深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2024-08-05	The association between DNA methylation and human height and a prospective model of DNA methylation-based height prediction 2024-Mar, Human genetics IF:3.8Q2 DOI:10.1007/s00439-024-02659-0 PMID:38507014	研究论文	本研究探讨了DNA甲基化与人类身高之间的关系，并构建了一个基于DNA甲基化的身高预测模型。	使用仅959个CpG位点的靶向甲基化测序结合深度学习技术，提供了比基于SNP预测模型更高的身高预测准确性。	样本主要针对中国人群，可能限制了研究结果的普遍适用性。	研究DNA甲基化与人类身高之间的关联，并基于此构建身高预测模型。	研究对象为与身高相关的DNA甲基化位点。	数字病理学	NA	靶向甲基化测序	深度神经网络	NA	11,730个与身高相关的位点
262	2024-08-05	Deep Learning-Based Kernel Adaptation Enhances Quantification of Emphysema on Low-Dose Chest CT for Predicting Long-Term Mortality 2024-Mar-01, Investigative radiology IF:7.0Q1 DOI:10.1097/RLI.0000000000001003 PMID:37428617	研究论文	本研究旨在利用深度学习的核适应技术来量化低剂量胸部CT上的肺气肿，以预测长期死亡率	该研究首次将深度学习应用于低剂量CT的核适应，显著改善了肺气肿的量化结果	研究仅限于60岁及以上的无症状个体，可能不适用于其他人群	调查低剂量CT量化肺气肿对长期死亡率的预测价值	从2009年到2016年期间进行健康检查的5178名无症状个体的低剂量CT图像	数字病理学	NA	低剂量计算机断层扫描 (LDCT), 深度学习	Cox比例风险模型	影像	5178名参与者
263	2024-08-05	[Development and Application of Deep Learning-Based Model for Quality Control of Children Pelvic X-Ray Images] 2024-Mar-30, Zhongguo yi liao qi xie za zhi = Chinese journal of medical instrumentation DOI:10.12455/j.issn.1671-7104.240010 PMID:38605612	研究论文	提出了一种基于深度学习的方法用于评估儿童髋关节X光图像的质量	首次尝试将人工智能算法应用于儿童髋关节X光的质量评估	NA	构建诊断模型并验证其临床可行性	3247名儿童的前后髋部X光片	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	3247个儿童的前后髋部X光图像
264	2024-08-05	A Review for Artificial Intelligence Based Protein Subcellular Localization 2024-Mar-27, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom14040409 PMID:38672426	review	本文回顾了基于人工智能的蛋白质亚细胞定位方法最新进展	文章的创新点在于整合了三种典型的基于人工智能的定位方法，并讨论了该领域的未来方向	文章未深入探讨具体的实验验证和实际应用案例	研究人工智能在蛋白质亚细胞定位中的应用与发展	主要研究各种类型的蛋白质定位方法	生物信息学	癌症、阿尔茨海默病	人工智能，机器学习	深度学习	序列、知识、图像	NA
265	2024-08-05	Distinct chemical environments in biomolecular condensates 2024-Mar, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-023-01432-0 PMID:37770698	研究论文	这篇文章探讨了生物分子凝聚体中的不同化学环境及其对分子分布的影响	文章首次表明不同的生物分子凝聚体具有独特的化学溶剂特性，并且可以通过深度学习方法预测探针在这些凝聚体内的选择性分配	在古典条件下对背景环境的影响未能详细探讨	研究无膜生物分子聚集体中分子的选择性包含机制	重点研究不同类型的生物分子凝聚体及其化学环境	数字病理学	NA	深度学习	NA	小分子探针	NA
266	2024-08-05	Deep Learning Promotes Profiling of Multiple miRNAs in Single Extracellular Vesicles for Cancer Diagnosis 2024-03-22, ACS sensors IF:8.2Q1 DOI:10.1021/acssensors.3c02789 PMID:38442411	研究论文	本研究介绍了一种通过深度学习检测单个外泌体中多种miRNA的方法，以用于癌症诊断。	首次结合全内反射荧光成像与深度学习算法对单个外泌体进行多miRNA特征分析，克服了外泌体异质性带来的挑战。	尚未提及其他癌症种类的验证，且样本量相对较小。	旨在通过单个外泌体分析提高癌症的早期诊断准确性。	研究对象为来自5种癌细胞和正常血浆的外泌体。	数字病理学	肺癌	全内反射荧光成像（TIRF）和深度学习（DL）	NA	图像	共分析了25名患者（5名肺癌、5名乳腺癌、5名宫颈癌和5名结肠癌）及5名健康对照
267	2024-08-05	Investigation of Deepfake Voice Detection Using Speech Pause Patterns: Algorithm Development and Validation 2024-Mar-21, JMIR biomedical engineering DOI:10.2196/56245 PMID:38875685	研究论文	本研究探讨了利用语音暂停模式检测深度伪造音频的算法开发与验证	引入固有生物过程的概念以区分真实人声与克隆音频	样本量有限，可能影响模型的泛化能力	旨在识别真实和克隆人声之间的差异	49名具有不同种族和口音的成年人提供音频样本	计算机视觉	NA	机器学习	AdaBoost模型	音频	49个成年参与者
268	2024-08-05	[Research Progress in Data Acquisition and Intelligent Sensing Methods for Lumbar Electromyographic Signals] 2024-Mar-30, Zhongguo yi liao qi xie za zhi = Chinese journal of medical instrumentation DOI:10.12455/j.issn.1671-7104.240014 PMID:38605608	研究论文	该论文回顾了不同传感器获取腰部肌电信号的进展	提出了无线传感器与深度学习算法结合的研究方向	未提及具体的实验数据或样本分析	分析和干预老年人低背痛的肌电信号	腰部肌电信号及其相关传感器	智能感知	老年疾病	生物电信号获取	深度学习算法	电生理信号	NA
269	2024-08-05	D3EGFR: a webserver for deep learning-guided drug sensitivity prediction and drug response information retrieval for EGFR mutation-driven lung cancer 2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae121 PMID:38555474	研究论文	本研究建立了D3EGFR平台，以实现EGFR突变驱动的非小细胞肺癌药物敏感性预测和病例检索	D3EGFR是首个实现所有已批准小分子药物的临床级药物反应预测的平台	研究可能缺乏对非EGFR突变驱动肺癌的适用性验证	旨在为EGFR突变驱动的非小细胞肺癌提供临床级药物推荐	包含来自1339名EGFR突变患者的临床病理特征和药物反应数据	数字病理学	肺癌	深度学习	深度学习模型D3EGFRAI	临床数据	1339名EGFR突变患者
270	2024-08-05	KDGene: knowledge graph completion for disease gene prediction using interactional tensor decomposition 2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae161 PMID:38605639	研究论文	本文提出了一种基于交互张量分解的生物知识图谱补全框架KDGene，用于疾病基因预测	KDGene通过引入交互模块，改善了知识图谱中实体和关系嵌入的表达能力，从而提高对疾病相关基因的预测准确性	目前的表示学习技术在应用于领域特定的生物数据时性能仍然不尽如人意	旨在通过构建生物知识图谱来提高对疾病相关基因的预测能力	疾病及其相关的基因	计算机视觉	疾病基因	张量分解	NA	生物知识图谱	实验结果未提供具体样本数量
271	2024-08-05	Pediatric ECG-Based Deep Learning to Predict Left Ventricular Dysfunction and Remodeling 2024-03-19, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.123.067750 PMID:38314583	研究论文	本文探讨了基于深度学习的ECG分析在儿童左心室功能障碍和重塑预测中的应用潜力	该研究首次将人工智能增强的ECG分析应用于儿童群体，且模型表现优于儿科心脏病专家基准	研究对象主要是无重大先天性心脏病的患者，可能限制了模型的泛化能力	评估基于深度学习的ECG分析在预测儿童左心室功能障碍和重塑的有效性	年龄不超过18岁且无重大先天性心脏病的儿童患者	机器学习	心血管疾病	卷积神经网络	CNN	ECG和超声心动图	92377对ECG-超声心动图（46261名患者）
272	2024-08-05	Artificial intelligence-guided detection of under-recognized cardiomyopathies on point-of-care cardiac ultrasound 2024-Mar-15, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2024.03.10.24304044 PMID:38559021	研究论文	本研究开发并验证了深度学习模型用于在床边心脏超声中检测未被充分诊断的心肌病	提出了一种新的适应性建模策略，以改善心脏超声图像的获取质量	研究主要基于回顾性病例数据，对于实时临床应用的验证不足	旨在提高对未被诊断的心肌病的识别率	基于大型美国医疗系统中不同医院的患者心脏超声数据进行研究	计算机视觉	心血管疾病	深度学习，卷积神经网络 (CNN)	卷积神经网络 (CNN)	视频	290,245个TTE视频和3,758个现实世界的POCUS视频
273	2024-08-05	A novel lightweight deep learning approach for simultaneous optic cup and optic disc segmentation in glaucoma detection 2024-Mar-04, Mathematical biosciences and engineering : MBE DOI:10.3934/mbe.2024225 PMID:38872528	研究论文	该文章提出了一种轻量级深度学习方法用于青光眼检测中的视杯和视盘的同时分割	创新点在于采用模糊学习和多层感知器来简化学习复杂性并提高分割准确性	未提及具体的限制	研究青光眼检测中的视杯和视盘的自动分割方法	视杯（OC）和视盘（OD）在眼底图像中的分割	数字病理学	青光眼	深度学习	多层感知器	图像	未提及具体的样本量
274	2024-08-05	DRANetSplicer: A Splice Site Prediction Model Based on Deep Residual Attention Networks 2024-03-26, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes15040404 PMID:38674339	研究论文	本研究开发了一种名为DRANetSplicer的深度学习模型，用于增强剪接位点预测的准确性	该模型结合了残差学习和注意力机制，以准确捕捉剪接位点的复杂特征	NA	提高剪接位点识别的准确性，以便更好地进行基因注释	采用来自三种不同生物的基因组数据构建多个数据集进行模型训练	机器学习	NA	深度学习	深度残差注意力网络	基因组数据	来自三种不同生物的多个高质量数据集
275	2024-08-05	Combining Deep Learning and Radiomics for Automated, Objective, Comprehensive Bone Mineral Density Assessment From Low-Dose Chest Computed Tomography 2024-03, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2023.08.030 PMID:37730494	研究论文	本文开发了一种基于低剂量胸部计算机断层扫描的智能骨密度筛查模型	该研究结合了深度学习和放射组学，创建了一个完全自动化的骨密度评估流程	缺乏不同人种和年龄段的广泛验证	研究旨在开发智能诊断模型用于骨质疏松症筛查	研究对象为442名接受低剂量胸部CT和定量CT检查的参与者	数字病理	骨质疏松症	低剂量胸部计算机断层扫描 (LDCT)	VB-Net	影像	共442名参与者
276	2024-08-05	Characterization of organic fouling on thermal bubble-driven micro-pumps 2024 Mar-Apr, Biofouling IF:2.6Q1 DOI:10.1080/08927014.2024.2353034 PMID:38785127	研究论文	该文章研究了热泡驱动微泵与生物流体的相互作用，尤其是有机污垢对其性能的影响	首次探讨了热泡驱动微泵在与血液和富含蛋白质的液体接触时的有机污垢现象	当前研究仅集中在鸡蛋清和牛全血的影响上，未考虑其他类型的生物流体	了解热泡驱动微泵与生物流体的相互作用及其对泵性能的影响	主要研究对象是热泡驱动微泵在与鸡蛋清和牛全血接触时的污垢效应	微流体	NA	高速度成像和基于RESNET-18的深度学习神经网络	NA	图像	NA
277	2024-08-05	Development of MRI-Based Deep Learning Signature for Prediction of Axillary Response After NAC in Breast Cancer 2024-03, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2023.10.004 PMID:37914627	研究论文	本研究开发了一种基于MRI的深度学习特征，用于预测乳腺癌患者在新辅助化疗后腋窝反应	本研究利用深度学习从动态对比增强MRI中提取特征，并提出了一种新的预测模型	NA	开发一种用于预测乳腺癌患者在新辅助化疗后腋窝反应的MRI基础深度学习特征	327名乳腺癌患者，这些患者在新辅助化疗后接受腋窝手术	医学影像学	乳腺癌	动态对比增强MRI	支持向量机	医学影像	327名乳腺癌患者
278	2024-08-05	Shortening Acquisition Time and Improving Image Quality for Pelvic MRI Using Deep Learning Reconstruction for Diffusion-Weighted Imaging at 1.5 T 2024-03, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2023.06.035 PMID:37500416	研究论文	本研究探讨使用深度学习重建技术对1.5T下骨盆扩散加权成像的采集时间和图像质量的影响	创新地应用深度学习技术来缩短扩散加权成像的采集时间并提高图像质量	研究仅限于单一中心，样本量相对较小且为回顾性研究	研究骨盆MRI的扩散加权成像中，深度学习重建对采集时间和图像质量的影响	55名患者接受了标准扩散加权成像和深度学习重建的扩散加权成像	数字病理学	NA	深度学习重建	NA	图像	55名患者（年龄范围27至89岁）
279	2024-08-05	Test Retest Reproducibility of Organ Volume Measurements in ADPKD Using 3D Multimodality Deep Learning 2024-03, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2023.09.009 PMID:37798206	研究论文	本研究利用3D多模态深度学习降低ADPKD患者的器官体积测量变异性	使用多种脉冲序列进行器官体积测量，通过异常值分析和平均值计算减少了变异性	样本量相对较小，只有19名ADPKD患者参与了重复测试	减少ADPKD患者MRI图像上的器官体积测量变异性	413名受试者的MRI和CT影像数据被用于训练和验证模型	数字病理学	多囊肾病	MRI	nnU-net	影像	19名ADPKD患者的38次扫描
280	2024-08-05	Deep learning for water quality 2024-Mar-12, Nature water DOI:10.1038/s44221-024-00202-z PMID:38846520	综述	本综述探讨了深度学习在水质研究中的应用潜力	提出深度学习可以填补时空数据缺口，并识别影响水质的关键因素	传统基于过程的模型与统计模型在预测水质时通常表现不佳	探讨深度学习在水质科学中的应用及其优势	聚焦于内陆水体质量的理解与预测	数字病理学	NA	深度学习	NA	高维数据	NA