深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1621	2024-12-14	Language task-based fMRI analysis using machine learning and deep learning 2024, Frontiers in radiology DOI:10.3389/fradi.2024.1495181 PMID:39664795	研究论文	本研究探讨了使用机器学习和深度学习算法对基于任务的语言功能磁共振成像（fMRI）数据进行分类，以识别与语言相关的大脑区域	本研究首次将机器学习和深度学习方法应用于基于任务的语言fMRI数据分析，特别是针对非结构化fMRI范式的语言区域识别	本研究的样本量较小，且仅使用了七种任务范式，可能限制了结果的普适性	研究目的是评估不同机器学习和深度学习算法在基于任务的语言fMRI数据分类中的有效性	研究对象是基于任务的语言fMRI数据，用于识别与语言相关的大脑区域	机器学习	NA	功能磁共振成像（fMRI）	机器学习（ML）和深度学习（DL）	时间序列	26名个体
1622	2024-12-14	Deep learning based landmark detection for measuring hock and knee angles in sows 2024, Translational animal science IF:1.3Q3 DOI:10.1093/tas/txad033 PMID:39664862	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的视觉方法，用于自动从母猪图像中确定跗关节和膝关节角度	本文创新性地使用深度学习模型来自动检测母猪图像中的关键身体标志，并通过三角公式计算跗关节和膝关节角度，实现了自动化测量	NA	开发一种自动化的方法来测量母猪的跗关节和膝关节角度，以优化母猪繁殖单元的管理	母猪的跗关节和膝关节角度	计算机视觉	NA	深度学习	深度学习模型	图像	NA
1623	2024-12-14	Development of a deep learning model for automatic detection of narrowed intervertebral disc space sites in caudal thoracic and lumbar lateral X-ray images of dogs 2024, Frontiers in veterinary science IF:2.6Q1 DOI:10.3389/fvets.2024.1453765 PMID:39664893	研究论文	本研究开发了一种深度学习模型，用于自动检测狗的胸腰椎侧位X光片中椎间盘空间狭窄的部位	首次使用大核一维卷积神经网络量化椎间盘空间距离并检测狭窄部位	样本量相对较小，且仅限于胸腰椎侧位X光片	开发一种自动检测狗椎间盘空间狭窄的深度学习模型，辅助椎间盘疾病的初步筛查和病变定位	狗的胸腰椎侧位X光片中的椎间盘空间狭窄	计算机视觉	犬科疾病	深度学习	一维卷积神经网络	图像	241张胸腰椎侧位X光片，来自142只狗
1624	2024-12-14	AppleLeafNet: a lightweight and efficient deep learning framework for diagnosing apple leaf diseases 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1502314 PMID:39665107	研究论文	本文设计了一种轻量级深度学习框架AppleLeafNet，用于诊断苹果叶病害	提出了一种轻量级深度学习模型，通过两阶段框架实现苹果叶健康状况和病害的分类，相比其他预训练模型具有更少的可学习参数	未提及具体的研究局限性	开发一种高效的深度学习框架，用于准确识别苹果叶病害	苹果叶的健康状况和病害类型	计算机视觉	NA	深度学习	深度学习模型	图像	使用了一个在线可用的数据集进行验证
1625	2024-12-14	Interpretable Diabetic Retinopathy Diagnosis Based on Biomarker Activation Map 2024-01, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2023.3290541 PMID:37405891	研究论文	本文介绍了一种基于生成对抗学习的生物标志物激活图（BAM）框架，用于解释基于光学相干断层扫描（OCT）和其血管造影（OCTA）的糖尿病视网膜病变（DR）自动诊断	提出了一个新颖的生物标志物激活图（BAM）框架，通过生成对抗学习使分类器的决策过程可解释	NA	开发一种可解释的糖尿病视网膜病变诊断方法，帮助临床医生验证和理解分类器的决策	糖尿病视网膜病变（DR）的自动诊断	机器学习	糖尿病视网膜病变	生成对抗学习	生成对抗网络（GAN）	图像	456个黄斑扫描数据
1626	2024-12-14	A Novel Approach Analysing the Dynamic Brain Functional Connectivity for Improved MCI Detection 2024-01, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2023.3294511 PMID:37436866	研究论文	本研究提出了一种新的动态脑功能连接分析方法，用于改进轻度认知障碍的检测	本研究提出了几种新的特征用于动态脑功能连接分析，并展示了其在轻度认知障碍检测中的优越性能	本研究未详细讨论所提出方法在计算效率和可解释性方面的改进	探索动态脑功能连接分析中几种新特征的可行性，以实现可靠的轻度认知障碍检测	健康对照组、早期轻度认知障碍患者和晚期轻度认知障碍患者的动态脑功能连接	机器学习	老年疾病	功能磁共振成像	支持向量机	图像	包含健康对照组、早期轻度认知障碍患者和晚期轻度认知障碍患者的公共静息态功能磁共振成像数据集
1627	2024-12-14	Image-Decomposition-Enhanced Deep Learning for Detection of Rotor Cores in Cardiac Fibrillation 2024-01, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2023.3292383 PMID:37440380	研究论文	本研究开发了一种基于图像分解增强的深度学习框架，用于自动识别心房颤动中的转子核心	采用集成经验模态分解算法（EEMD）对原始图像进行分解，并将最具代表性的成分输入YOLO目标检测架构进行转子检测	NA	开发一种自动识别心房颤动中转子核心的深度学习框架	心房颤动中的转子核心	计算机视觉	心血管疾病	集成经验模态分解算法（EEMD）	YOLO	图像	来自双域模拟模型的模拟数据和从离体兔心中获取的光学映射数据
1628	2024-12-14	Location-Aware Encoding for Lesion Detection in 68Ga-DOTATATE Positron Emission Tomography Images 2024-01, IEEE transactions on bio-medical engineering DOI:10.1109/TBME.2023.3297249 PMID:37471190	研究论文	本文提出了一种新的单阶段病变检测方法，使用68Ga-DOTATATE正电子发射断层扫描（PET）图像进行病变检测	本文创新性地设计了一个可插拔的代码本学习模块，并将其集成到U-Net类似的神经网络中，以促进多尺度病变位置特定特征学习	NA	开发一种高效的单阶段病变检测方法，以提高神经内分泌肿瘤（NETs）患者的治疗效果	68Ga-DOTATATE PET图像中的病变检测	计算机视觉	神经内分泌肿瘤	深度学习	U-Net	图像	NA
1629	2024-12-14	A neural machine translation method based on split graph convolutional self-attention encoding 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.1886 PMID:39669465	研究论文	提出了一种基于分割图卷积自注意力编码的神经机器翻译方法，以更好地利用句法依赖关系并降低模型复杂度	提出了基于分割图卷积自注意力编码（SGSE）的新方法，结合了分割自注意力网络和句法语义自注意力网络，有效利用了非欧几里得空间中的句法依赖关系	未提及具体的局限性	提高跨语言协作团队成员之间的沟通效率	跨语言协作团队中的沟通效率	自然语言处理	NA	神经机器翻译（NMT）	分割图卷积自注意力编码（SGSE）	文本	多个标准数据集以及涉及团队协作和企业管理场景的数据集
1630	2024-12-13	Improving genome-scale metabolic models of incomplete genomes with deep learning 2024-Dec-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111349 PMID:39660058	研究论文	本文提出了一种基于深度神经网络的代谢途径填补方法，用于改进不完整基因组的基因组尺度代谢模型	本文引入了深度神经网络引导的代谢途径填补方法（DNNGIOR），通过学习不同细菌基因组中代谢反应的存在与缺失来提高填补效果	NA	改进不完整基因组的基因组尺度代谢模型	微生物代谢模型中的代谢反应填补	机器学习	NA	深度学习	深度神经网络	基因组数据	涉及多种细菌基因组
1631	2024-12-13	IndoHerb: Indonesia medicinal plants recognition using transfer learning and deep learning 2024-Dec-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40606 PMID:39660181	研究论文	本研究利用迁移学习和深度学习技术，通过卷积神经网络对印度尼西亚药用植物进行分类识别	首次应用迁移学习方法对印度尼西亚药用植物进行大规模分类，并比较了多种深度学习模型的性能	实验仅使用了图像数据，未考虑其他类型的数据（如文本描述），且样本量相对较小	开发一种自动化的方法来识别印度尼西亚药用植物，以促进传统医学实践和农业发展	印度尼西亚的药用植物	计算机视觉	NA	迁移学习，卷积神经网络	CNN	图像	一个包含印度尼西亚药用植物图像的广泛数据集，经过手动精心挑选
1632	2024-12-13	Evaluating the Impact of BoNT-A Injections on Facial Expressions: A Deep Learning Analysis 2024-Dec-12, Aesthetic surgery journal IF:3.0Q1 DOI:10.1093/asj/sjae204 PMID:39365026	研究论文	本研究使用深度学习技术评估了肉毒杆菌毒素A（BoNT-A）注射对面部表情的影响	首次使用卷积神经网络（CNN）基于面部情感识别系统客观测量BoNT-A注射对面部表情的影响	需要进一步研究以理解这些变化更广泛的影响	客观测量BoNT-A注射对面部表情的影响	BoNT-A注射对面部表情的影响	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）	卷积神经网络（CNN）	图像	180名年龄在25至60岁之间的患者
1633	2024-12-13	Extraction of agricultural plastic greenhouses based on a U-Net convolutional neural network coupled with edge expansion and loss function improvement 2024-Dec-12, Journal of the Air & Waste Management Association (1995) DOI:10.1080/10962247.2024.2412708 PMID:39440842	研究论文	本研究通过改进U-Net卷积神经网络模型，结合边缘信息扩展和联合损失函数，提高了从遥感图像中提取农业塑料大棚的准确性	本研究提出了一个改进的U-Net卷积神经网络模型，结合边缘信息扩展和联合损失函数，显著提高了农业塑料大棚的提取精度	NA	提高农业塑料大棚的空间分布信息获取的准确性，支持农业管理和环境监测	农业塑料大棚的空间分布信息	计算机视觉	NA	遥感技术	U-Net卷积神经网络	图像	使用GF-7卫星影像数据
1634	2024-12-13	Deep Learning Prediction of Drug-Induced Liver Toxicity by Manifold Embedding of Quantum Information of Drug Molecules 2024-Dec-12, Pharmaceutical research IF:3.5Q2 DOI:10.1007/s11095-024-03800-4 PMID:39663331	研究论文	本文提出了一种利用量子信息嵌入分子表面流形来预测药物诱导肝毒性的深度学习方法	通过将分子表面的局部电子属性映射到低维流形嵌入，并将其作为深度学习模型的输入，创新性地利用量子信息来预测药物诱导的肝毒性	NA	开发一种新的深度学习方法来预测药物诱导的肝毒性	药物分子及其诱导的肝毒性	机器学习	肝损伤	深度学习	深度学习模型	分子表面电子属性	使用了一个精心策划的数据集进行训练和交叉验证
1635	2024-12-13	Assessment of the stability of intracranial aneurysms using a deep learning model based on computed tomography angiography 2024-Dec-12, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-024-01939-z PMID:39666223	研究论文	本研究构建了一个基于卷积神经网络的深度学习模型，用于通过CTA图像评估颅内动脉瘤的稳定性	本研究的创新点在于开发了一个基于卷积神经网络的深度学习模型，结合临床、形态学和深度学习特征，能够更准确地预测颅内动脉瘤的稳定性	本研究的局限性在于使用了回顾性数据，且外部验证集的样本量较小	本研究的目的是构建一个深度学习模型，用于通过CTA图像识别不稳定的颅内动脉瘤	本研究的对象是颅内动脉瘤的稳定性评估	计算机视觉	NA	卷积神经网络	CNN	图像	1041名患者，共1227个动脉瘤，其中833名患者（991个动脉瘤）用于训练，208名患者（236个动脉瘤）用于内部验证，197名患者（229个动脉瘤）用于外部验证
1636	2024-12-13	Digital Twin for EEG seizure prediction using time reassigned Multisynchrosqueezing transform-based CNN-BiLSTM-Attention mechanism model 2024-Dec-11, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/ad992c PMID:39622083	研究论文	本文提出了一种基于时间重分配多同步挤压变换（TMSST）和CNN-BiLSTM-Attention机制模型的数字孪生系统，用于脑电图（EEG）癫痫发作预测	创新点在于结合了TMSST时间-频率分析方法和CNN-BiLSTM-Attention机制模型，提取患者特定的脉冲特征并进行癫痫发作预测	NA	研究目的是开发一种高效的数字孪生系统，用于脑电图癫痫发作预测	研究对象是脑电图数据和癫痫发作预测	机器学习	神经疾病	时间重分配多同步挤压变换（TMSST）	CNN-BiLSTM-Attention机制模型	脑电图（EEG）数据	22名患者
1637	2024-12-13	Accuracy of Machine Learning in Detecting Pediatric Epileptic Seizures: Systematic Review and Meta-Analysis 2024-Dec-11, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/55986 PMID:39661965	meta-analysis	本文系统综述和荟萃分析了机器学习在检测儿童癫痫发作中的准确性	本文首次系统性地评估了机器学习和深度学习在儿童癫痫发作检测中的效果，并比较了两者的准确性	本文仅基于已发表的研究，可能存在发表偏倚；且研究对象均为基于脑电图数据的儿童	评估机器学习在监测儿童癫痫发作中的有效性，为未来智能工具的开发和改进提供证据基础	儿童癫痫发作的检测	machine learning	神经疾病	NA	ML, DL	脑电图数据	28项原始研究，基于儿童的脑电图数据
1638	2024-12-13	Leveraging Large Language Models for Improved Understanding of Communications With Patients With Cancer in a Call Center Setting: Proof-of-Concept Study 2024-Dec-11, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/63892 PMID:39661975	研究论文	本研究评估了GPT-4在分类癌症患者电话咨询目的方面的表现，并将其与LSTM和BERT等判别模型的表现进行了比较	GPT-4在处理复杂和模糊查询方面表现出色，无需大量重新训练，显著优于传统的LSTM和BERT模型	需要进一步优化提示设计和类别定义，以充分发挥GPT-4在实际医疗应用中的潜力	评估GPT-4在分类癌症患者电话咨询目的方面的表现，并探索其在医疗环境中的应用潜力	癌症患者的电话咨询数据	自然语言处理	癌症	GPT-4	GPT-4	文本	430,355条来自2016年至2020年癌症患者电话咨询的句子
1639	2024-12-13	Predicting blood loss volume in a canine model of hemorrhagic shock using arterial waveform machine learning analysis 2024-Dec-11, American journal of veterinary research IF:1.3Q2 DOI:10.2460/ajvr.24.09.0256 PMID:39662033	研究论文	本研究旨在验证人类补偿储备算法是否可应用于犬类，并探讨简化波形分析预测失血量的可行性	开发了一种基于犬类动脉波形特征的失血量预测模型（cBLVM），并展示了其在预测犬类出血性休克中的优越性	研究样本量较小，仅包括6只犬类，可能影响结果的普适性	验证人类补偿储备算法在犬类中的适用性，并开发一种简化的波形分析方法来预测失血量	犬类出血性休克模型中的失血量预测	机器学习	NA	机器学习	深度学习（hCRM-DL）和机器学习（hCRM-ML）	波形	6只经过麻醉的犬类
1640	2024-12-13	An efficient deep unrolling network for sparse-view CT reconstruction via alternating optimization of dense-view sinograms and images 2024-Dec-11, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad9dac PMID:39662047	研究论文	本文提出了一种高效的深度展开网络，用于稀疏视角CT重建，通过交替优化密集视角正弦图和图像来提高重建效率和质量	本文的创新点在于通过优化密集视角正弦图而非全视角正弦图，减少了计算资源和运行时间，并降低了稀疏比极小时正弦图修复的难度，从而减少了从正弦图域到图像域的估计误差传播	NA	本文的研究目的是解决稀疏视角CT重建中计算成本高的问题，同时保持重建图像的质量	本文的研究对象是稀疏视角CT重建中的正弦图和图像	计算机视觉	NA	深度学习	深度神经网络	图像	512×512像素的图像和2304×736的投影数据