深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
901	2024-09-11	Neural network-based processing and reconstruction of compromised biophotonic image data 2024-Sep-04, Light, science & applications DOI:10.1038/s41377-024-01544-9 PMID:39237561	综述	本文深入探讨了通过故意损害生物光子成像中的测量指标，利用深度学习模型进行补偿的方法	本文介绍了通过故意损害测量指标（如点扩散函数、信噪比、采样密度和像素分辨率），利用深度学习网络进行补偿的创新方法	NA	探讨如何通过故意损害生物光子成像中的测量指标，利用深度学习模型进行补偿，以提高成像速度和简化硬件要求	生物光子成像中的测量指标，如点扩散函数、信噪比、采样密度和像素分辨率	计算机视觉	NA	深度学习	深度学习网络	图像	NA
902	2024-09-11	ChoroidSeg-ViT: A Transformer Model for Choroid Layer Segmentation Based on a Mixed Attention Feature Enhancement Mechanism 2024-Sep-03, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.13.9.7 PMID:39235399	研究论文	开发了一种基于混合注意力特征增强机制的Vision Transformer模型，用于光学相干断层扫描图像中脉络膜层的分割	提出了ChoroidSeg-ViT模型，通过集成局部增强特征提取和语义特征融合路径，实现了脉络膜层的精确分割	NA	开发一种新的Transformer模型，用于精确和自动分割脉络膜层	光学相干断层扫描图像中的脉络膜层	计算机视觉	NA	光学相干断层扫描	Vision Transformer (ViT)	图像	100张OCT B-扫描图像
903	2024-09-11	Generalizable Deep Learning for the Detection of Incomplete and Complete Retinal Pigment Epithelium and Outer Retinal Atrophy: A MACUSTAR Report 2024-Sep-03, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.13.9.11 PMID:39235402	研究论文	本研究开发了一种深度学习算法，用于检测和量化不完全和完全的视网膜色素上皮和外层视网膜萎缩（iRORA和cRORA），并在不同设备的光学相干断层扫描（OCT）数据上进行验证	本研究的创新点在于使用了领域适应（DA）模型，提高了算法在不同设备数据上的泛化能力，并结合分割模型进行iRORA/cRORA的检测	本研究的局限性在于对ZEISS OCTs的敏感性和特异性较低，且去除DA后对Spectralis OCTs的κw分数有所下降	本研究旨在开发一种能够跨设备检测和量化不完全和完全视网膜色素上皮和外层视网膜萎缩的深度学习算法，并在中间年龄相关性黄斑变性（iAMD）患者中进行验证	本研究的研究对象是中间年龄相关性黄斑变性（iAMD）患者的视网膜色素上皮和外层视网膜萎缩（iRORA和cRORA）	计算机视觉	眼科疾病	光学相干断层扫描（OCT）	深度学习算法	图像	168名中间年龄相关性黄斑变性（iAMD）患者
904	2024-09-11	The use of artificial intelligence in musculoskeletal ultrasound: a systematic review of the literature 2024-Sep, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-024-01856-1 PMID:39001961	综述	系统回顾了人工智能在肌肉骨骼超声中的应用，重点探讨了AI算法的类别和验证策略	NA	缺乏对外部数据集的独立临床验证	系统回顾人工智能在肌肉骨骼超声中的应用	肌肉骨骼超声中的AI算法和验证策略	计算机视觉	NA	人工智能	深度学习 (DL) 和传统机器学习 (ML)	超声图像	16项研究，涉及2020年至2023年发表的论文
905	2024-09-11	Deep Deblurring in Teledermatology: Deep Learning Models Restore the Accuracy of Blurry Images' Classification 2024-Sep, Telemedicine journal and e-health : the official journal of the American Telemedicine Association DOI:10.1089/tmj.2023.0703 PMID:38934135	研究论文	本文研究了深度学习模型在远程皮肤病学中对模糊图像的去模糊效果，以恢复分类准确性	本文提出了使用深度学习模型对模糊皮肤病图像进行去模糊处理，以提高诊断准确性和图像清晰度	研究仅使用了有限的公共数据集和医疗中心的图像，可能无法全面代表所有皮肤病学场景	确定深度学习模型对模糊图像去模糊后诊断准确性的恢复程度	模糊的皮肤病图像及其去模糊后的图像	计算机视觉	皮肤病	深度学习	深度学习模型	图像	19,191张皮肤图像，54张模糊皮肤图像，53张医疗中心的模糊皮肤病咨询照片
906	2024-09-11	Comparing code-free and bespoke deep learning approaches in ophthalmology 2024-Sep, Graefe's archive for clinical and experimental ophthalmology = Albrecht von Graefes Archiv fur klinische und experimentelle Ophthalmologie DOI:10.1007/s00417-024-06432-x PMID:38446200	综述	本文综述了无代码深度学习（CFDL）在眼科领域的应用，并与定制深度学习（DL）方法进行了比较	CFDL允许没有编码专业知识的临床医生构建高质量的人工智能模型，无需编写代码	CFDL的讨论大多是单维度的，且适用性差距较大，需要多维度的分析和改进数据集质量、适用性问题和研究设计的不规范性	比较无代码深度学习和定制深度学习在眼科领域的优势	糖尿病视网膜病变筛查、视网膜多疾病分类、手术视频分类、眼科组学和资源管理等任务	机器学习	NA	深度学习	无代码深度学习（CFDL）和定制深度学习（DL）	文本	10项相关研究
907	2024-09-10	SmartCADD: AI-QM Empowered Drug Discovery Platform with Explainability 2024-Sep-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.4c00720 PMID:39177478	研究论文	介绍了一个名为SmartCADD的创新开源虚拟筛选平台，结合了深度学习、计算机辅助药物设计（CADD）和量子力学方法	SmartCADD整合了多种独立技术，包括ADMET属性预测、从头2D和3D药效团建模、分子对接以及可解释AI机制	NA	解决AI在科学研究中因模型不透明、实施复杂和数据稀缺而面临的阻力	开发一个用户友好的Python框架，用于药物发现和虚拟筛选	计算机辅助药物设计	HIV	深度学习、量子力学	NA	分子数据	NA
908	2024-09-10	Hybrid Diffusion Model for Stable, Affinity-Driven, Receptor-Aware Peptide Generation 2024-Sep-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.4c01020 PMID:39193724	研究论文	本文介绍了一种名为HYDRA的混合深度学习方法，用于生成针对特定受体的稳定、亲和力驱动的肽	HYDRA结合了扩散模型的分布建模能力和结合亲和力最大化算法，用于从头设计针对各种目标受体的肽结合剂	NA	开发一种新的深度学习方法，用于设计针对特定受体的治疗性肽	治疗性肽及其与目标受体的结合	机器学习	NA	深度学习	扩散模型	肽序列	NA
909	2024-09-10	Conformations of KRAS4B Affected by Its Partner Binding and G12C Mutation: Insights from GaMD Trajectory-Image Transformation-Based Deep Learning 2024-Sep-09, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.4c01174 PMID:39197061	研究论文	研究了KRAS4B与其伙伴结合及G12C突变对其构象动态的影响	采用高斯加速分子动力学模拟结合深度学习和主成分分析，揭示了G12C突变和伙伴结合对KRAS4B关键结构域接触的改变	NA	深入理解KRAS4B的功能	KRAS4B的构象变化及其与伙伴结合和G12C突变的关系	生物信息学	NA	高斯加速分子动力学模拟	深度学习	分子动力学轨迹	NA
910	2024-09-10	High-quality AFM image acquisition of living cells by modified residual encoder-decoder network 2024-Sep, Journal of structural biology IF:3.0Q3 DOI:10.1016/j.jsb.2024.108107 PMID:38906499	研究论文	提出了一种基于残差编码器-解码器的自适应注意力图像重建网络，用于提高原子力显微镜成像质量	结合深度学习技术和原子力显微镜成像，提出了一种新的网络结构，显著提高了图像重建质量和细胞识别率	未提及	提高原子力显微镜成像质量，以便更好地进行细胞研究和分析	活细胞的原子力显微镜图像	计算机视觉	NA	原子力显微镜	残差编码器-解码器网络	图像	未提及
911	2024-09-10	Challenges and opportunities in the development and clinical implementation of artificial intelligence based synthetic computed tomography for magnetic resonance only radiotherapy 2024-09, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.radonc.2024.110387 PMID:38885905	研究论文	本文讨论了基于人工智能的合成计算机断层扫描（sCT）在仅使用磁共振成像（MRI）的放射治疗中的开发和临床实施的挑战与机遇	本文提出了在没有共识的情况下，如何通过专家讨论来解决sCT在不同医院中的实施差异问题	本文主要集中在sCT的开发和实施方面，未深入探讨具体的算法和技术细节	探讨sCT在放射治疗中的临床应用及其面临的挑战	合成计算机断层扫描（sCT）在仅使用磁共振成像（MRI）的放射治疗中的应用	计算机视觉	NA	深度学习（DL）	NA	图像	NA
912	2024-09-10	Artificial intelligence-assisted quantitative CT analysis of airway changes following SABR for central lung tumors 2024-09, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.radonc.2024.110376 PMID:38857700	研究论文	本文评估了一种基于人工智能的自动化评分方法，用于量化中央肺肿瘤患者接受立体定向消融放疗（SABR）后支气管变化	本文的创新点在于使用基于人工智能的气道自动分割技术，能够更早地检测到支气管狭窄/闭塞，并提高了检测率	本文的局限性在于仅在两个数据集上进行了验证，且样本量相对较小	研究目的是评估一种基于人工智能的自动化评分方法，用于量化中央肺肿瘤患者接受SABR后支气管变化	研究对象是接受SABR治疗的中央肺肿瘤患者	计算机视觉	肺癌	立体定向消融放疗（SABR）	深度学习模型（MEDPSeg）	CT扫描图像	共59名患者，其中26名来自阿姆斯特丹大学医学中心（AUMC），33名来自彼得·麦克卡勒姆癌症中心（PMCC）
913	2024-08-26	Correction: PSMA‑positive prostatic volume prediction with deep learning based on T2‑weighted MRI 2024-Sep, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-024-01829-4 PMID:39180615	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
914	2024-09-10	Ambulatory ECG noise reduction algorithm for conditional diffusion model based on multi-kernel convolutional transformer 2024-Sep-01, The Review of scientific instruments DOI:10.1063/5.0222123 PMID:39248622	研究论文	本文提出了一种基于多核卷积变压器的条件扩散模型，用于动态心电图噪声抑制	引入条件噪声增强扩散模型网络，设计多核卷积变压器网络结构，并整合扩散模型逆过程实现噪声抑制	NA	提高动态心电图信号的清晰度，以便更准确地分析心血管疾病	动态心电图信号及其噪声干扰	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	卷积变压器网络	心电图信号	QT数据库和MIT-BIH噪声应激测试数据库
915	2024-09-09	AI-based seagrass morphology measurement 2024-Sep-05, Journal of environmental management IF:8.0Q1 DOI:10.1016/j.jenvman.2024.122246 PMID:39241598	研究论文	本文开发了一种基于人工智能的机器学习模型，用于自动测量海草的形态参数	利用YOLO-v6深度学习模型自动分类和测量海草的形态参数，提高了测量效率和准确性	NA	研究海草的表型可塑性及其对环境压力的形态适应能力，以评估生态系统健康并制定保护策略	海草的形态参数，包括叶片、根茎和根的长度和宽度	计算机视觉	NA	机器学习	YOLO-v6	图像	三种不同类型的海草对象
916	2024-09-09	Deep learning meets histones at the replication fork 2024-Sep-05, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.07.055 PMID:39241742	研究论文	本文探讨了在复制叉处，异染色质的表观遗传继承需要将亲代H3-H4四聚体转移到两个子代双链中，并揭示了复制体组件Mrc1/CLASPIN作为H3-H4四聚体伴侣在亲代组蛋白向子代转移中的重要作用	利用酵母遗传学与继承分析以及AlphaFold2-多聚体预测与生物化学相结合的方法，揭示了Mrc1/CLASPIN在组蛋白转移中的新角色	NA	探讨异染色质表观遗传继承的机制	H3-H4四聚体在复制过程中的转移	数字病理学	NA	AlphaFold2-多聚体预测	NA	NA	NA
917	2024-09-09	Recent trends in AI applications for pelvic MRI: a comprehensive review 2024-Sep, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-024-01861-4 PMID:39096356	综述	本文综述了人工智能在盆腔MRI中的应用及其在诊断路径各个阶段的发展	重点介绍了多中心研究的趋势，以提高AI的通用性	NA	探讨人工智能在盆腔MRI诊断中的应用及其进展	盆腔MRI在前列腺、膀胱、子宫、卵巢和直肠等器官的诊断	计算机视觉	NA	MRI	机器学习和深度学习算法	图像	NA
918	2024-09-09	Classification of gait variation under mental workload in big five personalities 2024-Sep, Gait & posture IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.gaitpost.2024.06.004 PMID:38878610	研究论文	研究通过惯性传感器捕捉步态变化，揭示人格、心理负荷与步态模式之间的关系	首次通过深度学习模型对不同人格维度和心理负荷下的步态进行分类，并评估了不同身体部位传感器数据对分类性能的影响	研究样本量较小，且仅限于走廊行走场景，未来需在更多样化的环境中验证模型性能	揭示人格、心理负荷与步态模式之间的相互关系，并构建步态分类模型	60名参与者在不同心理负荷下的步态数据及其五大人格特质	机器学习	NA	惯性测量单元 (IMU)	滑动窗口长短期记忆网络 (LSTM)	步态数据	60名参与者
919	2024-09-09	Development and validation of a fully automated tool to quantify 3D foot and ankle alignment using weight-bearing CT 2024-Sep, Gait & posture IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.gaitpost.2024.05.029 PMID:38850852	研究论文	开发并验证了一种全自动工具，用于使用负重CT量化3D足踝对齐	结合负重CT成像和深度学习技术，自动化并增强3D足踝对齐的量化	在某些角度（如距舟覆盖角和远端跖骨关节角）的测量中存在一定的误差	开发一种全自动工具，用于量化3D足踝对齐，并验证其准确性和可靠性	32名接受足踝负重CT的患者	计算机视觉	NA	深度学习	3D nnU-Net	图像	45例用于模型训练和验证，32例用于研究
920	2024-09-09	Fully Automated Hippocampus Segmentation using T2-informed Deep Convolutional Neural Networks 2024-Sep, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120767 PMID:39103064	研究论文	本文提出了一种利用T2加权MR图像和深度卷积神经网络实现全自动海马体分割的方法	本文创新性地利用高分辨率T2加权图像来增强临床T1加权图像的海马体分割效果	本文未提及具体的局限性	旨在提高海马体分割的准确性和可靠性，以便在阿尔茨海默病临床试验中更精确地估计海马体体积和追踪其体积损失	海马体及其在阿尔茨海默病中的萎缩情况	计算机视觉	阿尔茨海默病	深度学习	3D卷积神经网络	医学影像	包含T1和T2加权图像的多对比度数据集