深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
12061	2025-01-03	Optimized smFISH Pipeline for Studying Nascent Transcription in Mouse Embryonic Tissue Samples 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4322-8_5 PMID:39745605	研究论文	本文优化了单分子荧光原位杂交（smFISH）技术，并结合深度学习算法，用于自动化检测小鼠胚胎组织样本中的新生转录	通过优化smFISH技术并结合深度学习算法，实现了对小鼠胚胎组织样本中新生转录的自动化检测和精确量化	该方法主要应用于小鼠胚胎组织样本，尚未在其他哺乳动物胚胎中进行验证	研究新生转录的空间和时间动态，以揭示基因表达的分子机制	小鼠胚胎组织样本	数字病理学	NA	单分子荧光原位杂交（smFISH）	深度学习算法	图像	小鼠胚胎组织样本
12062	2025-01-02	Assessing small molecule conformational sampling methods in molecular docking 2025-Jan-05, Journal of computational chemistry IF:3.4Q2 DOI:10.1002/jcc.27516 PMID:39476310	研究论文	本研究评估了不同小分子构象采样方法在分子对接中的影响	结合了传统采样方法和基于深度学习的模型（Torsional Diffusion）进行评估，并探讨了不同方法的性能差异	不同采样方法因独特的偏好（如可旋转键的二面角采样范围）而表现不一，可能需要结合互补方法以进一步提升对接性能	评估小分子构象采样方法在分子对接中的效果	小分子构象采样方法	分子对接	NA	分子对接	Torsional Diffusion	分子构象数据	Platinum Diverse Dataset、PoseBusters dataset、DUDE-Z dataset
12063	2025-01-02	Point-of-Care Potassium Measurement vs Artificial Intelligence-Enabled Electrocardiography for Hyperkalemia Detection 2025-Jan-01, American journal of critical care : an official publication, American Association of Critical-Care Nurses IF:2.7Q1 DOI:10.4037/ajcc2025597 PMID:39740977	研究论文	本研究比较了床旁血钾检测和人工智能心电图在检测高钾血症中的准确性	首次比较了床旁血钾检测和人工智能心电图在检测高钾血症中的准确性	样本量较小，仅包括15名高钾血症患者和252名非高钾血症患者	确定床旁血钾检测和人工智能心电图在检测高钾血症中的准确性	重症监护患者	医疗人工智能	高钾血症	深度学习模型	深度学习模型	心电图数据	267名患者（15名高钾血症患者和252名非高钾血症患者）
12064	2025-01-01	An attention 3DUNET and visual geometry group-19 based deep neural network for brain tumor segmentation and classification from MRI 2025-Feb, Journal of biomolecular structure & dynamics IF:2.7Q2 DOI:10.1080/07391102.2023.2283164 PMID:37979152	研究论文	本文提出了一种基于注意力3DUNET和视觉几何组-19的深度神经网络，用于从MRI图像中进行脑肿瘤分割和分类	提出了一种新颖的深度学习系统，结合了空间和通道注意力机制的三维U形网络（SC3DUNet）和基于扩张卷积的视觉几何组-19（DCVGG-19），用于脑肿瘤的分割和分类	该方法主要针对3D脑MRI图像，未涉及其他类型的医学影像	提高脑肿瘤的早期检测和分类准确率	脑肿瘤	数字病理学	脑肿瘤	深度学习	SC3DUNet, DCVGG-19	3D MRI图像	BraTS2020数据集
12065	2025-01-01	DeepCTG® 2.0: Development and validation of a deep learning model to detect neonatal acidemia from cardiotocography during labor 2025-Jan, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109448 PMID:39608037	研究论文	本文开发并验证了一种深度学习模型，用于从分娩期间的胎心监护（CTG）信号中检测新生儿酸血症	首次使用卷积神经网络（CNN）从CTG信号中检测新生儿酸血症，并在多中心数据库上进行评估	模型仍有显著改进空间，例如通过添加临床变量来考虑CTG信号中可能未出现的酸血症风险因素	开发一种能够从CTG信号中准确检测新生儿酸血症的深度学习模型	新生儿酸血症	机器学习	新生儿疾病	深度学习	卷积神经网络（CNN）	CTG信号	27662例，包括3457例中度酸血症和464例重度酸血症
12066	2025-01-01	Monkeypox Global Research: A Comprehensive Analysis from Emergence to Present (1961-2023) for innovative prevention and control approaches 2025-Jan, Journal of infection and public health IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.jiph.2024.102593 PMID:39608220	研究论文	本研究旨在识别猴痘（MPX）研究的热点和趋势，分析了1961年至2023年间发表的2655篇相关文章	通过文献计量学方法，结合深度学习和分子对接等新兴技术，全面分析了猴痘研究的发展历程和未来方向	研究依赖于Scopus数据库，可能未涵盖所有相关文献，且未进行实验验证	识别猴痘研究的热点和趋势，为未来的研究和防控策略提供指导	猴痘相关的研究文献	文献计量学	猴痘	文献计量分析，深度学习和分子对接	NA	文献数据	2655篇猴痘相关文章
12067	2024-12-29	Accelerated cardiac cine with spatio-coil regularized deep learning reconstruction 2025-Mar, Magnetic resonance in medicine IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mrm.30337 PMID:39428898	研究论文	本文提出了一种结合空间-线圈正则化的深度学习重建方法，用于加速心脏电影成像	提出了Spatio-Coil Regularized DL (SCR-DL)方法，结合多线圈信息进行数据一致性和正则化，显著提高了重建图像的质量	未提及具体样本量，且仅针对心脏电影成像进行了验证	开发一种加速心脏电影成像的深度学习重建方法	心脏电影成像数据	医学影像	心血管疾病	深度学习重建	SCR-DL	图像	NA
12068	2024-12-28	Low Skeletal Muscle Radiodensity Predicts Response to CDK4/6 Inhibitors Plus Aromatase Inhibitors in Advanced Breast Cancer 2025-Feb, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle DOI:10.1002/jcsm.13666 PMID:39686815	研究论文	本研究探讨了CT衍生的身体成分指数与激素受体阳性、HER2阴性晚期乳腺癌患者在接受内分泌治疗加CDK4/6抑制剂治疗时的治疗反应之间的关系	首次发现低骨骼肌放射密度（SMD）与接受CDK4/6抑制剂加芳香化酶抑制剂治疗的晚期乳腺癌患者的不良治疗结果相关	研究为回顾性设计，样本量相对较小，且仅来自单一中心	探讨CT衍生的身体成分指数与晚期乳腺癌患者治疗反应的关系	激素受体阳性、HER2阴性晚期乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	CT扫描	深度学习软件	图像	247名女性患者
12069	2024-12-28	Deep learning-assisted two-dimensional transperineal ultrasound for analyzing bladder neck motion in women with stress urinary incontinence 2025-Jan, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.07.021 PMID:39032723	研究论文	本研究利用深度学习辅助的二维经会阴超声技术，分析女性压力性尿失禁患者的膀胱颈运动	首次将深度学习技术应用于二维经会阴超声视频中，以评估膀胱颈运动，并探索其在压力性尿失禁诊断和评估中的应用	研究为回顾性研究，样本量相对较小，且未涉及其他可能的诊断参数	评估膀胱颈运动在压力性尿失禁中的作用，并探索其作为诊断和评估参数的有效性	217名女性（其中173名参与最终分析，包括82名压力性尿失禁患者和91名对照组）	数字病理学	压力性尿失禁	二维经会阴超声	深度学习	视频	173名女性（82名压力性尿失禁患者和91名对照组）
12070	2024-12-28	Intrapartum electronic fetal heart rate monitoring to predict acidemia at birth with the use of deep learning 2025-Jan, American journal of obstetrics and gynecology IF:8.7Q1 DOI:10.1016/j.ajog.2024.04.022 PMID:38663662	研究论文	本研究应用深度学习技术开发和验证了一个模型，用于从电子胎儿监护数据中预测胎儿酸血症	首次将深度学习技术应用于电子胎儿监护数据分析，以提高复杂数据处理和模式识别的能力	数据集中存在部分缺失，且外部验证仅使用了公开的捷克数据库	开发并验证一个能够从电子胎儿监护数据中预测胎儿酸血症的深度学习模型	电子胎儿监护数据和脐带血气结果	机器学习	胎儿酸血症	深度学习	深度学习模型	电子胎儿监护数据	最终数据集包含10,182个时间戳在最后30分钟内的电子胎儿监护记录
12071	2024-12-28	Enhancing Heart Failure Care: Deep Learning-Based Activity Classification in Left Ventricular Assist Device Patients 2025-Jan-01, ASAIO journal (American Society for Artificial Internal Organs : 1992) DOI:10.1097/MAT.0000000000002299 PMID:39231213	研究论文	本研究利用深度神经网络对左心室辅助装置（LVAD）患者的活动进行分类，以提高心衰护理的效果	首次将LVAD流量、心率和加速度计数据结合，使用深度神经网络进行活动分类，为医疗设备的闭环控制提供了新方法	样本量较小，仅涉及13名LVAD患者	提高左心室辅助装置患者的护理效果，通过精确的活动分类实现闭环控制	左心室辅助装置（LVAD）患者	机器学习	心血管疾病	深度神经网络（DNN）	双向长短期记忆网络（BiLSTM）	心率、LVAD流量、加速度计数据	13名LVAD患者
12072	2024-12-28	A Novel Deep Learning Approach for Analyzing Glomerular Basement Membrane Lesions in a Mouse Model of X-Linked Alport Syndrome 2025-Jan, The American journal of pathology DOI:10.1016/j.ajpath.2024.10.004 PMID:39427762	研究论文	本研究开发了一种新的深度学习方法，用于分析X连锁Alport综合征小鼠模型中的肾小球基底膜病变	结合了COL4α5染色荧光、周期性酸-甲胺银染色和低真空扫描电子显微镜图像，并应用监督深度学习预测GBM病变	研究仅基于小鼠模型，未涉及人类患者数据	研究X连锁Alport综合征小鼠模型中肾小球基底膜病变的一致性	X连锁Alport综合征小鼠模型	数字病理学	肾脏疾病	周期性酸-甲胺银染色、低真空扫描电子显微镜	监督深度学习	图像	NA
12073	2024-12-28	A prospectively deployed deep learning-enabled automated quality assurance tool for oncological palliative spine radiation therapy 2025-Jan, The Lancet. Digital health DOI:10.1016/S2589-7500(24)00243-7 PMID:39722248	研究论文	开发了一种基于深度学习的自动化质量保证工具（DL-SpiQA），用于检测肿瘤姑息性脊柱放射治疗中的解剖水平错误	首次提出了一种完全自动化的深度学习脊柱靶向质量保证系统，能够检测解剖水平错误并生成自动邮件报告	需要进一步的外部验证和定制	提高脊柱放射治疗的安全性，减少解剖水平错误	接受姑息性脊柱放射治疗的患者	数字病理	肿瘤	深度学习	nnU-Net	CT影像	回顾性测试513名患者，前瞻性部署520名患者
12074	2024-12-28	Implementation of an automated deep learning-based quality assurance tool for vertebral body identification in radiotherapy planning 2025-Jan, The Lancet. Digital health DOI:10.1016/S2589-7500(24)00266-8 PMID:39722249	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
12075	2024-12-28	Genetic improvement of low-lignin poplars: a new strategy based on molecular recognition, chemical reactions and empirical breeding 2025 Jan-Feb, Physiologia plantarum IF:5.4Q1 DOI:10.1111/ppl.70011 PMID:39727026	研究论文	本研究通过分子识别、化学反应和实证育种策略，探讨了低木质素杨树的遗传改良	结合深度学习筛选有利突变，为低木质素杨树的定向育种提供了新思路	NA	降低杨树中木质素含量，提高纸浆质量和工艺	杨树中的Caffeoyl-CoA-O methyltransferase (CCoAOMT)及其相关反应机制	机器学习	NA	深度卷积神经网络模型（DCNGP）、分子力学、Restrained Electrostatic Potential (RESP)、Independent Gradient Model (IGM)	CNN	基因组数据	NA
12076	2024-12-26	Deep learning model meets community-based surveillance of acute flaccid paralysis 2025-Mar, Infectious Disease Modelling IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.idm.2024.12.002 PMID:39720666	研究论文	本研究提出了一种简单的深度学习模型，用于急性弛缓性麻痹（AFP）的社区监测，利用从埃塞俄比亚社区关键信息员通过手机收集的图像进行迁移学习	该研究首次将迁移学习应用于AFP监测，使用预训练的视觉Transformer模型，显著提高了监测的准确性和效率	研究的主要限制在于收集的图像数据质量，未来需要改进数据质量并建立专门的数据存储和分析平台	提高急性弛缓性麻痹（AFP）的社区监测效率，特别是在资源匮乏的环境中	埃塞俄比亚社区关键信息员通过手机收集的AFP相关图像	计算机视觉	急性弛缓性麻痹	迁移学习	视觉Transformer	图像	NA
12077	2024-12-26	Utilizing machine learning to predict the risk factors of episiotomy in parturient women 2025-Feb, AJOG global reports DOI:10.1016/j.xagr.2024.100420 PMID:39720201	研究论文	本研究利用机器学习模型预测产妇进行会阴切开术的风险因素	首次使用多种机器学习模型评估会阴切开术的风险因素，并比较了不同模型的性能	研究仅基于单一医疗中心的回顾性数据，未考虑助产士的视角	预测产妇进行会阴切开术的风险因素	伊朗一家三级医疗中心2022年1月至2023年1月期间的1775例阴道分娩产妇	机器学习	产科疾病	机器学习	线性回归、深度学习、支持向量机、LightGBM、逻辑回归、XGBoost、随机森林、决策树、KNN	电子健康记录	1775例阴道分娩产妇
12078	2024-12-26	Profiling cell identity and tissue architecture with single-cell and spatial transcriptomics 2025-Jan, Nature reviews. Molecular cell biology DOI:10.1038/s41580-024-00768-2 PMID:39169166	综述	本文综述了单细胞转录组学和空间转录组学在细胞状态和多细胞邻域识别与表征方面的最新进展、挑战和前景	讨论了深度学习（包括基础模型）在单细胞和空间转录组数据分析中的应用，并展望了这些工具在干细胞生物学、免疫学和肿瘤生物学领域的未来应用	未具体提及研究的局限性	探讨单细胞和空间转录组学在细胞状态和多细胞邻域识别与表征方面的应用	单细胞和空间转录组数据	生物信息学	肿瘤生物学	单细胞转录组学、空间转录组学	深度学习、基础模型	转录组数据	数百到数百万个细胞
12079	2024-12-26	Inverse design of metalenses with polarization and chromatic dispersion modulation via transfer learning 2025-Jan-01, Optics letters IF:3.1Q2 DOI:10.1364/OL.540475 PMID:39718885	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的逆向设计模型，用于设计具有偏振和色散调制功能的超透镜	结合传播相位理论和光谱迁移学习，解决了色散问题，并实现了多功能超透镜的快速设计	数值模拟结果显示焦距偏差小于5%，但平均聚焦效率仅为43.3%，仍有提升空间	开发高效的深度学习方法来设计多功能超透镜，以解决传统成像系统的体积问题	偏振和波长复用的超透镜	计算机视觉	NA	深度学习	迁移学习	数值模拟数据	NA
12080	2024-12-26	A probabilistic deep learning approach to enhance the prediction of wastewater treatment plant effluent quality under shocking load events 2025-Jan-01, Water research X IF:7.2Q1 DOI:10.1016/j.wroa.2024.100291 PMID:39720317	研究论文	本研究开发了一种概率深度学习模型，用于增强在突发负荷事件下污水处理厂出水质量的实时预测	提出了结合编码器-解码器长短期记忆网络（LSTM）的概率深度学习模型，能够生成概率预测，提高了在突发负荷事件下实时预测的鲁棒性	模型仅在单一污水处理厂进行了测试，尚未在不同工艺的污水处理厂中广泛应用	提高污水处理厂在突发负荷事件下出水质量的实时预测能力	污水处理厂的出水质量，特别是总氮浓度	机器学习	NA	深度学习	概率编码器-解码器LSTM（P-ED-LSTM）	时间序列数据	实际污水处理厂的每小时出水质量数据