深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
7361	2024-09-11	Expert-Level Detection of Referable Glaucoma from Fundus Photographs in a Safety Net Population: The AI and Teleophthalmology in Los Angeles Initiative 2024-Aug-26, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.08.25.24312563 PMID:39252888	研究论文	开发并测试了一种基于深度学习算法，用于检测洛杉矶县卫生服务部门远程视网膜筛查计划中的可转诊青光眼	该算法在检测可转诊青光眼方面的表现与眼科医生和验光师相当或超过，且不受经验水平影响	NA	开发和测试一种深度学习算法，用于检测可转诊青光眼	青光眼检测	计算机视觉	眼科疾病	深度学习	VGG-19	图像	12,098张图像，来自5,616名患者（2,086名可转诊青光眼，3,530名非青光眼）
7362	2024-09-11	Automated Interpretation of Lung Sounds by Deep Learning in Children With Asthma: Scoping Review and Strengths, Weaknesses, Opportunities, and Threats Analysis 2024-Aug-23, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/53662 PMID:39178033	综述	本文对人工智能辅助儿童哮喘肺音分析的文献进行了范围综述，并进行了优势、劣势、机会和威胁分析	本文创新性地结合了范围综述和SWOT分析，全面评估了人工智能在儿童哮喘肺音分析中的应用	纳入的研究质量普遍较低，缺乏外部验证，且数据收集和解释缺乏标准化	客观回顾人工智能辅助儿童哮喘肺音分析的文献，并提供其优势、劣势、机会和威胁的平衡评估	儿童哮喘患者的肺音分析	机器学习	哮喘	人工智能	NA	音频	学术文献搜索中纳入7项研究，灰色文献搜索中纳入11项研究
7363	2024-09-11	Anatomically constrained tractography of the fetal brain 2024-Aug-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120723 PMID:39029605	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的解剖学约束胎儿脑部纤维束追踪方法	通过在dMRI空间中直接进行胎儿脑组织准确分割，显著提高了纤维束追踪的准确性，并能重建高度弯曲的纤维束如视辐射	NA	改进胎儿脑部扩散加权磁共振成像中的纤维束追踪技术	胎儿脑部白质纤维束	计算机视觉	NA	扩散加权磁共振成像（dMRI）	深度学习方法	图像	独立测试数据
7364	2024-09-11	MRGM: An enhanced catalog of mouse gut microbial genomes substantially broadening taxonomic and functional landscapes 2024-Aug-12, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.08.12.607507 PMID:39211244	研究论文	本文介绍了MRGM，一个包含42,245个非冗余小鼠肠道细菌基因组的全面目录，显著扩展了小鼠肠道微生物的分类和功能范围	MRGM通过改进的基因组质量评估技术，捕获了先前未被充分代表的分类群，并将小鼠肠道微生物蛋白的基因本体注释率从3.2%提高到60%	NA	增强小鼠肠道微生物组研究的转化价值，提供详细和高品质的小鼠肠道微生物基因组目录	小鼠肠道微生物基因组	NA	NA	深度学习	NA	基因组	42,245个非冗余小鼠肠道细菌基因组，涵盖1,524个物种
7365	2024-09-11	A Deep Learning Approach to Predict Recanalization First-Pass Effect following Mechanical Thrombectomy in Patients with Acute Ischemic Stroke 2024-Aug-09, AJNR. American journal of neuroradiology DOI:10.3174/ajnr.A8272 PMID:38871371	研究论文	研究利用深度学习方法预测急性缺血性中风患者在接受机械血栓切除术后首次通过效应的再通效果	首次提出完全自动化的深度学习方法，无需手动分割即可从术前CT和MR影像中预测首次通过效应	NA	开发一种完全自动化的深度学习方法，用于预测急性缺血性中风患者在接受机械血栓切除术后首次通过效应的再通效果	急性缺血性中风患者在接受机械血栓切除术后的首次通过效应	机器学习	中风	深度学习	混合变压器模型	影像	326名接受机械血栓切除术的患者
7366	2024-09-11	CT Reconstruction using Nonlinear Diffusion Posterior Sampling with Detector Blur Modeling 2024-Aug, Conference proceedings. International Conference on Image Formation in X-Ray Computed Tomography PMID:39247222	研究论文	本文提出了一种结合深度学习和探测器模糊物理建模的CT重建方法，以提高空间分辨率	利用扩散模型作为深度图像先验，结合似然性前向模型进行测量，提出了一种非线性扩散后验采样方法	仅在模拟数据上进行了验证，尚未在实际临床数据上进行测试	提高CT重建中的空间分辨率	CT图像重建	计算机视觉	NA	深度学习	扩散模型	图像	模拟数据
7367	2024-09-11	AI-NERD: Elucidation of relaxation dynamics beyond equilibrium through AI-informed X-ray photon correlation spectroscopy 2024-Jul-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49381-z PMID:39009571	研究论文	本文开发了一种无监督深度学习框架，用于从实验数据中自动分类弛豫动力学，无需任何先验物理知识	提出了一个无监督深度学习框架，用于自动分类弛豫动力学，并展示了其在大数据集探索中的应用	NA	理解和解释功能材料在原位环境中的动力学行为	功能材料的弛豫动力学	物理学	NA	X射线光子相关光谱（XPCS）	深度学习（DL）	实验数据	NA
7368	2024-09-11	Utilizing adaptive deformable convolution and position embedding for colon polyp segmentation with a visual transformer 2024-03-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-57993-0 PMID:38538774	研究论文	本文提出了一种基于视觉变换器的结肠息肉分割模型，结合了自适应可变形卷积和位置嵌入	本文提出的Polyp-Vision Transformer (Polyp-ViT)模型在传统Transformer架构基础上，增强了特征提取和位置嵌入的自适应机制	NA	开发一种自动化的结肠息肉检测系统，以辅助早期诊断结直肠癌	结肠息肉	计算机视觉	结直肠癌	视觉变换器 (ViT)	Transformer	图像	在Kvasir-seg和CVC-Clinic DB数据集上进行了测试，分别包含NA和NA个样本
7369	2024-09-11	MRGM: an enhanced catalog of mouse gut microbial genomes substantially broadening taxonomic and functional landscapes 2024 Jan-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2024.2393791 PMID:39230075	研究论文	本文介绍了一种增强版的鼠肠道微生物基因组目录MRGM，显著扩展了分类和功能范围	MRGM包含了42,245个非冗余的鼠肠道细菌基因组，覆盖1,524个物种，通过改进的基因组质量评估技术，捕捉到先前未被充分代表的谱系，并使用深度学习将基因本体注释率提高了18倍	NA	增强鼠肠道微生物组研究的转化价值，提供详细的鼠肠道微生物基因组目录	鼠肠道微生物组	NA	NA	深度学习	NA	基因组	42,245个非冗余的鼠肠道细菌基因组，覆盖1,524个物种
7370	2024-09-11	Deep learning model shows pathologist-level detection of sentinel node metastasis of melanoma and intra-nodal nevi on whole slide images 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1418013 PMID:39238597	研究论文	本文研究了深度学习模型在检测黑色素瘤前哨淋巴结转移和结内痣方面的能力	深度学习模型在检测黑色素瘤前哨淋巴结转移方面达到了病理学家水平，并能区分结内痣和转移	需要进一步验证	评估人工智能在检测黑色素瘤前哨淋巴结转移和结内痣方面的能力	黑色素瘤前哨淋巴结转移和结内痣	数字病理学	黑色素瘤	深度学习	深度学习模型	图像	485张全切片图像，包括196个前哨淋巴结活检样本
7371	2024-09-11	A Deep Learning Based Intelligent Decision Support System for Automatic Detection of Brain Tumor 2024, Biomedical engineering and computational biology IF:2.3Q3 DOI:10.1177/11795972241277322 PMID:39238891	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的智能决策支持系统，用于自动检测脑肿瘤	本文采用了从零开始构建的卷积神经网络（CNN）和迁移学习模型（VGG-16、VGG-19、LeNet-5），并通过数据增强和超参数调优来提高检测精度	NA	开发一种能够自动检测脑肿瘤的智能决策支持系统，以辅助医疗从业者进行诊断	脑肿瘤的自动检测	计算机视觉	脑肿瘤	卷积神经网络（CNN）	卷积神经网络（CNN）	图像	大量脑部图像数据
7372	2024-09-11	RT-DETR-SoilCuc: detection method for cucumber germinationinsoil based environment 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1425103 PMID:39239193	研究论文	本文提出了一种基于RT-DETR的黄瓜发芽检测方法，适用于土壤环境	设计了一种轻量级的实时黄瓜发芽检测模型，通过引入在线图像增强、Adown下采样操作符、广义高效轻量网络、在线卷积重参数化机制和归一化高斯Wasserstein距离损失函数，提高了模型的训练效果和轻量化程度	NA	解决现有深度学习种子发芽检测技术在复杂土壤环境中识别准确率下降的问题	黄瓜发芽过程	计算机视觉	NA	Real-Time DEtection TRansformer (RT-DETR)	RT-DETR-SoilCuc	图像	不同盐浓度压力下的黄瓜发芽实验
7373	2024-09-11	Modeling of SPM-GRU ping-pong ball trajectory prediction incorporating YOLOv4-Tiny algorithm 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0306483 PMID:39240792	研究论文	研究通过先进的计算机视觉和深度学习技术提高乒乓球轨迹预测的准确性，实现实时准确的乒乓球位置和运动轨迹跟踪	结合物理模型和深度学习方法，创新性地应用微型第四代实时目标检测算法与门控循环单元于乒乓球运动分析	NA	提高乒乓球轨迹预测的准确性	乒乓球的运动轨迹	计算机视觉	NA	YOLOv4-Tiny算法	门控循环单元（GRU）	图像	NA
7374	2024-09-11	Evaluation of influencing factors of China university teaching quality based on fuzzy logic and deep learning technology 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0303613 PMID:39240954	研究论文	本文基于模糊逻辑和深度学习技术，评估了中国大学教学质量的影响因素	本文提出了一种结合模糊逻辑和深度学习的评估模型，使用顺序直觉模糊（SIF）辅助长短期记忆（LSTM）模型来精确测量教学质量	NA	评估和提升大学教学质量	大学教学质量的影响因素	机器学习	NA	模糊逻辑，深度学习	LSTM	问卷调查数据	60多名教师和学生的开放式问卷调查
7375	2024-09-11	Multifunctional aggregation network of cell nuclei segmentation aiming histopathological diagnosis assistance: A new MA-Net construction 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0308326 PMID:39241001	研究论文	本文提出了一种基于U-Net的深度学习模型MA-Net，用于从H&E染色图像中准确分割细胞核，以辅助组织病理学诊断	本文创新性地应用了特征融合模块、注意力门单元和空洞空间金字塔池化到U-Net的编码器、解码器、跳跃连接和瓶颈部分，以提升网络在细胞核分割任务中的性能	NA	提升组织病理学图像中细胞核分割的准确性，以辅助自动化诊断系统	H&E染色图像中的细胞核	计算机视觉	NA	深度学习	U-Net	图像	多个公共数据集
7376	2024-09-11	Precision meets generalization: Enhancing brain tumor classification via pretrained DenseNet with global average pooling and hyperparameter tuning 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0307825 PMID:39241003	研究论文	研究通过预训练的DenseNet模型结合全局平均池化和超参数调优，提升脑肿瘤分类的准确性和泛化能力	采用DenseNet架构并结合全局平均池化和超参数调优，显著提高了脑肿瘤分类的准确性和泛化能力	NA	研究如何通过深度学习技术提高脑肿瘤分类的准确性和临床应用的泛化能力	脑肿瘤的分类，特别是三种常见类型：脑膜瘤、胶质瘤和垂体瘤	计算机视觉	脑肿瘤	深度学习	DenseNet	图像	3064张T1加权对比增强MRI图像，来自233名患者
7377	2024-09-11	Diagnostic accuracy of dental caries detection using ensemble techniques in deep learning with intraoral camera images 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0310004 PMID:39241044	研究论文	本文研究了使用深度学习中的集成技术通过口腔内相机图像进行龋齿检测的诊断准确性	本文创新性地应用了集成技术在口腔内相机图像分类任务中，显著提高了龋齿检测的性能	本文未详细讨论集成技术在不同深度学习模型中的具体应用细节	评估基于口腔内相机图像的深度学习技术在龋齿检测中的诊断性能	研究对象为2,682张口腔内相机图像，涉及534名参与者	计算机视觉	口腔疾病	深度学习	ResNet-50, Inception-v3, Inception-ResNet-v2, Faster R-convolutional neural network	图像	2,682张口腔内相机图像，534名参与者
7378	2024-09-11	Deep Learning Based Micro-RNA Analysis of Lipopolysaccharide Exposed Periodontal Ligament Stem Cells Exosomes Reveal Apoptotic and Inflammasome Derived Pathway Activation 2024, Biomedical engineering and computational biology IF:2.3Q3 DOI:10.1177/11795972241277639 PMID:39246530	研究论文	本研究利用深度学习算法分析脂多糖暴露的牙周韧带干细胞外泌体中的微小RNA，揭示了与细胞凋亡和炎症小体激活相关的通路	首次使用深度学习算法识别脂多糖暴露的牙周韧带干细胞外泌体中的新型微小RNA生物标志物	需要未来研究使用独立数据集和实验方法验证这些生物标志物	利用深度学习算法揭示脂多糖暴露的牙周韧带干细胞外泌体中的新型微小RNA生物标志物，以理解其激活通路	脂多糖暴露的牙周韧带干细胞外泌体中的微小RNA	机器学习	牙周疾病	深度学习分析	随机森林	微小RNA表达数据	NCBI GEO DATA SET GSE163489中的健康和脂多糖诱导的牙周韧带干细胞
7379	2024-09-11	Feasibility of tongue image detection for coronary artery disease: based on deep learning 2024, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2024.1384977 PMID:39246581	研究论文	研究探讨了基于深度学习的舌象检测在冠状动脉疾病诊断中的可行性	开发了一种新的冠状动脉疾病诊断算法，结合舌象特征提高了诊断性能	NA	验证舌象在冠状动脉疾病诊断中的潜在价值，并开发一种结合舌象输入的诊断模型	冠状动脉疾病患者	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	Resnet-18	图像	684名患者
7380	2024-09-11	Comparing Deep Learning Performance for Chronic Lymphocytic Leukaemia Cell Segmentation in Brightfield Microscopy Images 2024, Bioinformatics and biology insights IF:2.3Q3 DOI:10.1177/11779322241272387 PMID:39246684	研究论文	本文比较了八种先进的神经网络架构在低对比度明场显微镜图像中对慢性淋巴细胞白血病细胞进行分割的性能	本文采用了八种不同的神经网络架构进行比较，并结合了watershed算法和StarDist工具，以提高细胞边界检测的准确性	本文未详细讨论不同方法在不同应用场景下的适用性，且未提供大规模数据集上的验证结果	研究目的是通过自动检测明场时间序列显微镜图像中的细胞，为细胞形态学和迁移研究提供新的机会	研究对象是慢性淋巴细胞白血病细胞在低对比度明场显微镜图像中的分割	计算机视觉	血液疾病	深度学习	U-net, U-net++, Pyramid Attention Network, Multi-Attention Network, LinkNet, Feature Pyramid Network, DeepLabV3, DeepLabV3+	图像	未明确提及具体样本数量