深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1981	2025-01-29	Synergizing CRISPR-Cas9 with Advanced Artificial Intelligence and Machine Learning for Precision Drug Delivery: Technological Nexus and Regulatory Insights 2025-Jan-06, Current gene therapy IF:3.8Q2 DOI:10.2174/0115665232342293241120033251 PMID:39871553	研究论文	本文探讨了CRISPR-Cas9技术与先进人工智能和机器学习在精准药物递送中的协同作用，并提供了技术结合和监管见解	结合CRISPR-Cas9与AI/ML技术，优化基因编辑实验并预测结果，推动精准药物递送的发展	面临脱靶效应、病毒载体引发的免疫反应以及生殖系编辑的伦理问题等挑战	探索CRISPR-Cas9与AI/ML技术在精准药物递送中的应用，并解决相关技术挑战和监管问题	CRISPR-Cas9系统、AI/ML模型（如DeepCRISPR）、基因编辑实验	基因编辑与人工智能	镰状细胞病、β-地中海贫血	CRISPR-Cas9、深度学习	DeepCRISPR	基因数据	NA
1982	2025-01-29	Research on grading detection methods for diabetic retinopathy based on deep learning 2025-Jan, Pakistan journal of medical sciences IF:1.2Q2 DOI:10.12669/pjms.41.1.9171 PMID:39867796	研究论文	本文设计了一种基于深度学习的模型，用于糖尿病视网膜病变的早期筛查，并提供可解释的判断依据	采用Vision Transformer架构，结合公开的EyePACS数据集进行训练，并在预测病变区域方面表现优异	模型仅在IDRiD数据集的两个子集上进行了验证，可能需要更多样化的数据集进一步验证其泛化能力	实现糖尿病视网膜病变的早期筛查并提供可解释的诊断依据	糖尿病视网膜病变患者的眼底图像	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	深度学习	Vision Transformer	图像	使用EyePACS数据集进行训练，并在IDRiD数据集的两个子集上进行验证
1983	2025-01-29	Nanopore sequencing to detect A-to-I editing sites 2025, Methods in enzymology DOI:10.1016/bs.mie.2024.11.028 PMID:39870444	研究论文	本文介绍了使用纳米孔直接RNA测序技术结合深度学习模型Dinopore来检测A-to-I RNA编辑位点	利用纳米孔直接RNA测序技术结合深度学习模型Dinopore，直接检测A-to-I RNA编辑位点，避免了传统方法的间接性和混淆问题	NA	检测A-to-I RNA编辑位点，以研究其在生物体中的编辑景观	A-to-I RNA编辑位点	生物信息学	NA	纳米孔直接RNA测序	深度学习模型Dinopore	RNA序列数据	NA
1984	2025-01-29	Deep Learning MRI Reconstruction Delivers Superior Resolution and Improved Diagnostics 2025-Jan, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.242952 PMID:39873600	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1985	2025-01-29	Deep Learning Superresolution for Simultaneous Multislice Parallel Imaging-Accelerated Knee MRI Using Arthroscopy Validation 2025-Jan, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.241249 PMID:39873603	研究论文	本研究验证了深度学习超分辨率MRI在膝关节成像中的诊断性能，并与传统的加速MRI进行了比较	使用深度学习超分辨率技术提升加速MRI的图像质量，并通过关节镜检查作为独立参考标准进行验证	研究样本量相对较小（116名成人），且仅在膝关节成像中进行了验证	验证深度学习超分辨率MRI在膝关节成像中的诊断性能	患有膝关节疼痛的成人患者	医学影像	膝关节疾病	深度学习超分辨率技术	深度学习模型	MRI图像	116名成人（平均年龄45岁，74名男性）
1986	2025-01-28	Harnessing Spectral Libraries From AVIRIS-NG Data for Precise PFT Classification: A Deep Learning Approach 2025-Jan-27, Plant, cell & environment DOI:10.1111/pce.15393 PMID:39866067	研究论文	本研究利用AVIRIS-NG高光谱数据和机器学习技术，开发了一个包含130种植物物种的光谱库，用于精确分类植物功能类型（PFTs）	通过高光谱数据生成光谱库，结合机器学习方法，显著提高了植物功能类型分类的准确性	研究仅限于Shoolpaneshwar野生动物保护区的植物物种，可能不适用于其他地区	推进植物功能类型（PFTs）的分类和监测	Shoolpaneshwar野生动物保护区的130种植物物种	机器学习	NA	AVIRIS-NG高光谱成像和ASD手持光谱辐射计	Parzen Window (PW), Gradient Boosted Machine (GBM), Stochastic Gradient Descent (SGD)	高光谱图像	130种植物物种
1987	2025-01-28	Introduction to Memristive Mechanisms and Models 2025-Jan-24, Recent patents on nanotechnology IF:2.0Q3 DOI:10.2174/0118722105327900250115102034 PMID:39865807	研究论文	本文介绍了忆阻系统的机制和模型，探讨了其在神经形态计算中的应用	本文结合了Chua开发的动态系统框架和统计物理学及渗流理论，提供了对忆阻系统复杂动态行为的深入理解，并探讨了其在深度学习方法中的成功应用	本文主要关注理论模型和框架，缺乏对实际硬件实现的详细讨论	探讨忆阻系统在神经形态计算中的应用，以应对人工智能发展带来的计算能力需求增长	忆阻系统及其在神经形态计算中的应用	机器学习	NA	NA	动态系统模型、渗流理论模型	NA	NA
1988	2025-01-28	Deep learning for kidney trauma detection: CT image algorithm performance and external validation: experimental study 2025-Jan-24, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002221 PMID:39869390	研究论文	本研究开发并验证了一种用于检测肾脏创伤的深度学习算法，使用机构创伤数据和RSNA数据集进行外部验证	首次将深度学习技术应用于肾脏创伤的CT图像检测，并通过外部验证展示了其稳健性能	模型在外部验证中的阳性预测值较低，可能需要进一步优化图像分割和计算效率	开发并验证一种用于检测肾脏创伤的深度学习算法	肾脏创伤的CT图像	医学影像	肾脏创伤	深度学习	RenoTrNet	CT图像	机构创伤数据和RSNA数据集中的随机选择病例
1989	2025-01-28	MythicVision: a deep learning powered mobile application for understanding Indian mythological deities using weight centric decision approach 2025-Jan-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85922-2 PMID:39837968	研究论文	本文介绍了一个名为'MythicVision'的深度学习驱动的移动应用程序，旨在通过识别和解释印度神话神祇的图像，帮助外国游客更好地理解印度丰富的文化遗产	该应用程序采用了模型权重计算和权重中心决策机制，相比传统的多数投票方法，在多类图像分类中提供了更准确的结果	NA	开发一个能够识别和分类实时印度神祇图像，并为用户提供有关神祇的宝贵信息的应用程序	印度神话神祇的图像	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	10,970张印度神祇图像
1990	2025-01-28	Decoding the Functional Interactome of Non-Model Organisms with PHILHARMONIC 2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.25.620267 PMID:39553947	研究论文	本文介绍了一种名为PHILHARMONIC的计算方法，用于解码非模式生物的功能互作组	PHILHARMONIC结合深度学习网络推理和鲁棒的无监督谱聚类算法，能够揭示非模式生物中的功能关系和高层次组织	方法依赖于预测的网络，可能存在噪声，且需要进一步的实验验证	研究目的是开发一种计算工具，用于预测和分析非模式生物的蛋白质-蛋白质相互作用网络	研究对象包括珊瑚、藻类共生体和果蝇等非模式生物	生物信息学	NA	深度学习、谱聚类算法、远程同源功能注释	深度学习网络	蛋白质序列数据	珊瑚、藻类共生体和果蝇的蛋白质组数据
1991	2025-01-28	Non-Contact Optical Blood Pressure Biometry Using AI-Based Analysis of Non-Mydriatic Fundus Imaging 2025-Jan-07, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2025.01.06.25320084 PMID:39830244	研究论文	本研究旨在开发一种基于机器学习的模型，通过非散瞳眼底成像来评估血压，其准确性与臂式袖带测量相当	使用深度学习模型从眼底图像中评估血压，相比传统臂式袖带测量，可能更能反映长期高血压状况	需要在临床环境中进行更多试验，并开展更多前瞻性研究以验证结果	开发一种基于机器学习的模型，通过非散瞳眼底成像来评估血压	血压（收缩压和舒张压）	机器学习	高血压	深度学习	深度学习模型	眼底图像	基于UK Biobank数据集
1992	2025-01-27	Generalization Analysis of Transformers in Distribution Regression 2025-Jan-21, Neural computation IF:2.7Q3 DOI:10.1162/neco_a_01726 PMID:39556504	研究论文	本文提出了一个基于分布回归的transformer学习框架，并引入了一种称为注意力算子的数学公式，展示了transformer如何在不丢失信息的情况下将分布压缩为函数表示	提出了一个新颖的注意力算子，并证明了transformer在复杂结构函数学习上优于卷积神经网络和全连接网络	缺乏实际应用验证，理论结果尚未通过实验验证	研究transformer及其相关技术背后的机制，特别是在分布回归中的应用	transformer模型及其在分布回归中的应用	机器学习	NA	NA	transformer	分布数据	NA
1993	2025-01-27	Automated quantification of Enchytraeus crypticus juveniles in different soil types using RootPainter 2025-Jan-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117482 PMID:39662459	研究论文	本研究探讨了使用RootPainter工具自动量化不同土壤类型中Enchytraeus crypticus幼体的可行性	首次将RootPainter工具应用于Enchytraeus crypticus幼体的自动量化，减少了人工计数的耗时和主观性	研究仅使用了五种农药和四种土壤类型，可能无法涵盖所有可能的土壤和农药组合	研究目的是验证RootPainter工具在土壤毒性测试中自动量化Enchytraeus crypticus幼体的准确性和可靠性	Enchytraeus crypticus幼体	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）	CNN	图像	五种农药和四种土壤类型的测试样本
1994	2025-01-27	Breath-hold diffusion-weighted MR imaging (DWI) using deep learning reconstruction: Comparison with navigator triggered DWI in patients with malignant liver tumors 2025-Jan, Radiography (London, England : 1995) DOI:10.1016/j.radi.2024.11.027 PMID:39667265	研究论文	本研究探讨了使用深度学习重建的单次屏气扩散加权磁共振成像（BH-DWI）在恶性肝肿瘤患者中的可行性，并与导航触发的扩散加权成像（NT-DWI）进行了比较	首次将深度学习重建技术应用于单次屏气扩散加权磁共振成像，并与传统的导航触发扩散加权成像进行比较	研究样本量有限，且未考虑患者对屏气时间的耐受性	比较单次屏气扩散加权磁共振成像与导航触发扩散加权成像在恶性肝肿瘤患者中的成像质量和效果	恶性肝肿瘤患者	医学影像	肝癌	扩散加权磁共振成像（DWI）	深度学习重建（DLR）	磁共振图像	91名患者
1995	2025-01-27	MCBERT: A multi-modal framework for the diagnosis of autism spectrum disorder 2025-Jan, Biological psychology IF:2.7Q2 DOI:10.1016/j.biopsycho.2024.108976 PMID:39722324	研究论文	本文提出了一种名为MCBERT的多模态框架，用于自闭症谱系障碍（ASD）的诊断	提出了一种结合BERT和MCNN的多模态架构，用于ASD诊断，并引入了两种注意力机制来捕捉空间和通道特征	研究仅使用了ABIDE-I数据集，可能限制了模型的泛化能力	开发一种多模态框架以提高ASD诊断的准确性	自闭症谱系障碍（ASD）患者	数字病理学	自闭症谱系障碍	深度学习	BERT, MCNN	多模态数据（包括脑图像和功能MRI数据）	ABIDE-I数据集
1996	2025-01-27	Identifying protected health information by transformers-based deep learning approach in Chinese medical text 2025 Jan-Mar, Health informatics journal IF:2.2Q3 DOI:10.1177/14604582251315594 PMID:39862116	研究论文	本文提出了一种基于BERT的深度学习算法，用于识别中文临床文本中的隐私信息，并验证了该方法在中国临床环境中隐私保护的可行性	首次将BERT模型与BiLSTM-CRF结合，用于中文临床文本中的隐私信息识别，并展示了显著的性能提升	研究仅基于中国某市级区域健康信息平台的数据，可能无法完全代表其他地区或国家的临床文本特征	开发一种有效的深度学习模型，用于识别和保护中文临床文本中的隐私信息	中文临床文本中的隐私信息	自然语言处理	NA	BERT, BiLSTM, CRF	BERT-based BiLSTM-CRF	文本	33,017份出院摘要，来自151家医疗机构
1997	2025-01-26	Deep learning analyses of splicing variants identify the link of PCP4 with amyotrophic lateral sclerosis 2025-Jan-24, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1 DOI:10.1093/brain/awaf025 PMID:39852553	研究论文	本研究开发了基于深度学习的Spliformer模型，用于预测RNA剪接，并揭示了PCP4与肌萎缩侧索硬化症（ALS）的关联	开发了Spliformer和Spliformer-motif模型，能够准确预测和解释pre-mRNA剪接，并发现了与ALS相关的罕见剪接变异	研究主要依赖于计算模型预测，实验验证部分仍需进一步扩展	研究目的是通过深度学习模型预测RNA剪接，并探索ALS的遗传机制	研究对象包括ALS患者和对照组的全基因组测序数据、RNA-seq数据以及Clinvar数据集	自然语言处理	肌萎缩侧索硬化症	RNA-seq、全基因组测序（WGS）、minigene实验	Transformer	基因组数据、RNA-seq数据	1,370名ALS患者的全基因组测序数据
1998	2025-01-26	Artificial Intelligence Revolution in Pharmaceutical Sciences: Advancements, Clinical Impacts, and Applications 2025-Jan-23, Current pharmaceutical biotechnology IF:2.2Q3 DOI:10.2174/0113892010356115241224104018 PMID:39851128	综述	本文综述了人工智能在药物科学领域的革命性进展、临床影响及应用	探讨了AI在药物发现、开发过程中的应用，特别是在固体剂型开发中的创新，以及3D打印技术在个性化治疗中的应用	未具体提及研究的局限性	探讨人工智能在药物科学和医疗保健中的应用及其对提高生产效率和个性化医疗的贡献	药物发现与开发过程、个性化治疗、疾病诊断与预测	机器学习	NA	深度学习、神经网络	NA	复杂生物数据	NA
1999	2025-01-26	Research on the improvement method of imbalance of ground penetrating radar image data 2025-Jan-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87123-3 PMID:39843521	研究论文	本文提出了一种基于生成对抗网络（GAN）的损伤数据扩展方法，以提高地面穿透雷达（GPR）图像数据的分类准确性	提出了一种新的损伤数据扩展方法，通过改进生成器和判别器以及新增编码器，稳定生成损伤样本，从而提高分类网络的准确性	未提及具体的数据集大小和实验环境，可能影响结果的普适性	提高地面穿透雷达图像数据的分类准确性，降低现场数据收集成本	地面穿透雷达图像数据	计算机视觉	NA	生成对抗网络（GAN）	GAN	图像	未提及具体样本数量
2000	2025-01-26	Enhanced streamflow forecasting using hybrid modelling integrating glacio-hydrological outputs, deep learning and wavelet transformation 2025-Jan-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87187-1 PMID:39843529	研究论文	本研究提出了一种结合冰川水文模型输出、深度学习和小波变换的混合建模方法，以提高河流流量预测的准确性	结合冰川水文模型输出与深度学习方法，利用小波变换进行多尺度分析，显著提升了高流量事件的预测精度	缺乏直接测量数据	提高河流流量预测的准确性，以支持洪水风险评估和水资源管理	高山区河流流域的冰雪融化和径流动态	机器学习	NA	深度学习、小波变换	CNN-LSTM	气象数据、冰川水文模型输出	NA