深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-03-04	Exploiting the Role of Features for Antigens-Antibodies Interaction Site Prediction 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3985-6_16 PMID:38987475	研究论文	本文提出了一种混合方法HSS-PPI，用于预测抗体与抗原相互作用界面位点，通过层次化表示蛋白质并使用图卷积网络对氨基酸进行分类	采用HSS-PPI混合方法，结合层次化表示和图卷积网络，创新性地预测抗体与抗原的相互作用界面位点	未明确提及具体局限性	预测抗体与抗原相互作用界面位点，以支持药物和疫苗设计	抗体与抗原的相互作用界面位点	生物信息学	NA	图卷积网络	HSS-PPI, SVM	蛋白质序列和结构数据	未明确提及样本数量
42	2025-03-04	[The 30-Year History of the Japan-Korea Joint Meeting on Medical Physics] 2024, Igaku butsuri : Nihon Igaku Butsuri Gakkai kikanshi = Japanese journal of medical physics : an official journal of Japan Society of Medical Physics DOI:10.11323/jjmp.44.3_40 PMID:40024769	评论	本文回顾了日本-韩国医学物理联合会议30年的历史，探讨了会议对两国医学物理学家交流与合作的贡献	详细记录了日本-韩国医学物理联合会议的30年发展历程，并分析了会议对医学物理领域的推动作用	文章主要关注日本和韩国的医学物理合作，未涉及其他国家的类似合作	回顾日本-韩国医学物理联合会议的历史，探讨其对医学物理领域的贡献	日本和韩国的医学物理学家及其合作	医学物理	NA	NA	NA	NA	NA
43	2025-03-02	Deep Learning Identifies High-Quality Fundus Photographs and Increases Accuracy in Automated Primary Open Angle Glaucoma Detection 2024-01-02, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.13.1.23 PMID:38285462	研究论文	本文开发并评估了一种深度学习模型，用于评估眼底照片质量，并定量测量其在独立研究人群中自动化检测原发性开角型青光眼（POAG）的影响	首次将深度学习模型应用于眼底照片质量评估，并展示了其对提高POAG检测准确性的显著影响	研究依赖于特定数据集（DIGS/ADAGES和OHTS），可能限制了模型的泛化能力	提高自动化POAG检测的准确性，减少人工审查的负担	眼底照片	计算机视觉	青光眼	深度学习	深度学习模型	图像	2815张来自DIGS/ADAGES的眼底照片和11,350张来自OHTS的眼底照片
44	2025-03-02	Rapid and accurate classification of mung bean seeds based on HPMobileNet 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1474906 PMID:40017618	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的绿豆种子快速准确分类方法，通过改进MobileNetV2模型，引入了DMS块、ECA块和Mish激活函数，构建了高精度网络模型HPMobileNet	提出了HPMobileNet模型，结合DMS块、ECA块和Mish激活函数，显著提升了绿豆种子分类的准确率	研究未涉及模型在其他作物种子分类中的泛化能力，且未来优化和应用潜力仍需进一步探索	开发一种高效准确的绿豆种子分类方法，推动智能农业技术的发展	八种不同品种的绿豆种子	计算机视觉	NA	深度学习	HPMobileNet（基于MobileNetV2改进）	图像	34,890张绿豆种子图像
45	2025-03-02	A method of deep network auto-training based on the MTPI auto-transfer learning and a reinforcement learning algorithm for vegetation detection in a dry thermal valley environment 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1448669 PMID:40017619	研究论文	本文提出了一种基于MTPI自动迁移学习和强化学习算法的深度网络自动训练方法，用于干旱热谷环境中的植被检测	结合了MTPI（最大迁移潜力指数方法）和MTSA（多汤普森采样算法）强化学习，用于数据集自动增强和网络自动训练，减少了人工经验和试错成本	现有自动训练方法适应于简单数据集和网络结构，在非结构化环境（如干旱热谷环境）中实用性较低	减少深度学习中的手动干预，提高复杂植被信息收集的效率	干旱热谷环境中的植被	计算机视觉	NA	深度学习，强化学习，迁移学习	FCN, Seg-Net, U-Net, Seg-Res-Net 50	图像	NA
46	2025-03-01	Deep learning for transesophageal echocardiography view classification 2024-01-02, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-50735-8 PMID:38167849	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的多类别经食管超声心动图（TEE）视图分类模型，用于结构化术中和术中TEE成像数据	创新点在于开发了一个能够准确分类标准化TEE视图的深度学习模型，并进行了外部验证	研究的局限性在于仅使用了来自两个医疗中心的TEE视频数据进行训练和验证，样本来源较为单一	研究目的是通过深度学习技术对术中和术中TEE成像数据进行结构化分类	研究对象是术中和术中TEE视频数据	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	卷积神经网络（CNN）	视频	来自Cedars-Sinai Medical Center（CSMC）和Stanford University Medical Center（SUMC）的TEE视频数据
47	2025-02-28	Predicting epidermal growth factor receptor mutation status of lung adenocarcinoma based on PET/CT images using deep learning 2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2024.1458374 PMID:39735601	研究论文	本研究旨在开发基于18F-FDG PET/CT图像的深度学习模型，用于预测肺腺癌（LUAD）患者的表皮生长因子受体（EGFR）突变状态	利用深度学习模型预测EGFR突变状态，结合PET/CT图像和临床特征，提高了预测的准确性	研究仅基于两个机构的430名患者，样本量可能不足以代表所有肺腺癌患者	开发预测肺腺癌患者EGFR突变状态的深度学习模型	430名非小细胞肺癌患者	计算机视觉	肺癌	18F-FDG PET/CT成像	Inception V3	图像	430名非小细胞肺癌患者
48	2025-02-27	Among Artificial Intelligence/Machine Learning Methods, Automated Gradient-Boosting Models Accurately Score Intraoral Plaque in Non-Standardized Images 2024, Journal of the California Dental Association DOI:10.1080/19424396.2024.2422146 PMID:39990046	研究论文	本文开发并测试了用于非标准化口腔内菌斑图像自动选择和评分的模型，旨在提高预防试验中的主要结果测量准确性	使用梯度提升模型在非标准化图像中准确评分口腔内菌斑，避免了深度学习模型的高计算和财务成本	未使用深度学习模型，可能限制了模型的复杂性和潜在性能	开发并测试自动图像选择和口腔内菌斑评分模型，以提高预防试验中的主要结果测量准确性	435张来自UCSF/UCLA临床试验的照片中的1650颗菌斑显示的乳牙（牙齿D, E, F, G）	计算机视觉	NA	机器学习算法，包括支持向量机-高斯模型和梯度提升模型	支持向量机-高斯模型，梯度提升分类和回归模型	图像	435张照片中的1650颗乳牙
49	2025-02-26	Exploring the application of knowledge transfer to sports video data 2024, Frontiers in sports and active living IF:2.3Q2 DOI:10.3389/fspor.2024.1460429 PMID:39989920	研究论文	本研究探讨了知识转移在体育视频数据中的应用，特别是零样本学习（ZSL）和球员重识别技术	利用预训练的重识别模型提取特征嵌入，在零样本学习环境下评估其在橄榄球联赛和篮网球中的应用，展示了在动态体育环境中部分模型的有效性	非部分模型在背景干扰下表现不佳，且需要大量资源来重现结果	探索更高效的方法，以在不同体育项目中应用AI和计算机视觉技术，减少数据标注和模型训练成本	橄榄球联赛和篮网球的体育视频数据	计算机视觉	NA	零样本学习（ZSL）	预训练的重识别模型	视频	橄榄球联赛近35,000帧和篮网球近14,000帧的广播视频剪辑
50	2025-02-26	Multiomics Research: Principles and Challenges in Integrated Analysis 2024, Biodesign research DOI:10.34133/bdr.0059 PMID:39990095	综述	本文综述了多组学研究的基本原则和挑战，强调了数据整合在揭示生物系统复杂相互作用和调控机制中的必要性	探讨了深度学习、图神经网络（GNNs）和生成对抗网络（GANs）等最新计算方法在多组学数据合成和解释中的应用，并提出了大语言模型在多组学分析中的潜力	需要大量的计算资源和复杂的模型调优	指导研究人员在多组学研究中导航原则和挑战，以促进整合生物分析的发展	多组学数据	生物信息学	NA	多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等）	深度学习、图神经网络（GNNs）、生成对抗网络（GANs）	多组学数据	NA
51	2025-02-24	Deep learning performance on MRI prostate gland segmentation: evaluation of two commercially available algorithms compared with an expert radiologist 2024-Jan, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.11.1.015002 PMID:38404754	研究论文	本研究评估了两种商用深度学习算法在MRI前列腺分割中的表现，并与专家放射科医生的手动分割进行了比较	在真实临床环境中评估商用AI模型的前列腺分割性能，填补了现有研究的空白	未对深度学习算法进行内部训练，且样本量相对较小	验证商用AI模型在前列腺分割中的准确性和临床应用价值	123名患者的多中心、多扫描仪MRI数据集	数字病理学	前列腺癌	深度学习算法	深度学习算法（DLA1和DLA2）	MRI图像	123名患者
52	2025-02-23	Deep learning-based video-analysis of instrument motion in microvascular anastomosis training 2024-Jan-12, Acta neurochirurgica IF:1.9Q2 DOI:10.1007/s00701-024-05896-4 PMID:38214753	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的自动化器械尖端检测算法，并验证了其在微血管吻合训练中的性能	使用深度学习算法自动检测和跟踪手术器械尖端，提供了一种客观评估显微手术技能的新方法	研究主要基于模拟训练视频，临床实际应用效果需进一步验证	开发并验证一种基于深度学习的自动化器械尖端检测算法，以客观评估显微手术技能	显微手术器械的运动分析	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv2	视频	临床显微手术视频和微血管吻合练习视频
53	2025-02-23	ADVANCING THE UNDERSTANDING OF CLINICAL SEPSIS USING GENE EXPRESSION-DRIVEN MACHINE LEARNING TO IMPROVE PATIENT OUTCOMES 2024-Jan-01, Shock (Augusta, Ga.) DOI:10.1097/SHK.0000000000002227 PMID:37752080	研究论文	本研究探讨了机器学习技术在结合临床数据和基因表达信息以更好地预测和理解脓毒症方面的潜力	利用机器学习模型，特别是神经网络、深度学习和集成方法，填补脓毒症研究中的关键证据空白，并通过基因转录信息提供对脓毒症病理生理学和生物标志物识别的见解	机器学习模型在解释性和偏见方面存在挑战	提高脓毒症患者预后，推进精准医学方法	脓毒症患者	机器学习	脓毒症	基因表达分析	神经网络, 深度学习, 集成方法	基因表达数据, 临床数据	NA
54	2025-02-23	Adaptive spatial-channel feature fusion and self-calibrated convolution for early maize seedlings counting in UAV images 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1496801 PMID:39980762	研究论文	本文提出了一种基于DINO的深度学习方法RC-Dino，用于提高无人机图像中早期玉米幼苗计数的准确性	引入了两种创新组件：自校准卷积层RSCconv和自适应空间特征融合模块ASCFF，以提高早期玉米幼苗在特征图中的表示和区分能力	未提及具体局限性	提高无人机图像中早期玉米幼苗计数的准确性	早期玉米幼苗	计算机视觉	NA	深度学习	DINO, Faster R-CNN, RetinaNet, YOLOX, Deformable DETR	图像	1,233张标注图像，共83,404个标注
55	2025-02-23	Efficient and accurate identification of maize rust disease using deep learning model 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1490026 PMID:39980760	研究论文	本文开发了一种名为Maize-Rust的深度学习模型，用于高效准确地识别玉米锈病	该模型在YOLOv8s骨干网络中集成了SimAM模块和BiFPN进行尺度融合，并使用DWConv简化检测流程，显著提高了分类准确率和检测速度	未提及模型在其他作物病害上的泛化能力	提高玉米锈病的识别准确率和检测效率，以支持大规模田间锈病的有效检测和管理	玉米锈病（普通玉米锈病和南方玉米锈病）	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv8s, Faster-RCNN, SSD	图像	未提及具体样本数量
56	2025-02-21	Enhancing Human Activity Recognition in Smart Homes with Self-Supervised Learning and Self-Attention 2024-Jan-29, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s24030884 PMID:38339601	研究论文	本文提出了一种基于自监督学习和自注意力机制的新型AttCLHAR模型，用于智能家居环境中的人类活动识别，特别是在标注数据有限或无标注的情况下	结合了自监督学习框架SimCLR和自注意力机制，并引入了锐度感知最小化（SAM）以增强模型的泛化能力	需要进一步验证在更大规模和多样化数据集上的性能	提高智能家居环境中人类活动识别的准确性和效率，特别是在标注数据有限的情况下	智能家居环境中的老年人日常活动	机器学习	老年疾病	自监督学习，自注意力机制，锐度感知最小化（SAM）	AttCLHAR（结合SimCLR和自注意力机制）	环境传感器数据	三个CASAS智能家居数据集（Aruba-1, Aruba-2, Milan）
57	2025-02-21	Optimizing classification of diseases through language model analysis of symptoms 2024-01-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-51615-5 PMID:38233458	研究论文	本文研究了使用语言模型和深度学习技术从症状中自动化预测疾病的方法	探索了两种MCN-BERT模型和一种BiLSTM模型，每种模型使用不同的超参数优化方法，以从症状描述中预测疾病	NA	自动化疾病预测，支持早期检测和更及时的治疗，扩展远程诊断能力	症状描述和疾病标签	自然语言处理	NA	深度学习	MCN-BERT, BiLSTM	文本	Dataset-1: 1,200个数据点；Dataset-2: 23,516条推文
58	2025-02-21	Spatiotemporal convolutional long short-term memory for regional streamflow predictions 2024-Jan-15, Journal of environmental management IF:8.0Q1 DOI:10.1016/j.jenvman.2023.119585 PMID:38016234	研究论文	本文提出了一种结合CNN和LSTM的深度学习架构，用于同时预测美国86个流域的日径流量	创新点在于使用CNN编码空间模式，LSTM学习时间关系，有效结合了时空信息	未提及具体局限性	研究目的是改进区域尺度的降雨-径流（RR）建模	研究对象是美国86个流域的日径流量	机器学习	NA	深度学习	CNN-LSTM	时间序列数据（降水、最高温度、最低温度）	86个流域的一年数据
59	2025-02-21	Long short-term memory (LSTM)-based news classification model 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0301835 PMID:38814925	研究论文	本研究使用单向和双向长短期记忆（LSTM）深度学习网络进行中文新闻分类，并探讨了上下文信息对文本分类的影响，达到了较高的准确率	使用双向LSTM网络进行特征提取，结合单向LSTM网络进行特征整合，构建了一个高效的中文新闻分类模型	未提及模型在其他语言或更大数据集上的泛化能力	研究中文新闻分类的深度学习模型	中文新闻文章	自然语言处理	NA	word2vec, Adam优化器, dropout	LSTM, BiLSTM	文本	未提及具体样本数量
60	2025-02-21	TASA: Temporal Attention With Spatial Autoencoder Network for Odor-Induced Emotion Classification Using EEG 2024, IEEE transactions on neural systems and rehabilitation engineering : a publication of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society IF:4.8Q1 DOI:10.1109/TNSRE.2024.3399326 PMID:38722724	研究论文	本文提出了一种名为TASA的深度学习架构，用于使用脑电图（EEG）预测气味诱导的情绪	TASA架构通过两阶段学习框架改进，利用自编码器模块学习电极间的空间信息，并通过LSTM-MSA捕捉时间动态	NA	研究气味诱导的情绪分类	人类脑电图（EEG）数据	机器学习	NA	EEG	LSTM, 多头自注意力机制（MSA）	脑电图（EEG）数据	现有嗅觉EEG数据集