深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2024-12-05	Predicting Short-Term Mortality in Patients With Acute Pulmonary Embolism With Deep Learning 2024-Nov-30, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society IF:3.1Q2 DOI:10.1253/circj.CJ-24-0630 PMID:39617426	研究论文	本文开发了一种基于深度学习的多模态模型，用于预测急性肺栓塞患者的短期死亡率	本文提出的多模态深度学习模型在预测急性肺栓塞患者的短期死亡率方面显著优于现有的PESI评分	NA	开发一种新的短期死亡率预测模型，以优化治疗策略并改善患者预后	急性肺栓塞患者	机器学习	肺栓塞	深度学习	多模态深度学习模型	影像和临床/人口统计数据	207名急性肺栓塞患者，其中53名在住院期间死亡
202	2024-12-05	BMSMM-Net: A Bone Metastasis Segmentation Framework Based on Mamba and Multiperspective Extraction 2024-Nov-30, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2024.11.018 PMID:39617656	研究论文	本文提出了一种名为BMSMM-Net的新型骨转移分割框架，通过集成Bottleneck Gating Mamba层和多视角提取模块，提高了骨转移病变的分割精度	本文创新性地引入了Bottleneck Gating Mamba层和Skip-Mamba模块，以及多视角提取模块，增强了深度特征图的长程依赖性和多尺度特征融合能力	NA	旨在通过深度学习技术提高骨转移病变的快速和精确分割，从而改善患者预后	骨转移病变	计算机视觉	骨癌	深度学习	CNN	图像	BM-Seg数据集
203	2024-12-05	Interpretable multi-horizon time series forecasting of cryptocurrencies by leverage temporal fusion transformer 2024-Nov-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40142 PMID:39619580	研究论文	研究探讨了在波动性全球金融市场预测加密货币运动的挑战，并开发了一种先进的深度学习增强型时间融合变压器（ADE-TFT）模型来更准确地估计比特币价值	提出了ADE-TFT模型，该模型在预测准确性上优于其底层模型，特别是在使用更高隐藏层配置时，误差指标（MAPE、MSE和RMSE）显著降低	研究强调了需要尝试不同的归一化策略和利用各种市场相关数据来提高模型性能，并指出提高预测准确性可能需要解决这些限制并纳入市场情绪等额外因素	提高加密货币市场预测的准确性，为投资者提供更精确的市场预测	比特币价值预测	机器学习	NA	深度学习	时间融合变压器（TFT）	交易数据	NA
204	2024-12-05	FASNet: Feature alignment-based method with digital pathology images in assisted diagnosis medical system 2024-Nov-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40350 PMID:39624322	研究论文	本文提出了一种基于特征对齐的数字病理图像分割方法FASNet，用于辅助诊断医疗系统	FASNet通过在编码器和解码器中插入语义感知归一化和语义感知白化模块，实现了同类特征的紧凑性和不同类特征的分离性	深度学习模型需要大量标注数据，病理图像获取成本高且难以获得，标注数据不足容易导致偏差结果	提高数字病理图像分割的准确性和鲁棒性，特别是在训练数据与测试数据分布不匹配的情况下	数字病理图像中的细胞核和组织结构	数字病理学	肿瘤	深度学习	UNW网络	图像	未明确提及具体样本数量
205	2024-12-05	Design of a Low-Complexity Deep Learning Model for Diagnosis of Type 2 Diabetes 2024-Nov-29, Current diabetes reviews IF:2.4Q3 DOI:10.2174/0115733998307556240819093038 PMID:39620332	研究论文	本文设计了一种用于2型糖尿病诊断的低复杂度深度学习模型	提出了一个结合卷积神经网络和多层感知器的混合模型，以实现低复杂度和高准确性	NA	开发一种低复杂度的深度学习模型用于2型糖尿病的诊断	2型糖尿病的诊断	机器学习	糖尿病	深度学习	CNN+MLP	数据集	使用了公开的PIMA Indian Diabetes Dataset (PIDD)
206	2024-12-05	SIAM: Spatial and Intensity Awareness Module for cerebrovascular segmentation 2024-Nov-28, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2024.108511 PMID:39626410	研究论文	本文提出了一种新的空间和强度感知模块（SIAM），用于有限数据下的脑血管分割	SIAM模块引入了空间和像素强度扰动，构建新的匹配数据用于模型学习，并通过协作训练和共享特征，赋予模型脑血管语义	NA	提高脑血管分割的准确性和适应性，特别是在有限数据情况下的表现	脑血管结构及其在不同数据集上的分割效果	计算机视觉	脑血管疾病	深度学习	SIAM模块	图像	三个不同模态的脑血管数据集
207	2024-12-05	Based on computer simulation and experimental verification: mining and characterizing novel antimicrobial peptides from soil microbiome 2024-Nov-28, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2024.142275 PMID:39626551	研究论文	开发了一种基于深度学习的预测管道，从土壤宏基因组数据中识别潜在的抗菌肽，并通过实验验证其抗菌活性	利用深度学习技术从土壤微生物组中挖掘和表征新型抗菌肽，提供了一种高效且成本较低的筛选方法	NA	发现新型抗菌肽，以增强食品安全和延长食品保质期	土壤微生物组中的抗菌肽	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	宏基因组数据	九种候选肽
208	2024-12-05	Feasibility verification of deep-learning based collimator-less imaging system using a voxelated GAGG(Ce) single volume detector: A Monte Carlo simulation 2024-Nov-26, Applied radiation and isotopes : including data, instrumentation and methods for use in agriculture, industry and medicine IF:1.6Q3 DOI:10.1016/j.apradiso.2024.111605 PMID:39616796	研究论文	本文通过蒙特卡罗模拟验证了基于深度学习的无准直器成像系统的可行性	提出了一种基于深度学习的无准直器成像系统，并使用蒙特卡罗方法进行模拟验证	仅通过模拟数据验证了系统的可行性，尚未进行实际实验验证	验证基于深度学习的无准直器成像系统的可行性	4π视野的无准直器成像系统	计算机视觉	NA	蒙特卡罗模拟	全卷积网络	能量沉积模式	使用了Co、Ba、Na和Cs点源在2000个位置的数据进行模拟
209	2024-12-05	An AI-assisted explainable mTMCNN architecture for detection of mandibular third molar presence from panoramic radiography 2024-Nov-23, International journal of medical informatics IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.ijmedinf.2024.105724 PMID:39626596	研究论文	本文设计并系统评估了一种名为E-mTMCNN的架构，用于从全景放射摄影中检测下颌第三磨牙的存在	提出了E-mTMCNN架构，结合GoogLeNet和LIME方法，提高了检测准确性和模型的可解释性	NA	设计并评估一种新的架构，用于提高下颌第三磨牙检测的准确性和临床决策支持	下颌第三磨牙的存在检测	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN），迁移学习（TL），局部可解释模型不可知解释（LIME）	卷积神经网络（CNN）	图像	来自UESB数据集的原始全景放射图像，通过专家标注形成Mandibular Third Molar（m-TM）数据集
210	2024-12-05	Integrating artificial intelligence with smartphone-based imaging for cancer detection in vivo 2024-Nov-21, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2024.116982 PMID:39616900	研究论文	本文介绍了将人工智能与智能手机成像系统结合用于体内癌症检测的方法	利用智能手机成像系统和人工智能算法进行体内癌症检测，提供便携、经济且广泛可及的早期癌症检测工具	智能手机系统面临成像质量低和计算能力受限的挑战，AI算法的透明性和可靠性问题	探索将人工智能与智能手机成像系统结合用于早期癌症检测	不同类型的癌症	计算机视觉	NA	智能手机成像系统	深度学习算法	多模态数据	NA
211	2024-12-05	Deep learning-based fishing ground prediction with multiple environmental factors 2024-Nov, Marine life science & technology IF:5.8Q1 DOI:10.1007/s42995-024-00222-4 PMID:39620085	研究论文	研究开发了一种基于深度学习的渔场预测模型，结合多种环境因素，以提高渔场预测的准确性	通过引入多种环境因素，改进了单一环境因素模型中渔场区域过大且不集中的问题	研究仅使用了西北太平洋海域的鱿鱼数据，可能限制了模型的普适性	提高海洋经济物种渔场预测的准确性	西北太平洋海域的鱿鱼渔场	机器学习	NA	深度学习	U-Net	环境数据	2002年至2020年7月至11月的数据
212	2024-12-05	Deep learning for genomic selection of aquatic animals 2024-Nov, Marine life science & technology IF:5.8Q1 DOI:10.1007/s42995-024-00252-y PMID:39620094	综述	本文综述了深度学习在基因组选择中的应用现状和潜力	深度学习技术如深度神经网络、卷积神经网络和自编码器在基因组选择中的应用，提高了遗传评估的准确性	NA	探讨深度学习在基因组选择中的应用及其未来发展方向	水产动物的表型、基因型和基因组估计育种值	机器学习	NA	深度学习	深度神经网络、卷积神经网络、自编码器	基因型数据	NA
213	2024-12-05	Letter to the Editor Regarding "A Practical Roadmap to Implementing Deep Learning Segmentation in the Clinical Neuroimaging Research Workflow" 2024-Nov, World neurosurgery IF:1.9Q2 DOI:10.1016/j.wneu.2024.07.121 PMID:39623627	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
214	2024-12-05	Automatic segmentation of extensor carpi ulnaris tendon and detection of tendinosis with convolutional neural networks 2024-Nov, Acta radiologica open IF:0.9Q4 DOI:10.1177/20584601241297530 PMID:39624259	研究论文	本研究利用卷积神经网络（CNN）自动检测和分割尺侧腕伸肌腱及其腱鞘炎，并评估其在2D腕部MRI中的表现	首次使用卷积神经网络自动检测和分割尺侧腕伸肌腱及其腱鞘炎，提供了一种自动化诊断慢性腕痛的方法	研究样本量较小，且仅限于2D腕部MRI图像，未来需要在大规模数据集上验证和改进模型	开发一种用于自动检测尺侧腕伸肌腱及其腱鞘炎的卷积神经网络，并验证其在2D腕部MRI中的可行性	尺侧腕伸肌腱及其腱鞘炎的自动检测和分割	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）	卷积神经网络（CNN）	图像	1081名接受腕部MRI检查的患者，其中46名患者患有腱鞘炎
215	2024-12-02	Predicting early mortality in hemodialysis patients: a deep learning approach using a nationwide prospective cohort in South Korea 2024-Nov-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-80900-6 PMID:39609495	研究论文	本研究使用韩国全国性前瞻性队列数据，通过深度学习方法预测血液透析患者的早期死亡率	开发了一种带有自编码器的循环神经网络（RNN）来处理缺失数据和时间序列变量，并改进了早期死亡率的预测	NA	量化风险因素对血液透析患者死亡率的影响	3284名血液透析患者	机器学习	肾脏疾病	循环神经网络（RNN）	RNN	时间序列数据	3284名患者，平均年龄58.4±13.6岁，59.3%为男性
216	2024-12-02	Deep learning for predicting porosity in ultra-deep fractured vuggy reservoirs from the Shunbei oilfield in Tarim Basin, China 2024-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81051-4 PMID:39609489	研究论文	研究开发了一种用于塔里木盆地顺北油田超深裂缝-溶洞型储层孔隙度预测的高级深度学习方法	该方法通过深度学习技术构建了超深碳酸盐岩储层的孔隙度预测模型，相比传统阻抗反演技术，均方误差降低了76%	NA	解决中国深层和超深层碳酸盐岩储层孔隙度预测的挑战	塔里木盆地顺北油田的超深裂缝-溶洞型储层	计算机视觉	NA	深度学习技术	深度学习模型	三维地震数据	使用顺北油田的盲井进行验证
217	2024-12-02	Exploratory analysis of metabolic changes using mass spectrometry data and graph embeddings 2024-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-80955-5 PMID:39609505	研究论文	本文提出了一种基于图嵌入和异常检测算法的深度学习方法，用于分析质谱代谢组学数据	引入了一种新的深度学习方法GEMNA，通过节点嵌入和边嵌入来分析质谱代谢组学数据，相比传统方法能更好地识别代谢变化	传统统计方法可能会过度过滤原始数据，导致识别的代谢变化较少	开发一种新的方法来分析质谱代谢组学数据，以克服传统方法的局限性	质谱代谢组学数据	代谢组学	NA	质谱分析	图神经网络（GNN）	质谱数据	NA
218	2024-12-02	Cell quantification at the osteochondral interface from synchrotron radiation phase contrast micro-computed tomography images using a deep learning approach 2024-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81333-x PMID:39609521	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的方法，用于从同步辐射相位对比显微CT图像中对骨软骨界面处的软骨细胞和骨细胞进行三维分割	本文将nnU-Net与标记控制的分水岭算法结合，改进了细胞腔隙的识别和分割	研究样本量较小，仅分析了15个样本，可能影响结果的普适性	研究骨软骨界面处软骨细胞和骨细胞的三维分割方法，并分析其在骨关节炎中的表现	人类膝关节中的软骨细胞和骨细胞	计算机视觉	骨关节炎	同步辐射相位对比显微CT	nnU-Net	图像	15个样本，包括10个对照组和5个骨关节炎组
219	2024-12-02	Photorealistic attention style transfer network for architectural photography photos 2024-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81249-6 PMID:39609556	研究论文	本文提出了一种用于建筑摄影照片的逼真注意力风格迁移网络，通过深度学习算法实现建筑照片风格的转换，同时保留关键结构和内容	本文的创新点在于利用语义分割模型将输入图像分割为前景和背景进行独立风格迁移，并使用坐标注意力机制对建筑细节进行精细处理，同时引入损失函数捕捉光影和色彩，确保图像的逼真度和艺术美感	本文未提及具体的局限性	研究目的是解决现有算法在建筑摄影风格迁移中面临的复杂细节处理和艺术效果保持的挑战	研究对象是建筑摄影照片的风格迁移	计算机视觉	NA	深度学习算法	注意力机制网络	图像	未提及具体样本数量
220	2024-12-02	Enhancement and evaluation for deep learning-based classification of volumetric neuroimaging with 3D-to-2D knowledge distillation 2024-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-80938-6 PMID:39609597	研究论文	本文提出了一种新的3D-to-2D知识蒸馏框架，用于增强基于深度学习的体积神经影像分类	本文创新性地利用3D体积影像数据集和投影的2D数据集，通过知识蒸馏框架提升2D CNN的分类性能	由于医疗领域数据获取成本高和标注资源密集，可用数据量有限	提升基于深度学习的体积神经影像分类性能	体积神经影像数据和投影的2D数据	计算机视觉	NA	3D卷积神经网络 (CNN)	CNN	影像	两个数据集，分别来自123I-DaTscan SPECT和18F-AV133 PET