深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
741	2024-08-17	Precise and efficient measurement of tibial slope on magnetic resonance imaging (MRI): two novel autonomous pipelines by traditional and deep learning algorithms 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-23-1799 PMID:39144010	研究论文	本文提出两种新的自主测量后胫骨斜坡（PTS）的管道，分别基于传统算法和深度学习算法，以提高测量效率和准确性	首次提出基于传统算法和深度学习算法的自主测量PTS的管道，显著提高了测量效率和准确性	NA	提高后胫骨斜坡（PTS）测量的效率和准确性，以辅助前交叉韧带（ACL）损伤的筛查和预防及改善膝关节手术的成功率	后胫骨斜坡（PTS）的测量	计算机视觉	NA	磁共振成像（MRI）	传统算法和深度学习模型	图像	20名患者的MRI图像
742	2024-08-17	Deep learning-based quantitative morphological study of anteroposterior digital radiographs of the lumbar spine 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-22-540 PMID:39144021	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的模型，用于自动量化测量腰椎前后位数字X光片的形态学参数，并评估其性能	本研究首次使用深度学习模型自动量化测量腰椎的形态学参数，提高了测量效率	模型在L5椎体和L4-L5椎间盘高度的测量上表现不如其他参数，存在一定的局限性	开发一种自动量化测量腰椎形态学参数的深度学习模型，并评估其性能	腰椎的形态学参数，包括L1至L5椎体高度和L1-L2至L4-L5椎间盘高度	计算机视觉	腰椎疾病	深度学习	深度学习模型	图像	1368张腰椎前后位数字X光片
743	2024-08-17	Deep learning models for rapid discrimination of high-grade gliomas from solitary brain metastases using multi-plane T1-weighted contrast-enhanced (T1CE) images 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-380 PMID:39144024	研究论文	本研究开发了使用术前T1加权对比增强（T1CE）MRI图像区分高级别胶质瘤（HGG）和孤立性脑转移瘤（SBM）的深度学习模型	GoogLeNet模型在区分HGG和SBM方面表现优于以往方法，即使在肿瘤核心和瘤周水肿区域也能有效区分	NA	开发一种能够在术前通过MRI图像快速区分高级别胶质瘤和孤立性脑转移瘤的深度学习模型	高级别胶质瘤（HGG）和孤立性脑转移瘤（SBM）	计算机视觉	脑肿瘤	深度学习	GoogLeNet	图像	180名患者的多平面T1CE切片（轴向、冠状和矢状），以及29名患者的外部测试集
744	2024-08-17	Repeatability and reproducibility of deep learning features for lung adenocarcinoma subtypes with nodules less than 10 mm in size: a multicenter thin-slice computed tomography phantom and clinical validation study 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-77 PMID:39144035	研究论文	本研究评估了深度学习特征（DLFs）在区分小于10毫米的磨玻璃结节（GGNs）肺腺癌亚型中的重复性和可重复性，并进行了多中心薄层CT模拟和临床验证。	本研究首次在多中心环境中评估了DLFs的稳定性和诊断效能，并发现某些DLFs在不同制造商和扫描方案下仍表现出优异的稳定性。	不同制造商和扫描方案影响了DLFs的可重复性。	评估深度学习特征（DLFs）在区分小于10毫米的磨玻璃结节（GGNs）肺腺癌亚型中的重复性和可重复性。	小于10毫米的磨玻璃结节（GGNs）肺腺癌亚型。	计算机视觉	肺腺癌	薄层CT扫描	深度学习	图像	275名患者中的405个结节
745	2024-08-17	Deep learning-based detection of primary bone tumors around the knee joint on radiographs: a multicenter study 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-23-1743 PMID:39144039	研究论文	本研究旨在开发一种基于深度学习（DL）的模型，用于在膝关节周围骨骼X光片上检测原发性骨肿瘤	该深度学习模型在检测膝关节周围原发性骨肿瘤方面表现优于初级放射科医生	NA	开发和验证一种深度学习模型，用于在X光片上检测膝关节周围的原发性骨肿瘤	687名被诊断为骨肿瘤的患者和1988名正常骨骼X光片的参与者	机器学习	骨肿瘤	深度学习	DL	图像	687名骨肿瘤患者和1988名正常骨骼X光片的参与者
746	2024-08-17	DLCNBC-SA: a model for assessing axillary lymph node metastasis status in early breast cancer patients 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-257 PMID:39144041	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的模型DLCNBC-SA，用于早期乳腺癌患者腋窝淋巴结转移状态的评估	该模型集成了自注意力机制，能够从核心针活检和临床数据中提取特征，提高分析和增强特征的独立性	NA	利用深度学习技术改进医学图像分析，提高临床诊断效率和准确性	早期乳腺癌患者腋窝淋巴结转移状态	机器学习	乳腺癌	深度学习	CNN	图像	使用公开数据集进行实验验证
747	2024-08-17	A mutual reconstruction network model for few-shot classification of histological images: addressing interclass similarity and intraclass diversity 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-253 PMID:39144045	研究论文	本文提出了一种互重建网络模型，用于解决组织学图像少样本分类中的类间相似性和类内多样性问题	引入特征增强模块和互重建模块，增强类间差异并减少类内方差，提高了少样本分类性能	NA	克服深度学习在组织学图像分类中数据稀缺的挑战	组织学图像的自动分类	计算机视觉	癌症	深度学习	互重建网络模型	图像	使用了一个专门创建的少样本组织学图像数据集进行评估
748	2024-08-17	Artificial intelligence improves the diagnosis of human leukocyte antigen (HLA)-B27-negative axial spondyloarthritis based on multi-sequence magnetic resonance imaging and clinical features 2024-Aug-01, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-729 PMID:39144059	研究论文	本研究开发了一种名为NegSpA-AI的人工智能工具，利用骶髂关节磁共振成像和临床特征来提高HLA-B27阴性轴向脊柱关节炎的诊断	通过深度学习网络开发的NegSpA-AI工具，能够有效区分轴向脊柱关节炎和非轴向脊柱关节炎，其性能优于独立工作的初级风湿病学家	NA	开发一种人工智能工具，以提高HLA-B27阴性轴向脊柱关节炎的诊断准确性	HLA-B27阴性轴向脊柱关节炎患者	机器学习	风湿病	磁共振成像	深度学习网络	图像	共包括454名HLA-B27阴性患者，分为训练集（328名）、内部测试集（72名）和独立外部测试集（54名），以及进一步招募的87名患者用于构建前瞻性测试集
749	2024-08-17	Study of active food processing technology using computer vision and AI in coffee roasting 2024-Aug, Food science and biotechnology IF:2.4Q3 DOI:10.1007/s10068-023-01507-7 PMID:39144198	研究论文	本研究利用计算机视觉和人工智能技术，开发了一种咖啡豆分类模型（CBCM），用于咖啡烘焙过程中的质量控制和优化	本研究创新性地结合了计算机视觉和深度学习技术，实现了在复杂环境下的咖啡豆分类，并能准确区分咖啡豆，避免障碍和空隙	NA	研究目的是开发一种集成计算机视觉和深度学习技术的解决方案，以实现食品加工过程中的质量控制和优化	研究对象是咖啡烘焙过程中的咖啡豆	计算机视觉	NA	深度学习	机器学习模型	图像	137个样本
750	2024-08-17	Revolutionizing early Alzheimer's disease and mild cognitive impairment diagnosis: a deep learning MRI meta-analysis 2024-Aug, Arquivos de neuro-psiquiatria IF:1.0Q4 DOI:10.1055/s-0044-1788657 PMID:39146974	meta-analysis	本文通过meta分析评估了深度学习在磁共振成像（MRI）诊断阿尔茨海默病（AD）和轻度认知障碍（MCI）中的准确性	将深度学习与人工智能（AI）结合到磁共振成像（MRI）分析中，提供了一种无偏见且高度准确的诊断方法	NA	旨在分析深度学习在MRI图像上对AD和MCI模型的诊断准确性	阿尔茨海默病（AD）和轻度认知障碍（MCI）的诊断	machine learning	geriatric disease	MRI	deep learning	image	共识别出18项符合条件的研究
751	2024-08-16	A supervised graph-based deep learning algorithm to detect and quantify clustered particles 2024-Aug-15, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d4nr01944j PMID:39082742	研究论文	本文介绍了一种基于图神经网络的深度学习算法，用于检测和量化粒子聚集	首次应用图神经网络方法分析粒子聚集，具有潜在应用价值	NA	开发一种无需人工干预的算法，用于检测和量化动态粒子聚集	膜嵌入蛋白的拓扑结构	机器学习	NA	图神经网络（GNNs）	图神经网络（GNNs）	模拟数据和荧光显微镜实验数据	未具体说明
752	2024-08-16	AD-NEv: A Scalable Multilevel Neuroevolution Framework for Multivariate Anomaly Detection 2024-Aug-14, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3439404 PMID:39141460	研究论文	本文提出了一种可扩展的多级神经进化框架AD-NEv，用于多元时间序列异常检测	该框架能够协同优化特征子空间、单个异常检测模型的架构以及网络权重的非梯度微调	NA	旨在解决现有异常检测方法在模型优化方面的不足，提高检测效率和性能	多元时间序列异常检测	机器学习	NA	神经进化	神经网络	时间序列	使用了广泛采用的多元异常检测基准数据集
753	2024-08-16	Automatic Design of Deep Graph Neural Networks With Decoupled Mode 2024-Aug-14, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3438609 PMID:39141457	研究论文	本文提出了一种新的神经架构搜索（NAS）方法，用于自动设计深度图神经网络（GNNs），并探索其在各种节点分类任务中的应用潜力	创新点在于重新设计了深度GNNs的搜索空间，采用基于传播和转换过程的解耦模式，并将问题形式化为多目标优化，以平衡准确性和计算效率	NA	设计深度图神经网络以解决节点分类任务中的挑战，如过度平滑和信息压缩	图神经网络的架构设计及其在节点分类任务中的应用	机器学习	NA	神经架构搜索（NAS）	图神经网络（GNNs）	图数据	NA
754	2024-08-16	Domain-interactive Contrastive Learning and Prototype-guided Self-training for Cross-domain Polyp Segmentation 2024-Aug-14, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2024.3443262 PMID:39141465	研究论文	本文提出了一种新的域交互对比学习和原型引导自训练框架（DCL-PS），用于跨域息肉分割	引入域交互对比学习（DCL）和原型引导自训练（PS）策略，以减少域间差异并提高伪标签质量	未提及具体限制	提高在未见目标域数据集上的息肉分割性能	跨域息肉分割	计算机视觉	结直肠癌	对比学习	CNN	图像	未提及具体样本数量
755	2024-08-16	Learnable digital signal processing: a new benchmark of linearity compensation for optical fiber communications 2024-Aug-13, Light, science & applications DOI:10.1038/s41377-024-01556-5 PMID:39134543	研究论文	本文提出了一种基于可学习视角的数字信号处理（DSP）新设计思路，称为可学习DSP（LDSP），旨在提高光纤通信中的线性和非线性补偿性能	LDSP将传统DSP模块视为深度学习框架，通过全局尺度的反向传播算法自适应优化DSP参数，显著提升了400Gb/s信号在1600km光纤传输后的Q因子	NA	开发一种高效且低复杂度的数字信号处理方案，以提升下一代光纤传输的性能	光纤通信中的数字信号处理技术	光纤通信	NA	数字信号处理（DSP）	深度学习框架	信号	400Gb/s信号在1600km光纤传输
756	2024-08-16	Computational analysis of pathogen-host interactome for fast and low-risk in-silico drug repurposing in emerging viral threats like Mpox 2024-08-12, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69617-8 PMID:39134619	研究论文	本研究开发了一种计算方法，用于预测猴痘病毒（MPXV）感染期间的蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs），并探索现有FDA药物的再利用潜力	本研究采用了包含2-5节点图谱属性和基于蛋白质组成的特征的集成特征，用于深度学习模型预测PPIs，并结合分子动力学模拟进行验证	NA	旨在发现潜在的药物靶点和再利用现有FDA药物用于治疗猴痘病毒感染	猴痘病毒（MPXV）与人类蛋白质的相互作用	生物信息学	猴痘	深度学习（DL）	NA	蛋白质-蛋白质相互作用数据	NA
757	2024-08-16	Enhancing recognition and interpretation of functional phenotypic sequences through fine-tuning pre-trained genomic models 2024-Aug-12, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05567-z PMID:39135093	研究论文	本研究通过微调预训练的基因组模型，探索了深度学习在解释和表示人类基因组序列中的应用	本研究结合预训练基因组模型与经典方法分析基因组序列功能，促进了基因组学与人工智能的交叉融合	NA	旨在通过计算和实验方法解码人类基因组序列的功能性	人类基因组序列及其功能性	机器学习	NA	深度学习	DNA_bert_6 和 human_gpt2-v1	基因型-表型数据集	多个基因型-表型数据集，特别是HERV数据集
758	2024-08-16	Effective descriptor extraction strategies for correspondence matching in coronary angiography images 2024-08-11, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69153-5 PMID:39128936	研究论文	本研究针对冠状动脉造影图像中的对应匹配问题，提出了一种基于深度学习的图像匹配方法	改进了点检测器的结构并重新设计了损失函数，引入了多头描述符结构，提高了约6%的性能	NA	旨在填补冠状动脉造影图像匹配领域的研究空白，并提供一个改进的基准	冠状动脉造影图像	数字病理学	心血管疾病	深度学习	CNN	图像	NA
759	2024-08-16	Revealing the graded activation mechanism of neurotensin receptor 1 2024-Aug-05, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.134488 PMID:39111461	研究论文	本研究通过10微秒的增强采样模拟，结合重加权平均力势（PMF）、深度学习（DL）和转移熵（TE）的综合分析，揭示了神经降压素受体1（NTSR1）对完全激动剂SRI-9829、部分激动剂RTI-3a和反向激动剂SR48692的结合动力学差异及其分级激活机制。	本研究首次通过深度学习模型有效识别了贡献于分级激活的关键微开关，并利用转移熵计算可视化了受体内的变构通信网络，阐明了与信号转导相关的驱动-响应关系。	NA	揭示神经降压素受体1的分级激活机制，并为基于结构的药物设计提供启示。	神经降压素受体1（NTSR1）及其对不同激动剂的响应。	生物信息学	NA	增强采样模拟	深度学习（DL）	分子结构数据	10微秒的模拟数据
760	2024-08-16	Using Deep Learning Techniques as an Attempt to Create the Most Cost-Effective Screening Tool for Cognitive Decline 2024-Aug, Psychiatry investigation IF:1.8Q3 DOI:10.30773/pi.2024.0157 PMID:39086161	研究论文	本研究利用深度学习技术开发一种成本效益高且易于访问的筛查工具，以提高认知衰退（阿尔茨海默病的前兆）的检测	本研究展示了深度学习在改善阿尔茨海默病诊断方面的潜力，表明广泛的认知评估可能比传统方法提供更准确的诊断	本研究为未来更广泛的研究奠定了基础，需要进一步的研究来证实这种方法并进一步完善筛查工具	开发一种成本效益高且易于访问的筛查工具，以提高认知衰退的检测	2,863名有主观认知抱怨并接受全面神经心理学评估的受试者	机器学习	阿尔茨海默病	深度学习	随机森林分类器	神经心理学测试数据	2,863名受试者