深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
3181	2025-04-06	Artificial Intelligence (AI)-Based Computer-Assisted Detection and Diagnosis for Mammography: An Evidence-Based Review of Food and Drug Administration (FDA)-Cleared Tools for Screening Digital Breast Tomosynthesis (DBT) 2024-Aug, AI in precision oncology DOI:10.1089/aipo.2024.0022 PMID:40182614	综述	本文回顾了基于人工智能的计算机辅助检测和诊断工具在数字乳腺断层合成摄影筛查中的应用及其FDA批准情况	总结了新一代深度学习AI工具在乳腺筛查中的潜力，并评估了FDA批准的六种AI工具的性能	现有证据有限，仅包括两项小规模的实施后临床研究，需要更多前瞻性研究来全面评估影响	评估AI在数字乳腺断层合成摄影筛查中的应用效果	FDA批准的六种基于AI的计算机辅助检测/诊断工具	数字病理学	乳腺癌	深度学习	NA	医学影像	多项多读者多病例研究、回顾性分析和两项真实世界评估	NA	NA	NA	NA
3182	2025-04-06	DM-Fusion: Deep Model-Driven Network for Heterogeneous Image Fusion 2024-Jul, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3238511 PMID:37022081	research paper	本文提出了一种深度模型驱动的神经网络DM-Fusion，用于解决异构图像融合问题，结合了基于模型技术的可解释性和深度学习方法的一般化能力	设计了一种深度模型驱动的神经网络，结合了模型技术的可解释性和深度学习方法的泛化能力，提出了任务驱动的损失函数策略以实现特征增强和保留	未提及具体局限性	解决异构图像融合问题，提升融合质量和效率	异构图像	computer vision	NA	deep learning	CNN	image	未提及具体样本数量	NA	NA	NA	NA
3183	2025-04-06	Invertible Residual Blocks in Deep Learning Networks 2024-Jul, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3238397 PMID:37022256	research paper	本文研究了深度学习中可逆残差块的条件，并提出了相应的逆算法	提出了残差块可逆的充分必要条件，并针对广泛使用的卷积残差块，展示了在弱条件下通过特定零填充方法实现可逆性	研究仅针对包含一层ReLU的残差块，未涉及更复杂的网络结构	探索深度学习中残差块的可逆性条件及其应用	深度学习网络中的残差块	machine learning	NA	NA	CNN	NA	NA	NA	NA	NA	NA
3184	2025-04-06	TSRNet: A Dual-Stream Network for Refining 3D Tooth Segmentation 2024-Jun-18, IEEE transactions on visualization and computer graphics IF:4.7Q1 DOI:10.1109/TVCG.2024.3413345 PMID:38889041	research paper	提出了一种名为TSRNet的双流网络，用于优化现有3D牙齿分割算法的粗糙分割结果	通过双流网络TSRNet结合边界图和距离图的信息，迭代优化粗糙分割的边界	未提及具体的数据集规模或计算资源需求	改进3D牙齿分割的边界精度	3D牙齿分割结果	computer vision	NA	deep learning	TSRNet (dual-stream network)	3D image	NA	NA	NA	NA	NA
3185	2025-04-06	Machine Learning Prediction of Lymph Node Metastasis in Breast Cancer: Performance of a Multi-institutional MRI-based 4D Convolutional Neural Network 2024-05, Radiology. Imaging cancer DOI:10.1148/rycan.230107 PMID:38607282	research paper	开发了一种基于多机构MRI数据的4D卷积神经网络模型，用于无创预测乳腺癌淋巴结转移	提出了一种结合动态图像时间信息的4D CNN模型，整合临床病理指标以提高预测性能	研究为回顾性设计，样本量相对有限（350例患者）	开发深度学习模型预测乳腺癌淋巴结转移状态	新诊断的原发性浸润性乳腺癌患者	digital pathology	breast cancer	dynamic contrast-enhanced (DCE) breast MRI	4D CNN	MRI图像	350例女性患者（平均年龄51.7±11.9岁）	NA	NA	NA	NA
3186	2025-10-07	Targeted-BEHRT: Deep Learning for Observational Causal Inference on Longitudinal Electronic Health Records 2024-04, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2022.3183864 PMID:35737602	研究论文	开发基于Transformer的深度学习模型T-BEHRT，结合双重稳健估计方法，从纵向电子健康记录中进行观察性因果推断	首次将Transformer架构与双重稳健估计相结合用于EHR因果推断，在存在多种混杂因素情况下能更准确估计风险比	仅在抗高血压药物与癌症风险的特定关联上进行验证，需要进一步测试在其他临床场景的适用性	开发能够从观察性电子健康记录中得出无混杂因果结论的深度学习方法	抗高血压药物类别与癌症发病风险的因果关系	机器学习	心血管疾病	电子健康记录分析	Transformer	纵向电子健康记录	NA	NA	Transformer, T-BEHRT	绝对误差和, 风险比	NA
3187	2025-10-07	A Comprehensive Survey on Community Detection With Deep Learning 2024-Apr, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2021.3137396 PMID:35263257	综述	本文对深度学习在社区检测领域的最新进展进行了全面综述	提出了新的分类法系统梳理深度学习社区检测方法，涵盖深度神经网络、深度非负矩阵分解和深度稀疏过滤等前沿技术	作为综述文章，不包含原始实验验证，主要依赖现有文献分析	系统梳理和总结深度学习在社区检测领域的研究现状和发展趋势	网络数据中的社区结构	机器学习	NA	深度学习	CNN, GAN, 图注意力网络, 自编码器	网络数据	NA	NA	卷积网络, 图注意力网络, 生成对抗网络, 自编码器	NA	NA
3188	2025-10-07	Probabilistic Causal Effect Estimation With Global Neural Network Forecasting Models 2024-Apr, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2022.3190984 PMID:35853064	研究论文	提出一种结合概率预测与全局深度学习模型的新方法DeepProbCP，用于估计干预措施对多个处理单元的因果效应	首次将概率预测与全局深度学习模型结合用于因果效应估计，通过估计反事实时间序列概率分布而非仅点预测，能捕捉分布尾部或方差的变化	方法依赖于时间序列属性和大规模相关时间序列数据，在数据稀缺场景下可能受限	开发更准确的因果效应估计方法，特别适用于干预措施影响分布尾部或方差而非均值的情况	多个处理单元的时间序列数据	机器学习	NA	深度学习时间序列预测	RNN	时间序列数据	大规模相关时间序列集合	NA	自回归循环神经网络	分位数预测精度	NA
3189	2025-10-07	A Comprehensive Framework for Long-Tailed Learning via Pretraining and Normalization 2024-Mar, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2022.3192475 PMID:35895650	研究论文	提出通过对比预训练和特征归一化改进长尾学习特征提取器和分类器的综合框架	提出平衡对比损失和快速对比初始化方案改进长尾预训练，并提出包含广义归一化和分组可学习缩放的新型广义归一化分类器	NA	改进长尾识别中的特征提取器和分类器性能	视觉数据中的长尾分布	计算机视觉	NA	对比学习	深度学习	图像	NA	NA	NA	准确率, 效率	NA
3190	2025-04-06	Toward Blind Flare Removal Using Knowledge-Driven Flare-Level Estimator 2024, IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society IF:10.8Q1 DOI:10.1109/TIP.2024.3480696 PMID:39437280	研究论文	本文提出了一种基于知识驱动的盲光斑去除方法，通过光斑级别估计器和调制器来提升网络在训练和测试阶段的适应性	提出了一种新的盲光斑去除视角，设计了光斑级别估计器和调制器，以及光斑感知块，用于更准确的光斑识别和重建	合成数据与真实数据之间的偏差仍然存在，且光斑的混合机制依赖于多种不确定因素	解决盲光斑去除任务中的挑战，提升图像去光斑的效果	光斑污染的图像及其无光斑对应图像	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	三个基准数据集和一个新收集的真实世界光斑数据集WiderFlare	NA	NA	NA	NA
3191	2025-10-07	Preoperative Ultrasound Radomics to Predict Posthepatectomy Liver Failure in Patients With Hepatocellular Carcinoma 2024-Dec, Journal of ultrasound in medicine : official journal of the American Institute of Ultrasound in Medicine IF:2.1Q2 DOI:10.1002/jum.16559 PMID:39177192	研究论文	开发基于双模态超声特征和临床指标的深度学习模型预测肝细胞癌患者肝切除术后肝功能衰竭风险	提出融合双模态超声图像和临床指标的深度学习模型PHLF-Net，采用渐进式训练策略和多中心验证	研究仅针对乙型肝炎相关肝细胞癌患者，样本量相对有限	预测肝细胞癌患者肝切除术后肝功能衰竭风险	532例接受肝切除术的肝细胞癌患者	医学影像分析	肝细胞癌	二维剪切波弹性成像，B超成像	深度学习	超声图像，临床数据	532例患者（来自5家医院），其中147例发生PHLF	NA	ResNet50	AUC	NA
3192	2025-04-05	RiceSNP-ABST: a deep learning approach to identify abiotic stress-associated single nucleotide polymorphisms in rice 2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae702 PMID:39757606	研究论文	提出了一种名为RiceSNP-ABST的深度学习模型，用于识别水稻中与非生物胁迫相关的单核苷酸多态性（SNPs）	开发了一种新的负样本构建策略，提出了四种基于DNA序列片段的特征编码方法，并采用带有残差连接的卷积神经网络进行预测	高质量的水稻非生物胁迫相关数据稀缺，可能影响模型的泛化能力	开发预测模型以识别水稻中与非生物胁迫相关的SNPs，助力水稻抗性品种的培育	水稻中的单核苷酸多态性（SNPs）	机器学习	NA	全基因组关联研究（GWAS）	CNN	DNA序列	NA	NA	NA	NA	NA
3193	2025-04-05	GPS-pPLM: A Language Model for Prediction of Prokaryotic Phosphorylation Sites 2024-11-08, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13221854 PMID:39594603	research paper	介绍了一个名为GPS-pPLM的在线服务器，用于预测原核生物中的磷酸化位点	结合了transformer和深度神经网络两种深度学习方法，整合了10种序列特征和上下文特征，构建了针对特定磷酸化残基类型和物种的预测模型	NA	预测原核生物中的磷酸化位点	原核生物中的磷酸化位点	natural language processing	NA	transformer, deep neural network	transformer, DNN	protein sequences	44,839个非冗余磷酸化位点，来自16,041个蛋白质和95种原核生物	NA	NA	NA	NA
3194	2025-10-07	An All-in-One Array of Pressure Sensors and sEMG Electrodes for Scoliosis Monitoring 2024-11, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202404136 PMID:39115097	研究论文	开发了一种集成压力传感器和表面肌电电极的一体化阵列，用于脊柱侧弯监测	基于分层MXene/壳聚糖/PDMS/聚氨酯海绵和MXene/聚酰亚胺材料，开发了具有高灵敏度和稳定性的集成传感器阵列	NA	解决传统医学影像方法无法提供实时反馈的问题，提高脊柱侧弯治疗效率	脊柱侧弯患者	医疗传感器	脊柱侧弯	压力传感，表面肌电信号采集	深度学习	压力数据，肌电信号，运动数据	NA	NA	NA	灵敏度，线性检测范围，稳定性循环次数	NA
3195	2025-10-07	Global research evolution and frontier analysis of artificial intelligence in brain injury: A bibliometric analysis 2024-04, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2024.110920 PMID:38453035	文献计量分析	通过文献计量学方法分析人工智能在脑损伤领域的研究演进与前沿趋势	首次系统梳理人工智能在脑损伤领域的全球研究演进历程，识别研究热点并揭示该领域发展的波动特征	仅基于Web of Science核心数据库的3000篇文献，缺乏研究团队间的合作交流分析	识别人工智能在脑损伤领域的研究热点和前沿趋势	1998-2023年间Web of Science核心数据库收录的3000篇相关文献	文献计量学	脑损伤	文献计量分析，可视化分析	NA	文献数据	3000篇学术论文	VOSviewer, CiteSpace	NA	NA	NA
3196	2025-04-04	Multicenter investigation of preoperative distinction between primary central nervous system lymphomas and glioblastomas through interpretable artificial intelligence models 2024-Nov, Neuroradiology IF:2.4Q2 DOI:10.1007/s00234-024-03451-7 PMID:39225815	research paper	本研究通过可解释的人工智能模型，基于MRI图像对原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）和胶质母细胞瘤（GBM）进行术前区分	结合了放射组学模型和深度学习模型，提出了最优的Max-Fusion模型，并利用SHAP和Grad-CAM进行可解释性分析	研究为回顾性分析，样本量相对有限（261例患者），且仅来自两个医疗中心	探索基于MRI的深度学习和放射组学模型在术前区分PCNSL和GBM中的有效性和适用性	261例PCNSL和GBM患者的MRI图像和临床数据	digital pathology	brain tumor	MRI	MobileVIT, ConvNeXt, Max-Fusion Model	image	261例患者（训练集153例，外部测试集108例）	NA	NA	NA	NA
3197	2025-04-04	Evaluating Deep Learning Techniques for Detecting Aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage: A Comparative Analysis of Convolutional Neural Network and Transfer Learning Models 2024-07, World neurosurgery IF:1.9Q2 DOI:10.1016/j.wneu.2024.04.168 PMID:38710407	研究论文	本研究评估了卷积神经网络（CNN）和基于CNN的迁移学习模型在区分动脉瘤性蛛网膜下腔出血（SAH）和非动脉瘤性SAH中的有效性	采用迁移学习方法缓解了传统技术的时间限制，并展示了优越的性能	NA	评估深度学习技术在SAH检测中的有效性	动脉瘤性SAH和非动脉瘤性SAH患者	数字病理学	心血管疾病	深度学习	CNN, Inception-V3, EfficientNetB4	医学影像	203名患者（123名动脉瘤性SAH和80名非动脉瘤性SAH），共23,393张DICOM图像	NA	NA	NA	NA
3198	2025-04-04	Deepdefense: annotation of immune systems in prokaryotes using deep learning 2024-Jan-02, GigaScience IF:11.8Q1 DOI:10.1093/gigascience/giae062 PMID:39388605	研究论文	使用深度学习对原核生物中的免疫系统进行注释和分类	开发了名为Deepdefense的算法，通过深度学习模型预测免疫系统相关蛋白，并结合校准方法提高准确性，能够识别已知和潜在的新型免疫系统蛋白	现有方法通常基于封闭世界假设，而基因组学中新样本的出现可能超出训练数据范围	开发一种自动检测和分类原核生物免疫系统蛋白的算法	原核生物（古菌和细菌）的免疫系统蛋白	机器学习	NA	深度学习	神经网络	基因组数据	NA	NA	NA	NA	NA
3199	2025-04-03	Understanding the role of machine learning in predicting progression of osteoarthritis 2024-Nov-01, The bone & joint journal DOI:10.1302/0301-620X.106B11.BJJ-2024-0453.R1 PMID:39481441	系统综述	本文通过系统综述探讨了机器学习在预测骨关节炎进展中的作用	揭示了机器学习模型在预测骨关节炎进展中的可行性及当前临床应用的局限性	评估指标缺乏标准化，外部验证有限，临床适用性受限	探讨机器学习在预测骨关节炎进展中的应用及其潜力	骨关节炎（OA）患者	机器学习	骨关节炎	机器学习算法	深度学习，自动化机器学习	临床、放射学和生化数据	39项研究（初始筛选1,160项）	NA	NA	NA	NA
3200	2025-04-03	Automated detection of Bornean white-bearded gibbon (Hylobates albibarbis) vocalizations using an open-source framework for deep learning 2024-09-01, The Journal of the Acoustical Society of America IF:2.1Q1 DOI:10.1121/10.0028268 PMID:39248557	research paper	本文介绍了一个开源深度学习框架，用于自动检测婆罗洲白须长臂猿的鸣叫，以解决大规模声学数据分析的瓶颈问题	采用开源深度学习框架自动检测特定物种的鸣叫，显著减少分析时间，且检测结果与人工标注无显著差异	未来需要将该模型应用于长期声学数据集以了解鸣叫活动的时空变化	开发一个自动检测濒危物种鸣叫的深度学习框架，以促进声学监测	婆罗洲白须长臂猿（Hylobates albibarbis）的鸣叫	bioacoustics	NA	deep learning	neural network	audio recordings	90小时的手动标注音频记录	NA	NA	NA	NA