深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11521	2024-08-07	Predict lncRNA-drug associations based on graph neural network 2024, Frontiers in genetics IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fgene.2024.1388015 PMID:38737125	研究论文	本研究利用图卷积网络（GCN）和图注意力网络（GAT）基于lncRNA和药物相似网络预测lncRNA-药物关联（LDAs）	提出了一种基于深度学习的框架，用于预测新的lncRNA-药物关联，该方法在五个数据集上实现了良好的性能（平均AUCs > 0.92）	NA	开发预测lncRNA-药物关联的方法，以促进基于lncRNA的药物开发	lncRNA和药物的关联	机器学习	NA	图卷积网络（GCN），图注意力网络（GAT）	GCN，GAT	网络数据	五个数据集
11522	2024-08-07	FM-FCN: A Neural Network with Filtering Modules for Accurate Vital Signs Extraction 2024, Research (Washington, D.C.) DOI:10.34133/research.0361 PMID:38737196	研究论文	本文提出了一种名为过滤模块全卷积网络（FM-FCN）的新型网络，结合传统过滤技术与神经网络，用于增强生理信号并抑制噪声	FM-FCN通过引入过滤模块（FM）作为网络模块，利用过滤器结构消除不需要的干扰，构建了深度学习与信号处理方法之间的桥梁	NA	提高生理信号提取的准确性和可靠性	远程光电容积脉搏波（PPG）信号的提取和心率（HR）估计	机器学习	NA	全卷积网络（FCN）	CNN	信号	NA
11523	2024-08-07	How AI drives innovation in cardiovascular medicine 2024, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2024.1397921 PMID:38737711	comments	本文总结了人工智能和深度学习在心血管医学领域的一些重要进展	NA	NA	探讨人工智能在心血管医学中的应用及其对患者护理的影响	心血管医学领域	machine learning	cardiovascular disease	AI	deep learning	NA	NA
11524	2024-08-07	Evaluation of two deep learning-based approaches for detecting weeds growing in cabbage 2024-Jun, Pest management science IF:3.8Q1 DOI:10.1002/ps.7990 PMID:38323798	研究论文	本研究比较了两种基于深度学习的方法在卷心菜中检测杂草的效果	提出了一种间接检测杂草的方法，通过生成覆盖作物的边界框，并将边界框外的绿色像素视为杂草	直接检测杂草的性能较低，可能是由于不同密度和生长阶段的多种杂草物种及其不同的植物形态	比较两种不同的深度学习方法在卷心菜中检测杂草的效果	卷心菜中的杂草	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv5, YOLOv8	图像	NA
11525	2024-08-07	OMERACT validation of a deep learning algorithm for automated absolute quantification of knee joint effusion versus manual semi-quantitative assessment 2024-Jun, Seminars in arthritis and rheumatism IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.semarthrit.2024.152420 PMID:38422727	research paper	本文通过OMERACT过滤器评估深度学习（DL）自动量化膝关节积液-滑膜炎的效果	使用DL算法自动量化膝关节积液体积，并与专家的手动半定量评分进行比较	需要进一步评估区分度和真实性与临床结果的关系，以完全满足OMERACT过滤器的要求	评估深度学习自动量化膝关节积液的准确性	膝关节积液的量化	machine learning	NA	deep learning	NA	MRI image	53名OAI受试者
11526	2024-08-07	Image2InChI: Automated Molecular Optical Image Recognition 2024-May-13, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.3c02082 PMID:38359459	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的自动化分子光学图像识别模型Image2InChI，用于将分子图像转换为机器可读的表示	引入了具有注意机制的新型特征融合网络，以整合图像块和InChI预测	NA	提高分子图像识别的准确性和效率	分子图像的自动识别和分析	计算机视觉	NA	深度学习	SwinTransformer和Transformer Decoder	图像	NA
11527	2024-08-07	Intramolecular and Water Mediated Tautomerism of Solvated Glycine 2024-May-13, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.4c00273 PMID:38620066	研究论文	本研究使用基于深度学习势能的增强采样分子动力学方法，探究了水溶液中甘氨酸的互变异构平衡	本研究首次观察到甘氨酸的互变异构可以通过分子内和分子间质子转移两种途径进行，并且这两种途径的能垒相当，对反应通量的贡献几乎相等	NA	理解互变异构现象并表征溶剂对动态过程的影响	甘氨酸在水溶液中的互变异构平衡	NA	NA	增强采样分子动力学	深度学习模型	分子动力学模拟数据	NA
11528	2024-08-07	MMSyn: A New Multimodal Deep Learning Framework for Enhanced Prediction of Synergistic Drug Combinations 2024-May-13, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.4c00165 PMID:38676916	研究论文	本文提出了一种新的多模态深度学习框架MMSyn，用于增强协同药物组合的预测	MMSyn框架结合了药物分子特征和癌症细胞系数据，通过注意力机制和交互模块集成处理特征，提高了药物组合预测的准确性	NA	开发一种有效的深度学习框架，用于预测协同药物组合	协同药物组合的预测	机器学习	癌症	深度学习	多层感知器	基因表达数据、DNA拷贝数、通路活性	使用了多种药物分子特征和癌症细胞系数据
11529	2024-08-07	EEGminer: discovering interpretable features of brain activity with learnable filters 2024-May-13, Journal of neural engineering IF:3.7Q2 DOI:10.1088/1741-2552/ad44d7 PMID:38684154	研究论文	本文提出了一种新的可微分解码流程，包括可学习滤波器和预定的特征提取模块，用于从多通道EEG记录中学习信息丰富的潜在表示	引入了由广义高斯函数参数化的滤波器，提供平滑的导数以实现稳定的端到端模型训练，并允许学习可解释的特征	NA	设计一个系统，从多通道EEG活动中学习信息丰富的潜在表示	EEG数据中的脑活动模式	神经科学	NA	可学习滤波器	可微分解码模型	EEG数据	721名受试者
11530	2024-08-07	Omics data classification using constitutive artificial neural network optimized with single candidate optimizer 2024-May-12, Network (Bristol, England) DOI:10.1080/0954898X.2024.2348726 PMID:38736309	研究论文	本文提出了一种使用单候选优化器优化的组成型人工神经网络进行omics数据分类的方法	该方法通过使用自适应变分贝叶斯滤波进行数据预处理，并采用斑马优化算法进行降维，以及组成型人工神经网络进行分类，提高了分类准确性	NA	提高omics数据分类的准确性	omics数据	机器学习	NA	自适应变分贝叶斯滤波, 斑马优化算法, 组成型人工神经网络	组成型人工神经网络	omics数据	NA
11531	2024-08-07	The analysis of ecological security and tourist satisfaction of ice-and-snow tourism under deep learning and the Internet of Things 2024-May-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-61598-y PMID:38730047	研究论文	本文提出了一种基于深度学习和物联网技术的预测方法，用于解决冰雪旅游领域的生态安全和游客满意度问题	该方法通过结合深度学习模型和物联网技术，提高了预测冰雪旅游生态安全和游客满意度的准确性和性能指标	NA	提出一种新的预测方法，以提高冰雪旅游生态安全和游客满意度的预测准确性	冰雪旅游的生态安全和游客满意度	机器学习	NA	深度学习 (DL) 和物联网 (IoT)	卷积神经网络和循环神经网络	环境数据和游客行为数据	NA
11532	2024-08-07	Fine tuning deep learning models for breast tumor classification 2024-05-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-60245-w PMID:38730248	研究论文	本文提出了一种利用深度学习模型对乳腺癌肿瘤进行良恶性分类的方法	使用自定义卷积神经网络（Custom CNN）模型，结合灰狼优化（GWO）和改进的猩猩部队优化（MGTO）算法进行超参数调优，显著提高了分类准确率	NA	提高乳腺癌肿瘤良恶性分类的准确性	乳腺癌肿瘤的良恶性分类	计算机视觉	乳腺癌	卷积神经网络（CNN）	Custom CNN	图像	使用BreakHis数据集中的组织病理学图像
11533	2024-08-07	Fragment ion intensity prediction improves the identification rate of non-tryptic peptides in timsTOF 2024-May-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48322-0 PMID:38730277	研究论文	本文研究了在timsTOF平台上通过片段离子强度预测提高非胰蛋白酶肽的鉴定率	通过深度学习模型Prosit对片段离子强度预测进行微调，显著提高了免疫肽的鉴定率	NA	提高免疫肽的鉴定率，支持免疫疗法和疫苗开发	非胰蛋白酶肽的鉴定	蛋白质组学	NA	质谱分析	深度学习	质谱数据	分析了302,105个独特的合成非胰蛋白酶肽，生成了包含93,227个MS/MS光谱的基准数据集
11534	2024-08-07	A dual-branch selective attention capsule network for classifying kiwifruit soft rot with hyperspectral images 2024-05-09, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-61425-4 PMID:38724603	研究论文	本研究提出了一种双分支选择性注意力胶囊网络（DBSACaps），用于基于高光谱图像准确检测猕猴桃软腐病	使用双分支结构分别提取光谱和空间特征，并通过注意力机制融合这些特征，提高了分类准确性	NA	旨在通过深度学习方法基于高光谱图像准确检测猕猴桃软腐病	猕猴桃软腐病	计算机视觉	NA	高光谱图像	胶囊网络	图像	猕猴桃软腐病数据集
11535	2024-08-07	GAN Inversion for Data Augmentation to Improve Colonoscopy Lesion Classification 2024-May-07, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2024.3397611 PMID:38713568	研究论文	本研究探讨了使用生成对抗网络（GAN）生成的合成图像进行数据增强，以改善结肠镜检查病变分类的效果	通过将图像对反转到语义丰富且解耦的潜在空间并操纵潜在表示来生成新的合成图像，这种方法在结肠镜检查数据增强技术中表现优异，无需重新训练多个生成模型	NA	探索使用合成图像进行数据增强以解决结肠镜检查病变分类中标注数据不足的问题	结肠镜检查病变分类	计算机视觉	NA	生成对抗网络（GAN）	GAN	图像	NA
11536	2024-08-07	Enhancing Fetal Electrocardiogram Signal Extraction Accuracy through a CycleGAN Utilizing Combined CNN-BiLSTM Architecture 2024-May-06, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s24092948 PMID:38733053	研究论文	本文提出了一种新的深度学习模型CBLS-CycleGAN，用于提高胎儿心电图信号提取的准确性	模型结合了CNN提取的空间特征和BiLSTM提取的时间特征，确保重建信号具有空间和时间依赖性的组合特征	NA	提高胎儿心电图信号提取的准确性，以反映胎儿在子宫内的发育状态和生理心脏活动	胎儿心电图信号	机器学习	NA	CycleGAN	CNN-BiLSTM	信号	使用两个真实的胎儿心电图信号数据库进行评估
11537	2024-08-07	MultiFuseYOLO: Redefining Wine Grape Variety Recognition through Multisource Information Fusion 2024-May-06, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s24092953 PMID:38733058	研究论文	本研究提出了一种基于多源信息融合的方法，通过优化和改进YOLOV7模型，形成MultiFuseYOLO模型，以提高葡萄酒葡萄品种识别的准确性	本研究通过引入多源信息融合方法，特别是基于SynthDiscrim算法，显著提高了对相似葡萄品种的识别精度	NA	旨在通过多源信息融合方法提高葡萄酒葡萄品种识别的准确性和全面性	葡萄酒葡萄品种的识别	计算机视觉	NA	多源信息融合	YOLO	图像	未具体说明样本数量
11538	2024-08-07	An Optimized Instance Segmentation of Underlying Surface in Low-Altitude TIR Sensing Images for Enhancing the Calculation of LSTs 2024-May-05, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s24092937 PMID:38733039	研究论文	本研究提出了一种深度学习方法，用于优化低空热红外遥感图像中地表的实例分割，以提高地表温度计算的准确性	本研究采用基于掩膜的卷积神经网络进行像素级分类和分割，并通过优化超参数和架构，提高了地表分类的精确度	NA	提高基于低空热红外遥感图像的地表温度计算准确性	低空热红外遥感图像中的地表实例分割	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	1350张标注的热红外图像用于训练，150张新图像用于验证
11539	2024-08-07	Predicting Transcription Factor Binding Sites with Deep Learning 2024-May-03, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25094990 PMID:38732207	研究论文	本文提出了一种基于双向Transformer编码器的深度学习方法，用于预测转录因子结合位点，并通过实验验证了其在不同细胞系中的有效性	本文提出的方法结合了双向长短期记忆层和胶囊层，以提高遗传数据嵌入的鲁棒性和意义	NA	研究转录因子如何调控基因表达及其在治疗中的潜在应用	转录因子结合位点的预测	机器学习	NA	ChIP-seq	双向Transformer编码器	基因数据	使用了ENCODE数据库中的五个细胞系（A549, GM12878, Hep-G2, H1-hESC, 和 Hela）以及五个额外的细胞系进行测试
11540	2024-08-07	AI Concepts for System of Systems Dynamic Interoperability 2024-May-03, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s24092921 PMID:38733028	研究论文	本文探讨了在系统工程中动态建立异构网络物理系统间互操作性的问题，并总结了相关领域的最新进展	文章提出了利用机器学习和深度学习方法来解决互操作性问题的新思路，并讨论了相关架构和开放问题	目前尚未有能够完全解决复杂系统间动态互操作性的概念实例，且需要实际测试环境	研究如何自动建立具有目的性通信的系统，以实现动态互操作性	异构网络物理系统间的互操作性问题	机器学习	NA	深度学习	神经网络	文本和代码	NA