深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
761	2024-11-17	Cancer genetics and deep learning applications for diagnosis, prognosis, and categorization 2024, Journal of biological methods DOI:10.14440/jbm.2024.0016 PMID:39544183	研究论文	本文探讨了基因表达数据在癌症诊断、预后和分类中的应用，并介绍了深度学习技术在其中的作用	本文提出使用深度学习策略来增强基因表达数据集的维度，并通过合成样本来加强信息范围	基因表达数据集的样本数量有限，且癌症特征多样复杂	研究基因表达数据在癌症诊断、预后和分类中的应用，并探讨深度学习技术在其中的潜力	基因表达数据和癌症疾病	机器学习	癌症	基因表达微阵列	深度学习	基因表达数据	样本数量有限
762	2024-11-17	LCGSC-YOLO: a lightweight apple leaf diseases detection method based on LCNet and GSConv module under YOLO framework 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1398277 PMID:39544536	研究论文	提出了一种基于LCNet和GSConv模块的轻量级苹果叶病害检测方法LCGSC-YOLO	使用LCNet重建主干网络，引入GSConv和VOVGSCSP模块，并在模型尾部嵌入坐标注意力机制，以减少参数和计算量并提高检测精度	NA	开发一种轻量级且高效的苹果叶病害检测方法	苹果叶病害	计算机视觉	NA	YOLO框架	CNN	图像	Plant Pathology 2021 (FGVC8)和AppleLeaf9混合数据集
763	2024-11-10	An automated ECG-based deep learning for the early-stage identification and classification of cardiovascular disease 2024, Technology and health care : official journal of the European Society for Engineering and Medicine IF:1.4Q3 DOI:10.3233/THC-240543 PMID:39302394	研究论文	本文提出了一种基于心电图（ECG）的深度学习方法，用于早期识别和分类心血管疾病	本文创新性地结合了症状检测和ECG分析，并使用前馈神经网络（FFNN）和常数Q非平稳Gabor变换（CQNGT）来提高诊断准确性	NA	提高心血管疾病的诊断准确性	心血管疾病	机器学习	心血管疾病	深度学习	前馈神经网络（FFNN）	图像	NA
764	2024-11-15	Intelligent agriculture: deep learning in UAV-based remote sensing imagery for crop diseases and pests detection 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1435016 PMID:39512475	综述	本文综述了基于无人机遥感图像的深度学习技术在智能农业中用于作物病虫害检测的应用	本文介绍了大型语言模型（LLM）和大型视觉模型（LVM）在农业中的最新应用	本文讨论了现有研究中的一些不足和待解决的挑战	探讨智能农业中基于无人机遥感图像的深度学习技术在作物病虫害检测中的应用	作物病虫害检测	计算机视觉	NA	深度学习（DL）	深度学习模型	图像	NA
765	2024-11-15	Development of a deep learning model for automated detection of calcium pyrophosphate deposition in hand radiographs 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1431333 PMID:39512610	研究论文	开发了一种深度学习模型，用于在手部X光片中自动检测钙焦磷酸盐沉积	首次开发了一种深度学习算法，能够自动且可靠地检测手部X光片中的钙焦磷酸盐沉积特征	模型在某些情况下可能会出现意外的高亮区域，可能是由于不同手部区域的相关特征	开发和测试一种深度学习算法，用于自动检测手部X光片中的钙焦磷酸盐沉积特征	手部X光片中的钙焦磷酸盐沉积特征，特别是三角纤维软骨复合体和掌指关节的钙化	计算机视觉	关节炎	卷积神经网络	CNN	图像	926张手部X光片，包括319例钙焦磷酸盐沉积阳性病例和607例阴性病例
766	2024-11-15	Development and evaluation of a soft pneumatic muscle for elbow joint rehabilitation 2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2024.1401686 PMID:39512658	研究论文	开发并评估了一种用于肘关节康复的软气动肌肉	开发了生物力学兼容的软气动肌肉，优化了肘关节的精确旋转控制，并结合了基于深度学习的运动跟踪系统	NA	提高肘关节康复的安全性和有效性	肘关节的康复	NA	NA	有限元分析	深度学习算法	NA	NA
767	2024-11-15	De novo design of mIDH1 inhibitors by integrating deep learning and molecular modeling 2024, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2024.1491699 PMID:39512821	研究论文	本研究通过整合深度学习和分子建模技术，设计了新的mIDH1抑制剂	首次尝试使用深度学习设计mIDH1抑制剂，为mIDH1抑制剂的设计提供了理论指导	NA	设计新的mIDH1抑制剂，用于癌症治疗	mIDH1基因突变相关的急性髓系白血病、胶质瘤和某些实体瘤	机器学习	血液肿瘤	双向循环神经网络（BRNN）、分子对接、分子动力学模拟	BRNN	化合物	3890个新化合物（BRNN生成）和3680个新化合物（支架跳跃方法生成）
768	2024-11-15	Deep learning-based computed tomography urography image analysis for prediction of HER2 status in bladder cancer 2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.101296 PMID:39513113	研究论文	本研究利用深度学习技术分析计算机断层扫描尿路造影（CTU）图像，预测膀胱癌中的HER2状态	首次提出了一种非侵入性方法，通过CTU图像识别和检测膀胱癌中的HER2表达	NA	旨在通过CTU图像检测HER2表达，以实现更精确的治疗	膀胱癌患者的CTU图像	计算机视觉	膀胱癌	Pyradiomics包提取放射特征，主成分分析（PCA）降维	多层感知器（MLP）	图像	97名膀胱癌患者
769	2024-11-15	Deep Neural Network and Radiomics-based Magnetic Resonance Imaging System for Predicting Microvascular Invasion in Hepatocellular Carcinoma 2024, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.93712 PMID:39513126	研究论文	本文提出了一种基于深度神经网络和放射组学的磁共振成像系统，用于预测肝细胞癌中的微血管侵犯	本文的创新点在于结合了放射组学特征和临床特征，构建了一个用于预测微血管侵犯的深度神经网络模型	本文的局限性在于样本量相对较小，且未提及模型的泛化能力和在其他数据集上的表现	本文的研究目的是开发一种基于磁共振成像的自动化系统，用于准确预测肝细胞癌中的微血管侵犯	本文的研究对象是肝细胞癌患者的磁共振成像数据和临床特征	计算机视觉	肝癌	磁共振成像	深度神经网络	图像	420名肝细胞癌患者，其中140例为微血管侵犯，280例为非微血管侵犯
770	2024-11-12	A Siamese ResNeXt network for predicting carotid intimal thickness of patients with T2DM from fundus images 2024, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2024.1364519 PMID:38549767	研究论文	开发并验证基于眼底图像的人工智能诊断模型，用于预测2型糖尿病患者的颈动脉内膜厚度	提出了一种基于Siamese ResNeXt网络的深度学习模型，用于从眼底图像中预测2型糖尿病患者的颈动脉内膜厚度	研究仅限于单个医院的1236名患者，且年龄因素嵌入网络后分类性能下降	开发和验证基于眼底图像的人工智能模型，用于预测2型糖尿病患者的颈动脉内膜厚度	2型糖尿病患者的颈动脉内膜厚度和眼底图像	计算机视觉	糖尿病	深度学习	Siamese ResNeXt网络	图像	1236名2型糖尿病患者
771	2024-11-11	Artificial intelligence in forensic medicine and related sciences - selected issues 2024, Archiwum medycyny sadowej i kryminologii DOI:10.4467/16891716AMSIK.24.005.19650 PMID:39450596	综述	本文综述了人工智能在法医学及相关科学中的潜在应用，并探讨了在诊断和治疗中可能造成的伤害的法律责任问题	本文介绍了人工智能在法医学及相关科学中的多种应用，如法医病理学、法医创伤学、死后鉴定检查等	人工智能在医学中应被视为辅助工具，最终的诊断和治疗决策应由人类负责	探讨人工智能在法医学及相关科学中的应用及其法律责任问题	人工智能在法医学及相关科学中的应用	机器学习	NA	NA	NA	NA	NA
772	2024-11-11	Deep CANALs: a deep learning approach to refining the canalization theory of psychopathology 2024, Neuroscience of consciousness IF:3.1Q1 DOI:10.1093/nc/niae005 PMID:38533457	研究论文	本文利用深度学习理论对心理病理学的运河化理论进行改进	本文通过深度学习理论区分了大脑中信念表示的两个不同优化景观，并描述了每种景观运河化可能导致的独特病理	NA	改进心理病理学的运河化理论	心理病理学中的运河化现象	机器学习	NA	深度学习	深度神经网络	NA	NA
773	2024-11-10	The automated Greulich and Pyle: a coming-of-age for segmental methods? 2024, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2024.1326488 PMID:38533467	研究论文	本文回顾了自动化骨龄评估方法的成功与局限，并提出了一种新的假设，即深度学习网络在预测骨龄时捕捉到了超出参考类别的细微差别	提出了一个新的假设，即深度学习网络在预测骨龄时捕捉到了超出参考类别的细微差别，并建议使用基于特征骨组的评分来解释预测偏差	未具体提及	探讨自动化骨龄评估方法的进展及其潜在应用	骨龄评估方法及其自动化应用	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA
774	2024-11-10	A review of mechanistic learning in mathematical oncology 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1363144 PMID:38533513	综述	本文综述了数学肿瘤学中机制学习的现状，并展望了其在肿瘤学领域的发展前景	本文提出了机制学习的四种分类（顺序、并行、外在、内在），并讨论了物理信息神经网络、代理模型学习和数字孪生等技术	本文未详细讨论机制学习在其他医学领域的应用	探讨机制学习在肿瘤学中的应用及其未来发展	机制学习在肿瘤学中的应用，包括纵向肿瘤反应预测和时间到事件建模	机器学习	肿瘤学	物理信息神经网络、代理模型学习、数字孪生	NA	NA	NA
775	2024-11-09	Protein-protein and protein-nucleic acid binding site prediction via interpretable hierarchical geometric deep learning 2024-Jan-02, GigaScience IF:11.8Q1 DOI:10.1093/gigascience/giae080 PMID:39484977	研究论文	本文设计了一种名为GraphRBF的分层几何深度学习模型，用于预测蛋白质-蛋白质和蛋白质-核酸的结合位点	GraphRBF通过增强图神经网络描述物理化学信息交互，并通过优先径向基函数神经网络表征残基的空间分布，从而学习残基的结合模式	NA	提高蛋白质-蛋白质和蛋白质-核酸结合位点的预测准确性，并为疾病诊断和药物设计提供技术指导	蛋白质-蛋白质和蛋白质-核酸的结合位点	机器学习	NA	分层几何深度学习	图神经网络	蛋白质结构数据	涉及SARS-CoV-2 omicron spike蛋白的已知表位和多个潜在结合区域
776	2024-11-09	Efficient differential privacy enabled federated learning model for detecting COVID-19 disease using chest X-ray images 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1409314 PMID:38912338	研究论文	本文介绍了一种基于差分隐私的联邦学习模型，用于通过胸部X光图像检测COVID-19疾病	提出了一个自适应差分隐私的联邦学习模型，该模型能够根据实时数据敏感性分析动态调整隐私级别，提高了联邦学习在多样化医疗环境中的实用性	未明确提及	开发一种能够保护数据隐私和安全的COVID-19检测模型	COVID-19疾病的检测	机器学习	COVID-19	差分隐私、联邦学习	联邦学习模型	图像	未明确提及
777	2024-11-09	Few-shot learning for inference in medical imaging with subspace feature representations 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0309368 PMID:39504337	研究论文	本文探讨了在医学影像分析中使用子空间特征表示进行少样本学习的两种替代方法	提出了基于判别分析和非负矩阵分解的两种新方法，并在低维度下展示了它们相对于SVD的显著改进	文章未详细讨论在高维度下的性能表现	解决医学影像分析中由于数据量少而难以应用深度学习的问题	医学影像数据	计算机视觉	NA	判别分析（DA），非负矩阵分解（NMF）	NA	图像	14个不同数据集，涵盖11种不同疾病类型
778	2024-11-09	Non-small cell lung cancer detection through knowledge distillation approach with teaching assistant 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0306441 PMID:39504338	研究论文	本文通过教学助手框架中的知识蒸馏技术，利用CT扫描图像进行非小细胞肺癌的分类	采用教学助手框架，通过知识蒸馏技术提高学生模型的性能，并在边缘设备上实现高效的训练和预测	未提及	提高非小细胞肺癌分类模型的性能和效率	非小细胞肺癌的分类	计算机视觉	肺癌	知识蒸馏	CNN, VGG19, ResNet152v2, Swin, CCT, ViT	图像	未提及
779	2024-11-08	Impact of log parsing on deep learning-based anomaly detection 2024, Empirical software engineering IF:3.5Q1 DOI:10.1007/s10664-024-10533-w PMID:39161930	研究论文	本文研究了日志解析对基于深度学习的异常检测准确性的影响	本文首次系统地研究了日志解析对异常检测准确性的影响，并发现区分性比解析准确性更重要	研究仅限于13种日志解析技术和7种异常检测技术，可能无法涵盖所有情况	探讨日志解析对基于深度学习的异常检测准确性的影响	日志解析技术和异常检测技术	机器学习	NA	深度学习	NA	日志数据	使用了三个公开的日志数据集
780	2024-11-08	Dinucleotide composition representation -based deep learning to predict scoliosis-associated Fibrillin-1 genotypes 2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2024.1492226 PMID:39502335	研究论文	本文提出了一种基于二核苷酸组成表示（DCR）的深度学习方法，用于预测与脊柱侧弯相关的Fibrillin-1基因型	本文创新性地使用二核苷酸组成表示（DCR）和卷积神经网络（CNN）来预测脊柱侧弯相关的高风险基因型	NA	研究目的是通过深度学习方法预测青少年特发性脊柱侧弯（AIS）相关的基因型	研究对象是ClinVar数据库中的AIS相关变异记录	机器学习	脊柱侧弯	深度学习	卷积神经网络（CNN）	基因数据	58,000条脊柱侧弯相关记录