深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5341	2024-10-15	A lightweight defect detection algorithm for escalator steps 2024-Oct-11, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-74320-9 PMID:39394361	研究论文	提出了一种高效的电梯台阶缺陷检测算法ASF-Sim-YOLO，解决了检测网络模型参数过多、适应性差和视频流实时处理困难的问题	设计了ASF-Sim-P2结构以提高小目标检测精度，结合SimAM与SPPF增强模型捕捉关键信息的能力，采用NWD替代传统的CIoU损失函数，并对模型进行通道剪枝以满足移动设备部署需求	NA	开发一种轻量级且高效的电梯台阶缺陷检测算法	电梯台阶缺陷	计算机视觉	NA	目标检测	YOLO	视频	测试数据集上的平均精度(mAP50)为96.8%，比基线模型提高了22.1%，模型计算复杂度(GFLOPS)降低到基线模型的四分之一，帧率(FPS)提高到575.1
5342	2024-10-15	A comparative study on automatic treatment planning for online adaptive proton therapy of esophageal cancer: which combination of deformable registration and deep learning planning tools performs the best? 2024-Oct-10, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad80f6 PMID:39332445	研究论文	本文比较了四种在线自适应质子治疗（OAPT）策略在食管癌治疗计划中的表现，评估了变形图像配准（DIR）和深度学习（DL）工具的组合效果	本文首次系统地比较了四种OAPT策略，并展示了DL-DEF和DL-DL在10分钟内实现OAPT的潜力	在某些情况下，目标体积的分割错误导致剂量下降，需要进一步改进分割算法	评估和比较不同变形图像配准和深度学习工具组合在食管癌在线自适应质子治疗中的效果	食管癌患者的在线自适应质子治疗计划	计算机视觉	食管癌	变形图像配准（DIR），深度学习（DL）	nnU-Net	图像	17名食管癌患者
5343	2024-10-15	Comparison of deep-learning multimodality data fusion strategies in mandibular osteoradionecrosis NTCP modelling using clinical variables and radiation dose distribution volumes 2024-Oct-10, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad8290 PMID:39357529	研究论文	本文比较了不同深度学习多模态数据融合策略在颌骨放射性骨坏死NTCP模型中的应用	首次比较了早期、联合和晚期多模态数据融合策略在深度学习NTCP模型中的应用	晚期融合策略虽然技术复杂度较低，但缺乏关键的模态间交互作用	探讨不同多模态数据融合策略在深度学习NTCP模型中的有效性	颌骨放射性骨坏死的NTCP模型	机器学习	NA	深度学习	3D DenseNet-40	图像数据和临床数据	92例放射性骨坏死病例和92例对照组
5344	2024-10-15	Deep learning-based detection of affected body parts in Parkinson's disease and freezing of gait using time-series imaging 2024-10-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-75445-7 PMID:39390087	研究论文	提出了一种基于卷积神经网络的时间序列图像深度学习方法，用于检测帕金森病和冻结步态中受影响的身体部位	利用时间序列图像和卷积神经网络进行帕金森病和冻结步态中受影响身体部位的检测和区分	NA	开发一种辅助工具，用于评估帕金森病的严重程度和冻结步态	帕金森病患者和冻结步态患者在360°转身任务中的身体部位检测	计算机视觉	神经退行性疾病	卷积神经网络	CNN	时间序列图像	90名参与者，包括60名帕金森病患者（30名冻结步态患者和30名非冻结步态患者）和30名年龄匹配的老年人（对照组）
5345	2024-10-15	Electrocardiogram-based deep learning to predict mortality in paediatric and adult congenital heart disease 2024-Oct-10, European heart journal IF:37.6Q1 DOI:10.1093/eurheartj/ehae651 PMID:39387652	研究论文	本研究利用基于心电图的深度学习模型预测小儿和成人先天性心脏病患者的5年死亡率	本研究开发了一种人工智能增强的心电图工具，用于跨年龄段的先天性心脏病患者的风险分层，并展示了其在不同亚组中的优越性能	本研究仅限于波士顿儿童医院的心电图数据，未来需要进一步验证和扩展到其他人群和机构	开发一种基于心电图的深度学习模型，用于预测小儿和成人先天性心脏病患者的5年死亡率，以实现便捷且有效的风险分层	小儿和成人先天性心脏病患者	机器学习	先天性心脏病	卷积神经网络	CNN	心电图	训练集和测试集分别包含112,804和112,575份心电图数据，涉及39,784名患者，年龄范围为0-92岁
5346	2024-10-15	DETECTION OF ORAL SQUAMOUS CELL CARCINOMA USING PRE-TRAINED DEEP LEARNING MODELS 2024-Oct-09, Experimental oncology DOI:10.15407/exp-oncology.2024.02.119 PMID:39396172	研究论文	本文研究了使用预训练深度学习模型检测口腔鳞状细胞癌的方法	本文提出了一种基于迁移学习的预训练分类模型和卷积神经网络（CNN）用于口腔鳞状细胞癌的二分类	本文的实验数据集较小，且仅限于口腔鳞状细胞癌的检测	评估使用迁移学习方法和预训练模型在口腔鳞状细胞癌早期诊断中的应用	口腔鳞状细胞癌的组织病理学图像	计算机视觉	口腔癌	迁移学习	CNN	图像	5192张组织病理学图像
5347	2024-10-15	[Accelerated musculoskeletal magnetic resonance imaging with deep learning-based image reconstruction at 0.55 T-3 T] 2024-Oct, Radiologie (Heidelberg, Germany) DOI:10.1007/s00117-024-01325-w PMID:38864874	研究论文	本文探讨了使用深度学习技术加速肌肉骨骼磁共振成像（MRI）重建的方法	引入深度学习（DL）算法进行图像重建，以减少信噪比、空间分辨率和图像采集时间之间的相互依赖性，并允许使用更高的加速因子	NA	提高肌肉骨骼MRI的效率、患者舒适度、访问性和价值，同时保持高诊断准确性	肌肉骨骼系统的MRI图像重建	计算机视觉	NA	磁共振成像（MRI）	深度学习（DL）	图像	NA
5348	2024-10-15	Enhancing the analysis of murine neonatal ultrasonic vocalizations: Development, evaluation, and application of different mathematical models 2024-Oct-01, The Journal of the Acoustical Society of America IF:2.1Q1 DOI:10.1121/10.0030473 PMID:39400270	研究论文	本文系统评估了不同类型的神经网络用于小鼠新生超声发声（USV）分类的效果	首次系统评估了多种神经网络架构在USV分类中的适用性，并确定了最适合的架构	NA	确定最适合分析小鼠新生超声发声的神经网络架构	小鼠新生超声发声的分类	机器学习	NA	深度学习	卷积神经网络（CNN）	音频	NA
5349	2024-10-15	Comprehensive Characterization of Tissue Mineralization in an Ex Vivo Model 2024-Sep-27, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/67235 PMID:39400183	研究论文	本文提出了一种全面评估新骨形成的工作流程，使用相关的大型动物骨体外移植模型	本文创新性地结合了多种分析方法，包括微CT、深度学习图像分析、纳米压痕、组织学检查、背散射扫描电子显微镜和拉曼光谱，以全面评估新形成的骨组织	本文的局限性在于其研究对象仅限于羊的股骨头移植模型，可能无法完全代表所有骨再生情况	本文旨在通过多模态分析方法，全面评估新形成的骨组织，并标准化这些协议以促进研究间的比较和提高研究结果的有效性和可靠性	本文的研究对象是羊的股骨头移植模型中新形成的骨组织	数字病理学	NA	微CT、深度学习、纳米压痕、组织学检查、背散射扫描电子显微镜、拉曼光谱	深度学习	图像	1个羊的股骨头移植模型
5350	2024-10-15	DELR-Net: a network for 3D multimodal medical image registration in more lightweight application scenarios 2024-Sep-26, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-024-04602-3 PMID:39400589	研究论文	本文设计了一种用于3D多模态医学图像配准的轻量级网络DELR-Net	DELR-Net通过集成Mamba和ConvNet，使用状态空间序列模块和动态大核块作为双编码器的主要组件，动态特征融合块作为解码器的主要组件，实现了高质量的配准结果并减少了参数数量	NA	设计一种在保证高质量配准结果的同时减少参数数量的3D多模态医学图像配准网络	3D脑部MR图像和腹部MR及CT图像	计算机视觉	NA	深度学习	DELR-Net	图像	3D脑部MR图像和腹部MR及CT图像
5351	2024-10-15	ECG-Image-Database: A Dataset of ECG Images with Real-World Imaging and Scanning Artifacts; A Foundation for Computerized ECG Image Digitization and Analysis 2024-Sep-25, ArXiv PMID:39398215	研究论文	介绍了一个名为ECG-Image-Database的大型多样化心电图图像数据集，包含真实世界的扫描和成像伪影	首次创建了一个包含真实世界伪影的高保真合成心电图图像数据集，为心电图图像数字化和分析提供了基础	NA	开发和提供一个用于心电图图像数字化和分类的机器学习和深度学习模型的基础数据集	心电图图像及其数字化	计算机视觉	NA	ECG-Image-Kit	NA	图像	35,595张软件标记的心电图图像
5352	2024-10-15	PredPSP: a novel computational tool to discover pathway-specific photosynthetic proteins in plants 2024-Sep-24, Plant molecular biology IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s11103-024-01500-6 PMID:39316155	研究论文	介绍了一种名为PredPSP的新型计算工具，用于发现植物中特定途径的光合作用蛋白	首次提出了一种基于序列的计算方法，专门用于识别植物中的光合作用蛋白，填补了现有模型的空白	NA	开发一种全面的计算框架，用于预测植物中特定途径的光合作用蛋白	植物中的光合作用蛋白	机器学习	NA	深度学习与浅层学习算法	LightGBM	序列数据	涵盖多种植物物种，确保C和C途径的全面代表性
5353	2024-09-24	Application of machine learning for predicting lymph node metastasis in T1 colorectal cancer: a systematic review and meta-analysis 2024-Sep-23, Langenbeck's archives of surgery DOI:10.1007/s00423-024-03476-9 PMID:39311932	meta-analysis	本文综述并分析了机器学习和深度学习模型在T1期结直肠癌患者淋巴结转移预测中的应用	机器学习和深度学习模型在T1期结直肠癌淋巴结转移预测中表现出高灵敏度和特异性	研究间存在显著异质性，需要开发更可靠的算法	评估机器学习和深度学习模型在T1期结直肠癌淋巴结转移预测中的诊断准确性	T1期结直肠癌患者的淋巴结转移	machine learning	结直肠癌	机器学习 (ML) 和深度学习 (DL)	多种机器学习和深度学习模型	NA	33,199名T1期结直肠癌患者
5354	2024-10-15	Global research progress of electroencephalography applications in attention deficit hyperactivity disorder: Bibliometrics and visualized analysis 2024-Sep-20, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000039668 PMID:39312386	综述	本文对电生理学在注意力缺陷多动障碍（ADHD）中的应用进行了文献计量分析和可视化分析	本文通过文献计量分析和可视化工具，系统地总结了电生理学在ADHD诊断中的应用进展和研究趋势	本文主要基于文献计量分析，未涉及具体的实验数据或临床应用效果	旨在提供电生理学在ADHD应用领域的特征、主要研究领域、发展路径和趋势的概述	电生理学在ADHD中的应用	神经科学	神经发育障碍	电生理学（EEG）	NA	文本	1162篇文献
5355	2024-10-15	Leaf rolling detection in maize under complex environments using an improved deep learning method 2024-Aug-23, Plant molecular biology IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s11103-024-01491-4 PMID:39179745	研究论文	本文提出了一种改进的深度学习方法，用于在复杂环境中检测玉米叶卷曲现象	本文引入了卷积块注意力模块和可变形卷积网络v2，以增强特征提取能力和对目标形状和尺度变化的适应性	NA	深入理解叶卷曲现象，提高作物对环境压力的耐受性	玉米叶卷曲现象	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv8	图像	包含严重遮挡、叶片尺度和形状变化以及复杂背景场景的数据集
5356	2024-10-14	Protein-Protein Interaction Prediction via Structure-Based Deep Learning 2024-Nov, Proteins IF:3.2Q2 DOI:10.1002/prot.26721 PMID:38923590	研究论文	本文提出了一种基于结构深度学习的蛋白质-蛋白质相互作用预测框架RSPPI	结合残差神经网络（ResNet）和空间金字塔池化（SPP），利用蛋白质序列的物理化学性质和空间结构信息进行预测	未提及	开发一种新的AI算法来预测蛋白质-蛋白质相互作用	蛋白质-蛋白质相互作用	机器学习	NA	深度学习	ResNet	蛋白质序列	未提及
5357	2024-10-14	"Navigating the complexities of low-Grade glioma treatment: insights into SBT I-125 and novel assessment tools" 2024-Oct-12, Neurosurgical review IF:2.5Q1 DOI:10.1007/s10143-024-03028-1 PMID:39394531	meta-analysis	本文通过系统综述和荟萃分析评估了SBT I-125近距离放射治疗在低级别胶质瘤（LGGs）中的疗效和安全性	本文介绍了基于深度学习的自动化肿瘤评估工具在胶质瘤管理中的应用，这些创新工具提高了肿瘤体积和RANO测量的准确性和一致性	研究存在数据不足、研究异质性、缺乏随机对照试验和潜在的发表偏倚等局限性，且随访时间不一致影响了长期疗效和安全性的评估	评估SBT I-125近距离放射治疗在低级别胶质瘤中的疗效和安全性，并探讨自动化评估工具在胶质瘤管理中的应用	低级别胶质瘤（LGGs）患者和SBT I-125近距离放射治疗	NA	脑肿瘤	SBT I-125近距离放射治疗	深度学习	NA	988名患者
5358	2024-10-14	Validation of the Mirai model for predicting breast cancer risk in Mexican women 2024-Oct-10, Insights into imaging IF:4.1Q1 DOI:10.1186/s13244-024-01808-3 PMID:39387984	研究论文	验证Mirai模型在预测墨西哥女性乳腺癌风险中的表现	Mirai模型在非白人少数族裔中的应用研究较少	模型在预测未来乳腺癌风险中的表现中等，需要进一步改进	验证Mirai模型在预测墨西哥女性乳腺癌风险中的表现	墨西哥女性乳腺癌风险	机器学习	乳腺癌	深度学习	深度学习模型	影像	3110名患者，其中76名在5年随访期内发展为乳腺癌
5359	2024-10-14	A novel embedded kernel CNN-PCFF algorithm for breast cancer pathological image classification 2024-10-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-74025-z PMID:39390003	研究论文	提出了一种新的嵌入式核函数CNN-PCFF算法用于乳腺癌病理图像分类	通过在主成分分析中嵌入核函数，形成多核主成分，将高维特征融合为一些代表性的综合变量，从而实现降维	未提及具体限制	提高乳腺癌病理图像分类的性能	乳腺癌病理图像	计算机视觉	乳腺癌	主成分分析	CNN	图像	两个公开的乳腺癌图像数据集
5360	2024-10-13	Identification of dynamic networks community by fusing deep learning and evolutionary clustering 2024-Oct-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-74361-0 PMID:39390015	研究论文	本文提出了一种融合深度学习和进化聚类的动态网络社区检测方法	结合深度学习和进化聚类，提出了一种新的动态社区检测方法DLEC，能够有效挖掘复杂非线性结构并生成高质量的社区结构	NA	旨在提高动态网络中社区检测的准确性和鲁棒性	动态网络中的社区结构	机器学习	NA	深度学习	多层深度自编码器	网络数据	合成网络和真实世界网络