深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
661	2024-11-22	Deep learning algorithm for predicting left ventricular systolic dysfunction in atrial fibrillation with rapid ventricular response 2024-Nov, European heart journal. Digital health DOI:10.1093/ehjdh/ztae062 PMID:39563911	研究论文	研究深度学习算法在预测房颤伴快速心室反应患者左室收缩功能障碍中的表现	开发并验证了一种基于残差神经网络架构的深度学习算法，用于预测房颤伴快速心室反应患者的左室收缩功能障碍	研究仅在一个中心进行，样本量有限，且仅使用了12导联和1导联心电图数据	评估人工智能算法在预测房颤伴快速心室反应患者左室收缩功能障碍中的表现	房颤伴快速心室反应患者	机器学习	心血管疾病	深度学习	残差神经网络	心电图	423名患者，其中241名患者有可用的心脏超声数据
662	2024-11-22	Advancing dermoscopy through a synthetic hair benchmark dataset and deep learning-based hair removal 2024-Nov, Journal of biomedical optics IF:3.0Q2 DOI:10.1117/1.JBO.29.11.116003 PMID:39564076	研究论文	本文开发了一种合成毛发基准数据集和基于深度学习的毛发去除方法，以提高皮肤镜图像的清晰度，从而辅助黑色素瘤的早期检测	本文创新性地创建了一个综合的合成毛发数据集，并设计了一个卷积神经网络（CNN）模型，专门用于去除黑色素瘤皮肤镜图像中的毛发	NA	开发一种新的合成毛发皮肤镜图像数据集和深度学习模型，用于去除黑色素瘤皮肤镜图像中的毛发	黑色素瘤皮肤镜图像中的毛发去除	计算机视觉	皮肤癌	深度学习	卷积神经网络（CNN）	图像	合成毛发数据集包含模拟多种类型和大小的毛发覆盖在黑色素瘤病变上的图像
663	2024-11-21	Deep Lead Optimization: Leveraging Generative AI for Structural Modification 2024-Nov-20, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.4c11686 PMID:39499822	综述	本文综述了基于深度学习的分子生成模型在药物发现中的应用，特别是结构导向的先导优化方法	本文首次系统地将先导优化方法分类为目标导向和结构导向，并详细讨论了结构导向优化中的四个具体任务	本文主要集中在结构导向优化方法的综述，未涉及具体实验验证	探讨深度学习在药物发现中的应用，特别是先导优化过程中的结构导向方法	先导优化方法，特别是结构导向优化中的片段替换、连接子设计、骨架跳跃和侧链装饰	机器学习	NA	深度学习	生成对抗网络（GAN）	分子结构数据	NA
664	2024-11-21	Combination of Transfer Learning and Chemprop Interpreter with Support of Deep Learning for the Energy Levels of Organic Photovoltaic Materials Prediction and Regulation 2024-Nov-20, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.4c15835 PMID:39564708	研究论文	本文提出了一种结合迁移学习和化学解释器的定向消息传递神经网络模型，用于有机光伏材料能级预测和可视化	本文的创新点在于结合了迁移学习和化学解释器，提高了有机光伏材料能级预测的准确性和可解释性	本文的局限性在于模型在小样本测试集上的表现较好，但在更大规模数据集上的表现尚需验证	本文的研究目的是开发一种高效且可解释的模型，用于预测和调控有机光伏材料的能级	本文的研究对象是有机光伏材料的能级及其分子结构	机器学习	NA	迁移学习	定向消息传递神经网络	分子结构数据	小测试集包含少量样本
665	2024-11-21	Nuclear pleomorphism in canine cutaneous mast cell tumors: Comparison of reproducibility and prognostic relevance between estimates, manual morphometry, and algorithmic morphometry 2024-Nov-19, Veterinary pathology IF:2.3Q1 DOI:10.1177/03009858241295399 PMID:39560067	研究论文	本研究探讨了犬皮肤肥大细胞瘤中核异型性的评估方法，比较了不同方法的重复性和预后相关性	本研究开发了基于深度学习的自动形态测量方法，并发现其在预后评估中的高准确性	需要进一步研究验证结果，确定算法间的重复性和算法的鲁棒性，并探索整个肿瘤切片中核特征的肿瘤异质性	探索犬皮肤肥大细胞瘤中核异型性评估方法的局限性，并开发替代的形态测量解决方案	犬皮肤肥大细胞瘤的核异型性评估方法	数字病理学	犬皮肤肥大细胞瘤	深度学习	NA	图像	96例犬皮肤肥大细胞瘤
666	2024-11-21	Performance of deep learning models in predicting the nugent score to diagnose bacterial vaginosis 2024-Nov-19, Microbiology spectrum IF:3.7Q2 DOI:10.1128/spectrum.02344-24 PMID:39560430	研究论文	本研究评估了深度学习模型在预测Nugent评分以诊断细菌性阴道病中的表现	深度学习模型在预测Nugent评分方面表现出高准确性，优于实验室技术人员的平均准确率	需要在大规模上进行验证	提高细菌性阴道病诊断的一致性和准确性	1510张阴道涂片图像	计算机视觉	细菌性阴道病	深度学习	深度学习模型	图像	1510张阴道涂片图像，以及106张独立测试图像
667	2024-11-21	A Modified Transformer Network for Seizure Detection Using EEG Signals 2024-Nov-19, International journal of neural systems IF:6.6Q1 DOI:10.1142/S0129065725500030 PMID:39560448	研究论文	本文提出了一种改进的Transformer网络用于癫痫发作检测，结合了Inception和Residual网络提取不同尺度的脑电图（EEG）信号特征，并通过Co-MixUp方法处理数据不平衡问题	本文提出的Inresformer网络结合了Inception和Residual网络，增强了特征表示能力，并通过改进的Feedforward层增强了模型的非线性表示	NA	提高癫痫发作检测的准确性和性能	脑电图（EEG）信号	机器学习	NA	离散小波变换（DWT）	Transformer网络	信号	Bonn数据集和CHB-MIT数据集
668	2024-11-21	Evaluation of SR-DLR in low-dose abdominal CT: superior image quality and noise reduction 2024-Nov-19, Abdominal radiology (New York) DOI:10.1007/s00261-024-04686-x PMID:39560744	研究论文	评估超分辨率深度学习重建（SR-DLR）在低剂量腹部CT成像中的效果，并与混合迭代重建（HIR）和传统深度学习重建（cDLR）算法进行比较	SR-DLR在低剂量腹部CT成像中提供了优于cDLR和HIR的图像质量和噪声减少效果	NA	评估SR-DLR在低剂量腹部CT成像中的有效性	低剂量腹部CT成像的图像重建算法	计算机视觉	NA	超分辨率深度学习重建（SR-DLR）	深度学习模型	图像	35名患者的腹部CT扫描数据
669	2024-11-21	Discovery of Active Ingredient of Yinchenhao Decoction Targeting TLR4 for Hepatic Inflammatory Diseases Based on Deep Learning Approach 2024-Nov-19, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-024-00670-7 PMID:39560852	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的AIGO-DTI框架，用于预测Yinchenhao Decoction中主要成分对TLR4的靶向概率，并验证了其对肝病的治疗潜力	首次使用AIGO-DTI深度学习框架预测Yinchenhao Decoction中成分对TLR4的靶向概率，并建立了TLR4-Predict在线平台	NA	探索Yinchenhao Decoction中有效成分及其对TLR4的靶向治疗机制，以治疗肝病	Yinchenhao Decoction中的主要成分及其对TLR4的靶向作用	机器学习	肝病	深度学习	AIGO-DTI	化合物	NA
670	2024-11-21	TCKAN: a novel integrated network model for predicting mortality risk in sepsis patients 2024-Nov-19, Medical & biological engineering & computing IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11517-024-03245-2 PMID:39560917	研究论文	本文介绍了一种名为TCKAN的新型集成网络模型，用于预测脓毒症患者的死亡风险	TCKAN模型独特地整合了时间数据、常量数据和ICD代码，采用多模态数据集成策略，显著提高了预测准确性和鲁棒性	未来研究可以纳入更多类型的医疗数据，如影像和实验室测试结果，以实现更全面的数据集成并进一步提高预测准确性	开发一种能够准确预测脓毒症患者死亡风险的集成网络模型	脓毒症患者的死亡风险	机器学习	脓毒症	NA	集成网络模型	时间数据、常量数据、ICD代码	使用MIMIC-III和MIMIC-IV数据集进行验证
671	2024-11-21	Quantitative and Morphology-Based Deep Convolutional Neural Network Approaches for Osteosarcoma Survival Prediction in the Neoadjuvant and Metastatic Setting 2024-Nov-19, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2599 PMID:39561274	研究论文	本文探讨了三种深度学习策略在组织学样本上预测新辅助和转移性骨肉瘤生存结果的应用	本文创新性地使用深度卷积神经网络自动估计坏死与肿瘤的比例，并识别出特定的组织形态学生物标志物	NA	探索深度学习策略在新辅助和转移性骨肉瘤生存预测中的应用	骨肉瘤患者的组织学样本	数字病理学	骨癌	深度学习	深度卷积神经网络	图像	训练集来自纽约大学，外部验证集来自查尔斯大学
672	2024-11-21	Modeling gene interactions in polygenic prediction via geometric deep learning 2024-Nov-19, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.279694.124 PMID:39562137	研究论文	本文提出了一种基于几何深度学习的基因相互作用建模框架PRS-Net，用于增强复杂疾病的遗传风险预测和生物学发现	PRS-Net通过图神经网络显式地建模基因间的非线性关系，并引入注意力读出模块以增强模型的可解释性	NA	提高复杂疾病的遗传风险预测准确性和生物学发现的解释性	复杂疾病的遗传风险和基因间的相互作用	机器学习	NA	几何深度学习	图神经网络	基因数据	NA
673	2024-11-21	A statistical analysis for deepfake videos forgery traces recognition followed by a fine-tuned InceptionResNetV2 detection technique 2024-Nov-19, Journal of forensic sciences IF:1.5Q2 DOI:10.1111/1556-4029.15665 PMID:39562484	研究论文	本文提出了一种基于统计分析和深度学习技术的深伪视频检测方法	本文创新性地使用了欧几里得距离变化概率评分值来直接评估深伪视频的真实性，并通过微调InceptionResNetV2模型提高了检测准确率	NA	研究目的是开发一种高效准确的深伪视频检测技术	深伪视频	计算机视觉	NA	深度学习	InceptionResNetV2	视频	使用了FaceForensics++和CelebDF数据集进行训练和测试
674	2024-11-21	Automated Single Cell Phenotyping of Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry Tissue Images 2024-Nov-19, Journal of the American Society for Mass Spectrometry IF:3.1Q1 DOI:10.1021/jasms.4c00328 PMID:39563098	研究论文	本文介绍了使用深度学习技术对时间飞行二次离子质谱组织图像进行自动单细胞表型分析的方法	开发了MIBIsight工作流程，利用深度学习技术处理包含数千个细胞的图像，生成易于理解的报告和图表	NA	旨在通过深度学习技术简化复杂数据集的分析，以便更好地理解细胞在疾病研究中的作用	时间飞行二次离子质谱组织图像中的单细胞表型	计算机视觉	NA	时间飞行二次离子质谱（ToF-SIMS）	深度学习（DL）	图像	数千个细胞
675	2024-11-21	Preparing for downstream tasks in AI for dental radiology: a baseline performance comparison of deep learning models 2024-Nov-19, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twae056 PMID:39563402	研究论文	比较卷积神经网络（CNN）、视觉变换器（ViT）和门控多层感知器（gMLP）在牙科放射影像分类中的性能	视觉变换器和门控多层感知器在牙科放射影像分类中表现出与卷积神经网络相当的性能	NA	比较不同深度学习模型在牙科放射影像分类中的性能	牙科放射影像的分类任务，包括上颌窦、上颌和下颌切牙、颏孔的存在与否以及下颌第三磨牙与下颌神经管的位置关系	计算机视觉	NA	NA	CNN, ViT, gMLP	图像	从锥束计算机断层扫描体积中提取的二维图像用于训练模型
676	2024-11-21	Exploring protein natural diversity in environmental microbiomes with DeepMetagenome 2024-Nov-18, Cell reports methods IF:4.3Q2 DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100896 PMID:39515333	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的Python方法DeepMetagenome，用于探索环境微生物群中的蛋白质自然多样性	DeepMetagenome通过深度学习模型从宏基因组/蛋白质组中检测蛋白质多样性，无需先验假设，并成功识别了高置信度的金属硫蛋白序列	NA	探索环境微生物群中的蛋白质自然多样性	金属硫蛋白及其他三种蛋白质家族的多样性	机器学习	NA	深度学习	CNN, LSTM, Transformer	序列数据	超过14600万编码特征的数据库
677	2024-11-21	Uncovering the predictive and immunomodulatory potential of transient receptor potential melastatin family-related CCNE1 in pan-cancer 2024-Nov-18, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02169-7 PMID:39551726	研究论文	研究探讨了TRPM家族成员CCNE1在泛癌中的预测和免疫调节潜力	首次创建了TRPM家族成员相关的TRPM-Score，并发现CCNE1作为泛癌中的重要生物标志物	NA	探索新的分子生物标志物以改进癌症治疗和早期检测	TRPM家族成员及其在17种实体瘤中的作用	数字病理学	泛癌	机器学习和深度学习计算技术	NA	NA	17种实体瘤样本
678	2024-11-17	Correction: Multiparametric MRI based deep learning model for prediction of early recurrence of hepatocellular carcinoma after SR following TACE 2024-Nov-16, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-024-06027-3 PMID:39547976	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
679	2024-11-21	Wind power prediction based on deep learning models: The case of Adama wind farm 2024-Nov-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39579 PMID:39559238	研究论文	本文研究了基于深度学习模型的风力发电预测，以埃塞俄比亚的阿达玛风电场为例	本文首次为阿达玛风电场开发了基于深度学习的风力发电预测模型，并比较了LSTM、Bi-LSTM和GRU三种模型的性能	本文仅使用了阿达玛风电场的数据，未考虑其他风电场的数据，可能影响模型的泛化能力	开发一种准确可靠的风力发电预测模型，以帮助能源规划者和区域电力供应商计算电力生产和能源生成	阿达玛风电场的风力发电量	机器学习	NA	深度学习	LSTM, Bi-LSTM, GRU	时间序列数据	四年数据，共163,802行，每5分钟记录一次
680	2024-11-21	dsRNAPredictor-II: An improved predictor of identifying dsRNA and its silencing efficiency for Tribolium castaneum based on sequence length distribution 2024-Nov-09, Methods (San Diego, Calif.) DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.007 PMID:39528092	研究论文	本文通过优化现有模型dsRNAPredictor，设计基于不同序列长度的子模型，建立了一个深度学习模型来预测dsRNA的沉默效率	本文通过设计基于不同序列长度的子模型，优化了现有模型dsRNAPredictor，提高了预测dsRNA沉默效率的性能和鲁棒性	NA	建立一个深度学习模型，帮助研究人员识别具有最高RNAi效率的dsRNA片段	dsRNA的序列长度分布及其沉默效率	机器学习	NA	NA	卷积神经网络	序列	数据分为两组：130-399 bp和400-616 bp长的序列