深度学习在生物医药领域的应用
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当前共找到 1137 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Generative Biomedical Event Extraction With Constrained Decoding Strategy
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3480088
PMID:39401115
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研究论文 | 提出基于T5预训练语言模型的生物医学事件生成方法，采用约束解码策略和课程学习算法 | 首次将序列到序列生成范式应用于生物医学事件抽取，引入约束解码算法指导序列生成 | 仅在Genia 2011和Genia 2013两个数据集上验证，未在其他生物医学数据集测试 | 解决传统抽取式方法存在的级联错误问题，提升生物医学事件抽取性能 | 生物医学事件 | 自然语言处理 | NA | 序列到序列生成，约束解码，课程学习 | T5 | 文本 | Genia 2011和Genia 2013两个公共基准数据集 | NA | T5 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Enhancing Autism Spectrum Disorder identification in multi-site MRI imaging: A multi-head cross-attention and multi-context approach for addressing variability in un-harmonized data
2024-11, Artificial intelligence in medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.artmed.2024.102998
PMID:39442245
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研究论文 | 提出一种多头部交叉注意力和多上下文框架，用于解决多站点MRI数据中的扫描仪差异问题，以增强自闭症谱系障碍的识别 | 提出CCMSMCF框架整合多头部注意力跨尺度模块和残差多上下文模块，实现一定程度的数据内部协调，使其对扫描仪和站点不敏感 | 方法在完全未协调数据上的泛化能力仍需进一步验证 | 开发能够跨不同扫描仪和站点有效工作的自闭症谱系障碍识别模型 | 自闭症谱系障碍患者的多站点fMRI数据 | 医学影像分析 | 自闭症谱系障碍 | fMRI功能连接性分析 | 深度学习 | MRI图像 | ABIDE-I数据集中的多站点多扫描仪数据 | NA | 多头部注意力跨尺度模块(MHACSM), 残差多上下文模块(RMCN) | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Use of Artificial Intelligence in Cobb Angle Measurement for Scoliosis: Retrospective Reliability and Accuracy Study of a Mobile App
2024-11-01, Journal of medical Internet research
IF:5.8Q1
DOI:10.2196/50631
PMID:39486021
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研究论文 | 评估基于深度学习的移动AI应用在脊柱侧凸Cobb角自动测量中的可靠性和准确性 | 开发了完全自动化的Cobb角测量AI应用，无需医生手动测量，消除了观察者间差异性 | 回顾性研究，样本仅来自单一医疗中心 | 验证AI应用在脊柱侧凸Cobb角自动测量中的性能 | 脊柱侧凸患儿的脊柱X光片 | 医学影像分析 | 脊柱侧凸 | X射线成像 | 深度学习 | X光图像 | 601名患儿（89名男性，512名女性），802张全脊柱X光片 | NA | NA | Bland-Altman检验，组内相关系数(ICC)，绝对误差，一致性界限(LoAs) | 移动应用 |
| 84 | 2025-10-06 |
MMD-DTA: A Multi-Modal Deep Learning Framework for Drug-Target Binding Affinity and Binding Region Prediction
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3451985
PMID:39208057
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研究论文 | 提出一种多模态深度学习框架MMD-DTA，用于预测药物-靶点结合亲和力及结合区域 | 通过无监督学习同时预测结合亲和力和结合区域，整合药物和靶点的序列与结构多模态信息 | NA | 预测药物-靶点结合亲和力及识别结合区域 | 药物分子和靶点蛋白 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图神经网络 | 序列数据, 结构数据 | NA | NA | 图神经网络, 目标结构特征提取网络 | 关键评估指标 | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Multi-modality deep learning-based [68Ga]Ga-DOTA-FAPI-04 PET polar map generation: potential value in detecting reactive fibrosis after myocardial infarction
2024-Nov, European journal of nuclear medicine and molecular imaging
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s00259-024-06850-3
PMID:39060373
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研究论文 | 本研究开发了一种基于多模态深度学习的[68Ga]Ga-DOTA-FAPI-04 PET极坐标图生成方法，用于检测心肌梗死后反应性纤维化 | 提出融合多模态图像补偿PET图像中心脏结构信息丢失的深度学习方法，提高极坐标图生成准确性 | 样本量相对有限（87例患者），需要进一步验证 | 提高[68Ga]Ga-DOTA-FAPI-04 PET极坐标图生成准确性，探索其在检测心肌梗死后反应性纤维化中的价值 | 87例ST段抬高型心肌梗死患者 | 医学影像分析 | 心血管疾病 | PET/MR成像，深度学习 | 深度学习模型 | 多模态医学影像（PET/MR图像） | 87例患者的133对[68Ga]Ga-DOTA-FAPI-04 PET/MR图像，其中26例用于纵向分析 | NA | NA | 准确性，相关系数（LVESV%, LVEDV%, LVEF%） | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Enhancing the diagnostic capacity of [18F]PSMA-1007 PET/MRI in primary prostate cancer staging with artificial intelligence and semi-quantitative DCE: an exploratory study
2024-Nov-08, EJNMMI reports
DOI:10.1186/s41824-024-00225-5
PMID:39510993
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研究论文 | 探索人工智能和半定量DCE分析在增强[18F]PSMA-1007 PET/MRI对原发性前列腺癌分期诊断能力中的应用 | 首次将深度学习管道与半定量DCE分析结合应用于PSMA-放射性配体PET/MRI，提高前列腺癌诊断准确性 | 样本量较小（仅7例患者），属于探索性研究 | 提高原发性前列腺癌分期的诊断能力 | 原发性前列腺癌患者 | 数字病理 | 前列腺癌 | PET/MRI, DCE-MRI, DWI, T2加权成像 | 深度学习 | 医学影像 | 7例前列腺癌患者 | NA | NA | DICE系数 | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Multimodal Artificial Intelligence in Medicine
2024-Nov-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000000000000556
PMID:39167446
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综述 | 本文探讨了多模态人工智能在医学领域的应用、优势及面临的挑战 | 提出多模态Transformer模型能够有效处理医疗领域中的文本、图像和结构化数据等多模态数据 | 多模态人工智能模型的临床应用面临伦理和环境挑战 | 研究多模态人工智能在医学诊断和治疗中的应用潜力 | 医疗多模态数据（文本、图像、结构化数据） | 自然语言处理,计算机视觉,机器学习 | NA | 多模态深度学习 | Transformer | 文本,图像,结构化数据 | NA | NA | Transformer | 美国医师执照考试题库基准测试 | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Accurate de novo design of high-affinity protein binding macrocycles using deep learning
2024-Nov-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.622547
PMID:39605685
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研究论文 | 提出基于深度学习的RFpeptides流程，用于从头设计高亲和力蛋白结合大环化合物 | 首次开发基于去噪扩散模型的蛋白结合大环化合物设计方法，无需大规模筛选即可精确控制结合模式 | 仅测试了四种不同蛋白目标，样本规模有限 | 开发高效的大环肽配体设计方法用于诊断和治疗应用 | 蛋白结合大环化合物 | 机器学习 | NA | 去噪扩散模型 | 扩散模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 针对4种不同蛋白质各测试不超过20个大环化合物设计 | NA | RFpeptides | 结合亲和力(Kd), 半数抑制浓度(IC50), Ca RMSD | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Promoted production of Fe(IV)/Fe(V) intermediates in the calcium peroxide/ferrate(VI) process for low-damage removal of algal contaminants and membrane fouling control
2024-11-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.135709
PMID:39236536
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研究论文 | 本研究创新性地将过氧化钙与高铁酸盐耦合用于超滤过程中藻类污染物的低损伤去除和膜污染控制 | 首次将过氧化钙与高铁酸盐耦合，促进Fe(IV)/Fe(V)中间体生成，实现藻类污染物的低损伤去除和膜污染控制 | NA | 开发一种新的膜污染控制方法，从促进Fe(IV)/Fe(V)中间体生成的角度控制藻类膜污染 | 藻类污染物和超滤膜污染 | 环境工程 | NA | 超滤技术，化学氧化技术 | LSTM | 过滤过程数据 | NA | NA | 长短期记忆深度学习网络 | 过滤体积预测 | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Generative adversarial networks accurately reconstruct pan-cancer histology from pathologic, genomic, and radiographic latent features
2024-Nov-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq0856
PMID:39546597
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研究论文 | 开发并验证了能够从病理、基因组和影像学潜在特征重建癌症组织学的生成对抗网络HistoXGAN | 首次提出能够从多种特征提取器生成的特征向量重建代表性组织学的定制生成对抗网络，并展示了从影像学图像重建肿瘤组织学的虚拟活检能力 | 对生成特征生物学意义的理解仍然具有挑战性 | 开发能够从多模态特征重建癌症组织学的人工智能模型 | 29种癌症亚型的组织学图像 | 数字病理 | 泛癌种 | 生成对抗网络 | GAN | 组织学图像, 基因组数据, 影像学图像 | 29种癌症亚型 | NA | HistoXGAN | 肿瘤分级保留度, 组织学亚型保留度, 基因表达模式保留度 | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Leveraging Deep Learning of Chest Radiograph Images to Identify Individuals at High Risk for Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2024-Nov-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.11.14.24317055
PMID:39606360
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研究论文 | 本研究通过深度学习分析常规胸部X光片，识别慢性阻塞性肺疾病高风险个体 | 将已开发的CXR-Lung-Risk卷积神经网络模型应用于COPD风险预测，并在外部验证中证明其超越传统临床风险评分的预测价值 | 研究基于特定医疗机构的门诊患者数据，需进一步验证在其他人群中的适用性 | 评估深度学习模型在胸部X光片上识别COPD高风险个体的能力 | 无肺癌、COPD或肺气肿的门诊患者，包括有吸烟史和无吸烟史人群 | 计算机视觉 | 慢性阻塞性肺疾病 | 胸部X光成像 | CNN | 图像 | 主要分析：27,848人（12,550名有吸烟史者，15,298名无吸烟史者）；次要分析：2,097人 | NA | CXR-Lung-Risk | AUC | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Dynamic modulation of social gaze by sex and familiarity in marmoset dyads
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.16.580693
PMID:38405818
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研究论文 | 开发了一种新框架来追踪自由活动的狨猴面部特征和三维头部注视方向，并研究性别和熟悉度对社交注视行为的影响 | 结合深度学习计算机视觉工具与三角测量算法，首次实现了对自由活动狨猴的3D头部注视方向追踪，克服了传统方法需要限制头部运动的局限 | 研究仅针对狨猴这一物种，方法在严重遮挡情况下可能仍存在挑战 | 量化灵长类动物在自然状态下的社交注视行为，探究社会因素对注视动态的影响 | 普通狨猴成对组合 | 计算机视觉 | NA | 深度学习，三角测量算法，3D几何面部框架构建 | CNN | 视频，图像 | 多对狨猴组合 | 深度学习计算机视觉工具 | NA | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Natural Language Processing of Clinical Documentation to Assess Functional Status in Patients With Heart Failure
2024-11-04, JAMA network open
IF:10.5Q1
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研究论文 | 开发并验证一种深度学习自然语言处理策略，用于从非结构化临床文档中提取心力衰竭患者的功能状态评估 | 首次开发专门用于从临床文档中提取NYHA分级和心衰症状的深度学习NLP模型，将功能状态评估的可提取比例提高了83% | 研究数据仅来自美国康涅狄格州的三个医疗网络，可能限制模型的泛化能力 | 开发自然语言处理工具从临床文档中自动提取心衰患者功能状态信息 | 34,070名心力衰竭患者的电子健康记录数据 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 自然语言处理 | 深度学习 | 文本 | 34,070名患者，182,308份未标注文档和3,000份专家标注文档 | NA | NA | AUROC | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2024-Nov-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.11.18.24317499
PMID:39606364
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，增强了阿尔茨海默病相关表型的空间信息细胞类型特异性差异基因表达分析能力 | 首次将空间转录组数据与单核RNA测序数据整合，实现了皮层层级特异性细胞类型差异基因表达分析 | 研究基于死后脑组织样本，可能无法完全反映活体状态；空间位置是通过深度学习工具推断而非直接测量 | 提升阿尔茨海默病相关表型的空间信息差异基因表达分析能力 | 436例死后大脑背外侧前额叶皮层组织的约150万个细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单核RNA测序，深度学习 | 深度学习 | 基因表达数据，空间位置数据 | 436个死后大脑样本，约150万个细胞 | CelEry | NA | p值，基因集富集分析 | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
In vivo evaluation of complex polyps with endoscopic optical coherence tomography and deep learning during routine colonoscopy: a feasibility study
2024-11-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78891-5
PMID:39537775
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研究论文 | 本研究评估了内窥镜光学相干断层扫描结合深度学习在常规结肠镜检查中评估复杂结直肠息肉的可行性 | 开发了用于成人结肠镜的侧视OCT导管，并在常规结肠镜检查中实现了实时诊断，不仅区分良恶性病变，还区分多种组织学亚型息肉 | 样本量较小（35个息肉），仅为可行性研究 | 评估内窥镜OCT结合深度学习在结肠镜检查中评估结直肠息肉深部浸润的可行性 | 接受内镜治疗的大型结直肠息肉患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 内窥镜光学相干断层扫描，组织病理学 | 深度学习模型 | OCT图像 | 32名患者的35个息肉 | NA | NA | AUROC, Cohen's kappa | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
A wearable echomyography system based on a single transducer
2024-Nov, Nature electronics
IF:33.7Q1
DOI:10.1038/s41928-024-01271-4
PMID:40677283
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研究论文 | 开发了一种基于单个换能器的可穿戴回声肌电图系统，用于肌肉活动的无线监测和手势识别 | 采用单个定制换能器替代复杂的换能器阵列，实现了小型化、低功耗的可穿戴回声肌电图系统 | NA | 开发可穿戴肌肉活动监测系统，用于健康监测和身体运动追踪 | 膈肌活动和前臂肌肉的手势识别 | 生物医学工程 | NA | 回声肌电图，超声波检测 | 深度学习算法 | 射频数据，超声波信号 | NA | NA | NA | 平均误差7.9° | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
ViViEchoformer: Deep Video Regressor Predicting Ejection Fraction
2024-Nov-25, Journal of imaging informatics in medicine
DOI:10.1007/s10278-024-01336-y
PMID:39586913
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研究论文 | 提出一种基于视频视觉变换器的深度学习模型ViViEchoformer，用于从超声心动图视频直接预测射血分数 | 首次将视频视觉变换器应用于超声心动图视频分析，通过提取时空标记直接回归左心室功能 | 仅使用单一医疗中心的数据集，需要进一步多中心验证 | 开发自动量化左心室功能的深度学习模型，辅助人类评估 | 左心室射血分数和心力衰竭伴射血分数降低 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 超声心动图 | Transformer | 视频 | 10,030个心尖四腔心切面超声心动图视频 | NA | 视频视觉变换器 | 平均绝对误差,均方根误差,均方对数误差,R²,曲线下面积,准确率 | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
A deep learning feature importance test framework for integrating informative high-dimensional biomarkers to improve disease outcome prediction
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae709
PMID:39815828
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研究论文 | 提出一种用于整合高维生物标志物的深度学习特征重要性测试框架，以提升疾病结局预测能力 | 开发了高维特征重要性测试（HdFIT）框架，结合特征筛选和机器学习建模，能有效识别关键生物标志物并处理高维数据中的复杂关联 | 未明确说明框架在特定疾病类型或数据规模下的适用性限制 | 通过整合低维行为临床特征与高维分子特征来改进疾病结局预测和诊断 | 人类疾病相关的行为、临床和分子因素 | 机器学习 | NA | 蒙特卡洛实验，微生物组研究 | 深度学习神经网络 | 高维分子特征数据，低维行为临床特征数据 | NA | NA | 深度神经网络 | 预测准确率，特征识别能力 | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Comparison of Three Computational Tools for the Prediction of RNA Tertiary Structures
2024-Nov-08, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna10060055
PMID:39585047
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研究论文 | 比较三种计算工具在预测RNA三级结构方面的性能 | 首次系统比较RNAComposer、Rosetta FARFAR2和最新AlphaFold 3在预测不同类型RNA三级结构方面的表现 | 在预测人类前微RNA和较大BioRNA分子的远端环结构时存在显著差异，且这些分子的三维结构尚未通过实验表征 | 评估不同计算工具在RNA三级结构预测中的实用性和准确性 | 非编码RNA，包括小干扰RNA药物nedosiran和新型生物工程RNA分子 | 计算生物学 | NA | RNA三级结构预测 | 深度学习, 分子动力学 | RNA序列, 二级结构 | 多种RNA形式，包括小干扰RNA、孔雀石绿适体、tRNA、人类前微RNA和BioRNA分子 | AlphaFold 3, Rosetta FARFAR2, RNAComposer | NA | 结构相似性比较 | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
The global evolution and impact of systems biology and artificial intelligence in stem cell research and therapeutics development: a scoping review
2024-11-05, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxae054
PMID:39230167
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综述 | 通过范围综述分析系统生物学和人工智能在干细胞研究和治疗开发中的全球演变历程与影响 | 首次系统梳理2000-2024年间系统生物学和人工智能在干细胞研究领域的全球发展趋势和区域分布特征 | 仅基于PubMed数据库文献，未涵盖其他学术资源；时间跨度较大可能导致早期文献收录不全 | 评估系统生物学和人工智能在干细胞研究及治疗开发中的贡献和发展轨迹 | PubMed数据库中2000-2024年发表的干细胞研究相关文献 | 生物信息学 | NA | 系统生物学分析，机器学习，深度学习 | NA | 文献元数据 | 涵盖2000-2024年PubMed数据库相关文献 | NA | NA | 文献数量统计，增长倍数分析 | NA |