深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6541	2024-10-09	The Deep Learning-Crop Platform (DL-CRoP): For Species-Level Identification and Nutrient Status of Agricultural Crops 2024, Research (Washington, D.C.) DOI:10.34133/research.0491 PMID:39371687	研究论文	本文介绍了一种名为Deep Learning-Crop Platform (DL-CRoP)的深度学习平台，用于通过叶片、茎和根图像识别商业种植植物及其营养需求	DL-CRoP平台通过卷积神经网络提取内在特征模式，并在识别任务中取得了显著成果。此外，通过引入多头注意力机制改进了氮缺乏分类的准确性	尽管DL-CRoP平台在多个案例中表现出色，但在某些情况下（如案例D）的准确率仍有提升空间	开发一种可靠的深度学习平台，用于精确识别农作物种类及其营养状态	商业种植的植物及其营养需求	计算机视觉	NA	卷积神经网络	CNN	图像	使用了Jammu University-Botany Image Database (JU-BID)中的植物图像数据集，具体样本数量未明确说明
6542	2024-10-09	A global model-agnostic rule-based XAI method based on Parameterized Event Primitives for time series classifiers 2024, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2024.1381921 PMID:39372662	研究论文	本文提出了一种基于参数化事件原语的全局模型无关规则化XAI方法，用于时间序列分类器的解释	该方法通过生成决策树图和特定规则集，揭示了深度学习时间序列分类器推断背后的关键时间步，增强了模型的可解释性	NA	提高复杂时间序列分类模型的全局可解释性	时间序列分类器及其解释方法	机器学习	NA	决策树分类器	深度学习模型	时间序列数据	使用了来自UCR档案的多样化真实世界数据集进行实验
6543	2024-10-09	MLGCN: an ultra efficient graph convolutional neural model for 3D point cloud analysis 2024, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2024.1439340 PMID:39372661	研究论文	本文提出了一种超高效的图卷积神经网络模型MLGCN，用于3D点云分析	MLGCN模型利用浅层图神经网络块在不同空间局部性级别提取特征，并通过预计算的KNN图共享GCN块，显著减少了计算开销和内存使用	NA	开发一种高效且适用于低内存和低CPU设备的3D点云分析模型	3D点云数据的对象分类和部分分割任务	计算机视觉	NA	图卷积神经网络（GCN）	多级图卷积神经网络（MLGCN）	3D点云数据	NA
6544	2024-10-09	Multicenter Integration of MR Radiomics, Deep Learning, and Clinical Indicators for Predicting Hepatocellular Carcinoma Recurrence After Thermal Ablation 2024, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JHC.S482760 PMID:39372710	研究论文	开发并验证了一种创新的预测模型，该模型整合了多序列磁共振（MR）放射组学、深度学习特征和临床指标，以准确预测肝细胞癌（HCC）在热消融后的复发情况	首次将多序列MR放射组学、深度学习特征和临床指标整合到一个预测模型中，以提高肝细胞癌复发预测的准确性	研究为回顾性多中心队列研究，样本量相对较小，且仅限于接受热消融治疗的肝细胞癌患者	开发和验证一种能够准确预测肝细胞癌在热消融后复发的综合模型	接受热消融治疗的肝细胞癌患者	计算机视觉	肝癌	磁共振成像（MRI）	3D卷积神经网络（3D CNN）	图像	535名患者，包括462名男性和43名女性
6545	2024-10-09	Brain tumor grade classification using the ConvNext architecture 2024 Jan-Dec, Digital health IF:2.9Q2 DOI:10.1177/20552076241284920 PMID:39372816	研究论文	本研究提出了一种使用ConvNext架构对脑肿瘤进行分级分类的方法	本研究采用了现代卷积神经网络ConvNext，并结合迁移学习技术，实现了对脑肿瘤的高精度分类	NA	开发一种非侵入性且准确的方法来对脑肿瘤进行分级诊断	脑肿瘤的分级分类	计算机视觉	脑肿瘤	卷积神经网络	ConvNext	图像	使用了BraTS 2019数据集，输入了三种MRI序列作为预训练CNN的三个通道
6546	2024-10-09	Classification of underlying paroxysmal supraventricular tachycardia types using deep learning of sinus rhythm electrocardiograms 2024 Jan-Dec, Digital health IF:2.9Q2 DOI:10.1177/20552076241281200 PMID:39372813	研究论文	本研究利用深度学习模型对窦性心律心电图进行分类，以区分房室结折返性心动过速和隐匿性房室折返性心动过速	本研究首次使用深度学习模型对窦性心律心电图进行分类，以区分不同类型的阵发性室上性心动过速	研究样本量有限，且深度学习模型在区分两种心律失常类型时的表现仍有提升空间	探索利用窦性心律心电图通过深度学习进行房室结折返性心动过速和隐匿性房室折返性心动过速的分类	房室结折返性心动过速和隐匿性房室折返性心动过速患者	机器学习	心血管疾病	深度学习	ResNet-34	心电图	1179名患者，其中833名患有房室结折返性心动过速，346名患有隐匿性房室折返性心动过速
6547	2024-10-09	Deep Learning-Based Detection of Impacted Teeth on Panoramic Radiographs 2024, Biomedical engineering and computational biology IF:2.3Q3 DOI:10.1177/11795972241288319 PMID:39372969	研究论文	本文通过改进预训练的MedSAM模型，实现了全景X光片中阻生牙的检测	本文对SAM模型进行了改进，通过聚焦牙齿中心来提高阻生牙检测的准确性	模型的准确性和选择仍有待进一步提高	通过改进模型提高阻生牙在X光片中的检测准确性，辅助牙科诊断	阻生牙的检测	计算机视觉	NA	深度学习	MedSAM	图像	1016张X光片，分为训练集、验证集和测试集，比例为16:3:1
6548	2024-10-08	Enhancing practicality of deep learning for crop disease identification under field conditions: insights from model evaluation and crop-specific approaches 2024-Nov, Pest management science IF:3.8Q1 DOI:10.1002/ps.8317 PMID:39030887	研究论文	研究评估了在实验室、田间和混合条件下使用深度学习模型进行作物病害识别的准确性，并探讨了模型架构和作物特异性模型对准确性的影响	研究了不同条件下（实验室、田间和混合）的作物病害识别准确性，并探讨了作物特异性模型对减少跨作物病害误分类的影响	尽管作物特异性模型减少了跨作物病害误分类，但也导致了同种作物内病害误分类的轻微增加	评估在不同条件下使用深度学习模型进行作物病害识别的准确性，并探讨模型架构和作物特异性模型的影响	苹果、马铃薯和番茄的14种病害	计算机视觉	NA	卷积神经网络 (CNN)	DenseNets, ResNets, MobileNetV3, EfficientNet, VGG Nets	图像	包含苹果、马铃薯和番茄的14种病害的数据集
6549	2024-10-08	Causality-inspired crop pest recognition based on Decoupled Feature Learning 2024-Nov, Pest management science IF:3.8Q1 DOI:10.1002/ps.8314 PMID:39022822	研究论文	本文提出了一种基于解耦特征学习的因果关系启发式作物害虫识别框架	利用因果推断技术处理训练数据集偏差，通过分类置信度构建不同的训练域，并使用中心三重损失学习类核心特征	NA	提高作物害虫识别的准确性和可靠性	作物害虫	计算机视觉	NA	深度学习	解耦特征学习框架	图像	在Li、DFSPD和IP102数据集上分别进行了测试
6550	2024-10-08	Prediction of surgery-first approach orthognathic surgery using deep learning models 2024-Nov, International journal of oral and maxillofacial surgery IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.ijom.2024.05.003 PMID:38821731	研究论文	本研究利用深度学习模型预测正颌手术中手术优先方法的治疗方式，并评估其临床准确性	深度学习为加速工作流程、自动化辅助决策和个性化治疗计划提供了新方法	NA	利用深度学习预测正颌手术中手术优先方法的治疗方式	正颌手术患者	计算机视觉	NA	深度学习	卷积神经网络 (CNN)	图像	228名骨性III类错颌患者
6551	2024-10-08	Deep Variational Network Toward Blind Image Restoration 2024-Nov, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1 DOI:10.1109/TPAMI.2024.3365745 PMID:38349822	研究论文	本文提出了一种新的盲图像恢复方法，结合了经典模型方法和深度学习方法的优点	构建了一个通用的贝叶斯生成模型来描述盲图像恢复中的退化过程，并设计了一种变分推断算法，将所有期望的后验分布参数化为深度神经网络	NA	旨在解决盲图像恢复问题，并结合经典模型方法和深度学习方法的优点	盲图像恢复中的图像退化和恢复过程	计算机视觉	NA	变分推断算法	深度神经网络	图像	NA
6552	2024-10-08	Joint segmentation of tumors in 3D PET-CT images with a network fusing multi-view and multi-modal information 2024-Oct-07, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad7f1b PMID:39317235	研究论文	本文提出了一种用于3D PET-CT图像中肿瘤联合分割的深度学习算法	提出了多视图信息增强和多模态特征融合网络（MIEMFF-Net），结合动态多模态融合策略和多视图信息增强策略，有效利用PET和CT图像的代谢和解剖信息	未提及	解决现有方法在PET-CT图像肿瘤分割中忽略多模态和多视图信息的问题	3D PET-CT图像中的肿瘤	计算机视觉	软组织肉瘤	深度学习	MIEMFF-Net	图像	Soft Tissue Sarcomas数据集和AutoPET数据集
6553	2024-10-08	Meta-learning for real-world class incremental learning: a transformer-based approach 2024-Oct-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-71125-8 PMID:39367098	研究论文	本文提出了一种基于Transformer的元学习方法，用于解决现实世界中的类增量学习问题	本文的创新点在于将元学习应用于类增量学习，并提出了一种基于Transformer的聚合函数，能够在不重新训练的情况下完成任务	NA	本文的研究目的是将元学习应用于更贴近现实世界的类增量学习问题	本文的研究对象是类增量学习问题	自然语言处理	NA	元学习	Transformer	文本	NA
6554	2024-10-08	Advanced mathematical modeling of mitigating security threats in smart grids through deep ensemble model 2024-Oct-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-74733-6 PMID:39367158	研究论文	研究通过深度集成模型进行高级数学建模，以减轻智能电网中的安全威胁	提出了一种基于山羚优化和深度集成学习的入侵检测技术（MGODEL-ID），用于智能电网环境中的入侵检测	NA	开发一种新的入侵检测技术，以提高智能电网对网络攻击的可靠性和韧性	智能电网中的安全威胁和入侵检测	机器学习	NA	深度学习	深度集成模型	网络数据	NA
6555	2024-10-08	Tabular deep learning: a comparative study applied to multi-task genome-wide prediction 2024-Oct-04, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-024-05940-1 PMID:39367318	研究论文	本文比较了多种深度学习架构在多任务全基因组预测中的应用	首次系统性地比较了多种深度学习架构在表格数据上的表现，并应用于全基因组预测	实验仅限于特定的基因数据集，结果可能不适用于所有类型的基因数据	提高基因选择和疾病风险预测的准确性	多种深度学习架构在全基因组预测中的表现	机器学习	NA	深度学习	LassoNet	表格数据	三个多特征回归数据集和两个多类分类数据集
6556	2024-10-08	Leveraging explainable deep learning methodologies to elucidate the biological underpinnings of Huntington's disease using single-cell RNA sequencing data 2024-Oct-04, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-024-10855-5 PMID:39367331	研究论文	利用可解释深度学习方法解析亨廷顿病生物学基础的单细胞RNA测序数据	使用残差神经网络（ResNet）模型有效模拟亨廷顿病细胞，并利用SHapley Additive exPlanations（SHAP）算法识别影响亨廷顿病预测的基因	测试集的F1分数为96.53%，仍有提升空间	阐明亨廷顿病病理学的潜在机制	亨廷顿病细胞与健康细胞的差异基因表达模式	机器学习	神经退行性疾病	单细胞RNA测序	残差神经网络（ResNet）	基因表达数据	NA
6557	2024-10-08	The power of deep learning in simplifying feature selection for hepatocellular carcinoma: a review 2024-Oct-04, BMC medical informatics and decision making IF:3.3Q2 DOI:10.1186/s12911-024-02682-1 PMID:39367397	综述	本文综述了深度学习技术在肝细胞癌（HCC）特征选择中的应用	深度学习技术在简化HCC特征选择过程中展示了显著的进步	将深度学习的潜力转化为临床现实仍面临挑战	综述深度学习模型和算法在HCC特征选择中的应用，并讨论其在临床实践中的潜力	肝细胞癌（HCC）的特征选择	机器学习	肝癌	深度学习	NA	NA	NA
6558	2024-10-06	Development of brain tumor radiogenomic classification using GAN-based augmentation of MRI slices in the newly released gazi brains dataset 2024-Oct-04, BMC medical informatics and decision making IF:3.3Q2 DOI:10.1186/s12911-024-02699-6 PMID:39367444	研究论文	本文提出使用StyleGANv2-ADA模型对脑部MRI切片进行数据增强，以提高脑肿瘤分类模型的性能	首次在Gazi Brains 2020数据集上使用StyleGANv2-ADA进行数据增强，显著提高了脑肿瘤分类的准确率	NA	提高脑肿瘤分类模型的准确性	脑肿瘤的分类	计算机视觉	脑肿瘤	StyleGANv2-ADA	GAN	图像	使用了Gazi Brains 2020、BRaTS 2021和Br35h数据集
6559	2024-10-08	Deep learning to estimate response of concurrent chemoradiotherapy in non-small-cell lung carcinoma 2024-Oct-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05708-4 PMID:39367461	研究论文	本文构建了一个深度学习模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应	首次使用深度学习模型预测非小细胞肺癌患者对同步放化疗的反应，并探索了相关的生物信号通路	NA	开发和验证一个深度学习模型，用于预测非小细胞肺癌患者在接受同步放化疗后的反应	非小细胞肺癌患者及其在接受同步放化疗后的反应	机器学习	肺癌	深度学习	ResNet50	图像	229名非小细胞肺癌患者
6560	2024-10-08	Artificial intelligence and telemedicine in epilepsy and EEG: A narrative review 2024-Oct, Seizure DOI:10.1016/j.seizure.2024.08.024 PMID:39222613	综述	本文综述了人工智能和远程医疗在癫痫和脑电图诊断与管理中的应用	人工智能通过机器学习和深度学习提高了脑电图解释和癫痫发作预测的准确性	技术应用受到设备兼容性、临床工作流程整合、数据偏差和数据可用性等限制	探讨人工智能和远程医疗在癫痫和脑电图护理中的应用及其对未来癫痫护理的影响	癫痫患者和脑电图数据	机器学习	癫痫	机器学习	卷积神经网络 (CNN)	脑电图 (EEG)	NA