深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1021	2024-08-05	Deep learning-based and BI-RADS guided radiomics model for automatic tumor-infiltrating lymphocytes evaluation in breast cancer 2024-Jul-12, The British journal of radiology DOI:10.1093/bjr/tqae129 PMID:38995740	研究论文	本文研究了一种可解释的放射组学模型，用于从超声图像中自动预测乳腺癌中的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）水平	该模型结合了BI-RADS指导的放射组学特征和临床数据，优于传统的放射组学方法，并提供了众多可解释特征	研究的局限性未在摘要中提及	研究的目的是探索一种与临床决策一致的放射组学模型	378名侵袭性乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	超声（US）影像	深度学习模型	影像	378名患者
1022	2024-08-05	Integration of wearable devices and deep learning: New possibilities for health management and disease prevention 2024-Jul-09, Bioscience trends IF:5.7Q1 DOI:10.5582/bst.2024.01170 PMID:38925926	研究论文	探讨了可穿戴设备与深度学习的结合在健康管理和疾病预防中的新可能性	提出了通过将可穿戴设备与医疗记录整合来实现更准确的疾病预测和个性化生活方式指导	当前研究主要集中于短期预测，缺乏长期视角的深入研究	旨在通过整合数据提升可穿戴设备和深度学习在健康管理中的应用	研究对象为使用可穿戴设备的用户与其产生的健康数据	数字病理学	NA	深度学习	NA	传感器数据	NA
1023	2024-08-05	Deep 3D histology powered by tissue clearing, omics and AI 2024-Jul, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02327-1 PMID:38997593	研究论文	本文讨论了将三维组织组织学技术应用于生物医学研究的方法	创新地结合了组织清理化学、标记和体积成像技术，以实现细胞层级的全面三维映射	未来发展的整合方法仍需进一步完善，才能完全发挥下一代三维组织学的潜力	探讨三维细胞地图在理解组织和生物体生理及病理中的重要性	组织和细胞的三维结构数据及其分子组成	数字病理学	NA	组织清理技术	深度学习	结构数据和分子数据	NA
1024	2024-08-05	Clustering single-cell RNA sequencing data via iterative smoothing and self-supervised discriminative embedding 2024-Jul, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-024-03074-5 PMID:38834657	研究论文	提出了一种名为scRISE的深度聚类方法来处理单细胞RNA测序数据。	引入了一种迭代平滑和自监督的区分嵌入模块，提高了数据表示和聚类的质量。	未提及具体的限制因素。	提升单细胞转录组测序数据的聚类分析效果。	单细胞RNA测序数据集，尤其关注HNSCC数据集。	数字病理学	NA	深度学习	图自编码器	RNA测序数据	十七个scRNA-seq数据集
1025	2024-08-05	Lessons learned: Why study-abroad remains a critical component of nursing curriculums 2024 Jul-Aug, Journal of professional nursing : official journal of the American Association of Colleges of Nursing IF:2.8Q1 DOI:10.1016/j.profnurs.2024.05.007 PMID:38997189	研究论文	这篇文章探讨了护理本科生和高级实践护士在国外学习服务中共同工作的亲身经历	强调了留学沉浸体验在增强大学生文化能力和深度学习方面的重要性	研究仅限于在贝尔IZE的单一体验，可能缺乏普遍适用性	理解护理本科生和高级实践护士在国外服务学习经历中的生活体验	护理本科生和高级实践护士学生	护理教育	NA	诠释现象学分析	NA	文本	参与者为本科和高级实践护理学生的具体人数未提及
1026	2024-08-07	Simplifying deep learning to enhance accessibility of large-scale 3D brain imaging analysis 2024-Jul, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02246-1 PMID:38649743	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1027	2024-08-07	Deep learning method for the prediction of glycan structures from mass spectrometry data 2024-Jul, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02315-5 PMID:38951671	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1028	2024-08-05	A transformative framework reshaping sustainable drought risk management through advanced early warning systems 2024-Jul-19, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.110066 PMID:38989469	研究论文	本文提出一个框架，通过先进的早期预警系统重塑可持续的干旱风险管理	该框架通过引入第四次工业革命技术，如物联网、无人机、大数据分析和深度学习，增强干旱早期预警能力	框架的实际实施和政策修订仍然是关键的挑战	研究旨在通过早期预警系统有效减少干旱风险	研究对象包括干旱敏感领域和相关社区	自然语言处理	NA	物联网、无人机、大数据分析、深度学习	NA	文本	NA
1029	2024-08-05	Unsupervised Domain Adaptation for Low-Dose CT Reconstruction via Bayesian Uncertainty Alignment 2024-Jul-10, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3409573 PMID:38985555	研究论文	该文章提出了一种基于贝叶斯不确定性对齐的无监督领域适应技术以改进低剂量CT重建	提出了结合潜在空间和图像空间的联合差异最小化方法，特别是使用贝叶斯不确定性对齐来减少源域和目标域之间的知识差距	现有的无监督领域适应方法未能充分利用不确定性量化	旨在提高低剂量CT重建在临床场景中的性能	主要研究低剂量计算机断层扫描(LDCT)图像重建和无监督领域适应	数字病理学	NA	贝叶斯不确定性对齐	NA	图像	在两个模拟数据集和一个临床低剂量成像数据集中进行了实验
1030	2024-08-05	Identification of Parkinson's disease PACE subtypes and repurposing treatments through integrative analyses of multimodal data 2024-Jul-09, NPJ digital medicine IF:12.4Q1 DOI:10.1038/s41746-024-01175-9 PMID:38982243	研究论文	本研究通过整合多种数据模式分析，识别了帕金森病的三个不同类型及其潜在治疗方案。	发现了帕金森病的三种不同进展速度亚型，并识别了与这些亚型相关的潜在生物标志物和驱动基因。	缺乏足够的长期临床数据以验证所识别亚型的临床有效性。	旨在通过分析不同数据模式来解决帕金森病的异质性。	使用新确诊的帕金森病患者的临床进展数据进行分析。	机器学习	帕金森病	机器学习与深度学习	NA	临床数据	≥5年的帕金森病临床进展数据
1031	2024-08-05	An interpretable artificial intelligence model based on CT for prognosis of intracerebral hemorrhage: a multicenter study 2024-Jul-09, BMC medical imaging IF:2.9Q2 DOI:10.1186/s12880-024-01352-y PMID:38982357	研究论文	本文开发并验证了一种新的可解释人工智能模型，用于预测脑内出血患者的预后	通过整合放射组学特征、深度学习特征和多语义级别的影像特征，提出了一种多模态解释性人工智能模型	虽然使用了三种解释性方法，但仍未完全解决人工智能模型的可解释性问题	该研究旨在精准预测脑内出血患者的6个月预后	研究对象为222名脑内出血患者	计算机视觉	脑内出血	非对比计算机断层扫描	随机森林模型	影像	222名患者，训练队列186名，测试队列36名
1032	2024-08-05	Synthetic CT generation for pelvic cases based on deep learning in multi-center datasets 2024-Jul-09, Radiation oncology (London, England) DOI:10.1186/s13014-024-02467-w PMID:38982452	研究论文	本研究探讨了基于深度学习的合成CT图像生成方法，适用于多中心的数据集中的直肠癌MR影像。	提出了一种结合对比学习损失和一致性正则化损失的新模型，增强了多中心骨盆MRI到CT合成的模型泛化能力。	研究可能受限于参与者的代表性和模型在不同临床环境中应用的实际效果。	研究旨在调查在多中心数据集中，从磁共振成像合成计算机断层扫描图像的可行性。	研究对象为90名直肠癌患者和19名公共数据集中的患者。	数字病理学	直肠癌	生成对抗网络（GAN）	CycleGAN	影像	共109名患者的T2加权MR和CT图像
1033	2024-08-05	MDF-DTA: A Multi-Dimensional Fusion Approach for Drug-Target Binding Affinity Prediction 2024-Jul-08, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.4c00310 PMID:38888163	研究论文	提出了一种基于深度学习的多维融合方法来预测药物-靶标结合亲和力。	创新地结合了来自不同预训练模型的1D、2D和3D特征表示，以提高预测性能。	缺乏对不同特征重要性定量分析的深入探讨。	研究药物-靶标结合亲和力预测的有效方法。	药物和靶标的多个维度特征。	机器学习	NA	深度学习	NA	标准基准数据集	两个标准基准数据集：DAVIS和KIBA
1034	2024-08-05	Greater benefits of deep learning-based computer-aided detection systems for finding small signals in 3D volumetric medical images 2024-Jul, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.11.4.045501 PMID:38988989	研究论文	本研究探讨了深度学习计算机辅助检测系统在3D体积医学图像中发现小信号的优势	提出了基于卷积神经网络(CNN)的计算机辅助检测系统在3D搜索中显著提高了小信号的检测能力	对于大信号，2D搜索的优势并未显著超过3D搜索的优势	研究计算机辅助检测系统如何减少体积数据探索不足所造成的错误	十六名非专家观察者在数字乳腺断层合成(DBT)幻影中进行搜索	计算机视觉	乳腺癌	卷积神经网络(CNN)	CNN	图像	十六名非专家观察者
1035	2024-08-05	SPH-Net: Hyperspectral Image Super-Resolution via Smoothed Particle Hydrodynamics Modeling 2024-Jul, IEEE transactions on cybernetics IF:9.4Q1 DOI:10.1109/TCYB.2023.3323374 PMID:37906479	研究论文	提出了一种基于平滑粒子流体动力学模型的高光谱图像超分辨率方法SPH-Net	将高光谱图像超分辨率重建中像素运动与平滑粒子流体动力学中的粒子运动进行类比，以此设计了新的神经网络结构	具体的限制未在摘要中提及	研究高光谱图像的超分辨率重建问题	高光谱图像（HSI）	计算机视觉	NA	SPH近似方法	SPH网络	高光谱图像	三个公共高光谱数据集
1036	2024-08-05	Association of retinal age gap with chronic kidney disease and subsequent cardiovascular disease sequelae: a cross-sectional and longitudinal study from the UK Biobank 2024-Jul, Clinical kidney journal IF:3.9Q1 DOI:10.1093/ckj/sfae088 PMID:38989278	研究论文	本研究探讨了视网膜年龄差与慢性肾病（CKD）及随后的心血管疾病（CVD）并发症之间的关系	发掘了视网膜年龄差作为新型生物标志物在识别高风险CKD个体及CKD患者心血管疾病风险中的应用潜力	本研究的局限性在于样本的单一来源于UK Biobank，可能不具备广泛的代表性	研究视网膜年龄差与CKD及其后续心血管疾病并发症之间的关联	研究对象为在基线没有任何医疗历史的参与者，数据来源包含19200张眼底图像及35906名参与者	数字病理学	慢性肾病、心血管疾病	深度学习模型	NA	图像	35906名参与者
1037	2024-08-05	Deep Learning-based Image Enhancement Techniques for Fast MRI in Neuroimaging 2024-Jul-01, Magnetic resonance in medical sciences : MRMS : an official journal of Japan Society of Magnetic Resonance in Medicine IF:2.5Q2 DOI:10.2463/mrms.rev.2023-0153 PMID:38684425	研究论文	本文讨论了基于深度学习的图像增强技术，以加快神经成像中的MRI扫描速度	提出了利用深度学习技术在不妥协图像质量的情况下，进一步减少MRI扫描时间的方案	在文中未提到深度学习方法的具体实现及其应用中的潜在限制	研究在神经成像中减小MRI扫描时间的技术	主要针对MRI图像重建和优化的研究对象	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA
1038	2024-08-05	Multiview Deep Subspace Clustering Networks 2024-Jul, IEEE transactions on cybernetics IF:9.4Q1 DOI:10.1109/TCYB.2024.3372309 PMID:38517724	研究论文	该文章提出了一种多视角深度子空间聚类网络，以解决现有方法在特征学习和聚类中的不足	提出了多视角深度子空间聚类网络（MvDSCN），使用多视角自表示矩阵进行端到端学习	当前研究未明确提及潜在的限制	旨在通过融合多视角互补信息来发现数据的内在结构	研究对象为多视角数据，通过学习自表示矩阵进行聚类	机器学习	NA	深度卷积自编码器	NA	NA	NA
1039	2024-08-05	Machine Learning-Assisted Decision Making in Orthopaedic Oncology 2024-Jul-01, JBJS reviews IF:1.7Q2 DOI:e24.00057 PMID:38991098	研究论文	本研究探讨了机器学习在骨肿瘤学决策中的应用	文章创新点在于利用机器学习算法改善影像学评估和诊断，同时开发了预测原发性肉瘤和转移性骨病存活率的计算器	模型的鲁棒性需要通过标准化指南进行评估，且依然面临数据多样化、伦理问题和模型可解释性等挑战	研究的目的是利用机器学习提升骨肿瘤学中的临床预测能力	研究对象为原发性肉瘤和转移性骨病患者的特定数据	机器学习	癌症	机器学习算法	深度学习	数据集	NA
1040	2024-08-05	Projected pooling loss for red nucleus segmentation with soft topology constraints 2024-Jul, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.11.4.044002 PMID:38988992	研究论文	提出了一种基于投影池损失的新方法，以软拓扑约束自动分割红核	引入了一种新颖的损失函数，通过放大结构的小部分来引入软拓扑约束	对于小训练集可能仍然存在高准确度但极少的拓扑错误	研究旨在改善医学图像分割中的拓扑约束	主要研究对象是从定量易感映射中分割红核	医学图像处理	帕金森综合征	深度学习	NA	医学图像	NA