深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
781	2024-08-15	Deep learning reconstruction for coronary CT angiography in patients with origin anomaly, stent or bypass graft 2024-Aug, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-024-01846-3 PMID:39023665	研究论文	开发并验证了一种深度学习模型，用于自动重建冠状动脉CT血管造影（CCTA），特别是在有起源异常、支架或旁路移植的患者中。	该深度学习模型能够准确自动重建CCTA，显著减少了后处理时间并改善了临床工作流程。	NA	开发和验证一种深度学习模型，用于自动重建冠状动脉CT血管造影。	冠状动脉CT血管造影（CCTA）在有起源异常、支架或旁路移植的患者中的自动重建。	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	深度学习模型	图像	训练集包含6063名患者，验证集包含1962名患者，外部测试集包含812名患者。
782	2024-08-15	Attention 3D U-NET for dose distribution prediction of high-dose-rate brachytherapy of cervical cancer: Direction modulated brachytherapy tandem applicator 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17238 PMID:38830129	研究论文	本文开发了一种基于注意力机制的3D U-NET模型，用于预测宫颈癌高剂量率近距离治疗中方向调制近距离治疗（DMBT）的剂量分布。	引入了注意力门控机制的3D U-NET模型，提高了剂量预测的准确性，并能在近实时应用中快速预测剂量分布。	NA	开发一种高效的深度学习模型，用于宫颈癌高剂量率近距离治疗的剂量预测。	宫颈癌患者的剂量分布预测。	计算机视觉	宫颈癌	深度学习	3D U-NET	图像	122例回顾性临床高剂量率近距离治疗计划
783	2024-08-15	Deep learning-based magnetic resonance imaging analysis for chronic cerebral hypoperfusion risk 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17237 PMID:38820428	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的磁共振成像分析方法，用于提高慢性脑低灌注（CCH）的诊断准确性	提出了CCH-Network（CCHNet），一种结合卷积和Transformer模块的端到端深度学习模型，以及一种新颖的对抗训练方法，以提高特征知识捕获能力	NA	提高慢性脑低灌注（CCH）的诊断准确性	慢性脑低灌注（CCH）的诊断	机器学习	NA	磁共振成像（MRI）	CNN, Transformer	图像	训练和测试集共204例，验证集108例
784	2024-08-15	Liver fibrosis automatic diagnosis utilizing dense-fusion attention contrastive learning network 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17130 PMID:38753547	研究论文	本文提出了一种基于密集融合注意力对比学习网络的肝纤维化自动诊断方法	开发了一种自定义的多视角对比学习网络，用于自动分类多参数DWI图像并探索不同DWI参数之间的协同作用	在有限样本的数据集中识别有效的DWI参数并挖掘潜在特征仍是一个挑战	开发一种新的深度学习模型，用于自动识别和分类多参数DWI图像，以辅助肝纤维化的诊断	肝纤维化及其相关DWI参数	计算机视觉	肝病	扩散加权成像(DWI)	密集融合注意力对比学习网络(DACLN)	图像	使用了一组真实的临床数据进行模型评估
785	2024-08-15	Swin MoCo: Improving parotid gland MRI segmentation using contrastive learning 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17128 PMID:38749016	研究论文	本文提出了一种基于对比学习的Swin MoCo网络，用于改善腮腺MRI图像的分割效果	使用Swin Transformer作为骨干网络，并通过迁移学习初始化权重，提高了对小规模医学图像数据集的训练效果	NA	旨在通过对比学习方法改善腮腺肿瘤MRI图像的分割	腮腺及其肿瘤的MRI图像分割	计算机视觉	腮腺肿瘤	对比学习	Swin Transformer	图像	NA
786	2024-08-15	Deep learning enhancing guide RNA design for CRISPR/Cas12a-based diagnostics 2024-Aug, iMeta IF:23.7Q1 DOI:10.1002/imt2.214 PMID:39135699	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的增强型crRNA设计系统EasyDesign，用于Cas12a介导的诊断	该系统采用优化的卷积神经网络（CNN）预测模型，训练于包含11,496个实验验证的Cas12a检测案例的综合数据集，实现了0.812的Spearman相关系数，并在未训练数据中的四种病原体上展示了优越的预测性能	NA	提高患者治疗效果和抗击传染病，通过改进CRISPR/Cas12a系统的crRNA设计	Cas12a-based检测系统的crRNA设计	机器学习	NA	CRISPR/Cas12a	CNN	实验数据	11,496个实验验证的Cas12a检测案例
787	2024-08-15	Two-stage adversarial learning based unsupervised domain adaptation for retinal OCT segmentation 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17012 PMID:38426594	研究论文	本文提出了一种基于两阶段对抗学习网络（TSANet）的无监督跨域光学相干断层扫描（OCT）图像分割方法	采用傅里叶变换减少图像风格差异，并通过对抗学习网络和伪标签精调段器，提高了跨域泛化能力	NA	解决OCT图像因设备或成像协议不同导致的域偏移问题	OCT图像的跨域分割	计算机视觉	NA	对抗学习	TSANet	图像	用于脉络膜分割的模型在源域训练400张图像，验证100张图像，目标域I训练1320张未标记图像，测试330张图像，目标域II训练400张未标记图像，测试200张图像；用于视网膜劈裂分割的模型在源域训练1284张图像，验证312张图像，目标域训练1024张未标记图像，测试200张图像
788	2024-08-15	Pan-cancer image segmentation based on feature pyramids and Mask R-CNN framework 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17014 PMID:38436455	研究论文	本文提出了一种基于特征金字塔和Mask R-CNN框架的泛癌图像分割方法	采用特征金字塔处理数据集以实现目标分割中的多尺度协作	在分割任务中，大对象和小对象之间的效率存在差异，且对个别尺寸对象的分割效果有限	提高癌症图像分割的平均精度指数	Pan-Cancer Histology Dataset for Nuclei Instance Segmentation and Classification (PanNuke)数据集中的约7500张病理图像	计算机视觉	NA	Mask R-CNN	CNN	图像	约7500张病理图像，包含19种不同类型的组织和五种分类的细胞
789	2024-08-15	Quantitative measurement of the ureter on three-dimensional magnetic resonance urography images using deep learning 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17025 PMID:38477634	研究论文	本文利用深度学习模型在三维磁共振尿路造影图像上对输尿管进行定量测量	开发了一种全面的自动化工具，用于在磁共振图像中精确分割和测量输尿管	NA	旨在通过深度学习模型对三维磁共振尿路造影图像上的输尿管进行定量测量	输尿管的直径测量	数字病理学	泌尿系统疾病	深度学习	3D V-Net	图像	445个三维磁共振尿路造影扫描（443名患者，52 ± 18岁；217名女性患者）用于训练和验证，50个扫描（50名患者，55 ± 21岁；30名女性患者）用于外部测试
790	2024-08-15	Hepatic and portal vein segmentation with dual-stream deep neural network 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17090 PMID:38648676	研究论文	本文提出了一种双流深度神经网络结构，用于在CT图像上自动分割肝静脉和门静脉	本文创新性地结合了卷积和Transformer块的双流编码器结构，以及基于扩张卷积的多尺度特征融合块和多级融合注意力模块，有效提取肝静脉和门静脉的解剖信息，避免邻近外周血管的误分类	NA	开发一种全自动且鲁棒的语义分割算法，用于肝静脉和门静脉的分割，以指导后续的术前规划	肝静脉和门静脉的自动分割	计算机视觉	NA	CT	CNN, Transformer	图像	两个数据集，每个数据集随机选择50个病例进行模型评估
791	2024-08-15	Fast SPECT/CT planar bone imaging enabled by deep learning enhancement 2024-Aug, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17094 PMID:38652084	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的方法，用于从快速扫描中生成高质量的全身体骨图像	引入了基于Residual-in-Residual Dense Block (RRDB)的内容-注意力图像恢复方法，有效恢复高质量图像并减少噪声	NA	加速全身体骨扫描并提高图像质量	全身体骨扫描图像	计算机视觉	NA	深度学习	Residual-in-Residual Dense Block (RRDB)	图像	76例
792	2024-08-14	Deep Learning with Pretrained Framework Unleashes the Power of Satellite-Based Global Fine-Mode Aerosol Retrieval 2024-Aug-13, Environmental science & technology IF:10.8Q1 DOI:10.1021/acs.est.4c02701 PMID:39096297	研究论文	提出一种预训练深度学习框架，用于从卫星数据中提取细模态气溶胶光学厚度（fAOD）信息，以提高气候研究的准确性	该框架能够从每个卫星像素中提取潜在信息，生成新的特征，提高无实地数据区域的检索精度，并减少了全球趋势的过高估计	NA	提高细模态气溶胶光学厚度（fAOD）的检索准确性，改善气候研究	细模态气溶胶光学厚度（fAOD）及其在全球气候变化中的作用	机器学习	NA	深度学习	深度学习框架	卫星数据	2001年至2020年的全球fAOD数据
793	2024-08-14	Rational Design of Deep Learning Networks Based on a Fusion Strategy for Improved Material Property Predictions 2024-Aug-13, Journal of chemical theory and computation IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jctc.4c00187 PMID:39020520	研究论文	本文通过引入化学环境聚类向量（CECV）反馈方法，设计了一种融合长短期记忆网络和门控循环单元与深度卷积神经网络（L-G-DCNN）的深度学习模型，用于改进材料性质预测	开发了基于物理洞察的化学环境聚类向量（CECV）反馈方法，并设计了L-G-DCNN模型，该模型在28个基准数据集上超越了现有最先进的结构不可知模型	NA	改进材料科学中深度学习模型的设计，提高材料性质预测的准确性和效率	材料性质预测的深度学习模型设计	机器学习	NA	深度学习	L-G-DCNN	数据集	28个基准数据集
794	2024-08-14	Deep learning models for separate segmentations of intracerebral and intraventricular hemorrhage on head CT and segmentation quality assessment 2024-Aug-12, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17343 PMID:39133935	研究论文	本研究开发了一种用于脑内出血（ICH）和脑室内出血（IVH）分割的深度学习模型REUnet，并进行了外部验证和分割质量评估	提出的REUnet模型在ICH和IVH分割中表现优于其他模型，并首次提供了IVH分割质量评估方法	NA	开发一种稳健的深度学习模型，用于ICH和IVH的分割，并提供IVH分割质量评估	脑内出血（ICH）和脑室内出血（IVH）的分割	计算机视觉	脑血管疾病	深度学习	REUnet	CT图像	训练和内部验证使用977张CT图像，外部测试使用375张CT图像
795	2024-08-14	The impact of introducing deep learning based [18F]FDG PET denoising on EORTC and PERCIST therapeutic response assessments in digital PET/CT 2024-Aug-10, EJNMMI research IF:3.1Q1 DOI:10.1186/s13550-024-01128-z PMID:39126532	研究论文	本文评估了基于深度学习的[18F]FDG PET去噪技术SubtlePET™对EORTC和PERCIST治疗反应评估的临床影响。	使用深度学习AI技术对[18F]FDG PET图像进行去噪，并评估其对治疗反应评估的影响。	研究仅涉及110名患者，且仅评估了两种PET图像比较方法的临床满意度。	评估基于深度学习的[18F]FDG PET去噪技术在肿瘤治疗反应评估中的临床应用。	110名接受标准数字[18F]FDG PET/CT检查的患者。	数字病理学	肿瘤	深度学习	NA	图像	110名患者
796	2024-08-14	Evaluation of deep learning for predicting rice traits using structural and single-nucleotide genomic variants 2024-Aug-10, Plant methods IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s13007-024-01250-y PMID:39127715	研究论文	研究使用深度学习方法结合结构和单核苷酸基因组变异来预测水稻性状	首次探讨了深度学习网络在使用结构基因组变异和单核苷酸多态性作为遗传标记时的性能	研究主要集中在水稻上，可能需要进一步验证在其他作物中的适用性	探索结合结构基因组变异和单核苷酸多态性是否能提高水稻性状预测的准确性，并比较深度学习网络与贝叶斯线性模型的性能	水稻的性状预测	机器学习	NA	深度学习	多层感知器和卷积神经网络	基因组变异数据	涉及87%的复杂性状案例和75%的研究案例
797	2024-08-14	Two-stage deep neural network for diagnosing fungal keratitis via in vivo confocal microscopy images 2024-08-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-68768-y PMID:39117709	研究论文	本文提出了一种基于活体共聚焦显微镜图像的深度学习框架，用于诊断真菌性角膜炎，辅助眼科医生进行诊断	本研究采用了两阶段深度神经网络架构，结合图像级和序列级信息进行诊断预测，并收集了迄今为止最大的96,632张活体共聚焦显微镜图像数据集	NA	开发一种辅助眼科医生诊断真菌性角膜炎的深度学习框架	真菌性角膜炎的诊断	计算机视觉	眼科疾病	活体共聚焦显微镜(IVCM)	深度神经网络	图像	96,632张活体共聚焦显微镜图像
798	2024-08-14	A deep learning model for anti-inflammatory peptides identification based on deep variational autoencoder and contrastive learning 2024-08-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69419-y PMID:39117712	研究论文	本研究提出了一种基于变分自编码器和对比学习的深度学习模型DAC-AIPs，用于准确识别抗炎肽	采用多热编码捕获更丰富的序列信息，并通过变分推理增强潜在特征的表示能力，引入对比学习提高模型的分类能力	NA	开发更先进的计算模型用于识别抗炎肽	抗炎肽的识别	机器学习	NA	变分自编码器，对比学习	CNN	序列	未具体说明
799	2024-08-14	Deep learning-based automated angle measurement for flatfoot diagnosis in weight-bearing lateral radiographs 2024-08-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69549-3 PMID:39117787	研究论文	本研究旨在开发和评估一种基于深度学习的系统，用于在负重侧位足部X光片中自动测量角度（特别是Meary角和跟骨倾斜角），以诊断扁平足	本研究开发了一种基于深度学习的自动角度测量系统，用于扁平足诊断，该系统在所有测试案例中与临床专家评估的结果高度一致	研究排除了接受过全踝关节置换手术或踝关节融合手术的患者，可能影响结果的普遍性	开发和评估基于深度学习的自动角度测量系统，用于扁平足诊断	负重侧位足部X光片中的Meary角和跟骨倾斜角	机器学习	NA	深度学习	NA	图像	3960张侧位X光片，来自4000名患者
800	2024-08-14	Examining the challenges of blood pressure estimation via photoplethysmogram 2024-08-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-68862-1 PMID:39112533	研究论文	本文分析了使用光电容积脉搏波（PPG）预测血压的任务，并提出了一套工具来评估PPG信号是否是血压的良好预测指标	提出了新的工具来评估PPG信号与血压之间的关联性，并提供了对现有研究中数据泄露和不切实际约束的批判性分析	文章指出，使用PPG预测血压存在高多值映射因子和低互信息的问题，表明这一方法的预测能力有限	研究使用PPG信号预测血压的可行性和准确性	PPG信号和血压之间的关系	生物医学工程	心血管疾病	深度学习	NA	传感器数据	具体样本数量未在摘要中提及