深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
7021	2024-09-10	CBIL-VHPLI: a model for predicting viral-host protein-lncRNA interactions based on machine learning and transfer learning 2024-07-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-68750-8 PMID:39080344	研究论文	本文提出了一种基于深度学习和迁移学习的新模型CBIL-VHPLI，用于预测病毒-宿主蛋白-lncRNA相互作用	首次提出了一种结合卷积神经网络和双向长短时记忆网络模块的深度学习方法，并结合迁移学习来预测病毒-宿主蛋白-lncRNA相互作用	NA	解码病毒病原体和宿主免疫过程的分子机制	病毒-宿主蛋白-lncRNA相互作用	机器学习	NA	k-mer方法、one-hot编码、CTD方法、Z曲线方法	卷积神经网络、双向长短时记忆网络	蛋白质序列、lncRNA序列	包括植物、动物等的大量多样数据集
7022	2024-09-10	Deep Learning Analysis of Surgical Video Recordings to Assess Nontechnical Skills 2024-Jul-01, JAMA network open IF:10.5Q1 DOI:10.1001/jamanetworkopen.2024.22520 PMID:39083274	研究论文	研究利用手术视频记录中的运动特征自动评估心脏外科手术中的非技术技能	首次探索了通过手术视频记录中的运动特征自动评估非技术技能的可行性	研究仅限于一家医院的特定手术类型，需要进一步验证	探索自动评估手术室中非技术技能的可行性	心脏外科手术中的非技术技能	计算机视觉	心血管疾病	OpenPose库	NA	视频	30例完整的心脏手术
7023	2024-09-10	Knowledge, attitude, and perception of Arab medical students towards artificial intelligence in medicine and radiology: A multi-national cross-sectional study 2024-Jul, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-023-10509-2 PMID:38150076	研究论文	本文评估了阿拉伯医学生对医学和放射学中人工智能的知识、态度和认知	首次对阿拉伯医学生进行多国跨学科研究，评估他们对人工智能在医学和放射学中的知识、态度和认知	样本仅限于阿拉伯国家的医学生，可能无法代表全球医学生的观点	评估医学生对人工智能在医学和放射学中的知识、态度和认知	阿拉伯国家的医学生	NA	NA	NA	NA	NA	4492名医学生
7024	2024-09-09	Psychological resilience is positively correlated with Habenula volume 2024-Nov-15, Journal of affective disorders IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.jad.2024.08.012 PMID:39151760	研究论文	研究心理韧性与人脑Habenula体积之间的正相关关系	首次探讨了Habenula体积与心理韧性之间的关系，并发现这种关系在女性中更为显著	由于横断面设计，无法分析Habenula体积在韧性适应过程中的动态变化	探讨心理韧性、Habenula体积与抑郁倾向之间的关系	健康成年人的心理韧性、Habenula体积及抑郁倾向	NA	NA	深度学习技术	NA	图像	110名健康参与者
7025	2024-09-09	Low energy virtual monochromatic CT with deep learning image reconstruction to improve delineation of endoleaks 2024-Oct, Clinical radiology IF:2.1Q2 DOI:10.1016/j.crad.2024.07.002 PMID:39079807	研究论文	研究低能量虚拟单色CT与深度学习图像重建在增强双能量CT中对内漏轮廓的改进效果	结合40-keV虚拟单色成像与深度学习图像重建，显著提高了内漏的对比噪声比和可视性	研究样本量较小，且仅限于特定类型的内漏	探讨低能量虚拟单色成像与深度学习图像重建在增强双能量CT中对内漏轮廓的改进效果	内漏（EL）在血管内主动脉修复（EVAR）后的轮廓	计算机视觉	心血管疾病	深度学习图像重建（DLIR）	深度学习模型	图像	61名接受血管内主动脉修复并进行增强双能量CT的患者
7026	2024-09-09	A Deep Learning Application of Capsule Endoscopic Gastric Structure Recognition Based on a Transformer Model 2024-Oct-01, Journal of clinical gastroenterology IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCG.0000000000001972 PMID:38457410	研究论文	本文研究了基于Transformer模型的胶囊内窥镜胃结构识别的深度学习应用	首次将Transformer模型应用于胶囊内窥镜胃结构识别，提高了诊断准确性	NA	建立一个胶囊内窥镜胃结构识别模型，以提高深度学习在内窥镜图像识别中的临床适用性	胶囊内窥镜视频中的胃结构	计算机视觉	NA	深度学习	Transformer	视频	3343个胶囊内窥镜视频用于无监督预训练，2433个用于训练，118个用于验证
7027	2024-09-09	Reducing energy consumption in musculoskeletal MRI using shorter scan protocols, optimized magnet cooling patterns, and deep learning sequences 2024-Sep-07, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-024-11056-0 PMID:39242400	研究论文	研究通过优化协议、深度学习加速采集和优化磁体冷却系统来减少肌肉骨骼MRI的能耗	首次系统地研究了通过优化协议、深度学习技术和冷却系统来减少MRI能耗的方法	研究仅在两台MRI扫描仪上进行，结果可能不适用于所有类型的MRI设备	探索在不降低效率或图像质量的前提下，优化MRI扫描仪能耗的策略	肌肉骨骼MRI的能耗优化	医学影像	NA	MRI扫描	深度学习	MRI图像	两台MRI扫描仪（1.5-T Aera和1.5-T Sola）在德国慕尼黑的实践中使用
7028	2024-09-09	Multiparametric ultrasound evaluation of thyroid nodules 2024-Sep-06, Ultraschall in der Medizin (Stuttgart, Germany : 1980) DOI:10.1055/a-2329-2866 PMID:39242086	研究论文	本文探讨了多参数超声在甲状腺结节评估中的应用	本文介绍了使用多参数超声评估（包括超声弹性成像和对比增强超声）以及人工智能（特别是机器学习和深度学习）在提高诊断准确性方面的创新应用	本文指出了标准化TIRADS的必要性、超声弹性成像在常规实践中的作用以及将人工智能整合到临床协议中的挑战	本文旨在改进甲状腺结节的特征评估，减少不必要的介入治疗	甲状腺结节	医学影像	甲状腺疾病	多参数超声评估（包括超声弹性成像和对比增强超声）	机器学习和深度学习	图像	NA
7029	2024-09-09	The utility and reliability of a deep learning algorithm as a diagnosis support tool in head & neck non-melanoma skin malignancies 2024-Sep-06, European archives of oto-rhino-laryngology : official journal of the European Federation of Oto-Rhino-Laryngological Societies (EUFOS) : affiliated with the German Society for Oto-Rhino-Laryngology - Head and Neck Surgery IF:1.9Q2 DOI:10.1007/s00405-024-08951-z PMID:39242415	研究论文	评估深度学习算法作为头颈部非黑色素瘤皮肤恶性肿瘤诊断支持工具的实用性和可靠性	研究首次展示了视觉变换器在头颈部非黑色素瘤皮肤癌早期诊断中的应用潜力	研究为非随机化纵向研究，未来需要进一步研究以明确该技术在初级护理、皮肤科和头颈外科诊所中的作用	评估深度学习方法作为头颈部非黑色素瘤皮肤癌诊断辅助工具的有效性	头颈部非黑色素瘤皮肤恶性肿瘤，包括基底细胞癌和皮肤鳞状细胞癌	计算机视觉	皮肤癌	深度学习	视觉变换器	图像	135名患者，其中92名男性，43名女性，年龄中位数为71岁，包括108例恶性病理和27例良性病理
7030	2024-09-09	Human Tooth Crack Image Analysis with Multiple Deep Learning Approaches 2024-Sep-06, Annals of biomedical engineering IF:3.0Q3 DOI:10.1007/s10439-024-03615-9 PMID:39242442	研究论文	本研究利用多种深度学习方法分析人类牙齿裂纹图像，结合近红外荧光成像技术，提高了裂纹识别的准确性	本研究首次将多种深度学习方法应用于近红外荧光成像技术中的人类牙齿裂纹分析，包括分类、目标检测和超分辨率技术	本研究仅使用了593张裂纹牙齿图像和601张非裂纹牙齿图像，样本量相对较小	本研究的目的是利用深度学习模型提高牙齿裂纹的识别准确性，辅助牙医进行裂纹诊断	本研究的对象是人类牙齿裂纹图像	计算机视觉	NA	近红外荧光成像技术	残差网络、squeezenet1_1、单发多框检测器、超分辨率生成对抗网络	图像	593张裂纹牙齿图像和601张非裂纹牙齿图像
7031	2024-09-09	AI-based seagrass morphology measurement 2024-Sep-05, Journal of environmental management IF:8.0Q1 DOI:10.1016/j.jenvman.2024.122246 PMID:39241598	研究论文	本文开发了一种基于人工智能的机器学习模型，用于自动测量海草的形态参数	利用YOLO-v6深度学习模型自动分类和测量海草的形态参数，提高了测量效率和准确性	NA	研究海草的表型可塑性及其对环境压力的形态适应能力，以评估生态系统健康并制定保护策略	海草的形态参数，包括叶片、根茎和根的长度和宽度	计算机视觉	NA	机器学习	YOLO-v6	图像	三种不同类型的海草对象
7032	2024-09-09	Deep learning meets histones at the replication fork 2024-Sep-05, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.07.055 PMID:39241742	研究论文	本文探讨了在复制叉处，异染色质的表观遗传继承需要将亲代H3-H4四聚体转移到两个子代双链中，并揭示了复制体组件Mrc1/CLASPIN作为H3-H4四聚体伴侣在亲代组蛋白向子代转移中的重要作用	利用酵母遗传学与继承分析以及AlphaFold2-多聚体预测与生物化学相结合的方法，揭示了Mrc1/CLASPIN在组蛋白转移中的新角色	NA	探讨异染色质表观遗传继承的机制	H3-H4四聚体在复制过程中的转移	数字病理学	NA	AlphaFold2-多聚体预测	NA	NA	NA
7033	2024-09-09	Recent trends in AI applications for pelvic MRI: a comprehensive review 2024-Sep, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-024-01861-4 PMID:39096356	综述	本文综述了人工智能在盆腔MRI中的应用及其在诊断路径各个阶段的发展	重点介绍了多中心研究的趋势，以提高AI的通用性	NA	探讨人工智能在盆腔MRI诊断中的应用及其进展	盆腔MRI在前列腺、膀胱、子宫、卵巢和直肠等器官的诊断	计算机视觉	NA	MRI	机器学习和深度学习算法	图像	NA
7034	2024-09-09	Diabetic retinopathy screening through artificial intelligence algorithms: A systematic review 2024 Sep-Oct, Survey of ophthalmology IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.survophthal.2024.05.008 PMID:38885761	综述	本文综述了使用人工智能算法进行糖尿病视网膜病变筛查的现状和方法	本文提出了将卷积神经网络和U-Net架构集成以提高诊断和分类准确性的创新点	主要挑战包括高质量标注数据的获取困难、模型复杂性管理以及在实际临床环境中确保模型输出的可靠性	指导未来在自动糖尿病视网膜病变筛查领域的研究方向	糖尿病视网膜病变及其不同阶段的筛查和分类	计算机视觉	糖尿病	深度学习	卷积神经网络、U-Net	图像	IDRiD数据集包含516张彩色眼底图像
7035	2024-09-09	Classification of gait variation under mental workload in big five personalities 2024-Sep, Gait & posture IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.gaitpost.2024.06.004 PMID:38878610	研究论文	研究通过惯性传感器捕捉步态变化，揭示人格、心理负荷与步态模式之间的关系	首次通过深度学习模型对不同人格维度和心理负荷下的步态进行分类，并评估了不同身体部位传感器数据对分类性能的影响	研究样本量较小，且仅限于走廊行走场景，未来需在更多样化的环境中验证模型性能	揭示人格、心理负荷与步态模式之间的相互关系，并构建步态分类模型	60名参与者在不同心理负荷下的步态数据及其五大人格特质	机器学习	NA	惯性测量单元 (IMU)	滑动窗口长短期记忆网络 (LSTM)	步态数据	60名参与者
7036	2024-09-09	Development and validation of a fully automated tool to quantify 3D foot and ankle alignment using weight-bearing CT 2024-Sep, Gait & posture IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.gaitpost.2024.05.029 PMID:38850852	研究论文	开发并验证了一种全自动工具，用于使用负重CT量化3D足踝对齐	结合负重CT成像和深度学习技术，自动化并增强3D足踝对齐的量化	在某些角度（如距舟覆盖角和远端跖骨关节角）的测量中存在一定的误差	开发一种全自动工具，用于量化3D足踝对齐，并验证其准确性和可靠性	32名接受足踝负重CT的患者	计算机视觉	NA	深度学习	3D nnU-Net	图像	45例用于模型训练和验证，32例用于研究
7037	2024-09-09	Fully Automated Hippocampus Segmentation using T2-informed Deep Convolutional Neural Networks 2024-Sep, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120767 PMID:39103064	研究论文	本文提出了一种利用T2加权MR图像和深度卷积神经网络实现全自动海马体分割的方法	本文创新性地利用高分辨率T2加权图像来增强临床T1加权图像的海马体分割效果	本文未提及具体的局限性	旨在提高海马体分割的准确性和可靠性，以便在阿尔茨海默病临床试验中更精确地估计海马体体积和追踪其体积损失	海马体及其在阿尔茨海默病中的萎缩情况	计算机视觉	阿尔茨海默病	深度学习	3D卷积神经网络	医学影像	包含T1和T2加权图像的多对比度数据集
7038	2024-09-09	RS2-Net: An end-to-end deep learning framework for rodent skull stripping in multi-center brain MRI 2024-Sep, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120769 PMID:39122056	研究论文	本文提出了一种基于Swin-UNETR的轻量级深度学习框架RS2-Net，用于自动化小鼠和大鼠脑部MRI扫描中的颅骨剥离	该框架旨在消除预处理需求，减少工作量，并提供一个能够适应各种MRI图像分辨率的即插即用解决方案	NA	开发一种自动化的小鼠和大鼠脑部MRI扫描颅骨剥离方法	小鼠和大鼠的脑部MRI图像	计算机视觉	NA	MRI	Swin-UNETR	图像	1,037只啮齿动物和1,142张图像，来自89个中心
7039	2024-09-09	A comprehensive overview of diffuse correlation spectroscopy: Theoretical framework, recent advances in hardware, analysis, and applications 2024-Sep, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120793 PMID:39153520	综述	本文全面概述了扩散相关光谱（DCS）的理论框架、硬件、分析方法和应用的最新进展	介绍了高度集成的硅单光子雪崩二极管（SPAD）传感器在DCS中的新应用，并比较了SPAD与现有传感器的性能	NA	帮助新进入者更好地理解和应用扩散相关光谱技术	扩散相关光谱（DCS）的理论框架、硬件架构、数据分析工具及其在医学诊断中的应用	生物医学工程	NA	扩散相关光谱（DCS）	NA	光谱数据	NA
7040	2024-09-08	Probabilistic Forecasting With Modified N-BEATS Networks 2024-Sep-06, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3450832 PMID:39240737	研究论文	本文提出了一种改进的N-BEATS深度学习架构，用于生成参数化概率预测，并展示了其在供应链规划中的应用	提出了对N-BEATS架构的改进，使其能够生成参数化概率预测，并进一步扩展以优化预测精度和稳定性，以及联合优化单期边际和多期累积概率预测	仅在M4月度数据集上进行了验证，未提及在其他数据集上的表现	改进现有的N-BEATS深度学习架构，以生成更稳定和准确的概率预测	单变量时间序列点预测问题	机器学习	NA	深度学习	N-BEATS	时间序列	M4月度数据集