深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2081	2024-12-08	Transformer-based transfer learning on self-reported voice recordings for Parkinson's disease diagnosis 2024-12-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81824-x PMID:39627487	研究论文	本研究探讨了基于Transformer的迁移学习方法在自报告语音数据上诊断帕金森病的应用	首次使用Transformer模型对帕金森病诊断中的音频数据进行处理，并在此数据集上取得了最佳性能	未提及具体限制	探索深度学习技术在帕金森病诊断中的应用，特别是通过自报告语音数据进行早期检测和诊断	帕金森病的诊断	机器学习	神经退行性疾病	深度学习	Transformer	音频	使用mPower语音数据集
2082	2024-12-08	Deep learning versus human assessors: forensic sex estimation from three-dimensional computed tomography scans 2024-12-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81718-y PMID:39627517	研究论文	研究比较了深度学习模型与人类评估者在从三维CT扫描中进行法医性别估计的准确性	提出了一种自动深度学习框架，用于提高性别估计的准确性和减少偏差	研究仅限于印度尼西亚个体的颅骨CT扫描	探索使用深度学习技术来提高法医性别估计的准确性和减少人类偏差	颅骨CT扫描图像	计算机视觉	NA	深度学习	深度学习网络	图像	200个印度尼西亚个体的颅骨CT扫描
2083	2024-12-08	An explainable few-shot learning model for the directed evolution of antimicrobial peptides 2024-Dec-03, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138272 PMID:39631577	研究论文	本研究利用深度学习引导的定向进化方法，探索抗菌肽的化学空间，以发现新的抗菌剂	本研究首次将可解释的小样本学习模型应用于抗菌肽的定向进化，通过分子动力学模拟和梯路径框架揭示了杀菌机制	NA	发现新的抗菌剂以应对革兰氏阴性菌的抗生素耐药性威胁	抗菌肽及其脂多糖结合域的结构修饰	机器学习	NA	深度学习	小样本学习模型	蛋白质序列	来自Marsupenaeus japonicus的脂多糖结合域样本
2084	2024-12-08	DeepCt: Predicting Pharmacokinetic Concentration-Time Curves and Compartmental Models from Chemical Structure Using Deep Learning 2024-Dec-02, Molecular pharmaceutics IF:4.5Q1 DOI:10.1021/acs.molpharmaceut.4c00562 PMID:39505357	研究论文	本文提出了一种名为DeepCt的深度学习方法，用于从化合物结构预测药代动力学浓度-时间曲线和隔室模型	本文首次提出了一种基于深度学习的方法，直接从化合物结构预测药代动力学浓度-时间曲线，而不是传统的基于PK参数的预测方法	NA	旨在通过早期预测化合物的药代动力学特性，减少动物实验和周期时间	化合物结构和药代动力学浓度-时间曲线	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	化合物结构数据	NA
2085	2024-12-08	Development of an Open-Source Dataset of Flat-Mounted Images for the Murine Oxygen-Induced Retinopathy Model of Ischemic Retinopathy 2024-Dec-02, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.13.12.4 PMID:39625436	研究论文	描述了一个开放源代码的数据集，包含来自氧诱导视网膜病变（OIR）模型小鼠的平铺视网膜图像和血管分割	这是首个包含原始和分割平铺视网膜图像的开放源代码数据集	NA	开发一个用于氧诱导视网膜病变（OIR）研究的开放源代码数据集	小鼠的平铺视网膜图像和血管分割	计算机视觉	视网膜病变	NA	深度学习算法	图像	1170张图像，其中111张来自正常小鼠，1048张来自OIR小鼠
2086	2024-12-08	Effects of Physical Activity and Inactivity on Microvasculature in Children: The Hong Kong Children Eye Study 2024-Dec-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.65.14.7 PMID:39625440	研究论文	研究探讨了儿童的体育活动和不活动对视网膜微血管的影响	首次使用深度学习系统从视网膜照片中测量儿童的中央视网膜动脉等效值和中央视网膜静脉等效值	研究为横断面研究，无法确定因果关系	探讨体育活动和不活动对儿童视网膜微血管的影响	6至8岁儿童的视网膜微血管	NA	NA	深度学习系统	NA	图像	11,959名6至8岁儿童
2087	2024-12-08	Novel Insights into Enzymatic Thermostability: The "Short Board" Theory and Zero-Shot Hamiltonian Model 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202402441 PMID:39308285	研究论文	本文提出了一种新的“短板”理论和零样本哈密顿模型，用于理解和增强酶的热稳定性	提出了“短板”理论和零样本哈密顿模型，用于优化酶的热稳定性	NA	理解和增强酶的热稳定性	α-淀粉酶	生物工程	NA	深度学习	零样本哈密顿模型	蛋白质结构	多个域、残基和原子级别的实验验证
2088	2024-12-08	An anthropomorphic diagnosis system of pulmonary nodules using weak annotation-based deep learning 2024-Dec, Computerized medical imaging and graphics : the official journal of the Computerized Medical Imaging Society IF:5.4Q1 DOI:10.1016/j.compmedimag.2024.102438 PMID:39426342	研究论文	本文开发了一种基于弱标注深度学习的类人肺结节诊断系统	该系统使用弱标注数据进行训练，无需耗时且劳动密集的手动标注，且性能可与全标注诊断系统相媲美	NA	提高肺结节在CT扫描中的分类准确性，以辅助肺癌的早期检测和诊断	肺结节的分级和纹理分类	计算机视觉	肺癌	深度学习	NA	图像	814个测试病例的LIDC-IDRI数据集和822个测试病例的内部数据集
2089	2024-12-08	Meta-analysis of deep learning approaches for automated coronary artery calcium scoring: Performance and clinical utility AI in CAC scoring: A meta-analysis: AI in CAC scoring: A meta-analysis 2024-Dec, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109295 PMID:39437607	meta-analysis	本研究对使用深度学习方法进行冠状动脉钙化评分自动化的性能和临床效用进行了元分析	本研究首次对深度学习在冠状动脉钙化评分中的应用进行了全面的元分析，评估了其与手动评分方法的一致性	研究结果显示不同成像模态之间存在性能差异，需要进一步研究和标准化	评估深度学习模型在冠状动脉钙化评分中的性能和临床效用	冠状动脉钙化评分	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	CNN	图像	共包含25项研究
2090	2024-12-08	Artificial intelligence and deep learning algorithms for epigenetic sequence analysis: A review for epigeneticists and AI experts 2024-Dec, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109302 PMID:39500240	综述	本文综述了人工智能和深度学习算法在表观遗传序列分析中的应用	本文为AI专家和表观遗传学家提供了关于AI模型在表观基因组数据上训练的综述，并提出了研究问题的分类和候选AI解决方案	本文指出了文献中的几个空白和研究挑战，并提出了相应的建议	旨在为AI专家和表观遗传学家提供关于AI在表观遗传学研究中应用的综述	表观遗传学机制、基因表达调控、疾病标记预测、基因表达预测、增强子-启动子相互作用和染色质状态	机器学习	NA	NA	NA	表观基因组数据	NA
2091	2024-12-08	Space-for-time substitutions exaggerate urban bird-habitat ecological relationships 2024-Dec, The Journal of animal ecology IF:3.5Q1 DOI:10.1111/1365-2656.14194 PMID:39506196	研究论文	本文研究了北美城市鸟类栖息地变化对鸟类数量变化的影响，并测试了空间替代时间方法的有效性	本文首次使用深度学习模型和贝叶斯多物种数量模型，结合长时间序列的鸟类调查数据和遥感数据，评估了城市栖息地变化对鸟类数量的影响	本文仅限于北美一个城市的研究，结果可能不适用于其他地区	探讨城市栖息地变化对鸟类数量的影响，并评估空间替代时间方法的有效性	北美城市鸟类及其栖息地	生态学	NA	深度学习模型，贝叶斯多物种数量模型	深度学习模型	遥感数据，鸟类调查数据	1997年和2020年Metro Vancouver, BC, Canada的鸟类调查数据
2092	2024-12-08	Deep learning automatically distinguishes myocarditis patients from normal subjects based on MRI 2024-Dec, The international journal of cardiovascular imaging DOI:10.1007/s10554-024-03284-8 PMID:39509018	研究论文	本研究利用深度学习方法，基于心血管磁共振成像（CMRI）自动区分心肌炎患者与正常受试者	本研究创新性地采用深度学习框架，通过单帧和多帧分析评估不同视图和采集类型，以实现心肌炎的自动检测	NA	本研究旨在确定最佳的心血管磁共振成像视图，以区分正常和心肌炎病例	本研究对象为269名个体，其中231例确诊为心肌炎，38例为对照组	计算机视觉	心血管疾病	深度学习（DL）	NA	图像	269名个体，其中231例心肌炎，38例对照组
2093	2024-12-08	State-of-the-Art Deep Learning CT Reconstruction Algorithms in Abdominal Imaging 2024-Dec, Radiographics : a review publication of the Radiological Society of North America, Inc IF:5.2Q1 DOI:10.1148/rg.240095 PMID:39612283	研究论文	本文探讨了深度学习重建（DLR）CT算法在腹部影像中的应用	DLR算法通过在图像生成过程中引入深度学习方法，有效减少了低光子计数带来的图像噪声，并提高了重建速度	本文概述了DLR算法在CT中的当前局限性和未来展望	研究深度学习重建CT算法在腹部影像中的技术细节和临床应用	腹部CT影像中的深度学习重建算法	计算机视觉	NA	深度学习	深度神经网络	图像	NA
2094	2024-12-08	GD-Net: An Integrated Multimodal Information Model Based on Deep Learning for Cancer Outcome Prediction and Informative Feature Selection 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70221 PMID:39628446	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的集成多模态信息模型GD-Net，用于癌症预后预测和信息特征选择	GD-Net通过早期融合多模态信息，结合可解释的轻量级XGBoost模块，提高了生存预测的准确性	NA	提高癌症预后预测的准确性，并识别新的多模态预后生物标志物	八种癌症数据集，特别是肝癌的差异基因、差异miRNA和甲基化差异基因	机器学习	NA	深度学习	图深度学习算法	多模态数据	八个癌症数据集，肝癌研究中涉及319个差异基因、15个差异miRNA和155个甲基化差异基因
2095	2024-12-08	Automated Segmentation of Fetal Intracranial Volume in Three-Dimensional Ultrasound Using Deep Learning: Identifying Sex Differences in Prenatal Brain Development 2024-Dec-01, Human brain mapping IF:3.5Q1 DOI:10.1002/hbm.70058 PMID:39629904	研究论文	本文开发了一种基于卷积神经网络（CNN）的自动化方法，用于从三维超声图像中分割胎儿颅内体积（ICV），并研究了胎儿性别差异对ICV发育的影响	本文首次使用深度学习技术自动分割胎儿颅内体积，并通过大规模纵向数据集验证了该方法的有效性	本文仅在特定年龄段的胎儿数据上进行了验证，未来需要在更多年龄段和不同人群中进行验证	研究胎儿颅内体积的自动化分割方法，并探讨性别差异对胎儿大脑发育的影响	胎儿颅内体积（ICV）和性别差异	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）	卷积神经网络（CNN）	三维超声图像	2235名个体，共43492张超声图像
2096	2024-12-08	Deep Learning and Minimally Invasive Endoscopy: Panendoscopic Detection of Pleomorphic Lesions 2024-Dec, GE Portuguese journal of gastroenterology IF:1.0Q4 DOI:10.1159/000539837 PMID:39633912	研究论文	本文开发了一种人工智能模型，用于在胶囊内镜检查中自动检测多种形态的病变	首次将卷积神经网络应用于胶囊内镜的全面检测，解决了不同品牌设备间的互操作性技术难题	NA	开发一种人工智能模型，用于在胶囊内镜检查中自动检测多种形态的病变	胶囊内镜检查中的多种形态病变，包括血管性病变、隆起性病变、血迹残留、溃疡和糜烂	计算机视觉	NA	卷积神经网络	CNN	图像	355,110张图像，来自8种不同的胶囊内镜和结肠胶囊内镜设备
2097	2024-12-08	PaveDistress: A comprehensive dataset of pavement distresses detection 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111111 PMID:39633980	研究论文	介绍了一个名为PaveDistress的综合路面病害检测数据集	提供了高分辨率的路面病害图像，包括裂缝、修补、坑洞等，支持深度学习模型的发展	NA	支持非破坏性检测道路缺陷的深度学习模型开发	路面病害图像数据集	计算机视觉	NA	NA	深度学习模型	图像	包含高分辨率图像，每张图像代表3.9m × 2.1m的实际道路覆盖面积
2098	2024-12-08	External validation of SpineNetV2 on a comprehensive set of radiological features for grading lumbosacral disc pathologies 2024-Dec, North American Spine Society journal DOI:10.1016/j.xnsj.2024.100564 PMID:39640208	研究论文	本文对SpineNetV2模型在腰椎间盘病理分级中的外部验证进行了研究	SpineNetV2是一个用于检测和分级腰椎间盘病理的先进开源模型，本文对其在不同患者群体和成像协议中的鲁棒性和泛化能力进行了验证	对于椎间孔狭窄和椎间盘突出的评估，SpineNetV2与专家评估的一致性较低，表明矢状位MR图像在这些条件下的评估存在局限性	验证SpineNetV2模型在腰椎间盘病理分级中的可靠性和适用性	1747个腰椎间盘的MRI图像，来自353名患者	计算机视觉	腰椎间盘疾病	MRI	SpineNetV2	图像	1747个腰椎间盘样本，来自353名患者
2099	2024-12-08	Aspect based sentiment analysis datasets for Bangla text 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111107 PMID:39640395	研究论文	本文开发了一个高质量的孟加拉语基于方面的情感分析（ABSA）标注数据集BANGLA_ABSA	本文的创新点在于创建了首个高质量的孟加拉语ABSA数据集，涵盖了四个开放领域	数据集的样本量相对较小，且仅涵盖四个领域	研究目的是为孟加拉语的基于方面的情感分析提供高质量的标注数据集	研究对象是孟加拉语的文本情感分析	自然语言处理	NA	基于方面的情感分析（ABSA）	NA	文本	数据集包含801、800、975和1149条评论，分别对应手机、电影、餐厅和汽车领域
2100	2024-12-08	A fine-grained labeled dataset for textual sentiment analysis in technical education 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111120 PMID:39640403	研究论文	本文介绍了一个为技术教育领域文本情感分析精心策划的数据集	这是首个公开可用的同类数据集，为现有模型的评估和新模型的开发提供了丰富的资源	数据收集过程存在局限性和伦理考虑	推进技术教育领域情感分析及相关领域的研究和应用	技术教育领域的文本情感分析	自然语言处理	NA	NA	NA	文本	14,272条记录