深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11861	2024-08-07	Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold 3 2024-May-08, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-024-07487-w PMID:38718835	研究论文	本文介绍了AlphaFold 3模型，该模型采用更新后的基于扩散的架构，能够联合预测包括蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基在内的复合物结构	AlphaFold 3模型在蛋白质-配体相互作用、蛋白质-核酸相互作用以及抗体-抗原预测方面均显著优于现有工具	NA	旨在提高生物分子相互作用结构预测的准确性	蛋白质、核酸、小分子、离子和修饰残基的复合物结构	机器学习	NA	深度学习	AlphaFold 3	结构数据	NA
11862	2024-08-07	Artificial intelligence-based assessment of built environment from Google Street View and coronary artery disease prevalence 2024-May-07, European heart journal IF:37.6Q1 DOI:10.1093/eurheartj/ehae158 PMID:38544295	研究论文	本研究利用机器视觉技术从Google Street View（GSV）图像中提取建筑环境特征，并探讨其与美国城市冠状动脉疾病（CHD）患病率的关系	本研究首次使用深度学习技术从GSV图像中提取建筑环境特征，并将其与CHD患病率进行关联分析	本研究为横断面研究，未来需要纵向研究来验证结果的长期有效性	探讨机器视觉技术在评估建筑环境与心血管疾病患病率关系中的应用	建筑环境特征与冠状动脉疾病患病率的关系	机器学习	心血管疾病	卷积神经网络	CNN	图像	0.53百万张GSV图像覆盖789个美国城市的普查区域
11863	2024-08-07	Deep learning-based whole-body PSMA PET/CT attenuation correction utilizing Pix-2-Pix GAN 2024-May-07, Oncotarget DOI:10.18632/oncotarget.28583 PMID:38712741	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的人工智能工具，利用Pix-2-Pix GAN生成非衰减校正PET图像的衰减校正PET图像，以减少低剂量CT扫描的需求	使用Pix-2-Pix GAN模型生成衰减校正PET图像，显示出与原始图像高度相关的SUV指标	NA	开发一种人工智能工具，用于减少肿瘤患者治疗随访期间进行的PET/CT研究的辐射剂量	前列腺癌患者的18F-DCFPyL PSMA PET-CT研究	机器学习	前列腺癌	Pix-2-Pix GAN	GAN	图像	302名前列腺癌患者的PET-CT研究，分为训练、验证和测试组（分别为183、60、59例）
11864	2024-08-07	Automated detection of steno-occlusive lesion on time-of-flight magnetic resonance angiography: an observer performance study 2024-May-07, AJNR. American journal of neuroradiology DOI:10.3174/ajnr.A8334 PMID:38719612	研究论文	本研究旨在验证一种人工智能模型在检测颅内动脉狭窄闭塞性病变中的临床效用	本研究首次评估了人工智能方法在检测颅内动脉病理病变中的临床益处，特别是在提高检测准确性和减少阅读时间方面	尽管人工智能模型提高了检测准确性，但使用该模型后阅读时间有所增加	验证人工智能模型在检测颅内动脉狭窄闭塞性病变中的临床效用	颅内动脉狭窄闭塞性病变	计算机视觉	脑血管疾病	NA	人工智能模型	图像	138张TOF-MRA图像
11865	2024-08-07	Deep learning sheds new light on non-orthogonal optical multiplexing 2024-May-06, Light, science & applications DOI:10.1038/s41377-024-01460-y PMID:38710686	研究论文	提出了一种用于非正交输入通道编码的深度神经网络，通过多模光纤恢复散斑图像	该方法为通过散射介质的非正交光学复用提供了新的视角	NA	探索通过散射介质的非正交光学复用的新方法	非正交输入通道编码及散斑图像恢复	机器学习	NA	深度学习	深度神经网络	图像	NA
11866	2024-08-07	A comprehensive laser image dataset for real-time measurement of wheelset geometric parameters 2024-May-06, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-03288-y PMID:38710697	研究论文	本文构建了一个公开的轮对激光图像数据集（WLI-Set），用于实时测量轮对几何参数	首次构建了一个包含丰富标注的多线激光条纹图像的公开轮对数据集，有助于推动轮对研究	NA	开发一个高质量的轮对图像数据集，以支持深度学习模型在轮对几何参数测量中的应用	轮对图像及其几何参数	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	包含四个子数据集（原始、修复、分割和中心线）的轮对激光图像数据集
11867	2024-08-07	Enhancing tuberculosis vaccine development: a deconvolution neural network approach for multi-epitope prediction 2024-05-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-59291-1 PMID:38710737	研究论文	本文首次采用基于解卷积神经网络（DCNN）和双向长短期记忆网络（DCNN-BiLSTM）的深度学习框架，用于预测针对六种Mtb H37Rv蛋白的Mtb多表位疫苗（MtbMEV）亚单位，以增强结核病疫苗的开发。	首次应用深度学习框架DCNN-BiLSTM于结核病多表位疫苗预测，模型准确率达到99.5%，优于其他机器学习模型。	研究结果需通过进一步的实验验证，以建立未来临床试验的候选疫苗。	开发针对结核病的高效疫苗。	针对六种Mtb H37Rv蛋白的Mtb多表位疫苗亚单位。	机器学习	结核病	解卷积神经网络（DCNN）和双向长短期记忆网络（DCNN-BiLSTM）	DCNN-BiLSTM	蛋白质数据	六种Mtb H37Rv蛋白
11868	2024-08-07	Smart traffic management of vehicles using faster R-CNN based deep learning method 2024-May-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-60596-4 PMID:38710753	研究论文	本文研究了一种基于Faster R-CNN深度学习方法的智能车辆交通管理技术	提出了一种四步法解决车辆分割问题，包括自适应背景模型最小化、Faster R-CNN子网操作、初始细化及扩展拓扑主动网结果优化	未明确提及	解决智能车辆交通管理中的车辆分割问题	车辆分割、交通密度估计和车辆追踪	计算机视觉	NA	Faster R-CNN	CNN	视频	未明确提及
11869	2024-08-07	Detecting emotions through EEG signals based on modified convolutional fuzzy neural network 2024-05-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-60977-9 PMID:38710806	研究论文	本研究通过改进的卷积模糊神经网络基于脑电信号进行情绪识别	本研究改进了卷积模糊神经网络（CFNN）的架构，以提高情绪识别的准确性和可靠性	NA	提高基于脑电信号的情绪识别系统的准确性和可靠性	脑电信号的情绪识别	机器学习	NA	脑电图（EEG）	卷积模糊神经网络（CFNN）	脑电信号	未具体说明样本数量
11870	2024-08-07	Toward robust and high-throughput detection of seed defects in X-ray images via deep learning 2024-May-06, Plant methods IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s13007-024-01195-2 PMID:38711143	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的2D X射线图像种子缺陷检测方法，通过X-Robustifier管道实现快速且鲁棒的检测。	引入了特定的数据增强技术以补偿缺陷比例低的问题，并提高了对X射线成像系统物理参数变化的鲁棒性。	NA	优化种子批次的品质，通过非破坏性成像技术检测种子内部缺陷。	种子中的缺陷检测。	计算机视觉	NA	X射线成像	物体检测神经网络	图像	缺陷和无缺陷的种子2D X射线图像
11871	2024-08-07	Glaucoma detection using non-perfused areas in OCTA 2024-05-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-60839-4 PMID:38705883	研究论文	本文提出了一种基于光学相干断层扫描血管成像（OCTA）中非灌注区域的概率密度函数特征，用于区分青光眼患者和健康对照的新方法	该方法通过计算灌注距离区域的特征，减少了血管分割错误的影响，并且在不同毛细血管丛上的表现优于使用手工特征的先前方法	该方法依赖于血管分割的准确性，尽管灌注距离测量对分割错误较不敏感，但仍可能受其影响	旨在开发一种更敏感且计算效率高的方法，用于通过OCTA图像检测青光眼	青光眼患者和健康对照者的OCTA图像中的非灌注区域	数字病理学	青光眼	光学相干断层扫描血管成像（OCTA）	NA	图像	未具体说明样本数量
11872	2024-08-07	Image factory: A method for synthesizing novel CT images with anatomical guidance 2024-May, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.16864 PMID:38043097	研究论文	本文提出了一种基于解剖指导合成新型CT图像的方法	该方法能够利用小规模标注数据集和大规模非标注数据集，通过一系列步骤生成大规模标注数据集，用于医学应用中的深度学习网络训练	NA	解决医学应用中深度学习因缺乏大量标注、注释或分割训练数据集而受限的问题	肺部CT图像	计算机视觉	NA	StyleGAN, U-Net, CycleGAN/Pixel-to-Pixel (P2P)	GAN	图像	30名患者的标注肺部CT数据集和14000名患者的非标注高分辨率CT数据集
11873	2024-08-07	Hybrid-supervised deep learning for domain transfer 3D protoacoustic image reconstruction 2024-Apr-03, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad3327 PMID:38471184	研究论文	本研究开发了一种混合监督深度学习方法，用于解决质子声学成像中有限视角问题，并实现了3D质子剂量验证的高效重建	提出了一种两阶段的深度学习方法Recon-Enhance，其中Recon阶段使用基于transformer的网络从原始声学信号重建初始压力图，Enhance阶段使用3D U-net进一步增强图像质量	NA	解决质子声学成像中有限视角问题，提高3D质子剂量验证的准确性和效率	质子声学成像中的3D剂量验证	机器学习	前列腺癌	深度学习	transformer, 3D U-net	图像	126名前列腺癌患者的数据集
11874	2024-08-07	A deep learning based holistic diagnosis system for immunohistochemistry interpretation and molecular subtyping 2024-04, Neoplasia (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.neo.2024.100976 PMID:38412576	研究论文	开发了一种基于深度学习的整体智能乳腺癌肿瘤诊断系统，用于免疫组化图像的自动解读和分子亚型分类	该系统通过卷积神经网络自动提取和分析免疫染色多特征，提高了免疫组化图像解读的效率和准确性	NA	提高乳腺癌免疫组化图像解读的效率和准确性	乳腺癌的分子亚型分类	机器学习	乳腺癌	卷积神经网络	CNN	图像	NA
11875	2024-08-07	Application of computer vision and deep learning models to automatically classify medically important mosquitoes in North Borneo, Malaysia 2024-Apr, Bulletin of entomological research IF:1.6Q2 DOI:10.1017/S000748532400018X PMID:38557482	研究论文	本研究利用深度学习模型MobileNetV2自动检测和分类马来西亚北婆罗洲的城市和郊区收集的蚊子样本	开发了一个可以在实地使用的应用程序，用于自动检测蚊子，并在不同背景环境下实现了较高的准确率	未来需要更多的图像数据和更强大的深度学习架构来提高预测结果	利用深度学习模型开发一个能够自动检测蚊子的应用程序	马来西亚北婆罗洲的城市和郊区收集的蚊子样本	计算机视觉	NA	深度学习	MobileNetV2	图像	4880张蚊子图像
11876	2024-08-07	Deep learning in the radiologic diagnosis of osteoporosis: a literature review 2024-Apr, The Journal of international medical research IF:1.4Q4 DOI:10.1177/03000605241244754 PMID:38656208	综述	本文综述了深度学习方法在放射诊断骨质疏松症中的应用	深度学习在骨质疏松筛查中表现出显著能力	临床商业化骨质疏松诊断模型仍面临挑战	总结深度学习方法在放射诊断骨质疏松症中的应用	骨质疏松症的筛查和诊断	机器学习	骨质疏松症	深度学习	NA	图像	共包含40项研究，分为骨质疏松筛查（20项）、骨密度预测（13项）和骨质疏松骨折风险预测与检测（7项）
11877	2024-08-07	Slideflow: deep learning for digital histopathology with real-time whole-slide visualization 2024-Mar-27, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-024-05758-x PMID:38539070	研究论文	本文介绍了一个名为Slideflow的灵活深度学习库，用于数字病理学，支持多种深度学习方法，并包含一个快速的全切片接口用于部署训练好的模型	Slideflow提供了独特的工具，如全切片图像数据处理、高效的染色标准化和增强、弱监督的全切片分类、不确定性量化、特征生成、特征空间分析和可解释性	NA	开发一个灵活的深度学习库，用于数字病理学，支持多种深度学习方法，并提供一个快速的全切片接口	数字病理学中的全切片图像分析	数字病理学	NA	深度学习	CNN	图像	NA
11878	2024-08-07	Combining enhanced spectral resolution of EMG and a deep learning approach for knee pathology diagnosis 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0302707 PMID:38713653	研究论文	本研究开发了一种基于肌电图（EMG）的方法，结合深度学习技术用于诊断膝关节病理	利用高阶谱分析（HOSA）和深度学习技术，特别是改进的ResNet101 CNN模型，提高了膝关节病理诊断的准确性	尽管方法显示出高准确性，但仍存在一些局限性需要在未来研究中特别考虑和解决	开发一种基于EMG的诊断方法，用于识别膝关节病理，特别是膝关节骨性关节炎（KOA）	研究对象包括正常和KOA患者的膝关节周围肌肉的EMG信号	机器学习	关节疾病	高阶谱分析（HOSA）	CNN	图像	使用了公开数据库中的EMG信号数据，具体样本数量未详细说明
11879	2024-08-07	GELT: A graph embeddings based lite-transformer for knowledge tracing 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0301714 PMID:38713679	研究论文	本文提出了一种基于图嵌入的轻量级Transformer模型GELT，用于知识追踪任务	引入了基于图神经网络的模型GELT，并设计了一种节能注意力机制，以提高预测准确性并降低计算成本	NA	旨在解决传统深度学习模型在知识追踪任务中解释性不足的问题	研究学生技能与问题之间的关系，并预测知识状态	机器学习	NA	图嵌入	Transformer	数据集	三个公开的现实世界知识追踪数据集
11880	2024-08-07	ContourTL-Net: Contour-Based Transfer Learning Algorithm for Early-Stage Brain Tumor Detection 2024, International journal of biomedical imaging IF:3.3Q2 DOI:10.1155/2024/6347920 PMID:38716037	研究论文	本研究提出了一种基于轮廓的迁移学习模型ContourTL-Net，用于早期脑肿瘤检测，通过深度学习模型提高计算机化脑肿瘤检测的效率。	本研究创新性地采用了基于轮廓的MRI图像分割方法和迁移学习模型，以提高早期脑肿瘤检测的准确性和效率。	NA	旨在通过深度学习模型提高临床环境中计算机化脑肿瘤检测的效率。	早期脑肿瘤检测。	计算机视觉	脑肿瘤	深度学习	VGG-16	图像	两个基准数据集