深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
13241	2025-02-08	Refining the prediction of user satisfaction on chat-based AI applications with unsupervised filtering of rating text inconsistencies 2025-Feb, Royal Society open science IF:2.9Q1 DOI:10.1098/rsos.241687 PMID:39911884	研究论文	本文提出了一种框架，通过自然语言处理和机器学习技术对Google Play商店中的聊天AI应用评论数据进行情感分析，以提高用户满意度预测的准确性	提出了一种通过多数投票的无监督情感分析过滤评论数据不一致性的方法，并采用多种机器学习和深度学习算法进行监督情感分析	NA	提高聊天AI应用用户满意度预测的准确性，以改进服务质量	Google Play商店中的聊天AI应用评论数据	自然语言处理	NA	自然语言处理，机器学习，深度学习	多种机器学习和深度学习算法	文本	NA
13242	2025-02-08	Applying deep learning for underwater broadband-source detection using a spherical array 2025-Feb-01, The Journal of the Acoustical Society of America IF:2.1Q1 DOI:10.1121/10.0035787 PMID:39918577	研究论文	本文开发了一种基于深度神经网络（DNN）的球形阵列水下宽带源检测和到达方向估计方法	该方法通过球形傅里叶变换将元素压力信号转换为球形傅里叶系数作为DNN输入，并采用高斯分布设计DNN标签，显著提高了检测能力并有效抑制了误估计	该方法在训练数据中引入白噪声，可能对实际应用中的噪声环境适应性有限	提高水下宽带源的被动检测能力	水下宽带源	机器学习	NA	深度神经网络（DNN）	DNN	声压信号	模拟和实验处理结果
13243	2025-02-08	Inference of the Mass Composition of Cosmic Rays with Energies from 10^{18.5} to 10^{20} eV Using the Pierre Auger Observatory and Deep Learning 2025-Jan-17, Physical review letters IF:8.1Q1 DOI:10.1103/PhysRevLett.134.021001 PMID:39913843	研究论文	本文利用Pierre Auger Observatory的表面探测器和深度学习技术，首次在事件级别上推断出宇宙射线的大气深度最大值X_{max}，并扩展了X_{max}分布的测量范围至100 EeV，揭示了极端能量下宇宙射线的质量组成	首次在事件级别上推断X_{max}，并利用深度学习技术扩展了测量范围至100 EeV，提供了极端能量下宇宙射线质量组成的新见解	NA	研究极端能量下宇宙射线的质量组成	宇宙射线	机器学习	NA	深度学习	NA	探测器数据	NA
13244	2025-02-08	Computational Resources for lncRNA Functions and Targetome 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_13 PMID:39702714	综述	本章节全面回顾了长链非编码RNA（lncRNA）领域的数据库和预测工具，包括lncRNA数据库、基于机器学习的算法以及利用不同技术预测lncRNA的工具	提供了lncRNA资源的全面概述，特别是针对人类、小鼠、植物和其他模式生物开发的资源，并讨论了使用深度学习、支持向量机（SVM）和随机森林（RF）等算法进行lncRNA的计算识别	本章节主要集中于已有资源的综述，未涉及新的实验数据或方法开发	总结和评估现有的lncRNA计算资源，以帮助生物学家选择最适合其研究需求的工具	长链非编码RNA（lncRNA）及其在不同生物体中的功能和靶标组	生物信息学	NA	深度学习、支持向量机（SVM）、随机森林（RF）	NA	文本、数据库信息	NA
13245	2025-02-08	Structure-Based Prediction of lncRNA-Protein Interactions by Deep Learning 2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_16 PMID:39702717	研究论文	本章介绍了基于三维结构信息预测长非编码RNA（lncRNA）与蛋白质相互作用的基本框架	利用深度学习方法自动表示和学习lncRNA与蛋白质的三维结构信息，提出几何深度学习方法在lncRNA-蛋白质相互作用预测中的应用	未提及具体的数据集或实验验证结果，可能缺乏实际应用验证	预测lncRNA与蛋白质的相互作用并解析其机制	长非编码RNA（lncRNA）和蛋白质	机器学习	NA	深度学习方法	神经网络	三维结构数据	NA
13246	2025-02-08	Application of human-in-the-loop hybrid augmented intelligence approach in security inspection system 2025, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2025.1518850 PMID:39911181	研究论文	本文提出了一种人机协作的混合增强智能方法，用于提升安全检查系统的安全性和可靠性	提出了一种结合人类和机器智能的混合决策方法，采用“拒绝优先”和“放行优先”两种策略，以提升决策过程的整体性能	未提及具体的技术实现细节和潜在的局限性	提升安全检查系统的安全性和可靠性	安全检查系统	机器学习和人机协作	NA	深度学习	NA	安全检查数据	来自特定安全检查站点的数据集
13247	2025-02-08	AlphaFold 2, but not AlphaFold 3, predicts confident but unrealistic β-solenoid structures for repeat proteins 2025, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.016 PMID:39911842	研究论文	本文评估了AlphaFold 2在预测由完美重复序列组成的蛋白质结构时的表现，发现其经常预测出高置信度但不现实的β-螺旋结构	揭示了AlphaFold 2在预测完美重复序列时倾向于生成高置信度但不现实的β-螺旋结构，而其他深度学习方法则预测出不同的结构或低置信度的β-螺旋结构	研究主要关注完美重复序列，未全面评估AlphaFold 2在其他类型蛋白质上的表现	评估AlphaFold 2在预测完美重复序列蛋白质结构时的表现	由完美重复序列组成的蛋白质	蛋白质结构预测	NA	分子动力学	AlphaFold 2	蛋白质序列	不同长度的随机序列组成的完美重复序列
13248	2025-02-07	FedPD: Defending federated prototype learning against backdoor attacks 2025-Apr, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2024.107016 PMID:39708704	研究论文	本文提出了一种名为FedPD的框架，旨在防御联邦学习中的后门攻击	FedPD框架通过交换原型而非模型参数，有效防止恶意客户端在联邦学习训练中植入后门通道，显著减少通信开销	现有防御方法在训练或测试阶段需要大量计算和通信开销，限制了其在资源受限场景中的实用性，且不适用于一般联邦学习场景中的非独立同分布数据	防御联邦学习中的后门攻击	联邦学习中的客户端和服务器	机器学习	NA	联邦学习	深度学习模型	NA	NA
13249	2025-02-07	Enhancing consistency and mitigating bias: A data replay approach for incremental learning 2025-Apr, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.neunet.2024.107053 PMID:39732067	研究论文	本文提出了一种新的数据回放方法，通过量化数据一致性并开发新的损失函数来减少不一致性，同时引入正则化项以平衡类别权重，从而在类增量学习中提高性能	提出了一种新的损失函数，通过最小化KL散度来减少倒置数据与真实数据之间的不一致性，并引入正则化项以平衡类别权重	该方法依赖于对倒置数据与真实数据之间一致性的简化假设，可能在实际应用中存在局限性	解决深度学习系统在序列任务学习中的灾难性遗忘问题	深度学习系统在类增量学习中的性能	机器学习	NA	数据回放方法	NA	图像数据	CIFAR-100, Tiny-ImageNet, 和 ImageNet100 数据集
13250	2025-02-07	Advancing Optical Coherence Tomography Diagnostic Capabilities: Machine Learning Approaches to Detect Autoimmune Inflammatory Diseases 2025-Feb-06, Journal of neuro-ophthalmology : the official journal of the North American Neuro-Ophthalmology Society IF:2.0Q2 DOI:10.1097/WNO.0000000000002322 PMID:39910704	研究论文	本研究探讨了利用机器学习模型通过光学相干断层扫描（OCT）图像区分不同自身免疫性炎症疾病的可行性	首次使用机器学习模型结合OCT图像特征，区分多种自身免疫性炎症疾病、其他眼部疾病及健康对照	样本量相对较小，特别是其他眼部疾病组（n=16），且MS与NMOSD的区分准确率较低（0.53）	评估机器学习模型在基于OCT测量的自身免疫性炎症疾病诊断中的可行性	多发性硬化症（MS）、视神经脊髓炎谱系疾病（NMOSD）、髓鞘少突胶质细胞糖蛋白抗体相关疾病（MOGAD）患者、其他眼部疾病患者及健康对照	数字病理学	自身免疫性炎症疾病	光学相干断层扫描（OCT）	支持向量机（SVM）	图像	MS患者99人，NMOSD患者40人，MOGAD患者74人，其他眼部疾病患者16人，健康对照54人
13251	2025-02-07	Automating Prostate Cancer Grading: A Novel Deep Learning Framework for Automatic Prostate Cancer Grade Assessment using Classification and Segmentation 2025-Feb-06, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01429-2 PMID:39913023	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的三阶段框架，用于自动评估前列腺癌的严重程度，通过分类和分割技术提高诊断精度	提出了一种创新的深度学习系统，结合了分类、分割和ISUP等级计算，使用Self-ONN增强的DeepLabV3架构优化了分割性能	需要进一步研究以评估该框架在不同临床场景中的适应性和有效性	开发自动化系统以提高前列腺癌分级的诊断精度并减少人为错误	前列腺癌组织样本	数字病理学	前列腺癌	深度学习	DNN, DeepLabV3, EfficientNet, RandomForest	图像	2699例前列腺癌组织样本
13252	2025-02-07	Automatic Identification of Fetal Abdominal Planes from Ultrasound Images Based on Deep Learning 2025-Feb-05, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01409-6 PMID:39909994	研究论文	本研究探讨了人工智能架构在自动识别胎儿腹部标准扫描平面和结构中的潜力，特别是腹围的测量	首次将深度学习神经网络应用于胎儿腹部超声图像的自动识别，特别是使用MobileNet3Large和EfficientV2S模型	数据集分布非正态，需要进一步研究以比较这些AI模型与传统方法的整体性能	探索人工智能在自动识别胎儿腹部标准扫描平面和结构中的应用	胎儿腹部超声图像	计算机视觉	NA	深度学习	Xception, MobileNetV3Large, EfficientV2S	图像	包含九个类别的超声图像数据集
13253	2025-02-07	VisionMD: an open-source tool for video-based analysis of motor function in movement disorders 2025-Feb-04, NPJ Parkinson's disease DOI:10.1038/s41531-025-00876-6 PMID:39900649	研究论文	本文介绍了VisionMD，一个用于自动化视频分析的开源软件，旨在评估帕金森病和其他运动障碍患者的运动功能	VisionMD利用深度学习技术追踪身体运动，计算运动学特征以量化症状严重程度，并支持纵向监测，提供了一个精确、客观且可扩展的评估工具	未提及具体局限性	开发一个用户友好且可定制的框架，使临床医生和研究人员能够客观评估运动障碍患者的运动症状，而无需专用硬件	帕金森病和其他运动障碍患者的运动功能	计算机视觉	帕金森病	深度学习	NA	视频	NA
13254	2025-02-07	Annotation-free deep learning for predicting gene mutations from whole slide images of acute myeloid leukemia 2025-Feb-03, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-00804-0 PMID:39900774	研究论文	本文提出了一种基于多实例学习（MIL）和集成技术的深度学习模型，用于从急性髓性白血病（AML）的全切片图像（WSIs）中预测基因突变	该模型无需补丁级或细胞级注释即可预测NPM1和FLT3-ITD基因突变，且在572个WSIs的数据集上表现出色	尽管模型在预测基因突变方面表现出色，但仍依赖于图像分辨率和手动注释的挑战	研究目的是通过深度学习模型从AML的WSIs中预测基因突变	急性髓性白血病（AML）的全切片图像（WSIs）	数字病理学	急性髓性白血病	深度学习	多实例学习（MIL）	图像	572个全切片图像（WSIs）
13255	2025-02-07	A novel early stage drip irrigation system cost estimation model based on management and environmental variables 2025-Feb-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-88446-x PMID:39900997	研究论文	本研究旨在通过环境和管理变量建立一个早期滴灌系统成本估算模型	使用多种特征选择算法和机器学习模型来估算滴灌系统的成本，并确定了最佳的特征选择技术和模型	研究依赖于515个项目的数据库，可能无法完全代表所有滴灌系统的成本情况	估算早期滴灌系统的成本	515个滴灌系统项目	机器学习	NA	多种特征选择算法（如WCC、LCA、GA、PSO、ACO、ICA、LA、HTS、FOA、DSOS、CUK）和机器学习模型（如多元线性回归、支持向量回归、人工神经网络、基因表达式编程、遗传算法、深度学习、决策树）	支持向量机（SVM）、人工神经网络（ANN）	结构化数据	515个滴灌系统项目
13256	2025-02-07	AI-driven video summarization for optimizing content retrieval and management through deep learning techniques 2025-Feb-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87824-9 PMID:39901035	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的AI驱动视频摘要方法，用于优化大型异构媒体档案中的内容检索和管理	结合卷积神经网络（CNN）和长短期记忆网络（LSTM）提取帧级和时序视频特征，并集成ResNet50增强内容表示，采用双帧视频流提升系统性能	未提及具体的数据集规模限制或模型泛化能力的详细评估	解决大型异构媒体档案中视频内容的组织和检索挑战，提升在线视频数量和质量的需求	视频内容	计算机视觉	NA	深度学习	CNN, LSTM, ResNet50	视频	YouTube, EPFL, TVSum数据集
13257	2025-02-07	Meso Hybridized Silk Fibroin Watchband for Wearable Biopotential Sensing and AI Gesture Signaling 2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202410702 PMID:39660568	研究论文	本文介绍了一种智能且灵活的表带，用于可穿戴生物电位传感和AI手势信号识别	结合了基于Mo-Au丝网的微型柔性电极阵列和介观杂交丝素蛋白薄膜，实现了高信噪比、高灵敏度和显著的运动噪声减少	NA	开发一种用于生物电位传感和手势识别的智能表带	人类生物电位信号和肌肉动作	可穿戴技术	NA	深度学习	NA	生物电位信号	20名不同性别的志愿者
13258	2025-02-07	Enhancing signal-to-noise ratio in real-time LED-based photoacoustic imaging: A comparative study of CNN-based deep learning architectures 2025-Feb, Photoacoustics IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.pacs.2024.100674 PMID:39758833	研究论文	本研究系统评估了多种基于编码器-解码器的CNN架构在实时LED光声成像中提高信噪比的效果	首次系统评估了不同深度学习方法在LED光声成像中的去噪效果，并比较了多种U-Net变体的性能	研究未涉及人体样本，且未评估模型在临床环境中的实际应用效果	提高LED光声成像中的信噪比	模型、幻影、小鼠器官和肿瘤	计算机视觉	NA	光声成像	CNN、U-Net、Dense U-Net、R2 U-Net	图像	幻影、小鼠器官和肿瘤
13259	2025-02-07	AI-based methods for biomolecular structure modeling for Cryo-EM 2025-Feb, Current opinion in structural biology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.sbi.2025.102989 PMID:39864242	综述	本文综述了基于人工智能的冷冻电镜数据处理技术，特别是大分子结构建模和异质性分析方面的最新进展	讨论了深度学习等人工智能技术在冷冻电镜数据处理中的最新应用，显著提升了处理性能	NA	探讨人工智能在冷冻电镜数据处理中的应用，特别是大分子结构建模和异质性分析	冷冻电镜数据	结构生物学	NA	冷冻电镜（Cryo-EM）	深度学习	图像	NA
13260	2025-02-07	Image reconstruction of electromagnetic tomography based on generative adversarial network with spectral normalization and improved dung beetle optimization algorithm 2025-Feb-01, The Review of scientific instruments DOI:10.1063/5.0233552 PMID:39912879	研究论文	本文提出了一种基于生成对抗网络的深度学习模型STDBOGAN，用于改进电磁断层成像（EMT）的图像重建质量	STDBOGAN模型引入了谱归一化和双时间尺度更新规则以稳定训练过程，并采用改进的蜣螂优化算法自动调整网络超参数，提高了图像重建的准确性	NA	改进电磁断层成像（EMT）的图像重建质量，解决其高度非线性和不适定问题	电磁断层成像（EMT）的图像重建	计算机视觉	NA	深度学习	生成对抗网络（GAN）	图像	通过仿真软件建立的数据集