深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6021	2024-10-13	Machine learning, deep learning and hernia surgery. Are we pushing the limits of abdominal core health? A qualitative systematic review 2024-08, Hernia : the journal of hernias and abdominal wall surgery IF:2.6Q1 DOI:10.1007/s10029-024-03069-x PMID:38761300	综述	本文系统综述了机器学习和深度学习在疝气手术中的应用	展示了机器学习在预测手术结果和识别术后并发症相关因素方面的潜力	研究数量有限，且研究对象和使用的模型类型各异	评估机器学习和人工智能在疝气手术中的应用	疝气手术中的机器学习和深度学习应用	机器学习	NA	机器学习, 深度学习	深度学习模型 (DLM)	视频, 图像	共包含13篇研究文章，涉及腹股沟疝、腹壁疝或切口疝
6022	2024-10-13	1 Million Segmented Red Blood Cells With 240 K Classified in 9 Shapes and 47 K Patches of 25 Manual Blood Smears 2024-Jul-02, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-03570-z PMID:38956115	研究论文	本文介绍了一个包含100万个分割红细胞和24万个分类红细胞的数据集，用于开发和测试基于深度学习的红细胞形态/形状检查自动化技术	本文首次提供了一个大规模的红细胞形态数据集，并提供了用于图像处理和深度学习模型训练的代码	数据集仅包含25个手动制备的血涂片，可能不足以涵盖所有可能的红细胞形态	开发和测试基于深度学习的红细胞形态/形状检查自动化技术	红细胞的形态和形状	数字病理学	NA	深度学习	图像分类器	图像	25个手动制备的血涂片，共47000多个图像/补丁，包含100万个分割红细胞和24万个分类红细胞
6023	2024-10-13	Attention-based Imputation of Missing Values in Electronic Health Records Tabular Data 2024-Jun, Proceedings. IEEE International Conference on Healthcare Informatics DOI:10.1109/ichi61247.2024.00030 PMID:39387063	研究论文	本文提出了一种基于注意力机制的电子健康记录表格数据缺失值插补框架	利用特征间（自注意力）或样本间注意力来重建缺失数据，并采用对比学习中的数据处理方法提高插补模型的泛化能力	未提及具体局限性	提高机器学习在患者特定预测建模中对电子健康记录表格数据缺失值插补的准确性	电子健康记录表格数据中的缺失值	机器学习	NA	注意力机制	自注意力模型	表格数据	五个表格数据集和两个电子健康记录数据集
6024	2024-10-13	Knowledge mapping and bibliometric analysis of medical knee magnetic resonance imaging for knee osteoarthritis (2004-2023) 2024, Frontiers in surgery IF:1.6Q2 DOI:10.3389/fsurg.2024.1387351 PMID:39345660	研究论文	本研究系统分析了2004年至2023年间全球关于膝关节磁共振成像（MRI）在膝骨关节炎（KOA）治疗中应用的研究现状，并通过知识图谱展示研究热点和未来趋势	本研究首次通过知识图谱形式展示膝关节MRI在KOA治疗中的应用研究热点和未来趋势	研究仅基于Web of Science核心数据库的文献，可能存在数据偏差	系统分析全球膝关节MRI在KOA治疗中的应用研究现状，探索研究热点和未来趋势	2004年至2023年间关于膝关节MRI在KOA治疗中的应用研究	数字病理学	骨关节炎	磁共振成像（MRI）	NA	文本	共纳入2904篇文章
6025	2024-10-13	DynProfiler: a Python package for comprehensive analysis and interpretation of signaling dynamics leveraged by deep learning techniques 2024, Bioinformatics advances IF:2.4Q2 DOI:10.1093/bioadv/vbae145 PMID:39391633	研究论文	本文介绍了一个名为DynProfiler的Python包，利用深度学习技术对信号传导动力学进行全面分析和解释	DynProfiler利用整个信号传导动力学（包括中间变量）作为输入，并利用深度学习技术提取信息特征，无需任何标签，并结合现代可解释AI解决方案提供每个动力学的定量时间依赖性重要性评分	NA	开发一种能够有效提取信号传导动力学信息特征的工具，用于后续分析如患者分层和生存预测	信号传导动力学及其在乳腺癌患者中的应用	机器学习	乳腺癌	深度学习技术	NA	模拟信号传导动力学数据	NA
6026	2024-10-13	Estimation of sorghum seedling number from drone image based on support vector machine and YOLO algorithms 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1399872 PMID:39391781	研究论文	本文研究了基于支持向量机和YOLO算法从无人机图像中估算高粱幼苗数量的方法	本文提出了三种模型（支持向量机、YOLOv5和YOLOv8）用于从无人机RGB图像中快速自动地计数高粱幼苗，并验证了YOLOv8模型在不同飞行高度下的准确性	本文仅在特定飞行高度下验证了模型的准确性，未涵盖所有可能的环境条件	测试并比较三种模型在不同飞行高度下从无人机图像中估算高粱幼苗数量的准确性	高粱幼苗的数量	计算机视觉	NA	支持向量机、YOLO算法	支持向量机、YOLOv5、YOLOv8	图像	在15米、30米和45米飞行高度下采集的RGB图像
6027	2024-10-12	Practical guidelines for cell segmentation models under optical aberrations in microscopy 2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2024.09.002 PMID:39385997	研究论文	评估在光学畸变条件下细胞图像分割模型的性能	提出了点扩散函数图像标签分类模型（PLCM），能够快速准确地识别畸变类型和幅度	未提及具体局限性	评估细胞图像分割模型在光学畸变条件下的鲁棒性，并提供使用指南	细胞图像分割模型在光学畸变条件下的性能	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）	Mask R-CNN, Otsu threshold method, Cellpose 2.0	图像	使用DynamicNuclearNet (DNN) 和 LIVECell 数据集，分别代表荧光和明场显微镜细胞数据集
6028	2024-10-12	A dental intraoral image dataset of gingivitis for image captioning 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.110960 PMID:39386321	研究论文	本文提出了一种专门用于牙龈炎诊断图像描述的新数据集	该数据集包含1,096张高分辨率口腔内图像，由经验丰富的牙周病专家进行详细标注和描述，支持图像描述算法的开发	NA	开发用于牙龈炎诊断的图像描述算法	牙龈炎诊断的口腔内图像	计算机视觉	牙周病	深度学习	NA	图像	1,096张高分辨率口腔内图像
6029	2024-10-12	Optimal STI controls for HIV patients based on an efficient deep Q learning method 2024-11-07, Journal of theoretical biology IF:1.9Q3 DOI:10.1016/j.jtbi.2024.111914 PMID:39111541	研究论文	本文研究了一种基于深度Q学习方法的高效计算工具，用于为HIV患者提供优化的STI治疗方案	本文采用了改进的双深度Q网络与优先经验回放技术，相较于经典深度学习算法，显著提高了性能	NA	研究如何为HIV患者提供更优化的STI治疗方案	HIV感染者及其STI治疗策略	机器学习	HIV	深度Q学习	双深度Q网络	NA	NA
6030	2024-10-12	Accelerated Musculoskeletal Magnetic Resonance Imaging 2024-Nov, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29205 PMID:38156716	综述	本文综述了加速肌肉骨骼磁共振成像（MRI）技术的基本原理和应用	本文介绍了包括并行成像、压缩感知和同时多切片成像在内的传统加速MRI技术，以及基于深度学习的加速MRI技术，如欠采样MR图像重建、超分辨率成像、伪影校正和未获取对比度图像的生成	NA	旨在回顾加速肌肉骨骼MRI技术的基本原理和应用，以提高MRI工作流程的效率	肌肉骨骼MRI技术的加速方法	医学影像	NA	磁共振成像（MRI）	深度学习	图像	NA
6031	2024-10-11	Responds to the Comments on "A Channel-Dimensional Feature-Reconstructed Deep Learning Model for Predicting Breast Cancer Molecular Subtypes on Overall b-Value Diffusion-Weighted MRI" 2024-Nov, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29310 PMID:38363190	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
6032	2024-10-11	Comments on "A Channel-Dimensional Feature-Reconstructed Deep Learning Model for Predicting Breast Cancer Molecular Subtypes on Overall b-Value Diffusion-Weighted MRI" 2024-Nov, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29311 PMID:38366814	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
6033	2024-10-12	Synthesis and characterization of Fe(III)-doped beta-cyclodextrin-grafted chitosan cryogel beads for adsorption of diclofenac in aqueous solutions: Adsorption experiments and deep-learning modeling 2024-Nov, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.135161 PMID:39214200	研究论文	本文介绍了合成Fe(III)掺杂的β-环糊精接枝壳聚糖冷冻凝胶珠用于吸附水溶液中的双氯芬酸，并进行了吸附实验和深度学习建模	本文创新性地合成了Fe(III)掺杂的β-环糊精接枝壳聚糖冷冻凝胶珠，并利用人工神经网络模型预测双氯芬酸的去除率	本文未详细讨论冷冻凝胶珠的长期稳定性和大规模生产的可能性	开发高效去除水环境中双氯芬酸的吸附材料，并利用深度学习模型优化吸附过程	Fe(III)掺杂的β-环糊精接枝壳聚糖冷冻凝胶珠和双氯芬酸	环境科学	NA	吸附实验，深度学习建模	人工神经网络 (ANN)	实验数据	17组吸附实验，每组重复两次
6034	2024-10-12	Deep learning enables accurate brain tissue microstructure analysis based on clinically feasible diffusion magnetic resonance imaging 2024-Oct-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120858 PMID:39317273	研究论文	本文展示了基于临床可行的扩散磁共振成像（dMRI），深度学习（DL）方法能够准确重建脑组织微结构并进行分析	首次证明DL方法在临床可行的dMRI扫描下能够可靠地重建脑组织微结构，并准确识别与疾病和年龄相关的微结构变化	未明确提及	验证深度学习方法在临床可行的dMRI条件下重建脑组织微结构的准确性和临床应用潜力	脑组织微结构的重建和分析	计算机视觉	NA	扩散磁共振成像（dMRI）	深度学习（DL）	图像	四个不同的脑dMRI数据集，每个数据集使用12个扩散梯度
6035	2024-10-12	Comparative evaluation of interpretation methods in surface-based age prediction for neonates 2024-Oct-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120861 PMID:39326769	研究论文	本研究比较了两种解释方法在基于表面的新生儿脑龄预测中的有效性和适应性	本研究引入了扰动基础的显著性图方法，并评估了其在新生儿脑龄预测中的应用，揭示了其在复杂医疗场景中的潜力	本研究仅评估了两种解释方法，未涵盖其他可能的解释技术	评估和比较两种解释方法在新生儿脑龄预测中的有效性和适应性	新生儿的脑龄预测	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	664例T1 MRI扫描
6036	2024-10-12	Deep neural networks for automated damage classification in image-based visual data of reinforced concrete structures 2024-Oct-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38104 PMID:39386784	研究论文	本文提出了一种自动化技术，结合卷积神经网络（CNN）和全卷积网络（FCN），用于检测、分类和分割钢筋混凝土结构中的损伤	本文的创新点在于将CNN和FCN结合，用于从高分辨率智能手机图像中提取钢筋混凝土损伤特征，并实现了高精度的损伤分类和分割	本文的局限性在于仅使用了2000张图像进行训练和测试，样本量相对较小	本文的研究目的是开发一种自动化技术，用于评估钢筋混凝土结构中的损伤	本文的研究对象是钢筋混凝土结构中的损伤	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）和全卷积网络（FCN）	CNN和FCN	图像	2000张高分辨率智能手机图像
6037	2024-10-12	Identification of Chemical Scaffolds That Inhibit the Mycobacterium tuberculosis Respiratory Complex Succinate Dehydrogenase 2024-Oct-11, ACS infectious diseases IF:4.0Q1 DOI:10.1021/acsinfecdis.3c00655 PMID:39268963	研究论文	研究利用生物化学筛选和深度学习技术识别抑制结核分枝杆菌呼吸复合物琥珀酸脱氢酶的化学骨架	首次利用深度学习技术识别抑制结核分枝杆菌琥珀酸脱氢酶的化学骨架，并验证其作为下一代抗菌药物的潜力	NA	探索抑制结核分枝杆菌琥珀酸脱氢酶的新型抗菌药物	结核分枝杆菌的琥珀酸脱氢酶及其抑制剂	NA	传染病	生物化学筛选，深度学习	深度学习	化学结构	多个化学骨架
6038	2024-10-12	Multistage Spatial-Spectral Fusion Network for Spectral Super-Resolution 2024-Oct-10, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3460190 PMID:39388330	研究论文	提出了一种多阶段空间-光谱融合网络（MSFN）用于光谱超分辨率任务	设计了多阶段Unet架构，结合自注意力机制，创新性地设计了空间融合模块和光谱融合模块，以全面捕捉HSI的空间和光谱特征	未提及	提高光谱超分辨率任务中重建高光谱图像的保真度	高光谱图像（HSI）和RGB图像	计算机视觉	NA	深度学习	Unet架构	图像	两个最大的光谱超分辨率数据集（NTIRE2022和NTIRE2020）
6039	2024-10-12	Deep learning with photonic neural cellular automata 2024-Oct-08, Light, science & applications DOI:10.1038/s41377-024-01651-7 PMID:39379344	研究论文	本文提出并实验验证了一种用于光子深度学习的光子神经元细胞自动机（PNCA），通过稀疏连接克服了传统神经网络架构在光子实现中的实际挑战	本文的创新点在于提出了光子神经元细胞自动机（PNCA），利用光子的速度和互连性以及细胞自动机的自组织特性，实现了鲁棒、可靠和高效的计算	本文未提及具体的局限性	本文的研究目的是探索和验证光子神经元细胞自动机在光子深度学习中的应用，以解决传统神经网络架构在光子实现中的挑战	本文的研究对象是光子神经元细胞自动机（PNCA）及其在图像分类任务中的应用	机器学习	NA	光子学	光子神经元细胞自动机（PNCA）	图像	使用3个可编程光子参数进行二分类图像分类实验
6040	2024-10-12	Bio-inspired feature selection for early diagnosis of Parkinson's disease through optimization of deep 3D nested learning 2024-10-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-74405-5 PMID:39379451	研究论文	本文提出了一种基于生物启发特征选择和深度3D嵌套学习的帕金森病早期诊断方法	开发了一种新颖的3D-CNN架构，并通过鲸鱼优化算法进行特征融合和优化，显著提高了诊断准确率	NA	提高帕金森病的早期诊断准确率	帕金森病的早期诊断	计算机视觉	神经退行性疾病	3D-CNN	3D-CNN	图像	NA