深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
181	2024-12-01	MCMVDRP: a multi-channel multi-view deep learning framework for cancer drug response prediction 2024-Sep-01, Journal of integrative bioinformatics IF:1.5Q3 DOI:10.1515/jib-2024-0026 PMID:39238451	研究论文	本文提出了一种多通道多视角深度学习框架MCMVDRP，用于癌症药物反应预测	本文创新性地结合了三种不同类型的药物特征：分子图、SMILES字符串和分子指纹，以提高药物反应预测的准确性	NA	预测癌症患者对药物的反应	癌症药物反应	机器学习	NA	深度学习	MCMVDRP	分子图、SMILES字符串、分子指纹	NA
182	2024-11-29	Cortical and subcortical structural changes in pediatric patients with infratentorial tumors 2024-09-09, Diagnostic and interventional radiology (Ankara, Turkey) DOI:10.4274/dir.2024.242652 PMID:38836466	研究论文	本研究旨在检测后颅窝肿瘤患儿大脑皮层和皮层下结构的形态学变化	利用深度学习算法生成合成磁化准备快速梯度回波图像，并自动计算皮层厚度和局部脑回指数等参数	样本量相对较小，且仅包括后颅窝肿瘤患儿，可能限制了结果的普适性	研究后颅窝肿瘤对儿童大脑皮层和皮层下结构形态学的影响	后颅窝肿瘤患儿和健康对照组的大脑皮层和皮层下结构	NA	NA	深度学习算法	NA	图像	24名后颅窝肿瘤患儿和41名年龄性别匹配的健康对照组
183	2024-11-29	Application of deep learning and radiomics in the prediction of hematoma expansion in intracerebral hemorrhage: a fully automated hybrid approach 2024-09-09, Diagnostic and interventional radiology (Ankara, Turkey) DOI:10.4274/dir.2024.222088 PMID:38654561	研究论文	本文开发了一种全自动混合方法，利用深度学习和放射组学预测脑出血中的血肿扩大	本文首次将深度学习和放射组学结合，开发了一种全自动混合模型，用于预测脑出血中的血肿扩大	本文未详细讨论模型的泛化能力和在不同数据集上的表现	开发一种全自动混合方法，用于预测脑出血中的血肿扩大	脑出血患者的血肿扩大	计算机视觉	脑血管疾病	深度学习	卷积神经网络（CNN）	图像	未明确提及样本数量
184	2024-11-27	Three-Dimensional Dense Reconstruction: A Review of Algorithms and Datasets 2024-Sep-10, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s24185861 PMID:39338606	综述	本文综述了三维密集重建的算法和数据集	讨论了深度学习方法在三维密集重建中的应用	动态或复杂环境下的三维重建仍是一个未解决的挑战	全面概述经典的三维密集重建技术及其在深度学习中的应用	三维密集重建算法和数据集	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA
185	2024-11-26	Deep learning prediction of survival in patients with heart failure using chest radiographs 2024-Sep, The international journal of cardiovascular imaging DOI:10.1007/s10554-024-03177-w PMID:38969836	研究论文	本研究开发并验证了一种使用胸部X光片进行深度学习生存预测模型，用于预测心力衰竭患者的生存率	本研究首次使用深度学习模型结合胸部X光片和临床参数，显著提高了心力衰竭患者生存预测的准确性	本研究样本量较小，且仅限于特定时间段和机构的患者数据	开发和验证一种基于胸部X光片的深度学习生存预测模型，用于心力衰竭患者的生存预测	心力衰竭患者及其胸部X光片	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	深度学习模型	图像	353名心力衰竭患者
186	2024-11-26	USE OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN THE DIAGNOSIS AND TREATMENT OF ORTHOPEDIC DISEASES: LITERATURE REVIEW 2024-Sep, Georgian medical news PMID:39580822	综述	本文综述了人工智能技术在骨科疾病诊断和治疗中的应用	本文总结了人工智能在骨科疾病诊断和治疗中的有效性	NA	综述和分析人工智能在肌肉骨骼系统疾病诊断和治疗中的应用	骨科疾病的诊断和治疗	机器学习	NA	机器学习、深度学习、虚拟现实	神经网络	图像	348篇出版物，其中201篇可公开获取
187	2024-11-24	RiceSNP-BST: a deep learning framework for predicting biotic stress-associated SNPs in rice 2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae599 PMID:39562160	研究论文	本文介绍了一种名为RiceSNP-BST的深度学习框架，用于预测水稻中与生物胁迫相关的单核苷酸多态性（SNPs）	该框架通过整合多维特征，成功创新了数据集，提供了比现有最先进方法更高的精度，并在独立测试集和跨物种数据集上表现良好	NA	开发一种能够准确和快速识别水稻基因组中与生物胁迫相关的SNPs的深度学习框架	水稻基因组中与生物胁迫相关的SNPs	机器学习	NA	深度学习	卷积神经网络	DNA序列	NA
188	2024-11-23	PENTAGON: Physics-enhanced neural network for volumetric flame chemiluminescence tomography 2024-Sep-09, Optics express IF:3.2Q2 DOI:10.1364/OE.536550 PMID:39572993	研究论文	本文提出了一种物理增强的神经网络PENTAGON，用于体积火焰化学发光断层成像	通过结合数据先验和正向成像模型，PENTAGON能够准确预测3D光学场，即使在投影视图减少到三个的情况下也能克服数据驱动深度学习方法的泛化限制	NA	开发一种新的神经网络框架，用于解决体积断层成像中的逆问题	火焰化学发光断层成像	计算机视觉	NA	神经网络	神经网络	光学场数据	NA
189	2024-11-23	Terahertz image enhancement based on a multiscale feature extraction network 2024-Sep-09, Optics express IF:3.2Q2 DOI:10.1364/OE.529260 PMID:39572999	研究论文	本文提出了一种基于多尺度特征提取网络的太赫兹图像增强方法	利用生成对抗网络结构进行深度学习，通过引入金字塔池化残差密集块模块进行特征融合提取，设计并应用了超分辨率网络	未提及	提高太赫兹图像的质量，包括去噪和分辨率提升	变形的金属太赫兹图像	计算机视觉	NA	生成对抗网络 (GAN)	超分辨率生成对抗网络 (SRGAN)	图像	未提及
190	2024-11-23	Speckle denoising based on Swin-UNet in digital holographic interferometry 2024-Sep-09, Optics express IF:3.2Q2 DOI:10.1364/OE.533142 PMID:39573047	研究论文	本文提出了一种基于Swin-UNet的数字全息干涉测量中的散斑去噪方法	通过将模拟的高斯噪声和散斑噪声进行多路复用，模拟了复杂的噪声环境，并提出了基于Swin-UNet的去噪方法	本文的实验主要基于模拟数据，实际应用中的效果需要进一步验证	解决数字全息干涉测量中散斑噪声对相位图质量的影响问题	数字全息干涉测量中的散斑噪声	计算机视觉	NA	数字全息干涉测量	Swin-UNet	图像	1100张开放源代码的全息断层扫描噪声图像和25张来自DATABASE的散斑图像
191	2024-11-23	Multi-level efficient 3D image reconstruction model based on ViT 2024-Sep-09, Optics express IF:3.2Q2 DOI:10.1364/OE.535211 PMID:39573080	研究论文	提出了一种基于视觉变换器（ViT）的多层次高效3D图像重建模型	利用ViT的自注意力机制捕捉全局和局部特征，并通过生成对抗网络（GAN）提高在高噪声和低光子环境下的重建质量和鲁棒性	NA	解决单光子激光雷达在高质量3D重建中面临的高噪声、低精度和长推理时间问题	单光子激光雷达的3D图像重建	计算机视觉	NA	视觉变换器（ViT）、生成对抗网络（GAN）	视觉变换器（ViT）、生成对抗网络（GAN）	图像	NA
192	2024-11-23	Interpreting forces as deep learning gradients improves quality of predicted protein structures 2024-09-03, Biophysical journal IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.bpj.2023.12.011 PMID:38104241	研究论文	本文提出了一种利用分子动力学力场训练深度学习蛋白质结构预测模型的新方法，以提高预测结构的质量和物理直观性	引入了一种名为OpenMM-Loss的自定义PyTorch损失函数，该函数表示预测结构的势能，并可应用于任何全原子蛋白质结构表示	NA	提高深度学习模型预测蛋白质结构的质量和物理直观性，使其更适合下游任务	蛋白质结构预测模型	机器学习	NA	分子动力学力场	深度学习模型	蛋白质结构	NA
193	2024-11-22	Deep learning automatic semantic segmentation of glioblastoma multiforme regions on multimodal magnetic resonance images 2024-Sep, International journal of computer assisted radiology and surgery IF:2.3Q2 DOI:10.1007/s11548-024-03205-z PMID:38849632	研究论文	本研究评估了深度学习算法在自动化分割多模态磁共振图像中胶质母细胞瘤区域的有效性	本研究采用了3D U-Net神经网络算法，并增加了残差块，以提高分割精度	本研究仅在BraTS2021数据集和PerProGlio队列中进行了验证，未来需要在更多数据集上进行验证	评估深度学习算法在自动化分割多模态磁共振图像中胶质母细胞瘤区域的有效性	胶质母细胞瘤的四个不同区域：增强肿瘤、瘤周水肿、非增强/坏死肿瘤和总肿瘤	计算机视觉	脑肿瘤	磁共振成像	3D U-Net	图像	训练集包含1251名患者的多模态磁共振图像，测试集包含50名胶质母细胞瘤患者
194	2024-11-20	Nmix: a hybrid deep learning model for precise prediction of 2'-O-methylation sites based on multi-feature fusion and ensemble learning 2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae601 PMID:39550226	研究论文	介绍了一种名为Nmix的混合深度学习模型，用于精确预测RNA的2'-O-甲基化位点	采用了多特征融合和集成学习方法，结合一维/二维卷积神经网络、自注意力机制和残差连接，显著提高了预测性能	NA	开发一种精确预测RNA 2'-O-甲基化位点的计算工具	人类RNA的2'-O-甲基化位点	机器学习	NA	深度学习	混合深度学习模型	RNA序列	包含实验验证的Nm位点的最大低冗余数据集
195	2024-11-20	A topological deep learning framework for neural spike decoding 2024-09-03, Biophysical journal IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.bpj.2024.01.025 PMID:38402607	研究论文	本文提出了一种拓扑深度学习框架，用于神经尖峰解码，结合了单纯复数发现和深度学习	引入了一种新的单纯卷积循环神经网络架构，能够捕捉高阶连接性，超越传统图模型的局限	NA	开发一种能够解码头部方向和动物位置的拓扑深度学习框架	头部方向细胞和网格细胞的神经活动	机器学习	NA	拓扑深度学习	单纯卷积循环神经网络	神经尖峰数据	头部方向和网格细胞数据集
196	2024-11-20	3dDNAscoreA: A scoring function for evaluation of DNA 3D structures 2024-09-03, Biophysical journal IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.bpj.2024.02.018 PMID:38409781	研究论文	本文介绍了一种名为3dDNAscoreA的评分函数，用于评估DNA三维结构	提出了基于深度学习模型ARES的评分函数3dDNAscoreA，用于评估DNA三维结构，并采用了新的训练策略	NA	开发一种评分函数来评估和排序预测的DNA三维结构	DNA三维结构	生物信息学	NA	深度学习	ARES	结构数据	两个测试集
197	2024-11-20	VSG-GAN: A high-fidelity image synthesis method with semantic manipulation in retinal fundus image 2024-09-03, Biophysical journal IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.bpj.2024.02.019 PMID:38414236	研究论文	本文介绍了一种名为VSG-GAN的高保真图像合成方法，用于视网膜眼底图像的语义操作	提出了基于GAN的VSG-GAN算法，通过分离血管骨架和背景风格生成多样化的视网膜图像，并使用空间自适应归一化模块确保输入和生成图像的一致性	NA	解决视网膜图像分析中数据集多样性不足和样本不平衡的问题	视网膜眼底图像	计算机视觉	NA	生成对抗网络（GAN）	生成对抗网络（GAN）	图像	使用了MESSIDOR和RITE数据集进行评估
198	2024-11-20	An artificial intelligence-enabled electrocardiogram algorithm for the prediction of left atrial low-voltage areas in persistent atrial fibrillation 2024-Sep, Journal of cardiovascular electrophysiology IF:2.3Q2 DOI:10.1111/jce.16373 PMID:39054663	研究论文	本文构建了一种基于人工智能的心电图算法，用于预测持续性心房颤动患者左心房低电压区域	本文提出了一种基于深度学习和随机森林分类模型的心电图算法，相较于传统的DR-FLASH和APPLE风险评分，该算法在预测左心房低电压区域方面具有更高的准确性	NA	构建一种能够准确预测持续性心房颤动患者左心房低电压区域的人工智能心电图算法	持续性心房颤动患者及其心电图数据	机器学习	心血管疾病	深度学习	随机森林分类模型	图像	587名持续性心房颤动患者，942张12导联心电图图像
199	2024-11-20	Philosophy of cognitive science in the age of deep learning 2024 Sep-Oct, Wiley interdisciplinary reviews. Cognitive science DOI:10.1002/wcs.1684 PMID:38773731	研究论文	本文探讨了深度学习对认知科学哲学的影响	深度神经网络在克服旧连接主义模型的局限性方面取得了显著进展	深度神经网络的比较评估仍存在方法论挑战	探讨深度学习与认知科学哲学之间的关联	深度学习技术及其对认知科学哲学的影响	机器学习	NA	深度学习	深度神经网络	NA	NA
200	2024-11-20	Considerations on Image Preprocessing Techniques Required by Deep Learning Models. The Case of the Knee MRIs 2024-Sep, Maedica DOI:10.26574/maedica.2024.19.3.526 PMID:39553362	研究论文	本文研究了膝关节MRI图像的预处理步骤，以使用深度学习模型检测半月板损伤，并强调其在诊断膝关节疾病中的实际应用	本文引入了创新的预处理方法，有望推动该领域的发展	NA	展示膝关节MRI图像的预处理步骤，以使用深度学习模型检测半月板损伤，并强调其在诊断膝关节疾病中的实际应用	膝关节MRI图像和半月板损伤	计算机视觉	骨科疾病	深度学习	深度学习模型	图像	188名患者的PD-矢状位图像