深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
741	2024-08-05	Protein remote homology detection and structural alignment using deep learning 2024-Jun, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-023-01917-2 PMID:37679542	研究论文	本研究开发了两种深度学习方法TM-Vec和DeepBLAST，以改善低序列相似性蛋白质的对齐方法	提出的TM-Vec方法能够直接从序列对预测结构相似性，并且DeepBLAST在仅使用序列信息时能够结构性对齐蛋白质	抽象中未提及具体的局限性	改善生物技术中蛋白质的对齐方法，特别是低序列相似性的蛋白质	结构上相似的蛋白质	计算机视觉	NA	深度学习	NA	序列数据	多种数据集
742	2024-08-05	Predicting transcriptional outcomes of novel multigene perturbations with GEARS 2024-Jun, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-023-01905-6 PMID:37592036	研究论文	介绍了GEARS方法，通过深度学习和基因关系知识图谱预测多基因扰动的转录反应	GEARS能够预测从未在实验中扰动的基因组合的结果，展现出比现有方法更高的预测精度	未提及具体的局限性	研究细胞对基因扰动的响应，以指导生物医学应用	多基因扰动的转录反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	深度学习模型	RNA测序数据	NA
743	2024-08-05	Generative deep learning approaches for the design of dental restorations: A narrative review 2024-06, Journal of dentistry IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jdent.2024.104988 PMID:38608832	综述	本研究探讨了深度学习技术在牙齿重建中的最新进展	文章介绍了新颖的深度学习方法在部分和全牙重建中的应用，展示了生成对抗网络和变换器的讨论	仅包括2018年至2023年发布的9篇相关文献，且排除仅专注于DL方法应用或审查的文章	研究深度学习技术在牙齿重建领域的应用和方法	重点研究牙齿重建的不同深度学习方法和数据表征	数字病理学	NA	深度学习	生成对抗网络（GAN）和变换器	深度图、点云和体素化点云	涉及9篇文献的牙齿重建数据
744	2024-08-07	Editorial for "Parallel CNN-Deep Learning Clinical-Imaging Signature for Assessing Pathologic Grade and Prognosis of Soft Tissue Sarcoma Patients" 2024-Jun-19, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29476 PMID:38896101	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
745	2024-08-05	Deep learning-based approach for 3D bone segmentation and prediction of missing tooth region for dental implant planning 2024-06-16, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-64609-0 PMID:38880802	研究论文	本研究利用U-Net模型进行牙科CBCT扫描中缺失牙齿区域的骨骼分割和植牙位置预测	提出了一种基于深度学习的U-Net模型，针对牙科影像分析和植牙规划进行了创新应用	无相关限制信息	研究旨在提高牙科植牙规划的自动化水平	研究对象为Taibah大学牙科医院2018至2023年的CBCT数据集患者	数字病理	NA	CBCT	U-Net	影像	NA
746	2024-08-05	Detection of Parkinson disease using multiclass machine learning approach 2024-06-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-64004-9 PMID:38877028	研究论文	本研究使用机器学习和深度学习技术检测帕金森病。	提出了一种基于语音信号特征区分帕金森病患者和健康个体的方法，包括应用KNN和FNN模型。	样本数量相对较少，仅包含195个语音录音。	旨在通过声音信号的分析，及时检测帕金森病，以便有效管理疾病。	研究对象为31名帕金森病患者及其语音信号。	机器学习	帕金森病	机器学习、深度学习	KNN、FNN	语音	195个语音录音，来自31名患者
747	2024-08-05	Deep cell phenotyping and spatial analysis of multiplexed imaging with TRACERx-PHLEX 2024-Jun-15, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-48870-5 PMID:38879602	研究论文	本文介绍了一种名为TRACERx-PHLEX的深度细胞表型分析和空间分析的方法	该研究的创新点在于开发了一个基于深度学习的自动化计算管道，能够进行细胞分割、细胞类型注释和空间分析	在不同组织类型、固定条件、图像大小和抗体面板的评估中可能存在局限性	研究旨在提供一个可重复、全面且用户友好的多重成像计算管道	研究对象包括不同组织类型的细胞及其空间分布	数字病理学	NA	成像质谱细胞术	深度学习模型	图像	NA
748	2024-08-05	Biomarker-based human and animal sperm phenotyping: the good, the bad and the ugly† 2024-Jun-12, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioae061 PMID:38640912	review	本综述探讨了基于生物标志物的人类和动物精子表型分析的优缺点	文章创新地将下一代成像流式细胞术引入人类和动物精子分析中，结合机器学习和深度学习算法以提高诊断精度	文章中未详细论述每种生物标志物的临床应用案例	提高人类与经济重要动物精子的精子表型分析的精确度	人类及经济重要的牲畜动物的精子标志物	数字病理学	NA	流式细胞术，生物标志物成像	NA	NA	NA
749	2024-08-05	A novel deep learning framework for accurate melanoma diagnosis integrating imaging and genomic data for improved patient outcomes 2024-Jun, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI) IF:2.0Q3 DOI:10.1111/srt.13770 PMID:38881051	研究论文	本研究提出了一种新的深度学习框架，通过整合成像和基因组数据来诊断黑色素瘤	采用结合多模态成像和基因组数据的深度神经网络进行黑色素瘤分类，可能提供比现有医学方法更可靠的诊断	该框架的应用需要在更大规模上进行验证，并需要更多临床试验来确立其有效性和可行性	研究目的是改进黑色素瘤的早期和准确诊断方法	研究对象为皮肤癌黑色素瘤的诊断与分类	计算机视觉	皮肤癌	深度神经网络	卷积神经网络和图神经网络	图像和基因组数据	包含皮肤镜图像、组织病理切片和基因组资料的数据集
750	2024-08-05	Application of a novel deep learning-based 3D videography workflow to bat flight 2024-Jun, Annals of the New York Academy of Sciences IF:4.1Q1 DOI:10.1111/nyas.15143 PMID:38652595	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的3D视频拍摄流程，以研究飞行动物的生物力学细节	引入了深度学习驱动的自动数字化流程，结合质量指标进行过滤和纠正错误标记点	研究主要集中在蝙蝠的飞行上，可能不适用于其他动物的生物力学研究	提高飞行动物生物力学研究的数字化效率	主要研究对象为蝙蝠飞行	计算机视觉	NA	深度学习	NA	视频	四只蝙蝠
751	2024-08-05	Perfect Match: Radiomics and Artificial Intelligence in Cardiac Imaging 2024-Jun, Circulation. Cardiovascular imaging DOI:10.1161/CIRCIMAGING.123.015490 PMID:38889216	综述	本文探讨了放射组学与人工智能在心脏影像中的协同作用	提出了放射组学提取医疗影像中的定量特征与深度学习技术结合的潜力	讨论了使用放射组学和人工智能在临床应用中的挑战和局限性	增强心脏影像的诊断和预后能力	关注心血管疾病的影像学特征	数字病理学	心血管疾病	放射组学，深度学习	深度学习	医疗影像	NA
752	2024-08-05	Emerging trends and hotspots in cervical intraepithelial neoplasia research from 2013 to 2023: A bibliometric analysis 2024-Jun-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32114 PMID:38882369	研究论文	本文通过文献计量分析总结了宫颈上皮内瘤变（CIN）领域的研究热点和未来趋势	首次在宫颈上皮内瘤变领域进行了文献计量分析，揭示了关键的研究方向和趋势	研究主要集中在发表的文献，可能无法全面反映整个CIN领域的研究现状	归纳和预测宫颈上皮内瘤变领域的研究热点和未来趋势	分析过去十年间与宫颈上皮内瘤变相关的文献	数字病理学	宫颈癌	文献计量分析	NA	文献	4677篇相关论文
753	2024-08-05	Microscopy Image Dataset for Deep Learning-Based Quantitative Assessment of Pulmonary Vascular Changes 2024-Jun-15, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-024-03473-z PMID:38879569	研究论文	本文提出了用于评估肺循环血管变化的显微镜图像数据集	创新之处在于提供了一个用于深度学习语义分割技术的肺循环血管的数据集	本文未提及该数据集的局限性	研究旨在改善对肺动脉高压患者肺循环血管结构变化的定量评估	研究对象为609张肺循环血管的显微照片	数字病理学	肺动脉高压	深度学习，语义分割	U-Net	图像	609张显微照片
754	2024-08-05	Deep learning guided prediction modeling of dengue virus evolving serotype 2024-Jun-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e32061 PMID:38882365	研究论文	本研究提出了一种深度学习模型，用于预测登革热病毒的演变血清型	提出的DL-DVE生成和分类模型超越了传统方法，能够在连续向量空间中学习核苷酸之间的语义关系	本研究不提及样本的多样性及外部验证的局限性	研究登革热病毒(DENV)的演变，以预测出现的新型血清型	采用2000个已公开的DENV完整基因组序列进行研究	计算机视觉	登革热	深度学习	LSTM和前馈神经网络(FNN)	基因组序列	2000个DENV完整基因组序列
755	2024-08-07	Traffic planning in modern large cities Paris and Istanbul 2024-Jun-15, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-64483-w PMID:38879639	研究论文	该文章探讨了利用深度学习技术提高大城市交通状况预测准确性的复杂任务	提出了一种新模型，考虑了速度、流量和方向的累积影响，表现优于传统模型	未来研究需考虑更多信息源的整合，如物理交通流模型和天气条件等	旨在增强大规模交通条件预测的准确性	巴黎和伊斯坦布尔的历史交通数据	计算机视觉	NA	深度学习	NA	视频	基于两年真实数据生成的交通视频片段，涉及超过1000亿GPS探测点
756	2024-08-05	Sex classification of 3D skull images using deep neural networks 2024-06-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-61879-6 PMID:38877045	研究论文	本研究利用深度神经网络对3D头骨图像进行性别分类	首个评估深度学习模型处理3D医疗成像以区分出生时分配为男性或女性的个体的研究	成像样本数量有限，可能影响结果的推广性	研究性别分类的基础特征以及如何通过深度学习进行3D头骨图像分析	98个3D头骨样本	数字病理学	NA	深度学习	Resnet3D, PointNet++, MeshNet	图像	98个3D头骨样本
757	2024-08-05	Development of a real-time cattle lameness detection system using a single side-view camera 2024-06-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-64664-7 PMID:38877097	研究论文	本文研究了在奶牛养殖中使用深度学习进行牛只跛行检测的应用	提出了一种实时牛只跛行检测系统，结合了Mask-RCNN和YOLOv8两种物体检测算法	未提及具体的样本多样性和环境条件对系统性能的影响	旨在提高奶牛养殖管理，通过早期检测跛行来改善健康监测	主要研究对象为奶牛的跛行检测与跟踪	计算机视觉	NA	深度学习	Mask-RCNN, YOLOv8	图像	NA
758	2024-08-05	Deep Kernel learning for reaction outcome prediction and optimization 2024-Jun-14, Communications chemistry IF:5.9Q1 DOI:10.1038/s42004-024-01219-x PMID:38877182	研究论文	文章提出了一种深度核学习框架用于反应结果预测和优化	融合了神经网络的特征学习能力与高斯过程的不确定性量化	标准高斯过程的表现不如深度核学习模型	加速反应发现，通过整合准确的预测模型与贝叶斯优化	反应结果的预测和优化	机器学习	NA	高斯过程	神经网络	NA	NA
759	2024-08-05	Retention-aware zero-shifting technique for Tiki-Taka algorithm-based analog deep learning accelerator 2024-Jun-14, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adl3350 PMID:38875324	研究论文	本文展示了一种针对非理想模拟内存设备的Tiki-Taka算法的模拟神经网络训练加速器的退化意识零偏移技术	提出了一种面向保留特性的零偏移技术，以优化神经网络训练性能	主要研究在具有有限保留时间的交叉点设备中的应用，可能不适用于其他类型的设备	优化模拟神经网络的训练性能	使用ECRAM设备进行的Tiki-Taka版本2算法的实验研究	机器学习	NA	ECRAM	NA	NA	8 × 8 ECRAM阵列，具有100%的产量
760	2024-08-05	Deep learning-driven hybrid model for short-term load forecasting and smart grid information management 2024-Jun-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-63262-x PMID:38877081	研究论文	本文提出了一种计算方法来解决短期电力负荷预测和能源信息管理中的挑战	引入了一种混合方法，结合了多种深度学习模型，以提高负荷预测的准确性和效率	未提及具体的局限性	准确预测未来的电力负荷需求	短期电力负荷预测和能源信息管理	机器学习	NA	深度学习	Gated Recurrent Unit (GRU)和Temporal Convolutional Network (TCN)	时间序列数据	包含四个公共数据集，包括GEFCom2014