深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
181	2026-01-07	ReHA-Net: a ReVIN-hybrid attention network with multiscale convolution for robust EEG artifact removal in brain-computer interfaces 2025-Dec-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-28855-0 PMID:41345432	研究论文	本文提出了一种名为ReHA-Net的深度学习框架，用于脑电信号中伪影的鲁棒去除	结合了U-Net编码器-解码器结构、混合注意力机制（时空频）、多尺度可分离卷积块以及可逆实例归一化，以增强跨被试泛化能力	未明确提及模型在实时或在线脑机接口系统中的计算效率或延迟表现	开发一种鲁棒的脑电信号去噪方法，以提升脑机接口中信号质量	脑电图信号	机器学习	NA	脑电图	深度学习	时间序列信号	基于增强版EEGdenoiseNet数据集，具体样本量未明确	未明确提及	U-Net	PSNR, SNR, 相关系数, RRMSE	NA
182	2026-01-07	Urban expansion identification and change analysis in Panjin China from 1990 to 2020 2025-Dec-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-29448-7 PMID:41331411	研究论文	本研究利用深度学习模型和时间-光谱-纹理组合优化方法，分析了盘锦市1990年至2020年的城市扩张动态和空间形态变化	提出了一种新颖的深度学习模型和时间-光谱-纹理组合优化方法，用于识别基于像素的土地覆盖变化轨迹，并利用分段线性回归模型确定城市扩张的时间节点	NA	优化城市空间结构并促进可持续发展，通过动态映射不透水表面变化来分析城市扩张	中国盘锦市（一个资源型城市）的城市扩张过程	计算机视觉	NA	深度学习，时间-光谱-纹理组合优化方法，分段线性回归模型	深度学习模型	遥感图像（时间序列的土地覆盖数据）	盘锦市1990年至2020年的土地覆盖数据	NA	NA	轨迹分类准确率，宏观F1分数，城市扩张时间识别准确率	NA
183	2026-01-07	UNet with self-adaptive Mamba-like attention and causal-resonance learning for medical image segmentation 2025-Dec-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-28885-8 PMID:41339647	研究论文	本文提出了一种名为SAMA-UNet的新型U形架构，用于医学图像分割，通过引入自适应Mamba类注意力块和因果共振多尺度模块，在效率和准确性之间取得了更好的平衡	提出了两个关键创新：1. 自适应Mamba类聚合注意力块，通过动态注意力权重自适应整合局部和全局特征；2. 因果共振多尺度模块，通过调整特征分辨率和跨尺度的因果依赖关系，改善编码器-解码器交互	未明确提及具体限制，但暗示了现有状态空间序列模型在医学图像分割中的直接应用有限，主要由于与图像结构不兼容和自回归假设	开发一种能够平衡效率与准确性的医学图像分割模型	医学图像分割任务	数字病理学	NA	深度学习	U-Net	图像	使用了多个公开数据集（BTCV、ACDC、EndoVis17、ATLAS23），但未明确说明总样本数量	NA	U-Net, SAMA-UNet	DSC, NSD	NA
184	2026-01-07	Empowering emotional intelligence through deep learning techniques 2025-Dec-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-29073-4 PMID:41339679	研究论文	本文提出了一种结合多种深度学习模型的多模态情感智能系统，用于增强对人类情感的识别和适应性响应	采用集成深度学习模型（CNN、BERT、RNN、GAN）构建多模态情感智能系统，相比单一模型能更准确地识别和响应情感	未明确说明数据集的样本量、模型泛化能力及在真实世界应用中的潜在挑战	通过深度学习技术提升情感智能，以创建更具同理心和用户导向的AI系统	人类情感（面部表情、文本情绪、时序情感变化）	自然语言处理,计算机视觉,机器学习	NA	深度学习	CNN,BERT,RNN,GAN	图像,文本	Kaggle数据集（包括FER-2013面部表情数据集和标注文本数据）	TensorFlow,Keras,PyTorch	CNN,BERT,RNN,GAN	准确率	NA
185	2025-12-03	Comparing deep learning CNN method with traditional MRI-based hippocampal segmentation and volumetry for early Alzheimer's disease diagnosis across diverse populations 2025-Dec-02, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-29366-8 PMID:41326490	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
186	2026-01-07	Performance of artificial intelligence-based diagnosis and classification of peri-implantitis compared with periodontal surgeon assessment: a pilot study of panoramic radiograph analysis 2025-Dec, Journal of periodontal & implant science DOI:10.5051/jpis.2500280014 PMID:40350773	研究论文	本研究评估了基于深度学习的模型在利用全景X光片诊断和分类种植体周围炎相关骨缺损方面的性能，并与牙周外科医生的评估进行了比较	首次将集成YOLOv8深度学习模型应用于全景X光片，以自动诊断和分类种植体周围炎的骨缺损形态和严重程度，并证明其在整体准确性上优于专业牙周外科医生	数据集规模有限（1075张全景X光片），且仅基于单一模态成像（全景X光片），未来需扩展数据集并整合多模态成像	评估深度学习模型在种植体周围炎骨缺损诊断和分类中的性能，并探索其作为临床决策支持工具的潜力	种植体周围炎患者的全景X光片及相关的骨缺损	计算机视觉	种植体周围炎	全景X光成像	深度学习模型	图像	1075张全景X光片，来自426名患者，共2250个种植体部位	YOLOv8	集成YOLOv8	准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
187	2026-01-07	Evaluating Artificial Intelligence-Assisted Prostate Biparametric MRI Interpretation: An International Multireader Study 2025-Dec, AJR. American journal of roentgenology DOI:10.2214/AJR.24.32399 PMID:40668633	研究论文	评估深度学习AI模型对前列腺双参数MRI解释中前列腺癌检测和读者间一致性的影响	首次在国际多读者研究中评估AI辅助对前列腺双参数MRI解释在病变和患者层面检测前列腺癌及读者间一致性的影响	AI辅助略微降低了病变层面的敏感性，需要进一步优化以提高敏感性而不损害特异性	评估AI模型对前列腺双参数MRI解释中前列腺癌检测准确性和读者间一致性的影响	前列腺双参数MRI扫描	数字病理学	前列腺癌	双参数MRI	深度学习模型	MRI图像	180名患者（120例病例组，60例对照组）	NA	NA	敏感性, PPV, AUC, 读者间一致性（κ系数）, 覆盖概率	NA
188	2026-01-07	How Will AI Shape the Future of Pandemic Response? Early Clues From Data Analytics 2025-Dec, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis IF:3.0Q1 DOI:10.1111/risa.70103 PMID:40926588	综述	本文回顾了人工智能和数据分析在增强大流行防范、应对和恢复方面的10个关键领域，探讨了其潜力与挑战	系统性地分析了AI在疫情响应中的10个关键应用领域，并强调了其在提升预警系统、实时数据分析和流行病模型方面的创新潜力	实施AI在疫情响应中面临重大的伦理和治理挑战，如隐私、公平性和问责制问题	探讨人工智能和数据分析如何塑造未来大流行响应，以增强防范、应对和恢复能力	大流行（特别是COVID-19）的响应系统、预警机制、资源分配和决策过程	机器学习	NA	数据分析和人工智能技术	机器学习, 深度学习	实时数据、流行病学数据	NA	NA	NA	NA	NA
189	2026-01-07	A transfer learning-driven fine-tuning of YOLOv10 for improved brain tumor detection in MRI images 2025-Dec-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-28813-w PMID:41326486	研究论文	本文提出了一种基于YOLOv10的迁移学习微调方法，用于提高MRI图像中脑肿瘤的检测精度	采用迁移学习策略，将预训练于COCO数据集的YOLOv10模型参数微调至脑肿瘤检测任务，显著提升了模型在有限医疗数据下的性能	研究依赖于有限的标记脑肿瘤数据集，可能影响模型在更广泛临床场景中的泛化能力	开发一种自动、高效且精确的脑肿瘤检测系统，以支持计算机辅助诊断	MRI图像中的脑肿瘤	计算机视觉	脑肿瘤	MRI成像	CNN	图像	NA	NA	YOLOv10	mAP, 精度	NA
190	2026-01-07	Quantum resistant blockchain and deep learning revolutionize secure communications for autonomous vehicles 2025-Dec-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-28938-y PMID:41326509	研究论文	提出了一种结合抗量子区块链技术和深度学习的新型架构，以增强智能交通系统中自动驾驶车辆网络的安全性	首次将抗量子区块链与深度学习模型集成，为自动驾驶车辆网络提供针对量子计算威胁的端到端安全通信、数据共享和实时威胁检测解决方案	未详细讨论模型在极端网络条件或大规模攻击下的鲁棒性，也未提及框架在实际部署中的计算开销和延迟影响	解决自动驾驶车辆网络面临的网络安全威胁，特别是量子计算对传统加密防御的挑战，旨在构建安全、高效的智能交通系统	自动驾驶车辆网络、车辆到一切通信、智能交通系统	机器学习	NA	深度学习、区块链技术	深度学习模型	车辆通信数据、交易数据	NA	NA	NA	准确率, 精确率, 召回率, 数据完整性, 吞吐量, 区块验证时间	NA
191	2026-01-07	Automated Retinal Vascular Analysis Reveals Response to Acetazolamide in Idiopathic Intracranial Hypertension 2025-Dec-01, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.14.12.9 PMID:41342622	研究论文	本研究利用深度学习自动分析视网膜血管，评估乙酰唑胺对特发性颅内高压继发视乳头水肿的治疗反应	首次应用深度学习自动化流程量化视网膜血管参数，并将其与临床指标关联，为特发性颅内高压治疗监测提供非侵入性生物标志物	研究为回顾性分析，样本量相对有限（n=165），且仅针对特发性颅内高压患者，结果推广需进一步验证	评估自动化视网膜血管分析能否识别特发性颅内高压继发视乳头水肿的治疗反应	特发性颅内高压继发视乳头水肿患者	数字病理学	特发性颅内高压	彩色眼底照相、光学相干断层扫描（OCT）	深度学习	图像	165名轻度视力丧失患者	NA	AutoMorph	R2、P值	NA
192	2026-01-07	From multi-omics to deep learning: advances in cfDNA-based liquid biopsy for multi-cancer screening 2025-Nov-28, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-025-00874-z PMID:41310905	综述	本文综述了基于循环游离DNA（cfDNA）的液体活检在多癌筛查中的关键生物标志物、多模态特征融合方法以及机器学习与深度学习技术的应用进展	强调了多模态cfDNA生物标志物（如基因突变、拷贝数变异、DNA甲基化、片段化模式和末端基序）的整合与特征融合方法，结合机器学习与深度学习框架，以提升癌症分类模型的性能并稳定低丰度信号	面临肿瘤异质性、数据处理标准化、模型可解释性以及成本限制等挑战	探讨cfDNA液体活检在多癌筛查中的技术进展与临床应用潜力	循环游离DNA（cfDNA）生物标志物及其在癌症检测与监测中的应用	机器学习	癌症	cfDNA分析，包括基因突变、拷贝数变异、DNA甲基化、片段化模式和末端基序检测	传统机器学习，深度学习	多组学数据（遗传与表观遗传数据）	NA	NA	NA	NA	NA
193	2026-01-07	Global and regional accuracy of deep learning-based tumor segmentation from whole-body [18F]fluorodeoxyglucose PET/CT images 2025-Nov-28, EJNMMI research IF:3.1Q1 DOI:10.1186/s13550-025-01333-4 PMID:41313553	研究论文	本研究评估了基于深度学习的nnU-Net模型在全身体[18F]FDG PET/CT图像中肿瘤分割的全局和区域准确性	首次在全身体PET/CT图像中系统评估nnU-Net的分割性能，并揭示了肿瘤背景比（TBR）与分割准确性之间的显著关系	研究仅针对三种癌症类型（肺癌、淋巴瘤、黑色素瘤），且未在外部数据集上进行验证	测试深度学习算法预测体积与手动分割体积之间的关系，并评估预测准确性与正常背景摄取的相关性	1334例经组织学确诊的肺癌、淋巴瘤和黑色素瘤患者的[18F]FDG-PET/CT扫描图像	数字病理学	肺癌, 淋巴瘤, 黑色素瘤	[18F]FDG-PET/CT成像	CNN	医学图像（PET/CT扫描）	1334例PET/CT扫描（训练集933例，内部验证集267例，测试集134例）	MONAI	nnU-Net	Dice分数, F1分数, 线性相关系数	NA
194	2026-01-07	Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer 2025-Nov-24, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1 DOI:10.1186/s12957-025-04117-1 PMID:41276825	综述	本文综述了结直肠癌的共识分子亚型分类及其在预后预测和个性化治疗中的应用	系统总结了CMS分类的预后和预测作用、识别方法、与息肉和免疫治疗的关联、瘤内异质性以及临床应用的障碍，并探讨了基于深度学习的图像分类器（imCMS）等新兴策略	瘤内异质性和技术障碍阻碍了CMS分类的临床广泛应用	回顾CMS分类，旨在改善结直肠癌的预后预测并指导个性化治疗	结直肠癌及其分子亚型	数字病理学	结直肠癌	基因表达谱分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序	深度学习	基因表达数据、图像数据	NA	NA	NA	NA	NA
195	2026-01-07	The ANTsX ecosystem for mapping the mouse brain 2025-Nov-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-66741-5 PMID:41274934	研究论文	本文介绍了使用ANTsX生态系统开发的鼠标大脑映射流程，用于将多种数据对齐到共享坐标框架，并引入了两种新方法	提出了两种新方法：基于速度场的发育时间点连续插值方法和使用最小标注公开数据的深度学习自动大脑分区框架	未明确说明	开发用于鼠标大脑数据映射的标准化工具和流程	鼠标大脑	数字病理学	NA	MERFISH空间转录组学、高分辨率fMOST形态学数据、发育MRI、LSFM数据	深度学习	图像、空间转录组数据	未明确说明	ANTsX	未明确说明	未明确说明	未明确说明
196	2026-01-07	Direct video-based spatiotemporal deep learning for cattle lameness detection 2025-Nov-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-29118-8 PMID:41274941	研究论文	本研究提出了一种基于时空深度学习的端到端视频分类框架，用于自动检测牛跛行	采用直接的端到端视频分类方法，避免了传统方法中依赖目标检测和姿态估计的多阶段流程，显著降低了延迟和复杂性，更适合实时农场部署	数据集规模相对较小（50个视频片段，涉及42头牛），且模型仅在公开视频数据上进行了评估	开发一种自动化、准确的牛跛行检测方法，以改善动物福利并减少经济损失	牛（特别是其步态视频）	计算机视觉	牛跛行	视频分析	3D CNN, ConvLSTM	视频	50个在线视频片段，涉及42头个体牛	NA	3D CNN, ConvLSTM2D	准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
197	2026-01-07	DLCPD-25: A Large-Scale and Diverse Dataset for Crop Disease and Pest Recognition 2025-Nov-20, Sensors (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/s25227098 PMID:41305306	研究论文	本文介绍了一个用于作物病虫害识别的大规模、多样化公开基准数据集DLCPD-25，并验证了其通过自监督学习模型预训练的有效性	构建了首个大规模、覆盖多种作物与病虫害类别、包含真实田间复杂环境和自然长尾分布的公开数据集，弥补了现有数据集的不足	未明确说明数据集中各类别样本的具体数量分布细节，也未对比其他数据集的详细性能差异	为作物病虫害识别领域提供高质量的数据资源，以支持鲁棒深度学习模型的开发	23种作物类型中的203种病虫害类别及健康状态	计算机视觉	作物病虫害	图像采集与整合	自监督学习模型	图像	221,943张图像	NA	MAE, SimCLR v2, MoCo v3	准确率, F1分数	NA
198	2026-01-07	Next-generation antifungal peptide discovery: the synergy of artificial intelligence and omics technologies 2025-Nov-18, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-025-04662-7 PMID:41251968	综述	本文综述了人工智能与组学技术在下一代抗真菌肽发现中的协同作用，强调了AI在克服传统方法局限性和推动抗真菌肽临床转化中的关键角色	探讨了AI（包括机器学习、深度学习和自然语言处理）与组学技术结合，用于高效设计和识别新型抗真菌肽，并提出了利用基因编辑技术（如CRISPR-Cas9）提升生产规模的创新思路	AI在抗真菌肽预测模型中存在模型复杂性高、数据规模有限、决策过程影响性能等限制，需通过迁移学习、可解释AI、特征选择等方法优化	旨在通过人工智能和组学技术加速新型抗真菌肽的发现与开发，以应对真菌感染和耐药性问题	抗真菌肽（AFPs）及其相关基因、生物合成基因簇（BGCs）	自然语言处理, 机器学习	真菌感染	组学技术, CRISPR-Cas9基因编辑	机器学习, 深度学习	文本, 基因序列数据	NA	NA	NA	精度, 准确率	NA
199	2026-01-07	Employment of artificial intelligence for an unbiased evaluation regarding the recovery of right ventricular function after mitral valve transcatheter edge-to-edge repair 2025-Nov, European journal of heart failure IF:16.9Q1 DOI:10.1002/ejhf.3705 PMID:40488515	研究论文	本研究利用常规超声心动图和人工智能深度学习模型，评估了接受二尖瓣经导管缘对缘修复术的重度二尖瓣反流患者术后右心室功能的恢复情况	首次结合常规超声心动图测量（TAPSE）和基于深度学习模型预测的右心室射血分数，对M-TEER术后右心室功能恢复进行无偏评估	研究为双中心注册研究，可能存在选择偏倚；仅评估了术后3个月的短期恢复情况，缺乏长期随访数据	评估二尖瓣经导管缘对缘修复术对重度二尖瓣反流患者右心室功能恢复的影响	接受二尖瓣经导管缘对缘修复术的重度二尖瓣反流患者	数字病理学	心血管疾病	超声心动图	深度学习模型	二维心尖四腔视图超声心动图视频	851名患者	NA	NA	NA	NA
200	2026-01-07	SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation 2025-Nov, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1013667 PMID:41223185	研究论文	本文提出了一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的深度学习模型SpaMWGDA，用于空间转录组数据的空间域识别	通过多视图加权融合图卷积网络和数据增强，模型能全面捕获邻域信息、自适应融合关键特征，并减少聚类噪声	未明确说明模型的计算复杂度或对大规模数据的可扩展性限制	开发一种深度学习模型以改进空间转录组数据中的空间域识别	空间转录组数据中的细胞基因表达和空间信息	机器学习	NA	空间转录组学	GCN	基因表达和空间信息数据	NA	NA	多视图加权融合图卷积网络	空间域识别和轨迹推断性能	NA