深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5781	2024-10-26	The development and validation of a prognostic prediction modeling study in acute myocardial infarction patients after percutaneous coronary intervention: hemorrhea and major cardiovascular adverse events 2024-Sep-30, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3 DOI:10.21037/jtd-24-1362 PMID:39444902	研究论文	本研究开发并验证了一种机器学习模型，用于预测经皮冠状动脉介入治疗后急性心肌梗死患者的出血和主要心血管不良事件风险	本研究利用机器学习技术，通过正则化、交叉验证和集成学习等方法，提高了预测模型的准确性，并引入了SHAP方法以提高模型的可解释性	NA	本研究旨在通过机器学习方法识别经皮冠状动脉介入治疗后患者的出血和主要心血管不良事件风险	研究对象为7931名接受经皮冠状动脉介入治疗的患者	机器学习	心血管疾病	机器学习算法，包括XGBoost、随机森林和深度学习神经网络	XGBoost模型	临床特征数据	7931名患者
5782	2024-10-26	m6ATM: a deep learning framework for demystifying the m6A epitranscriptome with Nanopore long-read RNA-seq data 2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae529 PMID:39438075	研究论文	介绍了一种基于深度学习的计算框架m6ATM，用于解析m6A表观转录组，使用Nanopore长读长RNA-seq数据进行单碱基分辨率的m6A位点预测	提出了m6ATM框架，结合WaveNet编码器和双流多实例学习模型，能够从DRS数据中提取特征并预测m6A位点	NA	开发一种高性能的m6A检测工具，以推动表观转录组研究的进展	m6A表观转录组及其在生物过程中的作用	机器学习	肝癌	Nanopore长读长RNA-seq	深度神经网络	RNA序列数据	包含不同m6A修饰比例的体外转录数据集和人类细胞系数据
5783	2024-10-26	Predictability of antigen binding based on short motifs in the antibody CDRH3 2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae537 PMID:39438077	研究论文	本文提出了一种基于抗体CDRH3区域短基序预测抗原结合状态的方法	本文发现了一种简单分类器，其在独立生成的实验数据集上优于专门为此类数据集设计的深度学习模型	本文仅分析了基于突变实验的抗体数据集，未来需要更多实验数据验证	探索免疫受体与抗原结合的规则，预测未知免疫受体的抗原结合状态	抗体CDRH3区域的短基序	生物信息学	NA	NA	分类器	序列数据	11,336个位置特异性短基序，178个基序用于分类器训练
5784	2024-10-26	DeepCheck: multitask learning aids in assessing microbial genome quality 2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae539 PMID:39438078	研究论文	本文介绍了一种名为DeepCheck的多任务深度学习框架，用于同时预测微生物基因组的质量，包括完整性和污染度	DeepCheck通过多任务学习方法，同时预测基因组的完整性和污染度，克服了现有方法将这两个任务分开处理的局限性	NA	开发一种新的深度学习框架，以提高微生物基因组质量评估的准确性和泛化能力	微生物基因组的完整性和污染度	机器学习	NA	多任务深度学习	深度学习框架	基因组数据	NA
5785	2024-10-26	Learning-based Free-Water Correction using Single-shell Diffusion MRI 2024-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering DOI:10.1117/12.3006901 PMID:39281711	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的单壳扩散MRI自由水校正方法	利用数据驱动技术在不同扩散MRI采集方案中可靠地推断自由水体积，包括单壳采集	当前数学模型在临床常见的单壳采集中的适用性有限	提高单壳扩散MRI分析的准确性和可靠性	脑微结构和连接性评估	计算机视觉	NA	扩散磁共振成像（dMRI）	深度学习	图像	NA
5786	2024-10-26	An ensemble deep learning model for medical image fusion with Siamese neural networks and VGG-19 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0309651 PMID:39441782	研究论文	本文提出了一种基于Siamese神经网络和VGG-19的集成深度学习模型，用于多模态医学图像融合	该模型结合了预训练和非预训练网络，通过堆叠集成方法，能够有效保留详细信息并提高图像质量，显著改善对比度、增加分辨率并减少伪影	NA	开发一种高效的混合学习模型，用于多模态医学图像融合	多模态医学图像	计算机视觉	NA	深度学习	Siamese神经网络, VGG-19	图像	来自Havard-Medical-Image-Fusion Datasets、GitHub和Kaggle的公开可用源图像
5787	2024-10-26	Deep learning and AI in reducing magnetic resonance imaging scanning time: advantages and pitfalls in clinical practice 2024, Polish journal of radiology IF:0.9Q4 DOI:10.5114/pjr/192822 PMID:39444654	研究论文	本文探讨了深度学习和人工智能在减少磁共振成像扫描时间中的应用及其在临床实践中的优势和局限	开发了基于人工智能的算法，特别是深度学习模型，用于从更少的数据点重建高分辨率图像，显著提高了MRI效率	未具体提及	描述和讨论引入深度学习重建技术以减少MRI扫描时间在临床实践中的优缺点	磁共振成像（MRI）扫描时间的减少及其在临床实践中的应用	计算机视觉	NA	深度学习	深度学习模型	图像	未具体提及
5788	2024-10-26	Dry age-related macular degeneration classification from optical coherence tomography images based on ensemble deep learning architecture 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1438768 PMID:39444813	研究论文	本文提出了一种基于集成深度学习架构的光学相干断层扫描图像干性年龄相关性黄斑变性分类方法	本文创新性地整合了四种不同的卷积神经网络（ResNet50、EfficientNetB4、MobileNetV3和Xception），并通过集成学习提高了干性AMD的分类准确性	NA	开发一种深度学习架构，以提高干性年龄相关性黄斑变性的分类准确性	干性年龄相关性黄斑变性的分类	计算机视觉	眼科疾病	深度学习	集成学习	图像	1,310名患者的4,096张原始图像，经过旋转和翻转操作后，数据集包含16,384张视网膜OCT图像
5789	2024-10-26	Trends and hotspots in the field of diabetic retinopathy imaging research from 2000-2023 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1481088 PMID:39444814	研究论文	本研究通过文献计量分析评估了2000年至2023年间糖尿病视网膜病变成像研究领域的进展和热点	本研究首次通过文献计量分析方法，系统地评估了糖尿病视网膜病变成像研究领域的发展趋势和关键热点	本研究仅基于Web of Science Core Collection数据库中的文献信息，可能存在一定的数据偏差	评估糖尿病视网膜病变成像研究领域的发展趋势和关键热点	2000年至2023年间发表的糖尿病视网膜病变成像研究相关文献	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	文献计量分析	NA	文献	共分析了1328篇文献，其中美国发表719篇，中国发表609篇
5790	2024-10-26	Prediction of benign and malignant ground glass pulmonary nodules based on multi-feature fusion of attention mechanism 2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2024.1447132 PMID:39445066	研究论文	本研究开发并验证了一种新的特征融合算法，通过深度学习提高良性和恶性磨玻璃结节的分类性能	首次应用注意力机制融合全肺CT图像、影像组学特征、临床和形态学特征，显著提高了磨玻璃结节的分类性能	NA	开发和验证一种新的特征融合算法，以提高良性和恶性磨玻璃结节的分类性能	良性和恶性磨玻璃结节	计算机视觉	肺部疾病	深度学习	卷积神经网络 (CNN) 和反向传播神经网络 (BPNN)	图像	385例磨玻璃结节，其中172例为良性，203例为恶性
5791	2024-10-26	Enhancing facial feature de-identification in multiframe brain images: A generative adversarial network approach 2024, Progress in brain research DOI:10.1016/bs.pbr.2024.07.003 PMID:39448110	研究论文	本文提出了一种基于生成对抗网络（GAN）的深度学习方法，用于在脑部图像中对面部特征进行去识别化处理	本文的创新点在于使用生成对抗网络合成新的面部特征和轮廓，并专注于部分头部图像而非全头部图像	本文的局限性在于耳部检测的准确率在测试数据集中较低，仅为65.98%	本文的研究目的是开发一种有效的面部特征去识别化方法，以符合隐私法规	本文的研究对象是脑部图像中的面部特征，包括耳朵、鼻子、嘴巴和眼睛	计算机视觉	NA	生成对抗网络（GAN）	生成对抗网络（GAN）	图像	本文使用了490例公开的头颅CT图像数据集和70例头颅MR图像数据集进行训练和测试
5792	2024-10-25	Explainable artificial intelligence and domain adaptation for predicting HIV infection with graph neural networks 2024-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2024.2407063 PMID:39417227	研究论文	研究使用图神经网络和领域适应方法预测HIV感染，并评估模型的可解释性和跨数据集的可转移性	首次将可解释的人工智能和领域适应方法应用于图神经网络，以预测HIV感染，并评估模型在不同数据集间的转移能力	研究仅限于两个城市的年轻性少数男性群体，且数据收集时间较短	探索可解释深度学习方法在图神经网络中预测HIV感染的应用，并评估模型在不同数据集间的转移能力	年轻性少数男性群体的社交网络数据	机器学习	HIV感染	图神经网络	图注意力网络（GAT）	网络数据	两个城市的年轻性少数男性群体，数据收集时间为2014至2016年
5793	2024-10-25	Enhanced bone assessment of the shoulder using zero-echo time MRI with deep-learning image reconstruction 2024-Dec, Skeletal radiology IF:1.9Q3 DOI:10.1007/s00256-024-04690-8 PMID:38658419	研究论文	评估深度学习重建算法在1.5特斯拉肩部零回波时间MRI中的应用，以改善骨性病变的描绘	引入了一种基于深度学习的重建算法（DLRecon），用于增强零回波时间MRI图像质量，特别是在骨性病变的描绘上	研究为回顾性，样本量相对较小，且仅限于肩部MRI	评估深度学习重建算法在肩部零回波时间MRI中的效果，以提高骨性病变的诊断准确性	肩部MRI图像及其骨性病变	计算机视觉	NA	零回波时间MRI	深度学习	图像	63次肩部MRI检查，涉及52名患者（28名女性）
5794	2024-10-25	Forensic bone age assessment of hand and wrist joint MRI images in Chinese han male adolescents based on deep convolutional neural networks 2024-Nov, International journal of legal medicine IF:2.2Q1 DOI:10.1007/s00414-024-03282-4 PMID:39060444	研究论文	研究开发了一种基于深度卷积神经网络的中国汉族男性青少年手和腕关节MRI图像的法医骨龄评估系统	提出了一个新的深度学习模型，用于提取和增强MRI手和腕骨特征，以提高目标MRI手和腕骨年龄的预测和精确分类	样本量相对较小，且仅限于中国汉族男性青少年	探索使用深度学习技术对手和腕关节MRI图像进行骨龄评估的可行性	中国汉族男性青少年的手和腕关节MRI图像	计算机视觉	NA	MRI	深度卷积神经网络	图像	282名6.0-21.0岁的中国汉族男性
5795	2024-10-25	Can deep learning-designed anterior tooth-borne crown fulfill morphologic, aesthetic, and functional criteria in clinical practice? 2024-Nov, Journal of dentistry IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jdent.2024.105368 PMID:39326724	研究论文	本研究旨在比较基于深度学习（DL）软件设计的前牙冠与传统牙科计算机辅助设计（CAD）软件设计的前牙冠在形态、功能和美学方面的差异	本研究首次评估了基于深度学习的前牙冠设计软件在临床实践中的应用效果	研究样本量较小，且未评估所有可能的功能和美学指标	评估基于深度学习的前牙冠设计软件在形态、功能和美学方面的表现	前牙冠的设计效果	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	25个活体数据集，包括上颌和下颌弓扫描的预备上颌中切牙
5796	2024-10-25	Deep learning method to automatically diagnose periodontal bone loss and periodontitis stage in dental panoramic radiograph 2024-Nov, Journal of dentistry IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jdent.2024.105373 PMID:39332519	研究论文	本文提出了一种基于卷积神经网络（CNN）的深度学习集成模型，用于自动诊断牙科全景X光片中的牙周骨丢失和牙周炎阶段	本文的创新点在于提出了一种新的深度学习集成模型，结合了YOLOv8、Mask R-CNN和TransUNet算法，用于牙位检测、牙齿轮廓分割、牙齿组织分割以及牙周骨丢失和牙周炎阶段的预测	本文的局限性在于数据集仅包含320名患者的数据，可能不足以完全代表所有患者的情况	本研究旨在开发一种高效准确的深度学习方法，用于自动诊断牙周疾病	本研究的对象是牙科全景X光片中的牙周骨丢失和牙周炎阶段	计算机视觉	牙周疾病	深度学习	卷积神经网络（CNN）	图像	320名患者的8462颗牙齿
5797	2024-10-25	PET image reconstruction using weighted nuclear norm maximization and deep learning prior 2024-Oct-23, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad841d PMID:39374634	研究论文	本文提出了一种基于加权核范数最大化与深度学习先验的PET图像重建方法	本文的创新点在于在PET图像重建中应用了加权核范数最大化而非最小化，并使用神经网络控制由加权核范数最大化产生的噪声	NA	旨在提高PET图像重建的质量，特别是在低剂量情况下的图像细节恢复和噪声抑制	PET图像重建问题	计算机视觉	NA	加权核范数最大化	神经网络	图像	包括模拟数据集和临床数据集
5798	2024-10-25	Olfactory Visualization Sensing Array Made with CelluMOFs to Predict Fruit Ripeness Using Deep Learning 2024-Oct-23, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.4c09402 PMID:39403818	研究论文	本文开发了一种基于CelluMOFs的嗅觉可视化传感阵列，结合深度学习技术用于预测水果成熟度	首次将CelluMOFs与DenseNet结合，用于高灵敏度和准确性的水果成熟度检测	NA	开发一种高灵敏度和准确性的嗅觉可视化传感系统，用于检测水果成熟度	水果成熟度	计算机视觉	NA	深度学习	DenseNet	图像	九种特征水果气味
5799	2024-10-25	Simultaneous segmentation and classification of 99mTc-DMSA renal scintigraphic images with a deep learning approach 2024-Oct-22, EJNMMI reports DOI:10.1186/s41824-024-00223-7 PMID:39433648	研究论文	本研究测试了Mask R-CNN在99mTc-DMSA肾闪烁成像中诊断急性肾盂肾炎（APN）和分割肾脏的可行性和准确性	本研究首次将Mask R-CNN应用于99mTc-DMSA肾闪烁成像的分割和分类，展示了其在诊断APN和肾脏分割方面的潜力	本研究的样本量较小，仅包括260名患者，未来需要更大规模的研究来验证模型的泛化能力	测试Mask R-CNN在99mTc-DMSA肾闪烁成像中诊断APN和分割肾脏的准确性	99mTc-DMSA肾闪烁成像中的肾脏分割和APN诊断	计算机视觉	泌尿系统疾病	深度学习	Mask R-CNN	图像	260名疑似APN患者，其中358个肾脏被诊断为APN
5800	2024-10-25	Deep learning reconstruction of diffusion-weighted brain MRI for evaluation of patients with acute neurologic symptoms 2024-10-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-75011-1 PMID:39433559	研究论文	本文评估了深度学习加速的扩散加权成像（DWI）在急性神经系统症状患者中的临床可行性	深度学习算法显著缩短了DWI的扫描时间，同时保持了可接受的图像质量	深度学习DWI显示出更多的伪影，且ADC值略低于传统DWI	评估深度学习加速的DWI在急性神经系统症状患者中的临床应用	321名急性中风样症状患者的脑部DWI图像	计算机视觉	神经系统疾病	深度学习	NA	图像	321名患者