深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2281	2024-12-29	Emotion-Semantic-Aware Dual Contrastive Learning for Epistemic Emotion Identification of Learner-Generated Reviews in MOOCs 2024-11, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3294636 PMID:37486839	研究论文	本文提出了一种情感语义感知的双重对比学习方法（ES-DCL），用于识别大规模开放在线课程（MOOCs）中学习者生成评论的认知情感	通过从两个不同视角提取隐式语义特征和人类可解释的情感特征，形成互补的情感语义特征，并设计两种对比损失（标签对比损失和特征对比损失）来训练情感语义特征在样本空间中的判别分布，解决不同类别认知情感之间的各向异性问题	未明确提及具体局限性	提高MOOCs中学习者生成评论的认知情感识别性能	MOOCs中学习者生成的评论	自然语言处理	NA	双重对比学习	ES-DCL	文本	四个不同学科的MOOCs评论数据集
2282	2024-12-29	A comprehensive comparison of deep learning-based compound-target interaction prediction models to unveil guiding design principles 2024-Oct-28, Journal of cheminformatics IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13321-024-00913-1 PMID:39468635	研究论文	本文对12种基于深度学习的化合物-靶点相互作用预测模型进行了全面比较，揭示了设计原则	本文首次在大型、精选的CTI数据集上对多种深度学习模型进行了深入比较，并提出了性能最佳的Phys-DeepConv-DTI模型	本文未提及模型在实际药物发现中的应用效果，可能缺乏实际验证	评估和比较不同深度学习模型在化合物-靶点相互作用预测中的性能	化合物-靶点相互作用	机器学习	NA	深度学习	DeepConv-DTI, Phys-DeepConv-DTI	化合物和靶点的表示数据	超过30万个结合和非结合的CTI数据
2283	2024-12-29	Intraoperative Hypotension Prediction Based on Features Automatically Generated Within an Interpretable Deep Learning Model 2024-10, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3273187 PMID:37220057	研究论文	本文开发了一种可解释的深度学习模型，用于预测麻醉患者10分钟内的低血压发生	该模型不仅预测低血压，还能自动生成解释ABP趋势与低血压之间关联的预测因子，提供生理学解释	模型的外部验证性能略低于内部验证，可能在实际应用中存在一定的局限性	开发一种高精度且可解释的深度学习模型，用于预测麻醉患者的低血压发生	麻醉患者的动脉血压（ABP）数据	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	时间序列数据（ABP记录）	NA
2284	2024-12-29	Cross-Channel Specific-Mutual Feature Transfer Learning for Motor Imagery EEG Signals Decoding 2024-10, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3269512 PMID:37220058	研究论文	本文提出了一种跨通道特定-互特征迁移学习网络模型，用于解码运动想象脑电图信号	提出了一种新的跨通道特定-互特征迁移学习网络模型，能够提取大脑多区域信号的特定和互特征，并通过有效的训练技巧最大化这两种特征的区别	未提及具体的数据集规模或实验环境的限制	提高运动想象脑电图信号的解码能力，以更准确地理解大脑活动	运动想象脑电图信号	脑机接口	NA	深度学习	跨通道特定-互特征迁移学习网络模型	脑电图信号	使用了BCI Competition IV-2a和HGD数据集
2285	2024-12-29	Backpropagation-Based Learning Techniques for Deep Spiking Neural Networks: A Survey 2024-09, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3263008 PMID:37027264	综述	本文综述了基于反向传播的深度脉冲神经网络（SNNs）学习技术	提出了新的脉冲反向传播算法分类法，分为空间、时空和单脉冲三类	SNNs的离散信息表示使得基于反向传播的训练具有挑战性	探讨深度SNNs在低功耗应用中的训练策略	深度脉冲神经网络（SNNs）	机器学习	NA	反向传播	SNN	NA	NA
2286	2024-12-29	SSGCNet: A Sparse Spectra Graph Convolutional Network for Epileptic EEG Signal Classification 2024-09, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3252569 PMID:37030729	研究论文	本文提出了一种稀疏光谱图卷积网络（SSGCNet）用于癫痫脑电图（EEG）信号分类	提出了一种加权邻域场图（WNFG）来表示EEG信号，并结合稀疏权重剪枝和交替方向乘子法（ADMM）开发了序列图卷积网络	未提及具体局限性	开发一种轻量级的深度学习模型，同时保持高分类准确率	癫痫脑电图（EEG）信号	机器学习	癫痫	图卷积网络（GCN）	SSGCNet	EEG信号	Bonn公共数据集和SSW临床真实数据集
2287	2024-12-29	Higher Order Polynomial Transformer for Fine-Grained Freezing of Gait Detection 2024-09, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3264647 PMID:37043325	研究论文	本文提出了一种基于视觉输入的高阶多项式变换器（HP-Transformer）架构，用于细粒度冻结步态（FoG）检测	提出了高阶自注意力机制，基于高阶多项式构建了线性、双线性和三线性变换器，并通过跨阶融合策略进行FoG检测	NA	开发一种基于机器学习的细粒度冻结步态检测方法	帕金森病患者的冻结步态（FoG）事件	计算机视觉	帕金森病	NA	高阶多项式变换器（HP-Transformer）	图像	大型内部数据集
2288	2024-12-29	DSIL-DDI: A Domain-Invariant Substructure Interaction Learning for Generalizable Drug-Drug Interaction Prediction 2024-08, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3242656 PMID:37022856	研究论文	本文提出了一种名为DSIL-DDI的可插拔子结构交互模块，用于学习药物-药物相互作用（DDI）的领域不变表示，以提高DDI预测的泛化性和可解释性	DSIL-DDI模块能够从源领域学习领域不变的DDI表示，并在三种不同场景下进行测试，展示了其在OOD预测中的优势	未明确提及具体局限性	提高药物-药物相互作用（DDI）预测的泛化性和可解释性	药物-药物相互作用（DDI）	机器学习	NA	深度学习	DSIL-DDI	药物数据	未明确提及具体样本数量
2289	2024-12-29	Coupled Multimodal Emotional Feature Analysis Based on Broad-Deep Fusion Networks in Human-Robot Interaction 2024-07, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3236320 PMID:37021991	研究论文	提出了一种基于广深融合网络的耦合多模态情感特征分析方法（CMEFA），用于人机交互中的情感识别	使用广深融合网络（BDFN）提取面部和手势情感特征，并通过典型相关分析（CCA）分析双模态情感特征之间的相关性，建立耦合网络进行情感识别	未考虑特征贡献不平衡的问题	提高人机交互中多模态情感识别的准确率	面部表情和身体手势	自然语言处理	NA	典型相关分析（CCA）	广深融合网络（BDFN）	图像	双模态面部和身体手势数据库（FABO）及八名志愿者
2290	2024-12-29	Multiscale unsupervised network for deformable image registration 2024, Journal of X-ray science and technology IF:1.7Q3 DOI:10.3233/XST-240159 PMID:39240617	研究论文	本文提出了一种快速多尺度无监督变形图像配准方法（FMIRNet），用于单模态图像配准	设计了多尺度融合模块，结合并优化三个尺度的变形场，采用空间注意力机制逐像素加权位移场，并在训练阶段增加了结构相似性（ssim）度量以增强变形图像与固定图像之间的结构一致性	NA	提出一种快速多尺度无监督变形图像配准方法，用于单模态图像配准	单模态图像	计算机视觉	NA	NA	FMIRNet, FCN, UNet	图像	EchoNet, CHAOS, SLIVER数据集
2291	2024-12-29	A reconstruction method for ptychography based on residual dense network 2024, Journal of X-ray science and technology IF:1.7Q3 DOI:10.3233/XST-240114 PMID:39704747	研究论文	本文提出了一种基于残差密集网络的ptychography重建方法，旨在实现快速且鲁棒的重建	提出了一种基于ptychography双分支重建架构的密集残差双分支网络（RDenPtycho），并将ptychography的物理过程整合到网络训练中，以提高性能	未明确提及具体局限性	提出一种新的深度学习方法，以实现ptychography的快速且鲁棒的重建	ptychography数据集	计算机视觉	NA	深度学习	残差密集网络（RDenPtycho）	衍射图案	公开的ptychography数据集
2292	2024-12-29	Research on the effectiveness of multi-view slice correction strategy based on deep learning in high pitch helical CT reconstruction 2024, Journal of X-ray science and technology IF:1.7Q3 DOI:10.3233/XST-240128 PMID:39704749	研究论文	本研究探讨了基于深度学习的多视角切片校正策略在高螺距螺旋CT重建中的有效性	提出了一种数据驱动的切片校正策略，通过调整切片角度、数量和顺序来优化3D重建效果	未明确提及具体样本量及数据集的详细信息	探索高螺距螺旋扫描3D重建的最佳切片方法，为深度学习方法在临床中的应用提供有价值的见解	高螺距螺旋CT图像	计算机视觉	NA	深度学习	NA	3D图像	NA
2293	2024-12-29	A novel interpretable deep learning model for diagnosis in emergency department dyspnoea patients based on complete data from an entire health care system 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0311081 PMID:39729465	研究论文	本文设计了一种新型可解释的深度学习模型，用于急诊科呼吸困难患者的诊断	开发了一种名为CareNet的临床注意力循环编码网络，能够分析整个区域医疗系统的完整数据，并提供可解释的诊断支持	CareNet的敏感性在某些诊断上略低于CatBoost模型	设计一种诊断决策支持系统，用于急诊科呼吸困难患者的分类诊断	急诊科呼吸困难患者	机器学习	心血管疾病	深度学习	CareNet, CatBoost	临床数据	10,315例急诊科呼吸困难患者
2294	2024-12-29	Discovery of novel TACE inhibitors using graph convolutional network, molecular docking, molecular dynamics simulation, and Biological evaluation 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0315245 PMID:39729480	研究论文	本研究利用图卷积网络、分子对接、分子动力学模拟和生物评估，发现了一种新的TACE抑制剂	结合深度学习模型与传统药物筛选方法，成功识别出FDA批准药物中的新型TACE抑制剂	研究结果需要进一步的生物学实验验证，以确认Vorinostat在治疗炎症性疾病中的实际效果	识别针对TNF-α转化酶（TACE）的新型抑制剂，以用于治疗类风湿性关节炎等炎症性疾病	FDA批准的药物库	机器学习	类风湿性关节炎	图卷积网络、分子对接、分子动力学模拟	GraphConvMol	分子数据	DUD-E数据库中的活性化合物和诱饵化合物
2295	2024-12-28	Preictal period optimization for deep learning-based epileptic seizure prediction 2024-Dec-27, Journal of neural engineering IF:3.7Q2 DOI:10.1088/1741-2552/ad9ad0 PMID:39637549	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的癫痫发作预测方法，通过优化前发作期（OPP）来提高预测准确性	引入了新的度量方法来捕捉不同前发作期定义下的模型行为，并提出了一种以数据为中心的深度学习方法来确定最佳前发作期	跨患者和患者内部的预测时间异质性使得建立全局前发作期变得复杂	提高药物难治性癫痫患者的安全性和生活质量，通过准确预测癫痫发作	癫痫患者	机器学习	癫痫	深度学习	CNN-Transformer	EEG信号	使用公开的CHB-MIT数据集
2296	2024-12-28	Three-dimensional single-cell transcriptome imaging of thick tissues 2024-Dec-27, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.90029 PMID:39727221	研究论文	本文介绍了一种用于厚组织三维单细胞转录组成像的MERFISH方法	首次将MERFISH技术应用于厚度达200 µm的厚组织样本，并结合共聚焦显微镜和深度学习提高成像速度和质量	目前仅在小鼠脑组织切片上进行了验证，尚未在其他组织或物种中广泛应用	开发一种能够在厚组织中进行三维单细胞转录组成像的技术	小鼠脑组织切片	空间基因组学	NA	MERFISH, 共聚焦显微镜, 深度学习	深度学习	图像	小鼠脑组织切片，厚度达200 µm
2297	2024-12-28	Validation of a rapid algorithm for repeated intensity modulated radiation therapy dose calculations 2024-Dec-26, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/ad9f6a PMID:39681005	研究论文	本文验证了一种用于快速重复计算调强放射治疗（IMRT）剂量的算法的可行性	提出了一种不依赖深度学习模型的快速IMRT剂量计算算法，具有竞争性的速度和准确性	算法仅在特定设备（Elekta Unity MR-Linac）上进行了验证，未在其他设备上测试	验证一种快速重复计算IMRT剂量的算法的可行性	前列腺和肺癌的IMRT计划	放射治疗	前列腺癌, 肺癌	IMRT	NA	放射治疗计划数据	91例前列腺IMRT计划和20例肺癌IMRT计划
2298	2024-12-28	Development of a low-dose strategy for propagation-based imaging helical computed tomography (PBI-HCT): high image quality and reduced radiation dose 2024-Dec-26, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/ad9f66 PMID:39681007	研究论文	本研究开发了一种低剂量策略，用于螺旋采集模式的传播成像计算机断层扫描（PBI-HCT），以提高图像质量并减少辐射剂量	将Sparse2Noise（一种深度学习方法）与PBI-HCT成像策略性地结合，以减少辐射剂量而不影响图像质量	研究主要关注低密度材料的成像，尚未在更广泛的生物医学应用中验证	开发一种低剂量策略，用于PBI-HCT成像，以减少辐射剂量并保持高图像质量	低密度材料的成像	医学影像	NA	螺旋采集模式的传播成像计算机断层扫描（PBI-HCT）	卷积神经网络（CNN）	图像	NA
2299	2024-12-28	Diagnosis of intracranial aneurysms by computed tomography angiography using deep learning-based detection and segmentation 2024-Dec-26, Journal of neurointerventional surgery IF:4.5Q1 DOI:10.1136/jnis-2023-021022 PMID:38238009	研究论文	本文评估了一种名为VA-Unet的深度学习算法，用于高效检测和分割颅内动脉瘤	提出了一种新的深度学习算法VA-Unet，用于颅内动脉瘤的检测和分割	VA-Unet的检测召回率、假阳性率和分割准确性受到多种临床因素的影响，如动脉瘤大小、分叉动脉瘤以及动脉狭窄和蛛网膜下腔出血的存在	评估VA-Unet算法在头部CT血管造影图像中检测和分割颅内动脉瘤的效果	颅内动脉瘤	计算机视觉	颅内动脉瘤	CT血管造影	VA-Unet	图像	3190例CTA扫描，包含4124个颅内动脉瘤
2300	2024-12-28	Multimodal Flexible Sensor for the Detection of Pressing-Bending-Twisting Mechanical Deformations 2024-Dec-26, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.4c13941 PMID:39723727	研究论文	本文介绍了一种新型的多模态柔性传感器，能够检测按压、弯曲、扭转等多种机械变形	该传感器结合了光电、离子液体和导电织物三种传感单元，能够在极小空间内实现多达八种机械变形的检测，并采用基于Transformer的深度学习方法进行多模态信号的精确解耦	NA	开发一种能够检测多种机械变形的柔性传感器，以应用于智能穿戴和人机交互等领域	柔性传感器	传感器技术	NA	光电传感、离子液体传感、导电织物传感	Transformer	机械变形信号	NA