深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
881	2025-11-13	Investigation of scatter energy window width and count levels for deep learning-based attenuation map estimation in cardiac SPECT/CT imaging 2024-Nov-11, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad8b09 PMID:39447603	研究论文	本研究评估了深度学习在心脏SPECT/CT成像中估计衰减图的性能，重点分析了散射能量窗宽度和计数水平的影响	首次全面分析了不同散射窗作为深度学习输入的影响，并评估了在降低计数水平下深度学习的性能表现	研究仅针对心脏SPECT成像，结果可能不适用于其他类型的SPECT成像	评估深度学习在心脏灌注SPECT成像中生成衰减图的效用，特别是在不同散射窗设置和降低计数水平条件下的表现	心脏SPECT/CT成像中的衰减图估计	医学影像分析	心血管疾病	SPECT/CT成像，深度学习	深度学习模型	SPECT影像数据	1517名受试者（386名测试，1131名训练和验证）	NA	NA	归一化均方误差（NMSE）	NA
882	2025-11-12	EnergyShare AI: Transforming P2P energy trading through advanced deep learning 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36948 PMID:39296059	研究论文	介绍EnergyShare AI系统，通过深度强化学习优化点对点能源交易	将深度强化学习应用于点对点能源交易系统，相比传统线性整数规划模型在优化双向能源传输方面具有优势	NA	提高能源管理效率并降低能源交易成本	消费者和产消者通过太阳能阵列、储能系统和电动汽车进行的能源交易	机器学习	NA	深度强化学习	DRL	能源交易数据	NA	NA	NA	成本节约、能源传输量	NA
883	2025-11-12	Detection of Peri-Pancreatic Edema using Deep Learning and Radiomics Techniques 2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10782032 PMID:40039000	研究论文	本研究开发了一种结合深度学习和影像组学技术自动检测胰周水肿的方法	首次提出自动检测胰周水肿的研究，创建了首个该问题的基准测试，结合了现代深度学习架构和影像组学技术	样本量相对有限（255例患者），需要进一步验证	开发自动检测胰周水肿的方法以辅助胰腺炎诊断和管理	胰腺疾病患者的CT影像数据	医学影像分析	胰腺炎	CT影像分析	Transformer, XGBoost	CT图像	255例胰腺疾病患者	PyTorch	LinTransUNet, Swin-Tiny	Dice系数, mIoU, 召回率, 精确率, 准确率	NA
884	2025-11-12	Image fusion using Y-net-based extractor and global-local discriminator 2024-May-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30798 PMID:38784534	研究论文	提出一种基于Y-Net和全局-局部判别器的GAN模型用于红外与可见光图像融合	采用Y-Net作为生成器主干架构，引入残差密集块和跨模态上下文注意力捷径，结合全局-局部判别器实现无融合规则的端到端图像融合	NA	解决多模态图像融合中特征提取和信息保真度的挑战	红外图像与可见光图像	计算机视觉	NA	图像融合技术	GAN	图像	NA	NA	Y-Net, RDblock, CMSCA, PatchGAN	结构相似性指数, 强度相似性, 梯度相似性	NA
885	2025-11-09	Predicting protein interactions of the kinase Lck critical to T cell modulation 2024-11-07, Structure (London, England : 1993) DOI:10.1016/j.str.2024.09.010 PMID:39368461	研究论文	使用深度学习预测激酶Lck与免疫相关蛋白的关键相互作用，揭示T细胞调控新机制	首次系统预测Lck激酶的蛋白质相互作用网络，发现其与棕榈酰转移酶的特异性靶向机制、与CD45磷酸酶的构象激活机制以及与LAG3免疫检查点的抑制机制	预测结果需要实验验证，筛选范围仅限于约1000个免疫相关蛋白	揭示激酶Lck在T细胞信号转导中的蛋白质相互作用网络	激酶Lck及其相互作用的蛋白质（包括棕榈酰转移酶、CD45磷酸酶、LAG3免疫检查点等）	计算生物学	免疫相关疾病	深度学习结构预测	深度学习	蛋白质序列和结构数据	约1000个免疫相关蛋白质	AF2Complex	AlphaFold2架构	结构建模质量评估	NA
886	2025-11-08	ConoDL: a deep learning framework for rapid generation and prediction of conotoxins 2024-Dec-26, Journal of computer-aided molecular design IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s10822-024-00582-0 PMID:39724258	研究论文	提出一个名为ConoDL的深度学习框架，用于快速生成和预测芋螺毒素	结合迁移学习和大语言模型解决芋螺毒素生成中的数据限制问题，并生成具有新型半胱氨酸支架的人工芋螺毒素	芋螺毒素数据有限且结构复杂，限制了深度学习模型的应用	开发新型方法探索芋螺毒素的分子空间	芋螺毒素（小型二硫键丰富的生物活性肽）	机器学习	NA	深度学习	LLM	序列数据	NA	NA	ConoGen, ConoPred	序列和结构水平的肽特性评估	NA
887	2025-11-08	Liquid Biopsy-Based Detection and Response Prediction for Depression 2024-11-26, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c08233 PMID:39501510	研究论文	通过基于深度学习的血浆细胞外囊泡光谱分析开发抑郁症检测和治疗反应预测方法	首次将深度学习和拉曼光谱技术结合应用于细胞外囊泡分析，实现抑郁症的客观诊断和抗抑郁药物反应预测	样本来源仅限于血浆细胞外囊泡，需要进一步验证在其他人群和临床环境中的适用性	开发基于液体活检的抑郁症客观诊断和治疗反应预测方法	抑郁症患者、健康个体和恐慌障碍患者的血浆细胞外囊泡	机器学习	抑郁症	拉曼光谱分析，细胞外囊泡分离	深度学习	光谱信号数据	未具体说明样本数量，包括抑郁症患者、健康个体和恐慌障碍患者	NA	NA	AUC	NA
888	2025-11-08	Classification of Multi-Parametric Body MRI Series Using Deep Learning 2024-11, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2024.3448373 PMID:39178097	研究论文	开发基于深度学习的多参数体部MRI序列分类模型，用于准确识别8种不同的MRI序列类型	首次针对多参数体部MRI序列开发深度学习分类模型，比较多种网络架构性能，并系统评估不同训练数据量和外部数据集的表现	仅针对8种特定MRI序列类型，模型在外部数据集上性能有所下降	解决DICOM头文件信息错误问题，提高放射科医生阅片效率	多参数体部MRI序列	计算机视觉	NA	多参数磁共振成像(mpMRI)	CNN	医学影像	超过729项研究的多机构mpMRI数据，包含DLDS和CPTAC-UCEC外部数据集	NA	ResNet, EfficientNet, DenseNet-121	F1-score, 准确率	NA
889	2025-11-08	Vector field attention for deformable image registration 2024-Nov, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.11.6.064001 PMID:39513093	研究论文	提出一种用于可变形图像配准的向量场注意力框架，通过直接检索特征图中的位置对应关系来提高配准效率	引入无需可学习参数的注意力模块，能够直接从特征图中检索像素级对应关系，改进了现有网络设计	NA	开发更高效的可变形图像配准方法	固定图像和移动图像之间的空间对应关系	医学图像处理	NA	深度学习	注意力机制	医学图像	公共数据集和Learn2Reg挑战赛数据	NA	向量场注意力(VFA)	配准精度	NA
890	2025-11-04	A quantitative analysis of artificial intelligence research in cervical cancer: a bibliometric approach utilizing CiteSpace and VOSviewer 2024, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2024.1431142 PMID:39296978	文献计量学研究	通过文献计量学方法分析人工智能在宫颈癌研究中的应用现状和发展趋势	首次综合运用CiteSpace和VOSviewer对宫颈癌人工智能研究领域进行系统的文献计量分析	仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献	评估人工智能在宫颈癌研究中的作用，识别研究趋势和未来方向	927篇相关学术论文（2008-2024年）	文献计量学	宫颈癌	文献计量分析	NA	文献元数据	927篇文章，涉及5,299位作者，81个地区	CiteSpace, VOSviewer	NA	引用频率，爆发排名分析	NA
891	2025-11-03	A Comparison of CT-Based Pancreatic Segmentation Deep Learning Models 2024-11, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2024.06.015 PMID:38944630	研究论文	比较五种基于CT的胰腺分割深度学习模型在不同扫描和患者特征下的性能表现	首次系统评估五种高性能胰腺分割模型在不同临床特征下的分层性能，并识别影响分割准确性的关键因素	回顾性研究设计，部分患者性别和年龄数据缺失，仅评估了五种特定模型	评估和比较不同深度学习模型在CT胰腺分割任务中的性能表现	胰腺CT图像分割	计算机视觉	胰腺疾病	CT成像	深度学习模型	CT医学图像	352例CT扫描（30例女性，25例男性，297例性别未知；年龄58±7岁，327例年龄未知），训练数据规模从282到8448例扫描不等	NA	U-Net, Swin Transformer, nnUNet	Dice系数, Hausdorff距离, 平均表面距离	NA
892	2025-11-03	Cardiac MR Fingerprinting: Overview, Technical Developments, and Applications 2024-Nov, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29206 PMID:38153855	综述	本文全面概述了心脏磁共振指纹技术(MRF)的发展现状、技术进展及其临床应用	系统总结了心脏MRF这一新兴多参数成像技术的完整技术框架，包括脉冲序列实现、字典生成、快速k空间采样和模式识别方法	证据等级为5级，技术效能处于第一阶段，表明该技术仍处于发展初期	探讨如何通过多参数MRI技术简化心脏磁共振检查流程，提高检查效率和可重复性	心脏磁共振成像技术及其在心血管疾病评估中的应用	医学影像	心血管疾病	磁共振指纹技术(MRF)、多参数MRI、同时多层采样、3D采样、运动校正算法	深度学习	磁共振图像	NA	NA	NA	NA	NA
893	2025-11-03	Tricuspid valve flow measurement using a deep learning framework for automated valve-tracking 2D phase contrast 2024-Nov, Magnetic resonance in medicine IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mrm.30163 PMID:38817154	研究论文	开发了一种基于深度学习的自动瓣膜追踪二维相位对比方法，用于测量动态三尖瓣血流	首次将深度学习网络TVnet应用于自动追踪三尖瓣平面，实现了动态采集平面跟踪瓣膜运动的二维相位对比成像	样本量较小（9名健康受试者和2名患者），需要更大规模研究验证	解决心血管磁共振测量三尖瓣血流速度的临床挑战	三尖瓣血流和舒张功能	医学影像分析	心血管疾病	二维相位对比磁共振成像	深度学习网络	心脏长轴电影图像和相位对比图像	11名受试者（9名健康人，2名患者）	NA	TVnet	偏倚, 标准差, 组内相关系数	NA
894	2025-11-03	A deep learning-based approach for unbiased kinematic analysis in CNS injury 2024-Nov, Experimental neurology IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114944 PMID:39242068	研究论文	开发基于深度学习的无标记运动学分析系统用于中枢神经系统损伤研究	开发了两种基于深度学习的无标记运动学分析范式（MotorBox和MotoRater），消除了研究者偏见和变异性	NA	改进脊髓损伤后功能评估方法，提高临床转化成功率	小鼠运动功能	计算机视觉	脊髓损伤	深度学习	深度学习算法	视频	NA	DeepLabCut	NA	运动指标、步态指标	NA
895	2025-11-03	Joint self-supervised and supervised contrastive learning for multimodal MRI data: Towards predicting abnormal neurodevelopment 2024-11, Artificial intelligence in medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.artmed.2024.102993 PMID:39369634	研究论文	提出一种联合自监督和监督对比学习方法，用于从多模态MRI数据中学习鲁棒潜在特征表示，以预测异常神经发育	开发了联合自监督和监督对比学习的新方法，能够将异质多模态特征投影到共享公共空间，融合不同模态间的互补和相似信息	NA	预测异常神经发育	多模态MRI数据（结构、扩散张量、功能磁共振成像）	医学影像分析	神经发育异常	磁共振成像（MRI）	对比学习	多模态医学影像	两个独立数据集	NA	对比学习网络	NA	NA
896	2025-11-03	A Deep Learning System to Predict Epithelial Dysplasia in Oral Leukoplakia 2024-Nov, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241272048 PMID:39382109	研究论文	开发基于深度学习的系统通过口腔照片预测口腔白斑的上皮异常增生概率	首次使用深度学习模型通过非侵入性口腔照片预测口腔白斑的上皮异常增生，为临床决策提供支持	研究基于回顾性数据，需要进一步前瞻性验证	开发能够预测口腔白斑上皮异常增生的智能诊断系统	口腔白斑患者的口腔照片图像	医学影像分析	口腔癌前病变	深度学习	CNN	图像	2,073张口腔白斑图像	NA	EfficientNet-B2	Brier分数, AUC, 平衡准确率	NA
897	2025-11-03	A Survey on Hyperlink Prediction 2024-Nov, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2023.3286280 PMID:37363843	综述	本文系统综述了超图中的超链接预测方法，并通过基准研究比较了不同类别方法的性能	首次对超链接预测领域进行系统全面的综述，并采用链接预测的经典分类法将现有方法分为四类	NA	系统梳理和比较超链接预测方法，为相关研究提供参考	超图中的超链接预测方法	机器学习	NA	NA	深度学习	超图数据	NA	NA	NA	NA	NA
898	2025-11-03	Deep learning-based Fast Volumetric Image Generation for Image-guided Proton Radiotherapy 2024-Nov, IEEE transactions on radiation and plasma medical sciences IF:4.6Q1 DOI:10.1109/trpms.2024.3439585 PMID:40385936	研究论文	开发基于深度学习的快速体积图像生成框架，用于图像引导质子放疗中的肺癌治疗	提出结合正交kV X射线投影采集和深度学习的新型体积图像重建框架，专门针对FLASH超高剂量率放射治疗场景	研究仅基于30例肺癌患者数据，样本量相对有限；仅评估了肺部靶区	开发快速体积图像重建方法以提高图像引导质子放疗的精准度	肺癌患者	医学影像分析	肺癌	kV X射线投影，四维计算机断层扫描	深度学习	X射线投影图像，CT图像	30例肺癌患者，每人包含十个呼吸时相的四维CT数据集	NA	NA	平均绝对误差，峰值信噪比，结构相似性指数，水等效厚度误差	NA
899	2025-11-03	DeepSomatic: Accurate somatic small variant discovery for multiple sequencing technologies 2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.08.16.608331 PMID:39229187	研究论文	提出一种名为DeepSomatic的深度学习方法，用于从短读长和长读长测序数据中准确检测体细胞小变异	首个能够同时处理短读长和长读长测序数据的体细胞变异检测方法，并提供了公开的训练和基准数据集	未提及方法在特定癌症类型或复杂基因组区域的性能限制	开发高精度的体细胞变异检测工具，支持多种测序技术	体细胞单核苷酸变异(SNVs)和插入缺失(indels)	生物信息学	癌症	Illumina短读长测序, PacBio HiFi长读长测序, Oxford Nanopore长读长测序	深度学习	基因组测序数据	5对匹配的肿瘤-正常细胞系样本	NA	NA	NA	NA
900	2025-11-03	Comparison of deep learning approaches to estimate injury severity from the International Classification of Diseases codes 2024, Traffic injury prevention IF:1.6Q4 DOI:10.1080/15389588.2024.2356663 PMID:39485495	研究论文	比较不同深度学习方法从ICD编码估计损伤严重程度的性能	首次系统比较前馈神经网络与神经机器翻译模型在损伤严重程度估计中的表现，并对比直接与间接估计方法的优劣	仅使用美国国家创伤数据库数据，可能在其他医疗系统中泛化性有限	开发从ICD编码准确估计损伤严重程度的方法	创伤患者的ICD编码数据	自然语言处理	创伤	深度学习方法	前馈神经网络,神经机器翻译	医疗编码文本数据	训练集2,031,793例(2017-2018年)，测试集1,091,792例(2019年)	NA	编码器-解码器架构	ISS≥16正确分类百分比,ISS精确匹配百分比	GPU(具体型号未指定)