深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3081	2024-12-15	Deep learning for tooth identification and numbering on dental radiography: a systematic review and meta-analysis 2024-Jan-11, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twad001 PMID:38183164	综述	本文系统回顾和荟萃分析了深度学习在牙科放射图像中牙齿识别和编号的应用	深度学习模型在牙齿识别和编号方面表现出高精度和高准确性，能够增强复杂的自动化流程	研究仅包括了29篇符合条件的文献，可能存在选择偏倚	评估深度学习在牙科放射图像中牙齿识别和编号的应用效果	人类牙科放射图像中的牙齿识别和编号	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	29项研究
3082	2024-12-15	Comparison of deep learning methods for the radiographic detection of patients with different periodontitis stages 2024-Jan-11, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twad003 PMID:38214940	研究论文	本研究评估了使用深度学习方法在全景X光片上进行计算机辅助牙周分类骨丢失分期的准确性，并比较了不同模型和层的表现	本研究开发了一种新的基于DenseNet121 + GAP + mRMR的支持向量机模型，该模型在牙周骨丢失分类中表现优于其他模型，能够从原始图像中检测有效特征，无需手动选择	NA	评估深度学习方法在全景X光片上进行牙周分类骨丢失分期的准确性	全景X光片上的牙周骨丢失分期	计算机视觉	牙周病	深度学习	CNN	图像	2533张全景X光片，包括721张健康组，842张Stage1/2组，970张Stage3/4组
3083	2024-12-15	Automatic detection of posterior superior alveolar artery in dental cone-beam CT images using a deeply supervised multi-scale 3D network 2024-Jan-11, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twad002 PMID:38214942	研究论文	本研究开发了一种用于在牙科锥形束CT图像中自动检测后上牙槽动脉的深度监督多尺度3D网络	提出了多尺度深度监督的3D U-Net网络（3D U-Net MSDS），显著提高了后上牙槽动脉中心像素的定位精度	研究仅在150名受试者的数据上进行验证，样本量相对较小，可能影响模型的泛化能力	开发一种鲁棒且准确的深度学习网络，用于在牙科锥形束CT图像中检测后上牙槽动脉	后上牙槽动脉在牙科锥形束CT图像中的中心像素定位	计算机视觉	NA	深度学习	3D U-Net MSDS	图像	150名受试者的牙科锥形束CT数据
3084	2024-12-15	Coupled intelligent prediction model for medium- to long-term runoff based on teleconnection factors selection and spatial-temporal analysis 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0313871 PMID:39666703	研究论文	本文提出了一种基于遥相关因子选择和时空分析的耦合智能预测模型，用于中长期径流预测	本文创新性地结合了随机森林（RF）、支持向量回归（SVR）和多层感知器回归（MLPR），开发了两种耦合智能预测模型（RF-SVR和RF-MLPR），以提高预测精度和泛化能力	预测精度随着预测周期的延长而下降，表明长期预测由于不确定性增加和影响因素的累积而更具挑战性	提高中长期径流预测的准确性，为洪水控制、干旱缓解、水资源综合管理和生态恢复提供支持	雅砻江流域（YLRB）的中长期径流	水文学	NA	随机森林（RF）、支持向量回归（SVR）、多层感知器回归（MLPR）	耦合模型（RF-SVR和RF-MLPR）	径流数据	四个水文站点的数据
3085	2024-12-15	AMCFCN: attentive multi-view contrastive fusion clustering net 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.1906 PMID:39669450	研究论文	本文提出了一种名为AMCFCN的新型多视图聚类网络，通过对比注意策略有效提取多视图数据中的鲁棒特征	引入了对比注意策略，能够在减少噪声的同时保留视图完整性，并提取一致的多视图表示	未提及具体限制	改进多视图聚类技术，提高聚类结果的准确性	多视图数据中的视图特定表示和一致表示	机器学习	NA	多视图聚类	AMCFCN	多视图数据	四个多视图数据集
3086	2024-12-15	Detection of renal cell hydronephrosis in ultrasound kidney images: a study on the efficacy of deep convolutional neural networks 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.1797 PMID:39669452	研究论文	本研究探讨了深度卷积神经网络在超声肾脏图像中自动检测肾细胞肾积水的有效性	提出了创新的Novel DCNN模型，在肾细胞肾积水检测中表现出色，准确率达到99.8%	需要进一步探索更大和更多样化的数据集以及不同的优化策略来提升模型的收敛率和准确性	利用深度学习模型自动检测超声图像中的肾细胞肾积水	超声肾脏图像中的肾细胞肾积水	计算机视觉	肾脏疾病	深度学习	DCNN	图像	NA
3087	2024-12-15	Double-target self-supervised clustering with multi-feature fusion for medical question texts 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2075 PMID:39669457	研究论文	本文提出了一种双目标自监督聚类与多特征融合的方法，用于医疗问题文本的聚类	本文创新性地融合了词频和词汇语义信息，并引入了自注意力机制来计算文本中每个词的权重，同时构建了两个目标函数来实现跨文档主题特征的融合	NA	构建一个端到端的文本聚类模型，以更好地表示医疗问题文本的信息	医疗领域中的问题文本	自然语言处理	NA	自监督学习	自注意力机制	文本	NA
3088	2024-12-15	Deep ocular tumor classification model using cuckoo search algorithm and Caputo fractional gradient descent 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.1923 PMID:39669458	研究论文	本研究提出了一种结合Caputo分数梯度下降和布谷鸟搜索算法的优化器，用于提高眼肿瘤分类的准确性和收敛速度	创新点在于将Caputo分数梯度下降方法与布谷鸟搜索算法结合，提出了一种新的优化器，显著提高了分类准确性和收敛速度	研究仅使用了400张眼底图像进行训练和评估，样本量相对较小，可能影响模型的泛化能力	旨在开发一种用于眼肿瘤分类的鲁棒深度学习系统，并提出一种新的优化器以提高分类性能	研究对象为眼底图像中的良性和恶性眼肿瘤	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	400张眼底图像，分为良性和恶性两类
3089	2024-12-15	Automated generation of process simulation scenarios from declarative control-flow changes 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2094 PMID:39669460	研究论文	本文提出了一种自动化生成业务流程模拟场景的方法，允许用户以声明方式指定控制流变化，并自动生成假设场景	本文的创新点在于使用生成式深度学习模型来自动生成符合用户指定控制流变化的模拟场景，从而简化了手动调整模拟模型的复杂性	本文的局限性在于数据驱动模拟方法在追求准确性时可能生成过于复杂的模型，增加了手动调整的难度	本文的研究目的是简化业务流程模拟中手动调整模拟模型的复杂性，特别是涉及控制流变化的场景	本文的研究对象是业务流程模拟模型及其在控制流变化下的调整	机器学习	NA	生成式深度学习模型	生成式深度学习模型	事件日志	NA
3090	2024-12-15	Deep learning-based information retrieval with normalized dominant feature subset and weighted vector model 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.1805 PMID:39669463	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的信息检索方法，使用归一化主导特征子集和加权向量模型进行特征提取和选择	提出了归一化主导特征子集和加权向量模型（NDFS-WVM），用于从大数据中进行信息检索，并展示了其在文本检索中的优越性能	需要大规模数据集进行训练，且手动创建有效特征集的过程较为耗时	改进信息检索中的特征提取和选择方法，提高文本检索的准确性	多媒体数据中的文本信息	自然语言处理	NA	深度学习	NDFS-WVM	文本	大规模数据集，包含数百万变量
3091	2024-12-15	Performance enhancement in hydroponic and soil compound prediction by deep learning techniques 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2101 PMID:39669468	研究论文	本文提出了一种利用深度学习技术预测水培和土壤化合物动态的创新方法，以提高作物生产的可持续性和效率	本文创新性地利用深度学习技术预测水培和土壤化合物动态，采用迭代辅助增强母优化算法（IEMOA）获取权重特征，并通过多尺度特征融合卷积自编码器与门控循环单元（MS-CAGRU）网络进行预测	本文未提及具体的实验验证或实际应用效果，仅通过与传统模型的对比展示系统效能	开发数值模型以全面描述植物和土壤中化学物质的传输和反应，制定有效的缓解策略	水培和土壤化合物动态	机器学习	NA	深度学习	MS-CAGRU	数据	数据来自在线资源，具体样本量未提及
3092	2024-12-15	Demand prediction for urban air mobility using deep learning 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.1946 PMID:39669473	研究论文	本文研究了城市空中交通（UAM）需求预测问题，提出了一种基于深度学习的时间序列预测模型	本文首次使用Transformer模型进行UAM需求预测，并展示了其高性能	本文仅使用了单一的基准数据集，可能无法全面反映不同城市和地区的实际情况	探讨市场是否能够支持UAM的部署，并通过需求预测为决策者提供投资可行性和可行性分析	城市空中交通（UAM）的需求预测	机器学习	NA	深度学习	Transformer	时间序列数据	150,000条记录
3093	2024-12-15	A bigura-based real time sentiment analysis of new media 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2069 PMID:39669474	研究论文	本文提出了一种基于BiGura多层模型的实时情感检测技术，用于新媒体数据的情感分析	本文采用了深度学习技术，相较于传统的贝叶斯和KNN分类器，在情感分析中表现出显著优势，分类准确率分别提高了3.88%和4.33%	NA	实现更准确和实时的公众情感监测和舆论监控	新媒体数据中的文本和视频内容的情感分析	自然语言处理	NA	深度学习	BiGura	文本和视频	涉及不同病毒事件的案例，如加沙的入侵事件
3094	2024-12-15	LRMAHpan: a novel tool for multi-allelic HLA presentation prediction using Resnet-based and LSTM-based neural networks 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1478201 PMID:39669561	研究论文	本文介绍了一种名为LRMAHpan的新工具，用于使用基于Resnet和LSTM的神经网络进行多等位基因HLA呈递预测	LRMAHpan整合了LSTM网络和ResNet_CA网络，采用了一种新的pHLA编码方法，能够将新抗原预测任务集成到计算机视觉方法中，并有效捕捉结合信号	NA	开发一种能够准确预测多等位基因HLA呈递的工具，以促进新抗原疫苗设计	多等位基因HLA呈递预测和新抗原预测	计算机视觉	黑色素瘤	质谱数据	ResNet, LSTM	图像	转移性黑色素瘤患者队列
3095	2024-12-15	Integrative computational analyses implicate regulatory genomic elements contributing to spina bifida 2024, Genetics in medicine open DOI:10.1016/j.gimo.2024.101894 PMID:39669613	研究论文	本研究通过整合计算分析，揭示了与脊柱裂相关的调控基因组元件	本研究采用了一种无靶向的全基因组方法，结合深度学习优先框架，识别了与脊柱裂相关的罕见单核苷酸和拷贝数变异，并揭示了这些变异对基因表达和功能通路的影响	本研究主要集中在罕见变异和调控区域的分析，可能忽略了其他类型的遗传变异对脊柱裂的影响	旨在揭示脊柱裂病理生理学背后的全基因组调控特征	脊柱裂患者和健康对照组的基因组调控区域	基因组学	脊柱裂	深度学习	NA	基因组数据	脊柱裂患者和健康对照组的样本
3096	2024-12-15	Explainable light-weight deep learning pipeline for improved drought stress identification 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1476130 PMID:39670267	研究论文	本文提出了一种用于识别马铃薯作物干旱胁迫的可解释轻量级深度学习管道	创新点在于结合预训练网络与精心设计的自定义层，并集成了基于梯度的可视化技术（如Grad-CAM），增强了模型的可解释性	NA	旨在提高作物干旱胁迫的识别精度，并为实时农业应用提供可解释的深度学习模型	马铃薯作物的干旱胁迫	计算机视觉	NA	深度学习	DenseNet121	图像	NA
3097	2024-12-14	VAEEG: Variational auto-encoder for extracting EEG representation 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120946 PMID:39571641	研究论文	本文提出了一种基于变分自编码器（VAE）的EEG信号自监督学习模型VAEEG，用于提取脑活动的有用表示	VAEEG模型在EEG信号的重建性能上表现出色，并能有效提取与青少年脑发育、癫痫发作和睡眠阶段分类相关的潜在特征	NA	研究如何从复杂的EEG信号中提取更直观、简洁且有用的脑活动表示	EEG信号及其在青少年脑发育、癫痫发作和睡眠阶段分类中的应用	机器学习	NA	变分自编码器（VAE）	变分自编码器（VAE）	脑电图（EEG）信号	NA
3098	2024-12-14	Deep learning applied to the segmentation of rodent brain MRI data outperforms noisy ground truth on full-fledged brain atlases 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120934 PMID:39577575	研究论文	本文研究了深度学习模型在啮齿动物脑部MRI数据分割中的应用，发现其性能优于基于噪声标签的全脑图谱	本文首次展示了深度学习模型在啮齿动物脑部MRI数据分割中的应用，能够处理不同动物品系和尺寸的变化，并提供了不确定性估计和可解释性机制	本文仅在啮齿动物脑部MRI数据上进行了验证，尚未在其他类型的脑部图像或其他物种上进行测试	研究深度学习模型在啮齿动物脑部MRI数据分割中的应用，以提高定量分析的准确性	啮齿动物脑部MRI图像的自动分割	计算机视觉	NA	MRI	U-Net, Attention-U-Net, DeepLab	图像	超过10,000张啮齿动物脑部MRI图像
3099	2024-12-14	Generative modeling of the Circle of Willis using 3D-StyleGAN 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120936 PMID:39586344	研究论文	本文使用3D-StyleGAN生成Circle of Willis的Time-of-Flight磁共振血管成像（TOF MRA）数据，以解决医学数据稀缺问题	本文首次将StyleGANv2架构应用于3D，生成高质量且多样化的TOF MRA数据，并在下游任务中展示了其效用	本文未提及生成数据在其他病理数据集或不同医学成像模式中的应用效果	开发一种生成模型，用于合成Circle of Willis的3D TOF MRA数据，以提高深度学习模型在脑血管疾病诊断和治疗中的应用	Circle of Willis的脑血管结构	计算机视觉	脑血管疾病	3D-StyleGAN	StyleGANv2	图像	1782个TOF MRA扫描数据
3100	2024-12-14	Differentiating atypical parkinsonian syndromes with hyperbolic few-shot contrastive learning 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120940 PMID:39586345	研究论文	本文提出了一种新的少样本学习框架，用于在有限的训练数据下区分多系统萎缩帕金森型（MSA-P）和进行性核上性麻痹（PSP）	本文引入了超曲面空间嵌入技术，通过识别非目标分类类别的铁积累模式特征区域，增强了模型的稳定性	本文的实验结果主要基于特定的数据集和模型，可能需要进一步验证其在其他数据集和场景中的泛化能力	解决在有限训练数据下区分非典型帕金森综合征（APS）中不同亚型的挑战	多系统萎缩帕金森型（MSA-P）和进行性核上性麻痹（PSP）	机器学习	神经退行性疾病	少样本学习	对比学习	图像	少量数据样本