深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1481	2024-08-07	Multi-strategy modified sparrow search algorithm for hyperparameter optimization in arbitrage prediction models 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0303688 PMID:38748753	研究论文	本文提出了一种多策略改进的麻雀搜索算法（MSMSSA）用于优化LSTM网络的超参数，构建了一个套利价差预测模型（MSMSSA-LSTM）	引入了好点集理论、比例自适应策略和改进的位置更新方法，以增强麻雀算法的空间探索能力	NA	提高深度学习模型在套利数据特征捕捉和预测准确性方面的性能	套利数据特征和预测模型性能	机器学习	NA	麻雀搜索算法（SSA）	LSTM	数据	中国期货市场中的螺纹钢和热卷期货的实际价差数据
1482	2024-08-07	Attention pyramid pooling network for artificial diagnosis on pulmonary nodules 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0302641 PMID:38753596	研究论文	本文提出了一种注意力金字塔池化网络（APPN）用于肺结节的自动诊断	结合注意力机制和金字塔池化模块，实现了多尺度特征融合并聚焦于关键特征，使用门控空间记忆技术提取更精确的分类特征	未提及具体限制	提高肺结节在CT影像中的分类准确性，从而降低肺癌死亡率	肺结节的自动检测与分类	计算机视觉	肺部疾病	深度学习	CNN	图像	使用LIDC-IDRI数据集进行实验
1483	2024-08-07	Toward explainable AI in radiology: Ensemble-CAM for effective thoracic disease localization in chest X-ray images using weak supervised learning 2024, Frontiers in big data IF:2.4Q2 DOI:10.3389/fdata.2024.1366415 PMID:38756502	研究论文	本文开发了一种基于类激活映射（CAM）的集成模型Ensemble-CAM，用于通过弱监督学习解决胸部X光图像中胸腔疾病定位的问题	提出了Ensemble-CAM模型，结合集成学习和迁移学习，通过类激活函数实现疾病定位，减少对大量标注数据的依赖，并通过可视化解释性特征增强预测结果的信心	NA	开发一种可解释的人工智能模型，用于胸部X光图像中的胸腔疾病定位，并减少对大量标注数据的依赖	胸部X光图像中的胸腔疾病定位	计算机视觉	胸腔疾病	弱监督学习	集成模型	图像	三个胸部X光图像数据集
1484	2024-08-07	Apriori prediction of chemotherapy response in locally advanced breast cancer patients using CT imaging and deep learning: transformer versus transfer learning 2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2024.1359148 PMID:38756659	研究论文	本研究使用深度学习网络和CT影像预测局部晚期乳腺癌患者对新辅助化疗的反应，比较了ViT变换器和迁移学习网络的性能	首次使用ViT变换器和迁移学习网络结合CT影像预测局部晚期乳腺癌患者对新辅助化疗的反应，并展示了注意力机制的重要性	研究结果依赖于训练数据和测试数据的分割比例，且不同网络的性能差异较大	开发预测模型以预测局部晚期乳腺癌患者对新辅助化疗的肿瘤反应	局部晚期乳腺癌患者对新辅助化疗的反应	机器学习	乳腺癌	CT影像	ViT变换器, VGG16, VGG19, ResNet-50, ResNet-101, ResNet-152, InceptionV3, Xception	影像	117名局部晚期乳腺癌患者，其中82名有临床病理反应，35名无反应
1485	2024-08-07	Open and remotely accessible Neuroplatform for research in wetware computing 2024, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2024.1376042 PMID:38756757	研究论文	本文介绍了一个开放且远程访问的神经平台，用于湿件计算和类器官智能的研究	开发了一个硬件和软件系统，支持大规模的电生理实验，并设计了微流控系统以自动化培养基流动和更换	NA	探索使用生物神经网络进行计算的新方法	神经类器官	人工智能	NA	电生理技术	NA	数据	超过1,000个脑类器官
1486	2024-08-07	Contrastive learning with token projection for Omicron pneumonia identification from few-shot chest CT images 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1360143 PMID:38756944	研究论文	本文提出了一种名为CoTP的对比学习模型，通过令牌投影技术提高从少量胸部CT图像中识别Omicron肺炎的诊断质量	利用无标签数据进行CoTP的拟合，并通过少量标记样本进行微调，同时引入新的Omicron数据集和改进的数据增强策略	NA	提高基于少量胸部CT图像的Omicron肺炎诊断效率	Omicron肺炎的胸部CT图像识别	计算机视觉	肺炎	对比学习	ResNet50	图像	少量标记样本和无标签数据
1487	2024-08-07	A Survey on 3D Skeleton-Based Action Recognition Using Learning Method 2024, Cyborg and bionic systems (Washington, D.C.) DOI:10.34133/cbsystems.0100 PMID:38757045	综述	本文综述了基于三维骨骼的动作识别（3D SAR）在计算机视觉领域的研究进展，特别关注了深度学习架构的应用	首次全面讨论了基于深度学习的3D骨骼数据动作识别方法	之前的综述主要集中在视频或RGB数据为主的方法，对骨骼数据的覆盖有限	强调动作识别的重要性，并突出三维骨骼数据作为宝贵模态的意义	基于四种基本深度架构的动作识别技术	计算机视觉	NA	深度学习	循环神经网络、卷积神经网络、图卷积网络、Transformer	骨骼数据	涉及当前最大的3D骨骼数据集NTU-RGB+D及其新版本NTU-RGB+D 120
1488	2024-08-07	Human Pose Estimation for Clinical Analysis of Gait Pathologies 2024, Bioinformatics and biology insights IF:2.3Q3 DOI:10.1177/11779322241231108 PMID:38757143	研究论文	本研究提出了一种用于定量评估步态障碍的二分类方法，特别是针对杜兴肌营养不良症（DMD）的步态特征进行分析	研究利用从YouTube和公开数据集中收集的新颖基准数据集，提取时间距离变量和下肢矢状关节角度，并采用机器学习和深度学习技术进行模式识别	当前模型能够区分健康对象和DMD患者，但不能区分DMD患者和其他步态障碍患者	开发一种成本效益高的方法，通过分析2D和3D人体姿态估计轨迹来检测步态异常	杜兴肌营养不良症（DMD）患者的步态特征	计算机视觉	神经肌肉疾病	人体姿态估计	支持向量机（SVM）和深度网络	视频（RGB）	数据来自YouTube和公开数据集的健康儿童
1489	2024-08-07	[[Fundamentals] 8. Works on Mac or Windows! Practical Deep Learning with PyTorch] 2024, Nihon Hoshasen Gijutsu Gakkai zasshi DOI:10.6009/jjrt.2024-2336 PMID:38644222	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1490	2024-08-07	Deep learning-based classification of the capillary ultrastructure in human skeletal muscles 2024, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2024.1363384 PMID:38751446	研究论文	本研究利用卷积神经网络（CNN）对人类骨骼肌毛细血管超微结构进行分类，以区分健康参与者与系统性病理患者	使用预训练的CNN模型在电子显微镜图像上区分健康控制组与系统性病理患者的毛细血管超微结构，其准确性高于传统的形态计量分析	NA	训练CNN模型以识别健康参与者与系统性病理患者肌肉活检中毛细血管的形态计量模式，用于假设生成	人类骨骼肌毛细血管的超微结构	机器学习	糖尿病，高血压，外周动脉疾病	透射电子显微镜（TEM）	CNN（ResNet101）	图像	1810张电子显微镜图像，来自70名参与者
1491	2024-08-07	The Importance of Understanding Deep Learning 2024, Erkenntnis DOI:10.1007/s10670-022-00605-y PMID:38751773	research paper	本文探讨了深度神经网络（DNNs）的理解问题及其在科学中的应用	本文提出了对深度神经网络理解的不同概念，特别是解释性理解的重要性	本文未明确指出具体的实验或数据分析限制	探讨当前对深度神经网络理解不足是否限制了其在科学中的应用	深度神经网络（DNNs）及其在科学中的应用	machine learning	NA	NA	DNNs	NA	NA
1492	2024-08-07	Detection of sweet corn seed viability based on hyperspectral imaging combined with firefly algorithm optimized deep learning 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1361309 PMID:38751847	研究论文	本研究利用高光谱成像技术结合萤火虫算法优化的深度学习方法，对甜玉米种子的不同活力等级进行识别	本研究提出的萤火虫算法优化的CNN-LSTM模型在甜玉米种子活力等级分类中表现出优于其他模型的性能	NA	识别甜玉米种子的活力等级	甜玉米种子	机器学习	NA	高光谱成像	CNN-LSTM	光谱图像	496颗种子，包括四个活力等级的种子
1493	2024-08-07	Subcutaneous fat predicts bone metastasis in breast cancer: A novel multimodality-based deep learning model 2024, Cancer biomarkers : section A of Disease markers IF:2.2Q3 DOI:10.3233/CBM-230219 PMID:38043007	研究论文	本研究利用深度学习方法，结合临床信息和CT图像特征，预测乳腺癌患者的骨转移	首次提出使用皮下脂肪指数作为预测乳腺癌骨转移的独立预后因素，并采用多模态深度学习算法进行预测	NA	探索利用深度学习技术预测乳腺癌患者的骨转移	乳腺癌患者的骨转移预测	机器学习	乳腺癌	CT图像	CNN	图像	431名乳腺癌患者
1494	2024-08-07	Learning multi-site harmonization of magnetic resonance images without traveling human phantoms 2024, Communications engineering DOI:10.1038/s44172-023-00140-w PMID:38420332	研究论文	本文提出了一种无需人类受试者跨站点采集数据即可实现磁共振图像多站点协调的深度学习方法	该方法通过分离站点特定外观信息和站点不变解剖信息，生成适用于任何目标站点的图像，无需额外数据收集	NA	提高磁共振图像数据的一致性，实现多站点图像数据的有效整合	磁共振图像的多站点协调	计算机视觉	NA	深度学习	深度神经网络	图像	超过6,000张多站点T1和T2加权图像
1495	2024-08-07	MHCII-peptide presentation: an assessment of the state-of-the-art prediction methods 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1293706 PMID:38646540	研究论文	本文评估了最新的MHCII-肽结合预测计算方法的性能	采用了深度学习算法和大量训练数据，新开发的预测方法性能优于旧方法	NA	评估和概述最新的MHCII-肽结合预测计算方法	MHCII-肽结合预测方法	生物信息学	NA	深度学习	NA	蛋白质序列数据	包含20种人类MHCII蛋白同种型的结合和非结合肽的独立数据集
1496	2024-08-07	Artificial intelligence in the healthcare sector: comparison of deep learning networks using chest X-ray images 2024, Frontiers in public health IF:3.0Q2 DOI:10.3389/fpubh.2024.1386110 PMID:38660365	研究论文	本研究探讨了深度学习网络在胸部X光图像疾病诊断中的应用	本研究首次比较了ResNet101、AlexNet、GoogLeNet和Xception在胸部X光图像疾病诊断中的成功率	研究使用的数据集仅包含COVID-19、病毒性肺炎和健康个体的胸部X光图像	旨在确定深度学习网络在疾病诊断中的成功率	深度学习网络ResNet101、AlexNet、GoogLeNet和Xception	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	1,680张胸部X光图像，包括COVID-19、病毒性肺炎和健康个体
1497	2024-08-07	A hybrid deep learning scheme for MRI-based preliminary multiclassification diagnosis of primary brain tumors 2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2024.1363756 PMID:38746679	研究论文	本研究探索了一种结合多种先进技术的混合深度学习方案，用于提高原发性脑肿瘤诊断的分类性能和可解释性	本研究通过结合超分辨率重建、动态学习率退火策略、特征迁移和机器学习等技术，提高了深度学习模型的分类性能和可解释性	NA	探索一种混合深度学习方案，以提高原发性脑肿瘤诊断的准确性和自动化程度	原发性脑肿瘤的诊断	机器学习	脑肿瘤	深度学习	DenseNet121, LightGBM	MRI图像	230名原发性脑肿瘤患者，包括97名脑膜瘤、66名胶质瘤和67名垂体瘤
1498	2024-08-07	MAMILNet: advancing precision oncology with multi-scale attentional multi-instance learning for whole slide image analysis 2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2024.1275769 PMID:38746682	研究论文	本文介绍了MAMILNet，一种用于全切片图像分析的多尺度注意力多实例学习框架，旨在提高肿瘤检测、分类和治疗反应预测的精确度	MAMILNet通过引入注意力机制和多尺度策略，提高了模型的泛化能力和预测准确性，同时减少了病理学家的手动工作量	NA	推动精准肿瘤学和个体化治疗计划的发展	全切片图像分析中的肿瘤检测、分类和治疗反应预测	数字病理学	NA	多尺度注意力多实例学习	注意力机制	图像	1171例涵盖多种癌症类型
1499	2024-08-07	Editorial: IoT, UAV, BCI empowered deep learning models in precision agriculture 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1399753 PMID:38751845	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1500	2024-08-07	Convolutional Neural Networks for Glioma Segmentation and Prognosis: A Systematic Review 2024, Critical reviews in oncogenesis DOI:10.1615/CritRevOncog.2023050852 PMID:38683153	综述	本文综述了卷积神经网络（CNN）在胶质瘤分割和预后预测中的应用	CNN在医学影像处理中的应用，特别是在胶质瘤分类和预后预测中的创新应用	模型可解释性、数据可用性和计算效率方面的挑战	探讨CNN在神经肿瘤学领域中的应用及其未来发展方向	胶质瘤的分割、分类和预后预测	计算机视觉	脑癌	CNN	CNN	图像	NA