深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
181	2025-10-06	Deep Learning and Habitat Radiomics for the Prediction of Glioma Pathology Using Multiparametric MRI: A Multicenter Study 2025-Feb, Academic radiology IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.acra.2024.09.021 PMID:39322536	研究论文	本研究通过结合栖息地分析和深度学习技术，利用多参数MRI预测胶质瘤病理特征	首次将栖息地分析与深度学习相结合用于胶质瘤病理预测，通过多中心数据验证了不同特征提取方法在预测不同病理指标上的优势	样本量相对有限（387例），临床特征对预测的帮助证据较弱，需要更大规模研究验证	提高胶质瘤病理预测的准确性	原发性胶质瘤患者	医学影像分析	胶质瘤	多参数MRI（T1增强和T2加权序列）	LightGBM, SVM, MLP, CNN	医学影像	387例来自三家医院的胶质瘤病例（训练集264例，测试集82例，验证集41例）	NA	DenseNet161, ResNet50, Inception_v3	NA	NA
182	2025-10-06	Major advances in protein function assignment by remote homolog detection with protein language models - A review 2025-Feb, Current opinion in structural biology IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.sbi.2025.102984 PMID:39864241	综述	本文综述了基于蛋白质语言模型的远程同源检测方法在蛋白质功能注释中的重大进展	系统总结了利用蛋白质语言模型进行远程同源检测的创新方法，包括嵌入生成替代矩阵的过滤、特定pLM层的选择、嵌入压缩和蛋白质结构域划分等关键技术	NA	探讨蛋白质语言模型在蛋白质同源识别和功能注释中的应用	蛋白质序列及其同源关系	自然语言处理	NA	蛋白质语言模型	Transformer	蛋白质序列	NA	NA	Transformer	同源检测准确率	NA
183	2025-10-06	Using deep convolutional networks combined with signal processing techniques for accurate prediction of surface quality 2025-Feb-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92114-5 PMID:40021768	研究论文	本研究提出了一种结合深度学习与信号处理技术来预测铣削零件表面粗糙度的框架	创新性地将声发射信号通过四种编码技术转换为二维图像，并系统比较了不同卷积神经网络在表面粗糙度预测中的性能	NA	开发准确预测铣削零件表面粗糙度的数据驱动方法	铣削加工过程中的声发射信号和表面粗糙度	机器学习和信号处理	NA	声发射信号采集、信号编码技术（SSPC、SSSC、SSSC*、RP）	CNN, LSTM	声发射信号转换的二维图像	NA	NA	VGG16, ResNet18, ShuffleNet, CNN-LSTM	准确率	NA
184	2025-10-06	Coinciding Diabetic Retinopathy and Diabetic Macular Edema Grading With Rat Swarm Optimization Algorithm for Enhanced Capsule Generation Adversarial Network 2025-Feb, Microscopy research and technique IF:2.0Q3 DOI:10.1002/jemt.24709 PMID:39487733	研究论文	提出一种结合鼠群优化算法的增强胶囊生成对抗网络，用于糖尿病视网膜病变和糖尿病黄斑水肿的联合分级	首次将鼠群优化算法与增强胶囊生成对抗网络结合，用于DR和DME的联合分级任务	使用ISBI 2018不平衡数据集，可能影响模型在平衡数据上的泛化能力	开发自动化的糖尿病眼病分级系统以实现早期诊断	糖尿病视网膜病变和糖尿病黄斑水肿患者	计算机视觉	糖尿病眼病	眼底图像分析	GAN, Capsule Network	图像	ISBI 2018 IDRiD不平衡数据集	Python	增强胶囊生成对抗网络	准确率	NA
185	2025-10-06	Deep learning and radiomics for gastric cancer serosal invasion: automated segmentation and multi-machine learning from two centers 2025-Feb-03, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-025-06117-w PMID:39900688	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的脾脏CT图像自动分割方法，并结合影像组学和深度学习特征构建胃癌浆膜侵犯预测模型	首次使用U-Mamba模型实现脾脏CT图像全自动分割，并结合多中心数据开发了包含临床、影像组学和深度学习特征的预测模型	样本量相对有限（311例），仅来自两个医疗中心	开发胃癌浆膜侵犯的自动化预测方法	经病理证实的胃癌患者	医学影像分析	胃癌	CT影像分析	U-Mamba, 多种机器学习方法	CT图像	311例来自两个中心的患者	NA	U-Mamba	判别能力	NA
186	2025-10-06	Targeted Microperimetry Grids for Focal Lesions in Intermediate AMD: PINNACLE Study Report 7 2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.66.2.6 PMID:39903180	研究论文	本研究评估了基于OCT的靶向微视野检查网格在评估中期年龄相关性黄斑变性(iAMD)局灶性病变中的可行性和实用性	使用深度学习算法检测OCT图像中的局灶性病变，并开发了针对病变位置的5点靶向微视野检查网格	最终分析仅包含83名患者的93只眼睛，样本量相对有限	评估靶向微视野检查网格在iAMD局灶性病变评估中的应用价值	中期年龄相关性黄斑变性(iAMD)患者	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	光学相干断层扫描(OCT), 微视野检查	深度学习算法	医学影像	395名55-90岁iAMD患者，最终分析包含83名患者的93只眼睛	NA	NA	Pearson相关系数, 线性混合模型, 置信区间	NA
187	2025-10-06	Challenges and solutions of deep learning-based automated liver segmentation: A systematic review 2025-Feb, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109459 PMID:39642700	系统综述	系统分析基于深度学习的自动化肝脏分割面临的挑战及解决方案	首次将肝脏分割挑战系统分类为五大类别并对应分析解决方案	仅纳入2016-2022年Scopus和ScienceDirect数据库的88篇文献	分析肝脏分割技术面临的挑战及相应的网络模型改进方法	医学影像中的肝脏分割	数字病理	肝脏疾病	医学影像技术	深度学习模型	医学影像	88篇研究文献	NA	NA	评估指标	NA
188	2025-10-06	Deep Learning techniques to detect and analysis of multiple sclerosis through MRI: A systematic literature review 2025-Feb, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109530 PMID:39693692	系统文献综述	本文系统综述了基于深度学习的MRI多发性硬化检测与分析方法	首次系统性地总结和比较了深度学习在多发性硬化MRI分析中的应用现状	仅纳入82篇相关研究，可能存在文献选择偏差	系统评估深度学习技术在多发性硬化MRI检测与分析中的应用效果	多发性硬化患者的MRI医学影像数据	医学影像分析	多发性硬化	磁共振成像	CNN	医学影像	基于82项研究的汇总数据	NA	NA	NA	NA
189	2025-10-06	Deep Learning-Based Blood Abnormalities Detection as a Tool for VEXAS Syndrome Screening 2025-Feb, International journal of laboratory hematology IF:2.2Q3 DOI:10.1111/ijlh.14368 PMID:39275905	研究论文	开发基于深度学习的血液异常检测工具用于VEXAS综合征筛查	首次利用深度学习自动检测外周血多形核粒细胞中的异常特征来筛查VEXAS综合征	样本量相对有限（VEXAS患者仅25例），需多中心验证	开发VEXAS综合征的自动化筛查工具	外周血多形核粒细胞图像	数字病理学	血液系统疾病	外周血涂片图像分析	CNN	图像	9514张标注的多形核粒细胞图像，来自64名患者（25例VEXAS，14例骨髓增生异常，25例血细胞减少）	NA	卷积神经网络	AUC, F1-score, 敏感性, 特异性	NA
190	2025-10-06	Fuzz Testing Molecular Representation Using Deep Variational Anomaly Generation 2025-Feb-24, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.4c01876 PMID:39908426	研究论文	使用深度变分异常生成方法对分子表示进行模糊测试	首次使用变分自编码器生成SELFIES分子字符串的异常示例，探索影响分子表示可靠性的因素	仅针对SELFIES 2.1.1版本进行研究，未涵盖其他分子表示格式	压力测试和验证分子表示的鲁棒性	SELFIES分子字符串表示	机器学习	NA	变分自编码器	VAE	分子字符串	NA	NA	变分自编码器	NA	NA
191	2025-06-07	PRISM Lite: A lightweight model for interactive 3D placenta segmentation in ultrasound 2025-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering DOI:10.1117/12.3047410 PMID:40463735	research paper	提出了一种轻量级交互式分割模型PRISM Lite，用于实时从3D超声图像中分割胎盘	设计了一个轻量级模型，适用于临床使用，能够在资源有限的环境中实时运行，并通过人机交互实现迭代改进	尽管模型在分割精度上表现优异，但其在低资源环境或移动设备上的实际应用仍需进一步验证	开发一种适用于临床的轻量级交互式胎盘分割模型，以提高分割效率和质量	3D超声图像中的胎盘	digital pathology	pregnancy outcomes	3D ultrasound (3DUS)	lightweight interactive segmentation model	3D image	NA	NA	NA	NA	NA
192	2025-10-06	Extraction of agricultural plastic greenhouses based on a U-Net convolutional neural network coupled with edge expansion and loss function improvement 2025-Feb, Journal of the Air & Waste Management Association (1995) DOI:10.1080/10962247.2024.2412708 PMID:39440842	研究论文	本研究通过改进U-Net卷积神经网络，结合边缘扩展和损失函数优化，实现了农业塑料大棚的高精度遥感提取	提出结合Canny算子和高斯核函数进行样本边缘扩展，并使用二元交叉熵和高斯核函数联合约束损失函数，从而提升U-Net模型对农业塑料大棚的提取精度	NA	提高农业塑料大棚的位置和数量提取精度，为农业管理和环境监测提供快速准确的方法	农业塑料大棚	计算机视觉	NA	遥感技术	CNN	遥感图像	NA	NA	U-Net	提取精度	NA
193	2025-10-06	Weakly Supervised Multiple Instance Learning Model With Generalization Ability for Clinical Adenocarcinoma Screening on Serous Cavity Effusion Pathology 2025-Feb, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.modpat.2024.100648 PMID:39515585	研究论文	本研究提出一种弱监督多示例学习模型，用于浆膜腔积液中腺癌细胞的临床筛查	首次将细胞块技术与弱监督深度学习模型结合，采用多示例学习方法进行浆膜腺癌筛查	NA	提高浆膜腔积液中腺癌细胞的筛查效率和诊断准确性	浆膜腔积液中的腺癌细胞	数字病理学	腺癌	细胞块技术，全玻片成像	弱监督深度学习，多示例学习	病理图像	NA	NA	NA	NA	NA
194	2025-10-06	Radiomics-guided generative adversarial network for automatic primary target volume segmentation for nasopharyngeal carcinoma using computed tomography images 2025-Feb, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17493 PMID:39535436	研究论文	提出一种基于瘤周影像组学引导的生成对抗网络，用于鼻咽癌CT图像的原发肿瘤靶区自动分割	首次将瘤周影像组学特征作为先验知识融入生成对抗网络，解决CT图像中肿瘤边界不清的分割难题	样本量相对有限（157例患者），且仅基于CT图像	提高鼻咽癌原发肿瘤靶区在CT图像上的自动分割精度	鼻咽癌患者的CT图像	医学影像分析	鼻咽癌	CT成像	GAN	CT图像	157例鼻咽癌患者（训练集108例，验证集9例，测试集30例）	NA	生成对抗网络	Dice相似系数, 95% Hausdorff距离, 平均对称表面距离	NA
195	2025-10-06	Deep learning model for identifying acute heart failure patients using electrocardiography in the emergency room 2025-Feb-20, European heart journal. Acute cardiovascular care DOI:10.1093/ehjacc/zuaf001 PMID:39787045	研究论文	开发并评估一种利用心电图数据识别急诊室急性心力衰竭患者的深度学习模型	首次将常规12导联心电图与临床数据结合，使用CatBoost算法显著提升急性心力衰竭的识别准确率	回顾性研究设计，数据来源于三家医院可能限制泛化能力	提升急诊室中急性心力衰竭的诊断能力	急诊室就诊的急性心力衰竭患者	机器学习	心血管疾病	心电图分析	CatBoost, XGBoost, Light GBM, 线性回归	心电图数据、临床参数	19285名急诊患者，其中9119名确诊急性心力衰竭患者	CatBoost, XGBoost, Light GBM	梯度提升决策树	AUC, 准确率, 精确率, 召回率, F1分数	NA
196	2025-10-06	Enhancing motor imagery EEG signal decoding through machine learning: A systematic review of recent progress 2025-Feb, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109534 PMID:39672015	综述	本文系统综述了2017年以来机器学习在运动想象脑电信号解码领域的最新研究进展	聚焦2017年后的最新研究进展，系统总结了脑机接口中运动想象EEG信号解码的数据集、预处理方法、特征提取技术和深度学习模型	作为综述文章，不涉及原始实验研究，主要依赖已有文献的总结和分析	通过机器学习和深度学习技术提升运动想象脑电信号的解码能力，改善运动障碍患者的生活质量	运动想象脑电图信号和脑机接口系统	机器学习	运动障碍疾病	脑电图	深度学习模型	脑电信号	NA	NA	NA	NA	NA
197	2025-10-06	Diagnostic performance of neural network algorithms in skull fracture detection on CT scans: a systematic review and meta-analysis 2025-Feb, Emergency radiology IF:1.7Q3 DOI:10.1007/s10140-024-02300-7 PMID:39680295	系统性综述与荟萃分析	评估卷积神经网络在CT扫描中诊断颅骨骨折的诊断性能	首次对CNN模型在颅骨骨折CT诊断中的性能进行系统性综述和定量荟萃分析	研究存在显著异质性，可能受到模型拓扑结构、训练方法和验证技术差异的影响	评估CNN模型在CT图像中诊断颅骨骨折的诊断性能	颅骨骨折患者的CT扫描图像	医学影像分析	颅骨骨折	CT扫描	CNN	CT图像	11项研究，20,798名患者	NA	NA	AUC, 敏感度, 特异度, 准确度	NA
198	2025-10-06	Improving functional correlation of quantification of interstitial lung disease by reducing the vendor difference of CT using generative adversarial network (GAN) style conversion 2025-Feb, European journal of radiology IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.ejrad.2024.111899 PMID:39740598	研究论文	本研究使用生成对抗网络进行CT图像风格转换，以减少不同厂商CT设备间的差异，改善间质性肺病定量测量的功能相关性	首次将可路由生成对抗网络应用于CT图像风格转换，有效减少不同厂商设备间的量化变异	研究为回顾性设计，仅包含特发性肺纤维化患者，样本量有限	评估CT风格转换是否能最小化间质性肺病量化变异，改善定量CT测量的功能相关性	特发性肺纤维化患者	医学影像分析	间质性肺病	CT扫描，肺功能测试	GAN	CT图像	112名患者（平均年龄61岁，82名男性）	NA	RouteGAN	一致性相关系数，视觉准确性评分，相关系数	NA
199	2025-10-06	Adaptive genetic algorithm based deep feature selector for cancer detection in lung histopathological images 2025-Feb-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86362-8 PMID:39922836	研究论文	提出一种基于自适应遗传算法的深度特征选择方法用于肺癌组织病理图像检测	使用通道注意力深度学习模型作为特征提取器，结合自适应遗传算法进行特征选择，并采用滤波器方法而非分类器计算染色体适应度分数	NA	开发有效的肺癌检测方法以提高诊断准确性	肺癌组织病理图像	计算机视觉	肺癌	组织病理成像	CNN	图像	LC25000公共数据集	NA	通道注意力模型	准确率	NA
200	2025-05-31	Deep Learning Derived Adipocyte Size Reveals Adipocyte Hypertrophy is under Genetic Control 2025-Feb-12, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2025.02.11.25322053 PMID:39990583	研究论文	本研究利用深度学习技术自动分析脂肪细胞大小，探讨其与肥胖相关性状及遗传关联的关系	开发了基于深度学习的脂肪组织切片语义分割方法，进行了迄今为止最大规模的脂肪细胞表型与遗传关联研究	研究样本主要来自特定人群，可能限制结果的普适性	探究脂肪细胞大小与肥胖相关代谢特征的关联及其遗传基础	皮下和内脏脂肪组织样本	数字病理学	肥胖相关疾病	深度学习	语义分割模型	组织切片图像	5个独立队列中的2,667份样本，包含9,000张全切片图像和超过2,700万个脂肪细胞	NA	NA	NA	NA