深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2024-12-13	Deep learning-assisted surface-enhanced Raman spectroscopy detection of intracellular reactive oxygen species 2025-Mar-01, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.127222 PMID:39556973	研究论文	本文结合表面增强拉曼光谱（SERS）技术和深度学习，建立了一种基于神经网络的细胞内活性氧（ROS）智能检测方法	本文创新性地将SERS技术与深度学习相结合，利用神经网络模型提高了SERS分析能力，并实现了对细胞内ROS的初步浓度预测	本文仅以过氧亚硝酸盐（ONOO）和次氯酸盐（ClO）的同时检测为模板，未来可能需要扩展到更多种类的ROS检测	实现细胞内活性氧的智能分析，以促进疾病的快速诊断	细胞内活性氧（ROS），特别是过氧亚硝酸盐（ONOO）和次氯酸盐（ClO）	机器学习	NA	表面增强拉曼光谱（SERS）	神经网络模型（ENN）和一维卷积神经网络模型（1D-CNN）	光谱数据	AuNP/4-MPBA/2-MP纳米探针的SERS光谱数据
122	2024-12-13	Combining Biology-based and MRI Data-driven Modeling to Predict Response to Neoadjuvant Chemotherapy in Patients with Triple-Negative Breast Cancer 2025-Jan, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240124 PMID:39503605	研究论文	本文结合深度学习和基于生物学的建模方法，预测三阴性乳腺癌患者在接受新辅助化疗前的反应	本文创新性地将基于生物学的数学模型与卷积神经网络（CNN）相结合，用于预测肿瘤对新辅助化疗的反应	本文为回顾性研究，样本量相对较小，且仅基于单一临床试验的数据	预测三阴性乳腺癌患者在接受新辅助化疗前的反应	三阴性乳腺癌患者及其对新辅助化疗的反应	数字病理学	乳腺癌	卷积神经网络（CNN）	卷积神经网络（CNN）	图像	118名女性患者
123	2024-12-13	Deep learning for NAD/NADP cofactor prediction and engineering using transformer attention analysis in enzymes 2025-Jan, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2024.11.007 PMID:39571721	研究论文	本文介绍了一种基于transformer的深度学习模型DISCODE，用于预测和设计酶的NAD(P)辅因子偏好	DISCODE模型利用transformer的注意力机制，能够解释性地分析关键残基，从而实现酶的辅因子特异性预测和设计	NA	理解和操纵NAD(P)-依赖的氧化还原酶的辅因子偏好	NAD(P)-依赖的氧化还原酶的辅因子偏好	机器学习	NA	深度学习	transformer	序列	7,132个NAD(P)-依赖的酶序列
124	2024-12-13	Combining MRI radiomics and clinical features for early identification of drug-resistant epilepsy in people with newly diagnosed epilepsy 2025-Jan, Epilepsy & behavior : E&B IF:2.3Q2 DOI:10.1016/j.yebeh.2024.110165 PMID:39612633	研究论文	本研究结合MRI放射组学和临床特征，使用深度学习模型ResNet-18提取MRI特征，构建机器学习分类器以早期识别药物难治性癫痫	首次将放射组学与临床特征结合，使用深度学习模型提取MRI特征，并构建机器学习分类器进行早期诊断	样本量较小，可能影响模型的泛化能力	早期识别新诊断的药物难治性癫痫患者	新诊断的癫痫患者	机器学习	癫痫	MRI放射组学	ResNet-18	图像	134名新诊断的癫痫患者
125	2024-12-13	Decoding Depth of Meditation: Electroencephalography Insights From Expert Vipassana Practitioners 2025-Jan, Biological psychiatry global open science DOI:10.1016/j.bpsgos.2024.100402 PMID:39660274	研究论文	本研究使用脑电图（EEG）技术解码专家内观冥想者自我报告的冥想深度	引入了一种新的自发涌现方法来评估冥想深度，并提出了一种融合源活动和连接信息的新型机器学习方法	研究样本仅限于34名专家内观冥想者，可能限制了结果的普适性	解码自我报告的冥想深度，并探讨神经活动与冥想深度之间的关系	专家内观冥想者的冥想深度及其神经相关性	神经科学	NA	脑电图（EEG）	机器学习	脑电信号	34名专家内观冥想者
126	2024-12-12	LesionScanNet: dual-path convolutional neural network for acute appendicitis diagnosis 2025-Dec, Health information science and systems IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s13755-024-00321-7 PMID:39654693	研究论文	本文提出了一种名为LesionScanNet的双路径卷积神经网络模型，用于急性阑尾炎的计算机辅助诊断	LesionScanNet模型具有轻量级设计，包含多个DualKernel块，通过两条路径处理输入图像，分别使用3×3和1×1滤波器，展示了在急性阑尾炎诊断中的高准确性和泛化能力	NA	开发一种高效的卷积神经网络模型，用于急性阑尾炎的计算机辅助诊断	急性阑尾炎的诊断	计算机视觉	急性阑尾炎	卷积神经网络	CNN	图像	2400张CT扫描图像
127	2024-12-12	Adaptive Multicore Dual-Path Fusion Multimodel Extraction of Heterogeneous Features for FAIMS Spectral Analysis 2025-Mar, Rapid communications in mass spectrometry : RCM IF:1.8Q2 DOI:10.1002/rcm.9967 PMID:39658821	研究论文	本文提出了一种自适应多核双路径融合多模型提取异构特征的模型，用于FAIMS光谱分析	通过多模型特征提取实现多网络互补，自适应特征融合模块调整特征大小和维度融合，多核双路径融合能够捕捉和整合多尺度和多层次的信息	NA	提高FAIMS光谱分析的分析效果和工作效率	FAIMS光谱数据	机器学习	NA	FAIMS	多模型特征提取	光谱数据	小样本数据
128	2024-10-14	Corrigendum to 'Deep learning dives: Predicting anxiety in Zebrafish through novel tank assay analysis' Physiology & Behavior (2024), 114696 2025-Feb-01, Physiology & behavior IF:2.4Q2 DOI:10.1016/j.physbeh.2024.114705 PMID:39395874	correction	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
129	2024-12-12	Early identification of stroke through deep learning with multi-modal human speech and movement data 2025-Jan-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/1673-5374.393103 PMID:38767488	研究论文	本文提出了一种基于FAST的多模态深度学习方法，用于在急性环境中评估疑似中风患者，并通过视频和音频数据进行验证	本文的创新点在于提出了一种多模态深度学习模型，结合了动作视频和语音音频数据，显著提高了早期中风识别的准确性和敏感性	本文的局限性在于仅在急诊室环境中进行了验证，未来需要在更多临床场景中进行验证	本研究的目的是开发一种基于多模态数据的深度学习模型，用于早期识别中风	本研究的对象是疑似中风患者，特别是表现出肢体无力、面部轻瘫和言语障碍的患者	机器学习	中风	深度学习	多模态深度学习模型	视频和音频	包含急诊室患者的视频和音频数据集
130	2024-12-12	Deep learning-based detection of irreversible pulpitis in primary molars 2025-Jan, International journal of paediatric dentistry IF:2.3Q2 DOI:10.1111/ipd.13200 PMID:38725105	研究论文	本研究探讨了基于卷积神经网络（CNN）的图像分析技术在检测乳牙不可逆性牙髓炎中的可行性	本研究首次使用深度学习模型在根尖片上检测乳牙不可逆性牙髓炎，提供了一种便捷且互补的评估牙髓状态的方法	本研究为回顾性研究，样本量较小，且仅在两家健康中心进行	探讨基于卷积神经网络的图像分析技术在检测乳牙不可逆性牙髓炎中的可行性	乳牙不可逆性牙髓炎	计算机视觉	口腔疾病	卷积神经网络（CNN）	EfficientNet	图像	348张根尖片
131	2024-12-12	Detecting emerald ash borer boring vibrations using an encoder-decoder and improved DenseNet model 2025-Jan, Pest management science IF:3.8Q1 DOI:10.1002/ps.8442 PMID:39324448	研究论文	本研究提出了一种基于深度学习的联合识别网络VibroEABNet，用于检测翡翠灰螟的钻孔振动信号	本研究的创新点在于将去噪和识别模块集成到一个网络结构中，显著提高了模型在噪声环境下的检测性能	目前该研究仅限于检测特定害虫，未来工作将扩展到其他钻木害虫	开发一种高效、准确的害虫早期监测方法，以减轻经济和生态损害	翡翠灰螟的钻孔振动信号	机器学习	NA	深度学习	DenseNet	信号	测试数据集和真实森林数据集
132	2024-12-12	SCIseg: Automatic Segmentation of Intramedullary Lesions in Spinal Cord Injury on T2-weighted MRI Scans 2025-Jan, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240005 PMID:39503603	研究论文	开发了一种深度学习工具SCIseg，用于在T2加权MRI扫描中自动分割脊髓损伤中的脊髓和髓内病变	提出了一个开源的深度学习模型SCIseg，通过主动学习进行自动分割，并在多种数据集上验证了其准确性	研究是回顾性的，且依赖于手动标注的参考标准	开发一种自动分割脊髓和髓内病变的方法，以辅助脊髓损伤的诊断和评估	脊髓损伤患者的T2加权MRI扫描图像	计算机视觉	脊髓损伤	深度学习	卷积神经网络（CNN）	图像	191名脊髓损伤患者
133	2024-12-12	A new multi-object tracking pipeline based on computer vision techniques for mussel farms 2025, Journal of the Royal Society of New Zealand IF:2.1Q2 DOI:10.1080/03036758.2023.2240466 PMID:39649668	研究论文	本文提出了一种基于计算机视觉技术的新型多目标跟踪管道，用于自动检测和跟踪贻贝养殖场中的浮标	提出了一个新的基于图像处理操作符的检测器用于检测不同大小的贻贝浮标，并引入了一个新的描述符基于邻居的相对位置为浮标提供唯一身份标记	NA	开发一种自动化的方法来跟踪贻贝养殖场中的浮标，以减轻农民的劳动负担	贻贝养殖场中的浮标	计算机视觉	NA	图像处理操作符	NA	图像	在马尔堡海峡新西兰拍摄的图像
134	2024-12-12	MASSM: An End-to-End Deep Learning Framework for Multi-Anatomy Statistical Shape Modeling Directly From Images 2025, Shape in medical imaging : International Workshop, ShapeMI 2024, held in conjunction with MICCAI 2024, Marrakesh, Morocco, October 6, 2024, Proceedings. ShapeMI (Workshop) (2024 : Marrakech, Morocco) DOI:10.1007/978-3-031-75291-9_12 PMID:39649703	研究论文	本文介绍了一种名为MASSM的端到端深度学习框架，用于从图像中直接生成多解剖结构的统计形状模型	MASSM框架能够同时定位多个解剖结构，估计群体级别的统计表示，并直接在图像空间中描绘形状表示，超越了传统的像素级分割方法	NA	开发一种能够自动生成统计形状模型并直接从图像中描绘多解剖结构的深度学习框架	多解剖结构的统计形状模型	计算机视觉	NA	深度学习	多任务网络	图像	NA
135	2024-12-12	Integrating Deep Learning with Biology: A New Frontier in Triple-Negative Breast Cancer Treatment Prediction? 2025-Jan, Radiology. Artificial intelligence DOI:10.1148/ryai.240740 PMID:39660996	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
136	2024-12-11	Enhancing forensic blood detection using hyperspectral imaging and advanced preprocessing techniques 2025-Feb-01, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.127097 PMID:39454346	研究论文	本研究探讨了使用高光谱成像（HSI）和先进预处理技术来增强法医血液检测的方法	引入了名为Fast Extraction（FE）框架的新方法，包括Enhancing Transformation Reduction（ETR）方法和兼容的分类模型，显著提高了血液检测的准确性和效率	未提及具体局限性	提高法医血液检测的准确性和效率	血液检测中的高光谱成像数据	计算机视觉	NA	高光谱成像（HSI）	分类模型	图像	使用HyperBlood数据集进行验证
137	2024-12-11	Small-data-trained model for predicting nitrate accumulation in one-stage partial nitritation-anammox processes controlled by oxygen supply rate 2025-Feb-01, Water research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.watres.2024.122798 PMID:39581117	研究论文	本研究提出了一种基于氧气供应率控制硝酸盐积累的新策略，并通过实验和深度学习模型验证了其有效性	提出了基于氧气供应率控制硝酸盐积累的新策略，并开发了一种结合门控循环单元和多层感知器的深度学习模型来预测硝酸盐积累	实验规模为实验室级别，可能需要进一步验证其在实际污水处理中的应用效果	研究如何通过控制氧气供应率来有效防止部分硝化-厌氧氨氧化过程中硝酸盐的积累	部分硝化-厌氧氨氧化过程中的硝酸盐积累	环境工程	NA	深度学习	门控循环单元和多层感知器	实验数据	一个实验室规模的单级部分硝化-厌氧氨氧化系统，持续运行135天，分为五个阶段
138	2024-12-11	Stress recognition identifying relevant facial action units through explainable artificial intelligence and machine learning 2025-Feb, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2024.108507 PMID:39608217	研究论文	本文研究了基于面部动作单元（AUs）的自动急性应激识别，使用了传统机器学习和深度学习技术	本文提出了一个新的实验数据集，并使用计算特征选择方法来选择相关AUs的组合子集，结合传统机器学习和深度学习方法进行应激条件下的AUs识别	NA	研究自动急性应激识别	面部动作单元（AUs）	机器学习	NA	Layer-Wise Relevance Propagation算法	传统机器学习和深度学习方法	图像	58名参与者
139	2024-12-11	Predicting the risk of chronic kidney disease based on uric acid concentration in stones using biosensors integrated with a deep learning-based ANN system 2025-Feb-01, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.127077 PMID:39476796	研究论文	本研究开发了一种基于生物传感器的尿酸浓度检测方法，并结合深度学习的人工神经网络系统预测慢性肾病风险	首次将生物传感器与深度学习结合，用于检测尿石中的尿酸浓度并预测慢性肾病风险	实验范围仅限于0.15-5 mM的尿酸浓度，可能不适用于更高浓度的情况	开发一种新的方法来预测慢性肾病的风险	尿石中的尿酸浓度和慢性肾病风险	生物传感器	慢性肾病	生物传感器、循环伏安法	人工神经网络	数值数据	使用Chronic_Kidney_Disease数据集和文献中的补充数据进行训练
140	2024-12-11	Selective denoising autoencoder for classification of noisy gas mixtures using 2D transition metal dichalcogenides 2025-Feb-01, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.127129 PMID:39520916	研究论文	本文提出了一种名为选择性去噪自编码器（SDAE）的深度学习方法，用于在噪声环境下对气体混合物进行分类	创新点在于开发了一种新的深度学习方法SDAE，能够智能地利用来自真实环境的干净和噪声数据进行混合气体分类	NA	旨在解决电子鼻技术在实际工业应用中因环境变量引起的传感数据噪声问题	研究对象包括NO、NH及其混合物（比例为1:1、1:2和2:1）	机器学习	NA	Raman光谱、X射线光电子能谱、扫描电子显微镜	选择性去噪自编码器（SDAE）	气体传感数据	NA