深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
381	2024-09-15	Deep learning fusion framework for automated coronary artery disease detection using raw heart sound signals 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35631 PMID:39262986	研究论文	本文提出了一种基于原始心音信号的深度学习融合框架，用于自动化冠状动脉疾病检测	本文创新性地构建了一个融合框架，结合了多领域特征模型和医学多领域特征融合模型，用于冠状动脉疾病的检测	NA	研究目的是开发一种非侵入性的方法，用于早期冠状动脉疾病的检测	研究对象是冠状动脉疾病	机器学习	心血管疾病	深度学习	融合模型	心音信号	400名参与者的心音信号数据集	NA	NA	NA	NA
382	2024-09-15	Diabetes detection from non-diabetic retinopathy fundus images using deep learning methodology 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36592 PMID:39258195	研究论文	本文研究了使用深度学习方法从无糖尿病视网膜病变的视网膜图像中检测糖尿病	本文创新性地开发了一种人工智能机器学习模型，能够从无糖尿病眼病的视网膜图像中检测糖尿病	本文未详细讨论模型的泛化能力和在不同人群中的适用性	研究目的是开发一种能够从视网膜图像中非侵入性检测糖尿病的机器学习模型	研究对象包括47,076张视网膜图像和基于疾病持续时间的患者分组	机器学习	糖尿病	深度学习	机器学习算法	图像	47,076张视网膜图像	NA	NA	NA	NA
383	2024-09-15	Advancing sub-seasonal to seasonal multi-model ensemble precipitation prediction in east asia: Deep learning-based post-processing for improved accuracy 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35933 PMID:39258194	研究论文	本研究通过深度学习后处理技术提高了东亚地区次季节至季节性降水预测的准确性	采用基于U-Net架构的深度学习模型进行后处理，显著提升了降水预测的准确性	NA	提高次季节至季节性降水预测的准确性	东亚地区的降水预测	机器学习	NA	深度学习	U-Net	降水数据	使用了六个S2S气候模型的降水预测数据及其多模型集合	NA	NA	NA	NA
384	2024-09-15	Traditional Machine Learning, Deep Learning, and BERT (Large Language Model) Approaches for Predicting Hospitalizations From Nurse Triage Notes: Comparative Evaluation of Resource Management 2024-Aug-27, JMIR AI DOI:10.2196/52190 PMID:39190905	研究论文	比较传统机器学习、深度学习和BERT（大型语言模型）在预测护士分诊笔记中的住院情况方面的性能	比较了深度学习模型Bio-Clinical-BERT与基于词袋（BOW）的逻辑回归（LR）模型在预测住院情况方面的性能	研究仅限于特定医院的数据，未涵盖所有可能的医疗系统	评估不同模型在预测护士分诊笔记中住院情况的有效性，以优化资源管理	护士分诊笔记中的住院预测	机器学习	NA	深度学习、BERT、词袋模型、逻辑回归	Bio-Clinical-BERT、逻辑回归	文本	1,391,988名患者的数据	NA	NA	NA	NA
385	2024-09-15	Deep Learning for Automatic Gross Tumor Volumes Contouring in Esophageal Cancer Based on Contrast-Enhanced Computed Tomography Images: A Multi-Institutional Study 2024-Aug-01, International journal of radiation oncology, biology, physics DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.02.035 PMID:38432286	研究论文	开发并验证了一种基于对比增强CT图像的自动人工智能工具，用于食管鳞状细胞癌患者的肿瘤体积勾画	开发了一种三维深度学习模型，用于自动勾画肿瘤体积，并在多中心验证中表现良好	NA	开发和验证一种自动人工智能工具，用于食管鳞状细胞癌患者的肿瘤体积勾画，以辅助新辅助或根治性放疗计划	食管鳞状细胞癌患者的对比增强CT图像	计算机视觉	食管癌	深度学习	三维深度学习模型	图像	580名食管鳞状细胞癌患者	NA	NA	NA	NA
386	2024-09-14	Daily PM2.5 concentration prediction based on variational modal decomposition and deep learning for multi-site temporal and spatial fusion of meteorological factors 2024-Aug-29, Environmental monitoring and assessment IF:2.9Q3 DOI:10.1007/s10661-024-13005-2 PMID:39207594	研究论文	本文提出了一种基于变分模态分解和深度学习的多站点时空融合气象因子预测每日PM2.5浓度的混合模型	该研究引入了新的混合模型VCBA，结合了变分模态分解、因果卷积神经网络、双向长短期记忆网络和注意力机制，用于时空融合的多站点数据预测	NA	准确预测每日PM2.5浓度，以保护环境和公众健康	PM2.5浓度及其影响因素	机器学习	NA	变分模态分解（VMD）	因果卷积神经网络（CNN）、双向长短期记忆网络（BiLSTM）	气象数据	太原市多个站点	NA	NA	NA	NA
387	2024-09-14	A study on the classification of complexly shaped cultivated land considering multi-scale features and edge priors 2024-Aug-15, Environmental monitoring and assessment IF:2.9Q3 DOI:10.1007/s10661-024-12966-8 PMID:39145878	研究论文	本文提出了一种考虑多尺度特征和边缘先验的复杂形状耕地提取网络（MFEPNet），通过设计上下文交叉注意力融合模块和纹理增强边缘模块，提高了复杂形状耕地的提取精度	本文的创新点在于设计了上下文交叉注意力融合模块和纹理增强边缘模块，有效减少了尺度变化、边缘模糊和全局视野有限的影响	NA	研究目的是提高复杂形状耕地的提取精度，为可持续农业发展提供准确的耕地分布数据	研究对象是复杂形状的耕地，特别是其多尺度和模糊边缘问题	计算机视觉	NA	深度学习	CNN-transformer	图像	使用了IFLYTEK和荷兰数据集划分的规则和不规则耕地数据集	NA	NA	NA	NA
388	2024-09-13	The impact of AI-enabled CRM systems on organizational competitive advantage: A mixed-method approach using BERTopic and PLS-SEM 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36392 PMID:39253149	研究论文	本文探讨了AI驱动的CRM系统对组织竞争优势的影响，采用混合方法研究	本文结合BERTopic主题建模和PLS-SEM方法，分析了AI-CRM系统的关键特征及其对组织竞争优势的影响	NA	探讨AI-CRM系统的关键特征及其对组织竞争优势的影响	AI-CRM系统的关键特征及其对组织竞争优势的影响	机器学习	NA	BERTopic主题建模，PLS-SEM	NA	文本	NA	NA	NA	NA	NA
389	2024-09-13	Systematic review and meta-analysis on the classification metrics of machine learning algorithm based radiomics in hepatocellular carcinoma diagnosis 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36313 PMID:39253167	综述	本文系统综述和荟萃分析了基于机器学习算法的放射组学在肝细胞癌诊断中的分类指标表现	评估了机器学习驱动的放射组学在肝细胞癌诊断中的分类性能，并发现LASSO作为特征选择器和Logistic Regression作为分类器在二分类问题中的适用性	仅评估了2018年至2022年间的436篇文章中的34篇，可能存在选择偏倚	评估机器学习驱动的放射组学在肝细胞癌诊断中的分类性能	肝细胞癌的诊断	机器学习	肝癌	放射组学	Logistic Regression	图像	12个队列研究	NA	NA	NA	NA
390	2024-09-13	Development of deep learning model for diagnosing muscle-invasive bladder cancer on MRI with vision transformer 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36144 PMID:39253215	研究论文	开发并验证了一种基于Vision Transformer的深度学习模型，用于在MRI上自动诊断肌肉浸润性膀胱癌	使用Vision Transformer模型在MRI上诊断肌肉浸润性膀胱癌，并展示了其优于传统卷积神经网络的性能	研究为多中心回顾性研究，样本量相对较小，且未提及模型的泛化能力在其他数据集上的表现	开发和验证一种能够自动诊断肌肉浸润性膀胱癌的深度学习模型	肌肉浸润性膀胱癌的MRI图像	计算机视觉	膀胱癌	深度学习	Vision Transformer (ViT) 和卷积神经网络 (CNN)	MRI图像	训练集包含170名患者，测试集包含53名患者	NA	NA	NA	NA
391	2024-09-13	The technological assessment of green buildings using artificial neural networks 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36400 PMID:39253242	研究论文	本研究旨在构建一个全面的评估模型，用于高效评估绿色建筑中的适用技术	本研究结合物联网和人工神经网络，提出了一种混合评估模型，显著提高了建筑环境参数和能耗预测的准确性和稳定性	NA	构建一个全面的评估模型，用于高效评估绿色建筑中的适用技术	绿色建筑中的适用技术	机器学习	NA	物联网 (IoT)、人工神经网络 (ANN)	多层感知器 (MLP)、长短期记忆 (LSTM)	物理量数据、经济指标数据	包括温度、湿度、光照强度等物理量数据，以及能源效率和建筑运营成本等经济指标数据	NA	NA	NA	NA
392	2024-09-13	TSpred: a robust prediction framework for TCR-epitope interactions using paired chain TCR sequence data 2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btae472 PMID:39052940	研究论文	提出了一种名为TSpred的深度学习框架，用于基于配对链TCR序列数据预测TCR-表位相互作用	结合了CNN和注意力机制，设计了互惠注意力机制，提高了对未见表位的泛化能力和模型解释性	未提及	开发一种稳健的预测框架，用于预测TCR-表位相互作用，应用于癌症免疫疗法和疫苗设计	TCR-表位相互作用	机器学习	NA	深度学习	CNN和注意力机制	序列数据	未提及	NA	NA	NA	NA
393	2024-09-13	BertSNR: an interpretable deep learning framework for single-nucleotide resolution identification of transcription factor binding sites based on DNA language model 2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btae461 PMID:39107889	研究论文	提出了一种名为BertSNR的可解释深度学习框架，用于在单核苷酸分辨率下识别转录因子结合位点	BertSNR通过多任务学习整合序列级和标记级信息，基于预训练的DNA语言模型，显著提高了转录因子结合位点预测的准确性和可解释性	NA	开发一种高分辨率和可解释的计算方法，用于识别转录因子结合位点	转录因子结合位点	计算生物学	NA	深度学习	BertSNR	DNA序列	NA	NA	NA	NA	NA
394	2024-09-13	Attention-based approach to predict drug-target interactions across seven target superfamilies 2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btae496 PMID:39115379	研究论文	本文介绍了一种基于注意力机制的方法（MMAtt-DTA），用于预测跨七个目标超家族的药物-靶点相互作用	提出了一种新的基于注意力机制的方法（MMAtt-DTA），该方法在预测药物-靶点相互作用方面表现优异，超过了现有的十四种最先进的机器学习、深度学习和图方法	NA	旨在开发一种高效的方法来预测药物-靶点相互作用，以支持药物再利用和新药机制的发现	药物-靶点相互作用，特别是跨七个目标超家族的相互作用	机器学习	癌症	注意力机制	MMAtt-DTA	生物活性数据	185,676个药物-靶点对	NA	NA	NA	NA
395	2024-09-13	PGAT-ABPp: harnessing protein language models and graph attention networks for antibacterial peptide identification with remarkable accuracy 2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btae497 PMID:39120878	研究论文	提出了一种名为PGAT-ABPp的新型深度学习方法，用于高精度识别抗菌肽	利用AlphaFold2预测的结构和预训练的蛋白质语言模型ProtT5构建图，并通过图注意力网络（GAT）学习全局判别特征	NA	开发一种高精度的模型用于抗菌肽的识别	抗菌肽（ABPs）	机器学习	NA	图注意力网络（GAT）	深度学习模型	蛋白质结构数据	独立测试数据集	NA	NA	NA	NA
396	2024-09-13	Advancing mRNA subcellular localization prediction with graph neural network and RNA structure 2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btae504 PMID:39133151	研究论文	本文提出了一种名为Allocator的多视角并行深度学习框架，用于预测mRNA的亚细胞定位，并结合了RNA序列和结构信息	本文的创新点在于首次将RNA的二级结构信息纳入mRNA亚细胞定位预测模型中，并提出了多视角并行深度学习框架Allocator	本文未提及具体的局限性	本文的研究目的是开发一种能够准确预测mRNA亚细胞定位的计算工具，以深化对基因调控网络的理解	本文的研究对象是mRNA的亚细胞定位及其与RNA序列和结构的关系	机器学习	NA	图神经网络	多层感知器、多头自注意力机制、图神经网络	RNA序列、RNA结构	NA	NA	NA	NA	NA
397	2024-09-13	Deep Learning Reconstruction of Accelerated MRI: False-Positive Cartilage Delamination Inserted in MRI Arthrography Under Traction 2024-Aug-01, Topics in magnetic resonance imaging : TMRI DOI:10.1097/RMR.0000000000000313 PMID:39016321	研究论文	本文探讨了深度学习在加速MRI重建中的应用，特别是在关节造影牵引下的MRI图像重建中出现的假阳性软骨剥离问题	本文首次报道了深度学习重建加速MRI数据时可能出现的假阳性软骨剥离和软骨缺陷	本文仅展示了一个病例，未来需要对这种新技术进行更全面的测试，特别是训练数据选择带来的系统偏差	研究深度学习在加速MRI重建中的应用及其潜在问题	右髋关节的MRI图像	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	1名30岁健康男性患者	NA	NA	NA	NA
398	2024-09-13	Preface to the special issue of Food and Chemical Toxicology on "New approach methodologies and machine learning in food safety and chemical risk assessment: Development of reproducible, open-source, and user-friendly tools for exposure, toxicokinetic, and toxicity assessments in the 21st century" 2024-Aug, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association IF:3.9Q1 DOI:10.1016/j.fct.2024.114809 PMID:38857761	评论	本特刊包含关于毒理学和风险评估领域中各种新方法学（NAMs）应用的文章	介绍了多种新方法学（NAMs），包括高通量筛选、定量结构-活性关系（QSAR）建模、生理药代动力学（PBPK）建模、网络毒理学分析、分子对接模拟、组学、机器学习、深度学习和“模板与锚点”多尺度计算建模	NA	探讨新方法学和机器学习在食品安全和化学风险评估中的应用	新方法学（NAMs）在毒理学和风险评估中的应用	毒理学	NA	高通量筛选、定量结构-活性关系（QSAR）建模、生理药代动力学（PBPK）建模、网络毒理学分析、分子对接模拟、组学、机器学习、深度学习	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
399	2024-09-13	Automated shape-independent assessment of the spatial distribution of proton density fat fraction in vertebral bone marrow 2024-Aug, Zeitschrift fur medizinische Physik IF:2.4Q2 DOI:10.1016/j.zemedi.2022.12.004 PMID:36725478	研究论文	提出了一种自动标准化评估椎体骨髓体积和质子密度脂肪分数（PDFF）空间分布的方法	基于深度学习图像分割，将单个椎体的骨髓PDFF映射到圆柱模板并校正其相对于水平面的倾斜，实现了形状无关的空间PDFF分布特征化	仅在60名健康个体中进行了测试，未涉及疾病状态或干预效果的评估	开发一种自动方法，用于标准化评估椎体骨髓的体积和PDFF的空间分布	椎体骨髓的体积和质子密度脂肪分数（PDFF）的空间分布	计算机视觉	NA	深度学习图像分割	NA	图像	60名健康个体（30名男性，30名女性）	NA	NA	NA	NA
400	2024-09-11	Hybrid ensemble - deep transfer model for early cassava leaf disease classification 2024-Aug-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36097 PMID:39247275	研究论文	本文提出了一种基于混合集成-深度迁移模型的方法，用于早期木薯叶病害的分类	开发了三种新的混合模型，并展示了高准确率的结果	NA	提高木薯叶病害早期检测的准确性	木薯叶病害	计算机视觉	NA	深度学习	混合集成模型	图像	NA	NA	NA	NA	NA