深度学习在生物医药领域的应用
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当前共找到 1162 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
Local Mean Suppression Filter for Effective Background Identification in Fluorescence Images
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614955
PMID:39386682
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研究论文 | 提出一种用于荧光显微镜图像背景识别的非线性滤波器 | 基于局部均值比较的像素级滤波方法，通过变化邻域尺寸生成多重标签并累积决策 | NA | 开发有效的荧光图像背景识别方法 | 具有密集低对比度前景的荧光显微镜图像 | 计算机视觉 | NA | 荧光显微镜成像 | NA | 图像 | NA | Python 3 | 局部均值抑制滤波器 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
Semi-supervised CT image segmentation via contrastive learning based on entropy constraints
2024-Sep, Biomedical engineering letters
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s13534-024-00387-y
PMID:39220023
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研究论文 | 提出一种基于熵约束对比学习的半监督CT图像分割方法 | 融合CNN和Transformer架构，结合熵约束的对比学习机制，通过丢弃高熵值不可靠样本来提升模型性能 | 仅在COVID-19 CT公共数据集上验证，未在其他医学图像数据集测试 | 提高CT图像分割精度，减少对标注数据的依赖 | CT医学图像 | 计算机视觉 | COVID-19 | CT成像 | CNN, Transformer | 图像 | NA | NA | CNN, Transformer, 残差压缩激励模块 | DSC, HD, JC | NA |
| 163 | 2025-10-07 |
Deep learning for rapid analysis of cell divisions in vivo during epithelial morphogenesis and repair
2024-Sep-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87949
PMID:39312468
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研究论文 | 开发深度学习管道自动分析上皮组织中细胞分裂的动态特征 | 首次建立能够同时识别细胞分裂事件、确定分裂轴方向并量化分裂前后形状变化的深度学习管道 | 方法主要应用于果蝇蛹翅上皮组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 开发自动化工具分析上皮组织发育和修复过程中的细胞分裂动态 | 果蝇蛹翅上皮组织 | 计算机视觉 | NA | 延时显微成像 | 深度学习 | 延时显微图像序列 | NA | NA | NA | 准确性 | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
Whole-cell multi-target single-molecule super-resolution imaging in 3D with microfluidics and a single-objective tilted light sheet
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.27.559876
PMID:37808751
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研究论文 | 开发了一种结合微流控技术和单物镜倾斜光片的新型3D超分辨率成像方法，用于全细胞多靶点单分子成像 | 提出可操控的抖动单物镜倾斜光片用于光学切片以减少荧光背景，开发了3D纳米打印微流控系统反射光片至样品的新流程 | NA | 解决全哺乳动物细胞单分子超分辨率成像中高荧光背景和慢采集速度的问题 | 哺乳动物细胞亚细胞结构 | 生物医学成像 | NA | 单分子超分辨率荧光显微镜，Exchange-PAINT | 深度学习 | 3D荧光图像 | NA | NA | NA | 成像精度，成像速度 | NA |
| 165 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomic landscape of rice embryonic cells during seed germination
2024-09-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.05.016
PMID:38848718
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研究论文 | 本研究通过空间增强分辨率组学测序和单细胞RNA测序，揭示了水稻胚胎细胞在种子萌发过程中的时空转录组景观 | 开发了基于深度学习的自动细胞分割模型，首次报道了两种未发现的盾片细胞类型，并提供了探索胚胎细胞在种子萌发中作用的新方法 | NA | 阐明不同胚胎细胞在调控种子活力和幼苗建成中的复杂生物学功能 | 水稻胚胎细胞 | 数字病理学 | NA | 空间增强分辨率组学测序(Stereo-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 原位杂交 | 深度学习 | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 吸水后6、24、36和48小时的时间点样本 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2025-10-07 |
Constructing analogies: Developing critical thinking through a collaborative task
2024 Sep-Oct, Biochemistry and molecular biology education : a bimonthly publication of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology
IF:1.2Q3
DOI:10.1002/bmb.21843
PMID:38850246
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研究论文 | 探讨大学生通过构建复杂类比来发展批判性思维能力的定性研究 | 开发了新颖的评分方案来衡量内容知识和批判性思维，并证明结对合作能显著提升批判性思维能力 | 样本量较小（n=30），且为定性研究，结果可能缺乏普适性 | 研究通过构建复杂类比任务促进学生批判性思维发展的有效性 | 大学生物专业学生（30名） | 教育学 | NA | 定性访谈分析 | NA | 访谈数据 | 30名大学生物专业学生，共收集50份访谈数据 | NA | NA | 内容知识评分、批判性思维评分 | NA |
| 167 | 2025-05-16 |
RNA language models predict mutations that improve RNA function
2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588317
PMID:38617247
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研究论文 | 该研究创建了一个名为GARNET的新数据库，用于RNA结构和功能分析，并开发了一种类似GPT的RNA语言模型，以预测提高RNA功能的突变 | 创建GARNET数据库，结合GTDB基因组数据与生物生长温度信息，开发了重叠三连体标记化的RNA生成模型，用于预测增强RNA功能的突变 | RNA结构预测目前仍缺乏充足的高质量参考数据 | 理解RNA序列、结构与功能之间的联系 | RNA序列及其功能 | 自然语言处理 | NA | 深度学习，RNA生成模型 | GPT-like语言模型 | RNA序列数据 | GTDB基因组数据中的RNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2025-10-07 |
Automated analysis of fetal heart rate baseline/acceleration/deceleration using MTU-Net3 + model
2024-Sep, Biomedical engineering letters
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s13534-024-00388-x
PMID:39220035
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研究论文 | 本研究提出MTU-Net3+深度学习模型，用于自动化分析胎儿心率信号的基线、加速和减速 | 在UNet3+架构基础上集成自注意力机制和双向LSTM层，实现多任务胎儿心率分析 | 模型在公开数据集和私有数据集上表现存在差异，私有数据集性能更优 | 提高胎儿心率分析的诊断准确性和效率 | 胎儿心率信号 | 医疗人工智能 | 胎儿健康评估 | 深度学习 | UNet3+, LSTM | 胎儿心率信号 | 公开数据库子集和私有数据库 | NA | UNet3+ with self-attention and bidirectional LSTM | F1-score, RMSD, D15bpm, SI, MADI | NA |
| 169 | 2025-10-07 |
Development of Machine Learning-Based Mpox Surveillance Models in a Learning Health System
2024-Sep-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.25.24314318
PMID:39399027
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研究论文 | 开发基于机器学习的猴痘监测模型，用于从临床笔记中识别猴痘病例 | 在学习型医疗系统框架下开发监测模型，Lasso回归在最小化假阳性方面表现优于深度学习模型 | NA | 开发猴痘病例识别模型以支持持续质量改进 | 临床笔记中的猴痘病例 | 机器学习 | 猴痘 | NA | Lasso回归,深度学习模型 | 临床文本笔记 | NA | NA | NA | 假阳性率 | NA |
| 170 | 2025-05-04 |
Dendrites endow artificial neural networks with accurate, robust and parameter-efficient learning
2024-Sep-13, ArXiv
PMID:39314509
|
研究论文 | 本文提出了一种新型的人工神经网络架构，通过融入生物树突的结构化连接和受限采样特性，提高了学习精度、鲁棒性和参数效率 | 引入生物树突的特性到人工神经网络中，解决了传统深度学习算法参数过多、易过拟合的问题 | 未提及具体的应用场景限制或实验数据的局限性 | 提升人工神经网络的学习效率、鲁棒性和参数效率 | 人工神经网络（ANNs）及其学习策略 | 机器学习 | NA | NA | dendritic ANNs | 图像数据 | 未提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2025-10-07 |
Predicting metabolite response to dietary intervention using deep learning
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532589
PMID:36993761
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的代谢物对饮食干预反应预测方法McMLP | 首次将深度学习应用于代谢物对饮食干预反应的预测，提出了耦合多层感知器架构 | 未明确说明模型在更广泛人群中的泛化能力 | 精准预测个体对饮食干预的代谢物反应，实现精准营养 | 人类肠道微生物组和代谢物反应 | 机器学习 | NA | 深度学习，微生物消费者-资源模型 | MLP | 微生物组成数据，代谢物数据 | 来自六项饮食干预研究的真实数据加上合成数据 | NA | 耦合多层感知器 | NA | NA |
| 172 | 2025-05-02 |
A Practical Roadmap to Implementing Deep Learning Segmentation in the Clinical Neuroimaging Research Workflow
2024-09, World neurosurgery
IF:1.9Q2
DOI:10.1016/j.wneu.2024.06.026
PMID:38866234
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research paper | 本文探讨了一种利用开源工具加速和增强临床研究中图像分割的通用方法 | 提出了一种迭代的模型训练和迁移学习方法，强调在标记过程的早期进行内部验证和异常值处理，后期进行微调 | NA | 为使用机器学习技术进行图像分割的研究提供加速和增强可重复性的框架 | 临床神经影像研究中的图像分割 | machine learning | NA | deep learning | NA | image | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2025-10-07 |
Detection and classification of mandibular fractures in panoramic radiography using artificial intelligence
2024-09-01, Dento maxillo facial radiology
DOI:10.1093/dmfr/twae018
PMID:38652576
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研究论文 | 本研究评估YOLOv5深度学习模型在全景X光片中检测不同类型下颌骨骨折的性能 | 首次将YOLOv5模型应用于全景X光片中六种解剖位置下颌骨骨折的自动检测与分类 | 髁状突头部骨折检测性能相对较低，样本量有限 | 开发基于人工智能的下颌骨骨折自动检测系统 | 包含下颌骨骨折的全景X光片图像 | 计算机视觉 | 颌面部创伤 | 全景X光摄影 | YOLOv5 | 医学影像 | 498张全景X光片，包含673处骨折 | PyTorch | YOLOv5 | 准确率, 精确率, 敏感度, 特异度, Dice系数, AUC | NA |
| 174 | 2025-10-07 |
Single-Molecule Identification and Quantification of Steviol Glycosides with a Deep Learning-Powered Nanopore Sensor
2024-09-10, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c07038
PMID:39189792
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研究论文 | 本研究开发了一种基于深度学习的气溶素纳米孔传感器，用于单分子水平识别和定量甜菊糖苷 | 利用野生型气溶素纳米孔通过调节电压产生的电渗流效应区分不同甜菊糖苷物种，并首次结合深度学习模型实现单分子自动识别 | 仅测试了15种甜菊糖苷物种，样本规模有限 | 开发精确识别和定量复杂甜菊糖苷结构的方法 | 甜菊糖苷（一类高甜度无热量天然甜味剂） | 生物传感 | NA | 纳米孔传感技术 | 深度学习模型 | 纳米孔电信号数据 | 15种甜菊糖苷物种 | NA | NA | 识别精度，定量准确性 | NA |
| 175 | 2025-10-07 |
Deep Learning-Based Kinetic Analysis in Paper-Based Analytical Cartridges Integrated with Field-Effect Transistors
2024-09-10, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c02897
PMID:39252606
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研究论文 | 本研究结合场效应晶体管、纸基分析盒和深度学习技术，开发了一种用于定量生物传感的动力学分析方法 | 首次将场效应晶体管、纸基分析盒与深度学习相结合，通过动力学分析解决传统生物传感器的灵敏度低和样品基质干扰问题 | 目前仅为概念验证研究，需要进一步验证其在更广泛应用场景中的性能 | 开发一种经济高效、易于使用的即时诊断和家庭检测生物传感平台 | 胆固醇检测 | 机器学习 | 心血管疾病 | 场效应晶体管传感，纸基分析技术 | 深度学习 | 动力学电信号数据 | NA | NA | NA | 变异系数，相关系数(r值) | NA |
| 176 | 2025-10-07 |
High-Throughput and Integrated CRISPR/Cas12a-Based Molecular Diagnosis Using a Deep Learning Enabled Microfluidic System
2024-09-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c05734
PMID:39173188
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和深度学习的高通量微流控系统，用于快速检测SARS-CoV-2及其变异株 | 结合微流控技术、自研试剂和深度学习原型设备，实现了96样本/轮次的高通量检测，检测限低至250拷贝/mL | 样本规模有限（72个临床样本），需进一步验证系统普适性 | 开发高效集成的病原体分子诊断系统 | SARS-CoV-2病毒及其变异株 | 数字病理 | COVID-19 | CRISPR/Cas12a, RT-LAMP, 微流控技术 | 深度学习 | 分子检测数据 | 72个临床样本（22个野生型，26个突变型，24个阴性） | NA | NA | 准确率 | NA |
| 177 | 2025-10-07 |
High-throughput optimized prime editing mediated endogenous protein tagging for pooled imaging of protein localization
2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.613361
PMID:39345511
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研究论文 | 开发了一种基于prime editing的高通量内源蛋白标记方法，用于并行研究蛋白质亚细胞定位 | 首次将prime editing与光学读出和测序结合，实现大规模蛋白质亚细胞定位的准确测量 | 仅验证了60种蛋白质的标记效率，尚未在不同细胞类型和环境扰动中广泛验证 | 开发能够大规模测量蛋白质亚细胞定位的技术方法 | 60种具有不同定位模式的内源蛋白质 | 计算生物学 | NA | prime editing, 原位pegRNA测序, 高通量深度学习图像分析 | 深度学习 | 图像, 测序数据 | 17,280个pegRNAs设计的文库，覆盖60种蛋白质 | NA | NA | 标记效率预测准确性 | NA |
| 178 | 2025-10-07 |
Evaluating Performance of Different RNA Secondary Structure Prediction Programs Using Self-cleaving Ribozymes
2024-Sep-13, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae043
PMID:39317944
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研究论文 | 比较七种RNA二级结构预测工具在自切割核酶序列上的预测准确性 | 首次系统评估包括深度学习方法在内的多种RNA结构预测工具在不同复杂度任务中的表现 | 仅针对特定类别的自切割核酶序列进行评估，结果可能不适用于其他RNA类型 | 评估不同计算工具在预测RNA二级结构方面的性能差异 | 自切割核酶序列的RNA二级结构 | 生物信息学 | NA | RNA二级结构预测 | 深度学习,传统计算方法 | RNA序列数据 | 数十个自切割核酶序列 | NA | NA | 预测准确性 | NA |
| 179 | 2025-04-24 |
Reconstructing Cancellous Bone From Down-Sampled Optical-Resolution Photoacoustic Microscopy Images With Deep Learning
2024-09, Ultrasound in medicine & biology
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研究论文 | 本研究提出了一种名为PADA U-Net的深度学习模型，用于从欠采样的光学分辨率光声显微镜图像中重建完整的骨组织图像 | 提出PADA U-Net模型，突破成像速度与空间分辨率之间的权衡 | NA | 提高光学分辨率光声显微镜图像质量，同时不牺牲时间分辨率 | 牛松质骨样本 | 数字病理学 | 骨疾病 | 光学分辨率光声显微镜(OR-PAM) | PADA U-Net | 图像 | 牛松质骨测试集 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2025-04-24 |
A Semi-supervised Four-Chamber Echocardiographic Video Segmentation Algorithm Based on Multilevel Edge Perception and Calibration Fusion
2024-09, Ultrasound in medicine & biology
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research paper | 提出一种基于多级边缘感知和校准融合的半监督四腔心超声视频分割算法，以提高心内膜分割的准确性 | 引入了多级边缘感知模块和校准融合模块，结合半监督学习，有效解决了超声视频中的边缘模糊和特征融合问题 | 未提及具体的数据集规模和多样性限制，可能影响模型的泛化能力 | 提高心内膜的自动语义分割准确性，辅助心脏疾病诊断 | 超声心动图视频中的心内膜 | digital pathology | cardiovascular disease | deep learning | semi-supervised network | video | 两个公共超声心动图视频数据集和一个本地医院临床数据集 | NA | NA | NA | NA |