发了可变形卷积特征金字塔网络的特征融合结构和异常捕获头结构,结合扩张卷积与可变形卷积更好捕捉病灶多尺度信息 NA 开发能够准确定位和分类脊柱X射线照片中异常部位的物体检测网络 脊柱X射线图像中的异常部位 计算机视觉 脊柱疾病 X射线成像 Faster R-CNN 图像 1007张脊柱X射线图像 NA Faster R-CNN, Deformable Convolution Feature Pyramid Network, Abnormality Capture Head mAP@IoU=50%, Precision, Sensitivity NA
27 2025-10-06
Color-guided deformable convolution network for intestinal metaplasia severity classification using endoscopic images
2023-09-13, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1
研究论文 提出一种基于颜色引导可变形卷积网络的肠化生严重程度分类方法 首次提出基于颜色特征生成偏移量来引导可变形卷积的方法,能够自适应调整卷积采样位置以符合IM病变的不规则形状 NA 准确诊断肠化生严重程度并预防胃癌发生 胃镜图像中的肠化生病变 计算机视觉 胃癌 内窥镜成像 CNN, DCN 图像 自建IM严重程度数据集 NA 颜色引导可变形卷积网络(CDCN) 准确率 NA
28 2025-10-06
Unsupervised learning-based dual-domain method for low-dose CT denoising
2023-09-08, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1
研究论文 提出一种基于无监督学习的双域方法用于低剂量CT去噪 采用无监督学习方法解决监督学习中数据精确配对的挑战,结合投影域去噪和迭代增强的双域处理策略 在标记数据集可用性有限的情况下表现更优,但未明确说明在充足标记数据下的性能比较 开发无监督学习的低剂量CT成像方法以解决数据配对问题 低剂量CT图像 医学影像处理 NA CT成像 生成模型 CT投影数据和重建图像 NA NA Noise2Self SSIM NA
29 2025-10-06
Enhanced PET imaging using progressive conditional deep image prior
2023-09-01, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1
研究论文 提出一种渐进式条件深度图像先验的无监督学习方法,用于增强PET成像质量 将单步无监督学习分解为两个无监督学习步骤,通过渐进式学习策略缩小输入图像与目标PET图像之间的差距 当输入图像与目标PET图像差距较大时仍可能存在挑战 开发新的无监督学习方法来提高患者研究中病灶的可检测性 PET图像,包括体模研究和患者研究 医学影像处理 NA PET成像,迭代重建方法 深度神经网络 医学图像(PET图像,解剖图像) 体模和患者研究(具体数量未明确说明) NA 深度图像先验 图像噪声性能,病灶可检测性 NA
30 2025-10-06
Automated diagnosis and management of follicular thyroid nodules based on the devised small-dataset interpretable foreground optimization network deep learning: a multicenter diagnostic study
2023-09-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 开发基于小数据集可解释前景优化网络深度学习的滤泡性甲状腺结节自动诊断系统 针对小数据集设计可解释前景优化网络,并首次系统评估结节边缘纹理信息对滤泡性甲状腺癌预测的影响 样本量相对有限(总样本503例),外部验证仅包含71例患者 开发可靠的术前滤泡性甲状腺癌检测系统,减少侵入性诊断需求 滤泡性甲状腺结节患者 数字病理 甲状腺癌 超声成像 深度学习 超声图像 训练和内部验证队列432例(来自瑞金医院),外部验证队列71例(来自四个临床中心) NA FThyNet(可解释前景优化网络) AUC, 准确率 NA
31 2025-10-06
Automated Radiomic Analysis of Vestibular Schwannomas and Inner Ears Using Contrast-Enhanced T1-Weighted and T2-Weighted Magnetic Resonance Imaging Sequences and Artificial Intelligence
2023-09-01, Otology & neurotology : official publication of the American Otological Society, American Neurotology Society [and] European Academy of Otology and Neurotology IF:1.9Q2
研究论文 本研究开发了一种基于深度学习的自动分割系统,用于在MRI图像中分割前庭神经鞘瘤和内耳结构 首次使用三维卷积神经网络结合对比增强T1加权和T2加权MRI序列对前庭神经鞘瘤和内耳结构进行自动分割分析 研究仅限于前庭神经鞘瘤患者,未包含其他类型肿瘤或病变 通过深度学习客观评估前庭神经鞘瘤及其与同侧内耳的空间关系 490名成年前庭神经鞘瘤患者的高分辨率MRI扫描数据 医学影像分析 前庭神经鞘瘤 磁共振成像 CNN 医学影像 490名患者(390名训练集,100名测试集),外加100名外部验证集患者 NA 三维卷积神经网络 Dice分数, 相对体积误差, 平均对称表面距离, 95% Hausdorff距离, 质心位置 NA
32 2025-10-06
Correlation Between Intranodular Vessels and Tumor Invasiveness of Lung Adenocarcinoma Presenting as Ground-glass Nodules: A Deep Learning 3-Dimensional Reconstruction Algorithm-based Quantitative Analysis on Noncontrast Computed Tomography Images
2023-Sep-01, Journal of thoracic imaging IF:2.0Q3
研究论文 基于深度学习三维重建算法定量分析非增强CT图像中肺腺癌磨玻璃结节内血管特征与肿瘤侵袭性的相关性 首次采用深度学习三维重建技术对非增强CT图像中磨玻璃结节内血管进行定量分析,建立血管特征与肺腺癌侵袭性的关联 回顾性研究设计,样本来源单一机构,未进行外部验证 评估基于深度学习的结节内血管定量特征在区分肺腺癌侵袭性中的作用 474例患者的512个确诊磨玻璃结节(包括241个前驱腺体病变、126个微浸润腺癌和145个浸润性腺癌) 计算机视觉 肺癌 非增强计算机断层扫描 深度学习 医学影像 512个磨玻璃结节(来自474例患者) NA 基于区域分割和区域生长技术的三维重建算法 血管检出率、血管体积百分比、Mantel-Haenszel χ²检验、χ²检验、方差分析 NA
33 2025-10-06
Bering: joint cell segmentation and annotation for spatial transcriptomics with transferred graph embeddings
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种基于图深度学习的模型Bering,用于空间转录组学数据中的联合细胞分割与分子注释 利用转录共定位关系进行噪声感知的细胞分割,通过转移图嵌入增强基因关系学习 未明确说明模型在特定组织类型或技术平台上的潜在适应性限制 解决空间转录组学中细胞边界确定和身份注释的准确性挑战 二维和三维空间转录组学数据中的单个细胞 数字病理学 NA 空间转录组学测序技术 图深度学习 空间转录组数据 多种空间技术平台和组织类型的数据集 NA 基于图嵌入的深度学习架构 细胞分割准确率, 检测到的转录本数量 NA
34 2025-07-23
Machine Learning for the Prediction of Procedural Case Durations Developed Using a Large Multicenter Database: Algorithm Development and Validation Study
2023-Sep-08, JMIR AI
研究论文 本研究开发并验证了一种基于机器学习的算法,用于预测手术案例的持续时间,以提高手术室资源规划和患者沟通的效率 利用非线性预测模型和机器学习方法,开发了一个可扩展至多中心的预测算法,显著提高了手术持续时间的预测准确性 研究依赖于历史数据,可能无法完全适应未来手术技术或流程的变化 开发一个可扩展的机器学习算法,以准确预测手术案例的持续时间,优化手术室资源管理 手术案例的持续时间 机器学习 NA 深度学习、梯度提升和集成机器学习 梯度提升机 手术室数据 1,177,893例手术案例,来自13家学术和私立医院(2016-2019年) NA NA NA NA
35 2025-10-06
Spatially aware deep learning reveals tumor heterogeneity patterns that encode distinct kidney cancer states
2023-09-19, Cell reports. Medicine
研究论文 开发空间感知深度学习模型分析肾透明细胞癌的肿瘤异质性模式及其与免疫治疗反应的关系 首次通过空间感知深度学习识别出传统病理分析无法发现的肿瘤微异质性模式,并揭示其与PBRM1功能缺失和免疫检查点抑制剂反应的相关性 研究样本量有限(1,102例患者),且主要针对肾透明细胞癌,结果在其他癌症类型中的普适性有待验证 探索肾透明细胞癌中肿瘤-免疫联合状态与免疫检查点抑制剂治疗反应的关系 肾透明细胞癌患者(n=1,102)的全切片图像和多重免疫荧光图像 数字病理学 肾癌 全切片图像分析,多重免疫荧光 深度学习 病理图像 1,102例患者 NA 图神经网络 NA NA
36 2025-10-06
T1dCteGui: A User-Friendly Clinical Trial Enrichment Tool to Optimize T1D Prevention Studies by Leveraging AI/ML Based Synthetic Patient Population
2023-09, Clinical pharmacology and therapeutics
研究论文 开发了一个用户友好的临床试验富集工具,利用基于AI/ML的合成患者群体优化1型糖尿病预防研究 首次开发了结合加速失效时间模型和深度学习生成模型的临床试验富集图形用户界面工具 工具基于合成患者数据,可能与真实患者数据存在差异 优化1型糖尿病预防临床试验的受试者富集策略 1型糖尿病高风险人群 数字病理 1型糖尿病 深度学习生成模型 生成模型 临床数据 来自多个观察性研究的患者水平数据 NA 加速失效时间模型 NA NA
37 2025-10-06
Self-Supervised Contrastive Learning to Predict the Progression of Alzheimer's Disease with 3D Amyloid-PET
2023-Sep-28, Bioengineering (Basel, Switzerland)
研究论文 提出一种自监督对比学习方法SMoCo,基于3D淀粉样蛋白PET预测轻度认知障碍向阿尔茨海默病的转化 在预训练阶段同时利用标记和未标记数据,并结合标签信息生成针对下游分类任务的专用表示,不同于传统生成任务无关表示的自监督学习方法 仅使用ADNI数据集进行验证,需要更多外部数据集验证泛化能力 预测轻度认知障碍患者向阿尔茨海默病的转化进程 轻度认知障碍患者 计算机视觉 阿尔茨海默病 淀粉样蛋白PET成像 深度学习模型 3D医学图像 ADNI数据集 NA SMoCo AUROC, 准确率, 灵敏度, 特异性 NA
38 2025-10-06
The Swin-Transformer network based on focal loss is used to identify images of pathological subtypes of lung adenocarcinoma with high similarity and class imbalance
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 提出基于Focal Loss的Swin-Transformer网络(FL-STNet)用于肺腺癌病理亚型分类 首次开发基于11分类的深度学习分类器,结合Focal Loss解决类别不平衡问题,融合Swin-Transformer模型优势 NA 改进肺腺癌病理分类的临床问题,提供辅助诊断 肺腺癌及其他肺部疾病亚型 数字病理 肺腺癌 全切片图像(WSI)组织病理学 Transformer 图像 360例确诊肺腺癌及其他肺部疾病患者样本 NA Swin-Transformer 准确率,F1-score,AUC NA
39 2025-10-06
Deep learning-based methods for classification of microsatellite instability in endometrial cancer from HE-stained pathological images
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究开发了一种基于注意力机制的深度学习架构,用于从子宫内膜癌HE染色病理图像中分类微卫星不稳定性状态 提出结合注意力模块的新架构来提取病理图像特征,并采用词袋方法聚合预测概率获得切片级微卫星状态 NA 开发快速、低成本的微卫星不稳定性自动检测方法,替代传统劳动密集且昂贵的检测方式 子宫内膜癌患者的HE染色全切片图像 数字病理 子宫内膜癌 HE染色 深度学习 图像 来自癌症基因组图谱子宫内膜癌队列的HE染色全切片图像 NA 基于注意力模块的架构 AUC, 准确率, 灵敏度, F1分数 NA
40 2025-10-06
A novel staging system based on deep learning for overall survival in patients with esophageal squamous cell carcinoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 开发基于深度学习的食管鳞癌患者总生存期预测模型及新型分期系统 提出基于深度学习模型风险评分的新型分期系统,相比传统列线图具有更好的预测性能 回顾性研究设计,数据来源于单一数据库 预测食管鳞癌患者总生存期并建立新型分期系统 食管鳞癌患者 机器学习 食管癌 深度学习 DeepSurv 临床数据 6020例食管鳞癌患者 NA DeepSurv C-index, AUC, 校准曲线, 决策曲线分析 NA
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