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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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341 | 2024-10-24 |
predicTTE: An accessible and optimal tool for time-to-event prediction in neurological diseases
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.20.604416
PMID:39091819
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研究论文 | 本文介绍了一个名为predicTTE的工具,用于神经疾病中的时间到事件预测,并提供了一个在线门户和应用程序,供非专业用户使用 | 本文提出了一个集成深度学习和样条模型的工具,用于时间到事件预测,并优化了数据插补和模型训练流程 | NA | 开发一个易于使用且优化的工具,用于神经疾病中的时间到事件预测 | 神经疾病中的时间到事件预测 | 机器学习 | 神经疾病 | 深度学习 | 集成模型 | 时间到事件数据 | NA |
342 | 2024-10-24 |
Deep learning guided design of dynamic proteins
2024-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.17.603962
PMID:39071443
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研究论文 | 本文介绍了一种基于深度学习的动态蛋白质设计方法 | 提出了一种新的深度学习引导的蛋白质动态变化设计方法,能够在原子级别上精确模拟自然界中常见的开关机制 | NA | 开发一种新的方法来设计具有动态变化的蛋白质结构 | 蛋白质的动态变化和结构设计 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 蛋白质结构 | 4个验证设计的构象结构 |
343 | 2024-10-24 |
Robust deep learning estimation of cortical bone porosity from MR T1-weighted images for individualized transcranial focused ultrasound planning
2024-Jul-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.07.18.24310644
PMID:39072036
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习的方法,从T1加权MRI图像中估计皮质骨孔隙度,用于个性化经颅聚焦超声规划 | 本文创新性地使用深度学习方法从T1加权MRI图像中估计皮质骨孔隙度,避免了使用辐射诱导的CT扫描 | NA | 开发一种无需CT扫描的个性化经颅聚焦超声规划方法 | 皮质骨孔隙度估计和经颅聚焦超声治疗规划 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | cGAN | 图像 | 数千个光束传播场景 |
344 | 2024-10-24 |
Digital pathology assessment of kidney glomerular filtration barrier ultrastructure in an animal model of podocytopathy
2024-Jul-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599097
PMID:38948787
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的数字病理学计算方法,用于测量动物模型中肾小球滤过屏障超微结构的宽度 | 首次使用深度学习技术自动测量肾小球基底膜和足突细胞足突的宽度,提高了测量效率和客观性 | 自动测量方法在ILK cKO样本中与手动测量结果存在差异 | 开发一种自动化方法来测量肾小球滤过屏障的超微结构,以促进足细胞病的研究和临床诊断 | 肾小球基底膜和足突细胞足突的宽度 | 数字病理学 | 肾病 | 透射电子显微镜(TEM) | U-Net | 图像 | 来自野生型和ILK cKO同窝小鼠的肾小球TEM图像 |
345 | 2024-10-24 |
Multi-dataset Integration and Residual Connections Improve Proteome Prediction from Transcriptomes using Deep Learning
2024-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.08.602560
PMID:39026798
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研究论文 | 本文通过深度学习模型和残差连接,提高了从转录组数据预测蛋白质组的准确性 | 使用神经架构搜索(NAS)设计的深度学习模型,结合残差连接,显著提高了从转录组数据预测蛋白质组的准确性 | NA | 提高从转录组数据预测蛋白质组的准确性 | 转录组和蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 使用Clinical Proteomics Tumor Analysis Consortium的公开数据 |
346 | 2024-10-24 |
Current genomic deep learning models display decreased performance in cell type specific accessible regions
2024-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602265
PMID:39026761
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研究论文 | 评估了基因组深度学习模型在不同细胞类型特异性染色质可及区域的性能 | 发现现有基因组深度学习模型在细胞类型特异性可及区域的性能下降,并提出了通过增加模型容量和单任务学习来提高性能的策略 | 文章未详细讨论现有模型的具体局限性或改进方法 | 评估和改进基因组深度学习模型在细胞类型特异性染色质可及区域的性能 | 基因组深度学习模型在不同细胞类型特异性染色质可及区域的性能 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型(如Enformer和Sei) | DNA序列 | 数千个输出(细胞类型和表观遗传标记) |
347 | 2024-10-24 |
Quantifying social roles in multi-animal videos using subject-aware deep-learning
2024-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.07.602350
PMID:39026890
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研究论文 | 本文介绍了一种基于深度学习的系统LabGym2,用于识别和量化多动物群体中的社会角色 | 本文提出了一个主体感知的方法,评估群体中每个个体的社会和环境背景下的行为状态,适用于不同物种和实验 | NA | 开发一种自动化方法来识别和量化多动物群体中的社会角色 | 多动物群体中的社会角色 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 视频 | 两到多个动物的群体 |
348 | 2024-10-24 |
qMAP enabled microanatomical mapping of human skin aging
2024-Jul-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.03.588011
PMID:39005293
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研究论文 | 本文介绍了一种名为qMAP的组织图像分析工作流程,利用深度学习和机器视觉技术对皮肤组织进行微解剖学映射,以研究与衰老相关的微解剖学变化 | 首次在组织水平上进行量化微解剖学分析,揭示了皮肤微解剖学特征与衰老的强关联,并提出了一种新的衰老生物标志物类别 | 研究仅限于皮肤组织,且样本量相对较小 | 开发一种新的方法来量化和分析与衰老相关的组织微解剖学变化 | 皮肤组织的微解剖学特征及其与衰老的关系 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | NA | 图像 | 99名年龄在14至92岁之间的捐赠者 |
349 | 2024-10-24 |
CPIExtract: A software package to collect and harmonize small molecule and protein interactions
2024-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601957
PMID:39005430
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研究论文 | 介绍了一个名为CPIExtract的软件包,用于从多个数据库中提取和整合小分子与蛋白质相互作用的数据 | CPIExtract能够从多个数据库中提取实验性结合相互作用数据,并进行过滤和整合,相比单一来源的数据库(如DrugBank),能够收集到超过10倍数量的注释 | NA | 开发一个工具来整合分散在多个机构中的小分子与蛋白质相互作用数据,以解决数据异质性问题 | 小分子与蛋白质的相互作用数据 | 生物信息学 | NA | 数据整合与过滤 | NA | 表格数据 | NA |
350 | 2024-10-24 |
Deep learning identifies heterogeneous subpopulations in breast cancer cell lines
2024-Jul-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.02.601576
PMID:39005432
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研究论文 | 本文探讨了使用深度学习方法通过细胞形态特征识别乳腺癌细胞系中的异质性亚群 | 首次展示了细胞形态可以反映体外转录组差异,并使用卷积神经网络识别乳腺癌细胞系中的亚群 | NA | 研究细胞形态特征是否可以用于分类体外癌细胞系中的转录组亚群 | 乳腺癌细胞系及其亚群 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 卷积神经网络 | CNN | 图像 | NA |
351 | 2024-10-24 |
IRTCI: Item Response Theory for Categorical Imputation
2024-Jul-02, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4529519/v1
PMID:39011102
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研究论文 | 本文介绍了一种基于项目反应理论(IRT)的新型分类插补方法,并将其与现有的几种机器学习插补技术进行了比较 | 提出了基于项目反应理论的分类插补方法(IRTCI),并展示了其在多种条件下的优越性 | 未提及 | 开发和评估一种新的分类插补方法,以解决数据集中缺失值的问题 | 分类数据集中的缺失值插补 | 机器学习 | NA | 项目反应理论(IRT) | NA | 分类数据 | 三个不同类型的数据集,分别代表序数、名义和二元类别 |
352 | 2024-10-24 |
Analysis of RNA translation with a deep learning architecture provides new insight into translation control
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.08.548206
PMID:39005319
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研究论文 | 开发了一种深度神经网络模型,用于直接预测和分析RNA序列中的翻译起始和终止位点 | 揭示了密码子使用在调控翻译终止中的新作用,并识别了数千个新的开放阅读框 | NA | 理解基因翻译的控制机制 | RNA序列中的翻译起始和终止位点 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度神经网络 | RNA序列 | 训练数据包括人类转录本,预测范围涵盖整个人类转录组及其他真核生物、原核生物和RNA病毒的转录本 |
353 | 2024-10-24 |
Big data for imaging assessment in glaucoma
2024 Jul-Sep, Taiwan journal of ophthalmology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/tjo.TJO-D-24-00079
PMID:39430345
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综述 | 本文综述了大数据和人工智能在青光眼研究中的应用 | 探讨了人工智能和深度学习算法在青光眼筛查、诊断和监测中的潜力 | 未具体讨论现有技术的局限性 | 评估大数据和人工智能在青光眼研究中的应用,以促进早期检测和疾病进展预测 | 青光眼及其相关影像评估 | 计算机视觉 | 眼科疾病 | 人工智能 (AI) 和深度学习 (DL) | 生成式AI | 影像 | NA |
354 | 2024-10-24 |
Artificial intelligence and big data integration in anterior segment imaging for glaucoma
2024 Jul-Sep, Taiwan journal of ophthalmology
IF:1.0Q4
DOI:10.4103/tjo.TJO-D-24-00053
PMID:39430364
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综述 | 本文探讨了人工智能和大数据在前段影像中对青光眼诊断和管理的整合 | 本文介绍了人工智能和大数据在青光眼诊断和管理中的应用,特别是机器学习和深度学习在图像分析和自动化复杂过程中的作用 | 本文讨论了标准化和整合多样化数据集的挑战,并建议未来合作和技术进步可能显著改善青光眼的管理和研究 | 探讨人工智能和大数据在前段影像中对青光眼诊断和管理的应用 | 前段影像技术,如前段光学相干断层扫描、超声生物显微镜和角膜照相术,以及这些技术在识别闭角疾病中的作用 | 计算机视觉 | 青光眼 | NA | 机器学习, 深度学习 | 图像 | NA |
355 | 2024-10-21 |
Short tandem repeat expansions in cortical layer-specific genes implicate in phenotypic severity and adaptability of autism spectrum disorder
2024-Jul, Psychiatry and clinical neurosciences
IF:5.0Q1
DOI:10.1111/pcn.13676
PMID:38751214
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研究论文 | 研究短串联重复序列(STR)在自闭症谱系障碍(ASD)中的作用及其与皮质层特异性基因的关系 | 首次在未充分研究的群体中展示了与ASD相关的STR扩展的证据 | NA | 研究STR扩展与ASD的遗传关联,并识别与ASD表型相关的风险位点 | 自闭症谱系障碍(ASD)及其相关基因 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 全基因组测序(WGS) | 深度学习 | 基因组数据 | 634个ASD家庭 |
356 | 2024-10-19 |
Implementing Triage-Bot: Supporting the Current Practice for Triage Nurses
2024-07-15, Surgical technology international
DOI:10.52198/24.STI.44.WH1804
PMID:39151148
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Triage-Bot的AI系统,旨在协助急诊护士进行患者分诊 | Triage-Bot系统结合了创新的分析方法、自动化常规操作和高效处理技术,能够通过语音和视频提问,自动测量患者的生命体征,并使用深度学习模型分析用户的面部表情和语音语调 | 系统在没有护士指导的情况下访问时,用户需要了解何时应访问医疗提供者或急诊室;系统需要不断改进以适应不同能力患者的可访问性,并考虑语言、文化和年龄因素对语音和文本交互的影响 | 探讨AI系统在急诊护理中的应用,特别是如何通过Triage-Bot系统提高患者分诊的效率和质量 | 急诊护士和患者 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 语音和视频 | NA |
357 | 2024-10-18 |
Objectification of evaluation criteria in microscopic agglutination test using deep learning
2024-07, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2024.106955
PMID:38754481
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研究论文 | 本文旨在通过深度学习方法客观化显微凝集试验中的凝集率评估标准 | 提出了一种利用深度学习从暗场显微图像中提取自由钩端螺旋体并计算凝集率的方法 | NA | 客观化显微凝集试验中的凝集率评估标准 | 显微凝集试验中的凝集率 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | NA | 图像 | NA |
358 | 2024-10-17 |
Ultra-low dose hip CT-based automated measurement of volumetric bone mineral density at proximal femoral subregions
2024-Jul-23, Medical physics
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/mp.17319
PMID:39042053
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研究论文 | 开发并评估了一种基于超低剂量髋部CT的自动化方法,用于评估近端股骨亚区域的体积骨矿物质密度 | 结合深度学习、形状模型和有限元分析,提出了一种准确、可重复且可推广的算法,用于自动化分割近端股骨和解剖股骨亚区域 | NA | 开发和评估一种基于超低剂量髋部CT的自动化方法,用于评估近端股骨亚区域的体积骨矿物质密度 | 近端股骨亚区域的体积骨矿物质密度 | 计算机视觉 | NA | 深度学习、有限元分析 | 深度学习网络 | CT图像 | 100名参与者(50名女性) |
359 | 2024-10-13 |
1 Million Segmented Red Blood Cells With 240 K Classified in 9 Shapes and 47 K Patches of 25 Manual Blood Smears
2024-Jul-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03570-z
PMID:38956115
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研究论文 | 本文介绍了一个包含100万个分割红细胞和24万个分类红细胞的数据集,用于开发和测试基于深度学习的红细胞形态/形状检查自动化技术 | 本文首次提供了一个大规模的红细胞形态数据集,并提供了用于图像处理和深度学习模型训练的代码 | 数据集仅包含25个手动制备的血涂片,可能不足以涵盖所有可能的红细胞形态 | 开发和测试基于深度学习的红细胞形态/形状检查自动化技术 | 红细胞的形态和形状 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 图像分类器 | 图像 | 25个手动制备的血涂片,共47000多个图像/补丁,包含100万个分割红细胞和24万个分类红细胞 |
360 | 2024-10-12 |
Association of retinal image-based, deep learning cardiac BioAge with telomere length and cardiovascular biomarkers
2024-Jul-01, Optometry and vision science : official publication of the American Academy of Optometry
IF:1.6Q3
DOI:10.1097/OPX.0000000000002158
PMID:38935034
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研究论文 | 本研究利用基于视网膜图像的深度学习模型评估心脏生物年龄,并探讨其与端粒长度和心血管疾病生物标志物的关系 | 开发了一种基于视网膜图像的深度学习心脏生物年龄模型,用于快速、准确、无创地筛查心血管疾病 | 研究为横断面研究,需要进一步的纵向研究来验证模型的长期有效性 | 验证基于深度学习的心脏生物年龄模型是否与已知的心血管疾病风险趋势和白细胞端粒长度一致 | 英国生物银行中的个体,包括其端粒长度数据和视网膜图像 | 机器学习 | 心血管疾病 | 深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | 英国生物银行中的个体,具体数量未在摘要中提及 |