深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-06-18	Improving Automated Hemorrhage Detection at Sparse-View CT via U-Net-based Artifact Reduction 2024-07, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.230275 PMID:38717293	research paper	本研究探讨了基于深度学习的伪影减少技术在稀疏视图颅脑CT扫描中的应用及其对自动出血检测的影响	使用U-Net进行伪影减少，显著提高了稀疏视图颅脑CT扫描中的自动出血检测性能	研究为回顾性研究，且仅基于模拟的稀疏视图CT数据	提高稀疏视图颅脑CT扫描中自动出血检测的准确性	稀疏视图颅脑CT扫描图像	digital pathology	hemorrhage	CT扫描	U-Net, EfficientNet-B2	image	3000名患者的模拟稀疏视图CT数据，以及17545名患者的全视图CT数据
62	2025-06-18	Deep Learning for Breast Cancer Risk Prediction: Application to a Large Representative UK Screening Cohort 2024-07, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.230431 PMID:38775671	研究论文	开发了一种基于深度学习的AI工具，用于从当前阴性筛查乳腺X光检查中预测未来乳腺癌风险，并在英国国家卫生服务乳腺筛查计划的数据上进行了评估	利用深度学习技术从阴性筛查乳腺X光检查中预测未来乳腺癌风险，并在大规模代表性英国筛查队列中验证模型性能	研究仅基于英国三个站点的数据，可能无法完全代表其他地区或人群	开发并验证一种能够预测未来乳腺癌风险的AI工具	50-70岁无癌症女性患者的筛查乳腺X光检查	数字病理学	乳腺癌	深度学习	AI深度学习模型	乳腺X光图像	5264风险阳性和191488风险阴性检查，包括89,285训练集、2,106验证集和39,351测试集
63	2025-06-16	Association of retinal image-based, deep learning cardiac BioAge with telomere length and cardiovascular biomarkers 2024-Jul-01, Optometry and vision science : official publication of the American Academy of Optometry IF:1.6Q3 DOI:10.1097/OPX.0000000000002158 PMID:38935034	research paper	该研究探讨了基于视网膜图像的深度学习心脏生物年龄模型与端粒长度及心血管生物标志物的关联	利用视网膜图像和深度学习模型非侵入性地预测心血管疾病风险，并验证其与端粒长度缩短的相关性	研究为横断面设计，无法确定因果关系，且样本仅来自UK Biobank数据库	验证深度学习心脏生物年龄模型与传统心血管风险标志物及端粒长度的关联	UK Biobank中具有端粒长度数据的个体	digital pathology	cardiovascular disease	deep learning	DL cardiac BioAge model	retinal images	UK Biobank队列中具有端粒长度数据的个体（具体数量未明确说明）
64	2025-06-15	A practical machine learning approach for predicting the quality of 3D (bio)printed scaffolds 2024-Jul-25, Biofabrication IF:8.2Q1 DOI:10.1088/1758-5090/ad6374 PMID:39008994	research paper	本研究提出了一种实用的机器学习方法，用于预测3D（生物）打印支架的质量	提供了最全面的开源数据集，并应用了从无监督到监督学习的多种AI技术，开发了一个具有六层隐藏层的全连接神经网络	AI在组织工程中的应用常因缺乏全面可靠的数据而受到阻碍	预测3D（生物）打印支架的质量	3D（生物）打印支架	machine learning	NA	AI, machine learning, deep learning	XGBoost, Gradient Boosting, Extra Trees Classifier, Random Forest Classifier, LightGBM, fully connected neural network	dataset on 3D-printed scaffolds	1171 scaffolds, 60 biomaterials, 49 cell lines
65	2025-06-15	A hybrid model for the detection of retinal disorders using artificial intelligence techniques 2024-Jul-10, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/ad5db2 PMID:38955139	research paper	该研究提出了一种结合机器学习和深度学习技术的混合模型，用于自动分类视网膜疾病	提出了一种新的框架，结合了多种分类器（SVM、K-NN、DT、EM）和InceptionV3 CNN特征提取器，实现了高精度的视网膜疾病分类	未提及模型在临床环境中的实际应用效果或泛化能力	开发一种自动化的视网膜疾病分类方法	视网膜疾病（脉络膜新生血管、糖尿病性黄斑水肿、玻璃膜疣）和正常病例	computer vision	视网膜疾病	OCT（光学相干断层扫描）	SVM、K-NN、DT、EM、InceptionV3 CNN	image	18000张OCT图像
66	2025-06-14	Deep Learning Prostate MRI Segmentation Accuracy and Robustness: A Systematic Review 2024-07, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.230138 PMID:38568094	系统性综述	本研究通过系统性综述探讨了深度学习在前列腺MRI分割中的准确性和鲁棒性，并与专业放射科医生进行了比较	首次系统性评估深度学习在前列腺MRI分割中的表现，并比较不同MRI厂商、前列腺区域和测试方法下的性能	仅纳入截至2022年7月31日前的英文文献，可能遗漏最新研究成果	评估深度学习在前列腺MRI分割中的准确性和鲁棒性	前列腺MRI图像	数字病理学	前列腺癌	MRI	深度学习算法	医学影像	48项研究（来自691篇初步筛选文献）
67	2025-06-14	Validation of de novo designed water-soluble and transmembrane β-barrels by in silico folding and melting 2024-Jul, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.5033 PMID:38864690	研究论文	通过计算机模拟折叠和熔解验证了从头设计的水溶性和跨膜β桶蛋白	揭示了AlphaFold2和ESMFold在不同任务中的优势，并引入了一种基于预测增量扰动的'计算机模拟熔解'新方法	缺乏高质量预测模型与实验成功机会之间关系的正式证据	验证和比较深度学习结构预测算法在蛋白质设计中的应用	从头设计的水溶性和跨膜β桶蛋白	计算生物学	NA	深度学习结构预测算法(AlphaFold2, ESMFold)	AlphaFold2, ESMFold	蛋白质序列和结构数据	NA
68	2025-06-10	Combining Artificial Intelligence and Simplified Image Processing for the Automatic Detection of Mycobacterium tuberculosis in Acid-fast Stain : A Cross-institute Training and Validation Study 2024-Jul-01, The American journal of surgical pathology DOI:10.1097/PAS.0000000000002223 PMID:38595262	研究论文	本文介绍了一种结合人工智能和简化图像处理技术的自动化结核分枝杆菌检测平台	采用改进的EfficientNet模型和图像处理技术，显著提高了结核分枝杆菌的检测准确率和效率	研究仅在两家医院的数据上进行验证，可能需要更多样化的数据集进一步验证	开发高效的结核分枝杆菌自动检测方法以提高病理诊断效率	抗酸染色中的结核分枝杆菌	数字病理学	结核病	深度学习、图像处理	改进的EfficientNet	图像	来自2家医院的全切片图像
69	2025-06-07	Designing Clinical MRI for Enhanced Workflow and Value 2024-07, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29038 PMID:37795927	research paper	探讨如何通过优化MRI工作流程和采用数字工具提升临床MRI的价值和效率	提出利用数字工具和深度学习加速图像重建方法优化MRI工作流程，并强调患者准备流程的重新配置和实时信息工具的应用	未提及具体实施这些优化策略的临床效果数据或案例研究	优化MRI工作流程，提升患者价值和医疗效率	MRI成像过程及其相关技术和人员	数字病理	NA	深度学习加速图像重建方法	NA	图像	NA
70	2025-06-07	Global and Regional Deep Learning Models for Multiple Sclerosis Stratification From MRI 2024-07, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29046 PMID:37803817	research paper	本研究比较了全脑输入采样策略和区域/特定组织策略，以基于残疾水平对多发性硬化症患者进行分层	首次比较了全脑与区域输入策略在MRI深度学习模型中对多发性硬化症患者残疾水平分层的效果	研究仅使用了单一供应商的MRI设备数据，可能影响模型的泛化能力	比较不同MRI输入策略对多发性硬化症患者残疾水平分层的效果	多发性硬化症患者的脑部MRI扫描数据	digital pathology	multiple sclerosis	MRI	3D-CNN	image	319名MS患者（382次脑部MRI扫描）的内部数据集和440名来自多中心的MS患者外部验证队列
71	2025-06-07	Automated Breast Density Assessment in MRI Using Deep Learning and Radiomics: Strategies for Reducing Inter-Observer Variability 2024-07, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29058 PMID:37846440	research paper	该研究探讨了利用深度学习和放射组学减少乳腺密度评估中观察者间变异性的可行性	结合深度学习和放射组学模型，通过AI辅助解释显著减少了乳腺密度评估的观察者间变异性	研究为回顾性设计，可能限制了结果的普遍适用性	评估人工智能辅助解释在减少乳腺密度评估观察者间变异性中的效果	621名无乳腺假体或重建手术的患者	digital pathology	breast cancer	deep learning, radiomics	CNN	MRI images	621名患者（训练集377名，验证集98名，独立测试集146名）
72	2025-06-07	Magnetic Resonance Deep Learning Radiomic Model Based on Distinct Metastatic Vascular Patterns for Evaluating Recurrence-Free Survival in Hepatocellular Carcinoma 2024-07, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29064 PMID:37888871	research paper	该研究旨在构建并比较基于VETC-MVI的临床、放射组学和深度学习模型，以评估肝细胞癌患者的无复发生存期	首次基于VETC和MVI两种转移性血管模式构建深度学习放射组学模型，用于评估HCC患者的无复发生存期	回顾性研究设计，样本量相对有限（398例患者）	评估肝细胞癌患者的无复发生存期	肝细胞癌患者	digital pathology	liver cancer	MRI（T1WI SPGR, T2WI FSE, 增强动脉期和延迟期成像）	deep learning model	medical imaging	398例HCC患者（训练队列358例，测试队列40例）
73	2024-08-07	Editorial for "Magnetic Resonance Deep Learning Radiomic Model Based on Distinct Metastatic Vascular Patterns for Evaluating Recurrence-Free Survival in Hepatocellular Carcinoma" 2024-07, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29063 PMID:37818933	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
74	2024-08-07	Editorial for "Automated Breast Density Assessment in MRI Using Deep Learning and Radiomics: Strategies for Reducing Inter-Observer Variability" 2024-07, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29059 PMID:37818764	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
75	2025-06-02	Geometric deep learning-guided Suzuki reaction conditions assessment for applications in medicinal chemistry 2024-Jul-17, RSC medicinal chemistry IF:4.1Q2 DOI:10.1039/d4md00196f PMID:39026644	研究论文	本文探讨了如何利用机器学习方法基于高通量实验数据快速选择Suzuki偶联反应条件，以加速小分子药物发现中的碳-碳键构建	引入了针对反应产率优化的96孔板设计算法，并评估了零样本和小样本机器学习在反应条件选择中的性能	零样本机器学习模型的平均ROC-AUC值较低（0.63±0.16），表明其在某些情况下可能不够可靠	加速小分子药物发现中的碳-碳键构建过程	Suzuki偶联反应条件选择	机器学习	NA	高通量实验(HTE)	零样本和小样本机器学习	实验数据	八个反应验证
76	2025-05-31	Quantifying social roles in multi-animal videos using subject-aware deep-learning 2024-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.07.602350 PMID:39026890	研究论文	介绍了一种基于深度学习的系统LabGym2，用于识别和量化多动物群体中的社会角色	采用主体感知方法，评估群体中每个个体的行为状态，同时考虑其社会和周围环境	NA	开发自动化工具以分析多动物群体中自由移动个体的社会角色	多动物群体中的个体	计算机视觉	NA	深度学习	NA	视频	多种物种和实验，包括自由移动昆虫和野外灵长类动物的社会互动
77	2025-05-31	Dynamic risk stratification of worsening heart failure using a deep learning-enabled implanted ambulatory single-lead electrocardiogram 2024-Jul, European heart journal. Digital health DOI:10.1093/ehjdh/ztae035 PMID:39081943	研究论文	该研究开发了一种基于深度学习的动态风险分层方法，利用植入式单导联动态心电图监测心力衰竭恶化的风险	首次将植入式循环记录器的动态心电图数据与深度学习算法结合，用于心力衰竭恶化的动态风险分层	研究仅基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证	开发心力衰竭恶化的早期预警系统	心力衰竭患者	数字病理学	心血管疾病	动态心电图监测	CNN	心电图数据	2247名患者（训练集），909名患者（验证集）
78	2025-05-31	CrysFormer: Protein structure determination via Patterson maps, deep learning, and partial structure attention 2024-Jul, Structural dynamics (Melville, N.Y.) DOI:10.1063/4.0000252 PMID:39148510	研究论文	提出了一种基于Transformer的模型CrysFormer，利用实验蛋白质晶体学数据和部分结构信息计算蛋白质的电子密度图	首次提出直接利用实验蛋白质晶体学数据和部分结构信息的Transformer模型，绕过晶体学相位问题	仅在合成数据集上进行了验证，未在真实复杂蛋白质结构上测试	解决蛋白质原子级结构确定的长期挑战	蛋白质晶体结构	计算生物学	NA	X射线晶体学	Transformer	Patterson图、蛋白质序列信息	两个合成数据集（一个每单位细胞含2个残基，另一个含15个残基）
79	2025-05-29	FedAssist: Federated Learning in AI-Powered Prosthetics for Sustainable and Collaborative Learning 2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10781961 PMID:40039020	研究论文	本文探讨了联邦学习在开发深度学习驱动的表面肌电信号解码方法中的应用，用于AI控制的假肢	提出了FedAssist框架，通过本地和全局预热策略，有效解决了sEMG数据集的非独立同分布问题	未提及具体样本量或实验规模	推进去中心化机器学习方法在sEMG领域的应用，提高假肢精度和康复效果	AI控制的假肢	机器学习	NA	联邦学习	深度学习	表面肌电信号(sEMG)	NA
80	2025-05-29	Multi-class Prediction of Cognitively Normal / Mild Cognitive Impairment / Alzheimer's Disease Status in Dementia Based on Convolutional Neural Networks with Attention Mechanism 2024-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference DOI:10.1109/EMBC53108.2024.10781557 PMID:40039646	研究论文	开发了一个基于MRI和深度学习的多类别阿尔茨海默病分类预测框架	在传统VGG19架构中嵌入卷积块注意力模块（CBAM）注意力层，构建了名为AD_Net的阿尔茨海默病定向预测3D卷积模型	未明确说明模型在其他独立数据集上的泛化能力	阿尔茨海默病的早期诊断	阿尔茨海默病（AD）、轻度认知障碍（MCI）和认知正常（CN）患者	数字病理学	阿尔茨海默病	MRI成像	CNN（VGG19架构改进）与注意力机制结合	MRI图像	来自ADNI开放数据资源的MRI图像（具体数量未说明）