深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1121	2025-02-06	Segmentation of cortical bone, trabecular bone, and medullary pores from micro-CT images using 2D and 3D deep learning models 2025-Feb-05, Anatomical record (Hoboken, N.J. : 2007) DOI:10.1002/ar.25633 PMID:39905914	研究论文	本文提出了一种使用2D和3D深度学习模型从微CT图像中分割皮质骨、松质骨和髓腔孔隙的方法	开发了名为BONe的新模型，旨在快速准确地进行骨分割，并比较了2D和3D模型的性能	3D模型的计算成本高，限制了其可扩展性和实用性	实现从微CT图像中自动分割皮质骨、松质骨和髓腔孔隙	水獭长骨的微CT扫描图像	计算机视觉	NA	微CT扫描	CNN	图像	NA
1122	2025-02-06	Artificial intelligence-based cardiac transthyretin amyloidosis detection and scoring in scintigraphy imaging: multi-tracer, multi-scanner, and multi-center development and evaluation study 2025-Feb-05, European journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:8.6Q1 DOI:10.1007/s00259-025-07117-1 PMID:39907796	研究论文	本研究旨在利用深度学习技术，在多示踪剂、多扫描仪和多中心数据集上自动检测和评分心脏转甲状腺素蛋白淀粉样变性（ATTR-CM）	开发了一个全自动的管道，用于在多示踪剂、多扫描仪和多中心数据集上检测和评分ATTR-CM，实现了高准确率	数据集#6中的3215名患者没有标签，可能影响模型性能的全面评估	自动检测和评分心脏转甲状腺素蛋白淀粉样变性（ATTR-CM）	心脏转甲状腺素蛋白淀粉样变性（ATTR-CM）患者	数字病理学	心血管疾病	深度学习	CNN	图像	六个数据集，包括93名、216名、41名、53名、129名和3215名患者
1123	2025-02-06	Class-aware multi-level attention learning for semi-supervised breast cancer diagnosis under imbalanced label distribution 2025-Feb-05, Medical & biological engineering & computing IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11517-025-03291-4 PMID:39907850	研究论文	本文提出了一种面向半监督乳腺癌诊断的类感知多级注意力学习模型，旨在减少对大量数据标注的依赖，并通过多级融合注意力学习模块和类感知自适应伪标签模块提高诊断准确性和平衡学习过程	提出了类感知多级注意力学习模型，结合多级融合注意力学习模块和类感知自适应伪标签模块，有效解决了现有乳腺癌诊断模型在数据标注依赖、特征提取和类别不平衡方面的局限性	实验仅在BACH数据集上进行验证，未在其他数据集或实际临床环境中测试其泛化能力	开发一种半监督乳腺癌诊断模型，减少对大量标注数据的依赖并提高诊断准确性	乳腺癌图像数据	计算机视觉	乳腺癌	深度学习	类感知多级注意力学习模型	图像	BACH数据集中的显微图像数据，仅使用40%的标注数据
1124	2025-02-06	Speech Technology for Automatic Recognition and Assessment of Dysarthric Speech: An Overview 2025-Feb-04, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR DOI:10.1044/2024_JSLHR-23-00740 PMID:39813019	综述	本文综述了近年来在构音障碍语音研究领域的最新进展，特别是语音技术在自动识别和评估构音障碍语音中的应用	本文综合了构音障碍语音研究的现有成果，并探讨了人工智能驱动的分析和远程治疗在构音障碍研究中的潜力	本文未涉及伦理委员会或机构审查委员会的批准，且主要依赖现有研究数据，可能存在数据不足的问题	提高构音障碍患者的生活质量，开发包容性对话界面以应对病理语音	构音障碍语音	自然语言处理	构音障碍	机器学习和深度神经网络	深度学习模型	语音数据	NA
1125	2025-02-06	Spatio-temporal transformers for decoding neural movement control 2025-Feb-04, Journal of neural engineering IF:3.7Q2 DOI:10.1088/1741-2552/adaef0 PMID:39870043	研究论文	本文介绍了一种新型的专门用于分析单神经元放电活动的transformer架构，用于解码神经运动控制	提出了一种新型的transformer架构，能够在低数据情况下高效且可解释地分析神经活动，并能够早期预测运动方向和是否生成运动	模型仅在非人类灵长类动物的背侧前运动皮层多电极记录数据上进行了测试，尚未在人类数据上验证	研究神经运动控制的解码方法	非人类灵长类动物的背侧前运动皮层	机器学习	NA	多电极记录	transformer	神经生理数据	非人类灵长类动物的多电极记录数据
1126	2025-02-06	Development and Evaluation of a Deep Learning-Based Pulmonary Hypertension Screening Algorithm Using a Digital Stethoscope 2025-Feb-04, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1 DOI:10.1161/JAHA.124.036882 PMID:39895552	研究论文	本文开发并评估了一种基于深度学习的肺动脉高压筛查算法，使用数字听诊器进行数据采集	提出了一种新的基于深度学习的肺动脉高压筛查方法，利用数字听诊器采集的PCG数据进行半监督学习，实现了低成本、无创且易于获取的筛查工具	测试数据集样本量较小（196例患者），可能影响模型的泛化能力	开发一种易于获取的筛查工具，用于早期检测肺动脉高压，以改善预后和及时治疗	肺动脉高压患者	数字病理学	心血管疾病	深度学习	深度卷积网络	PCG录音	约6000个带标签的PCG录音和约169000个无标签的PCG录音用于训练，196例患者用于测试
1127	2025-02-06	FLANet: A multiscale temporal convolution and spatial-spectral attention network for EEG artifact removal with adversarial training 2025-Feb-04, Journal of neural engineering IF:3.7Q2 DOI:10.1088/1741-2552/adae34 PMID:39902757	研究论文	本文提出了一种名为FLANet的多尺度时间卷积和空间-频谱注意力网络，结合对抗训练，用于自动过滤EEG信号中的伪影	FLANet结合了多尺度卷积模块和空间-频谱注意力网络，能够提取足够的时间信息以及非局部相似性和频谱依赖性，并通过对抗训练和新颖的损失函数提高去噪效率和准确性	尽管FLANet在去噪效果和计算开销之间取得了较好的平衡，但其在实际临床研究和人机交互系统中的应用仍需进一步验证	提高EEG信号中伪影去除的效率与准确性，以促进神经分析和神经工程的发展	被不同类型伪影污染的EEG信号	神经信号处理	NA	对抗训练	多尺度时间卷积网络和空间-频谱注意力网络	EEG信号	NA
1128	2025-02-06	High-resolution deep learning reconstruction for coronary CTA: compared efficacy of stenosis evaluation with other methods at in vitro and in vivo studies 2025-Feb-04, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-025-11376-9 PMID:39903239	研究论文	本研究比较了混合型迭代重建（IR）、基于模型的迭代重建（MBIR）、深度学习重建（DLR）和高分辨率深度学习重建（HR-DLR）在冠状动脉CT血管造影（CCTA）中对冠状动脉狭窄评估的效果	首次在体外和体内研究中直接比较了HR-DLR与其他重建方法在冠状动脉狭窄评估中的效果	研究样本量较小，仅包括31名患者	比较不同重建方法在冠状动脉狭窄评估中的效果	冠状动脉狭窄评估	医学影像	心血管疾病	CT扫描	深度学习重建（DLR）	CT图像	31名患者和三根不同直径的血管模型
1129	2025-02-06	Age-stratified deep learning model for thyroid tumor classification: a multicenter diagnostic study 2025-Feb-04, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-025-11386-7 PMID:39903238	研究论文	本研究开发了一种基于年龄分层的深度学习模型（ASMCNet），用于甲状腺结节的分类，并探讨了年龄分层对模型准确性的影响	首次将年龄分层引入深度学习模型，用于甲状腺结节的分类，并验证了其提高诊断准确性的潜力	研究为回顾性研究，可能存在数据偏差，且未在更大规模的多中心数据集中验证模型的泛化能力	探讨年龄分层对甲状腺结节分类模型准确性的影响，并评估模型在临床诊断中的辅助作用	甲状腺结节患者	数字病理	甲状腺癌	深度学习	ASMCNet	超声图像	5934名患者的10391张超声图像
1130	2025-02-06	Deep-ELA: Deep Exploratory Landscape Analysis with Self-Supervised Pretrained Transformers for Single- and Multi-Objective Continuous Optimization Problems 2025-Feb-04, Evolutionary computation IF:4.6Q1 DOI:10.1162/evco_a_00367 PMID:39903851	研究论文	本文提出了一种结合深度学习和探索性景观分析（ELA）特征的混合方法Deep-ELA，用于单目标和多目标连续优化问题的分析	提出了一种结合深度学习和ELA特征的混合方法，解决了传统ELA特征在多目标优化问题中的局限性，并减少了深度学习对大量标注数据的依赖	需要预训练大量随机生成的优化问题，可能在实际应用中存在计算资源消耗较大的问题	改进单目标和多目标连续优化问题的分析方法	单目标和多目标连续优化问题	机器学习	NA	深度学习，探索性景观分析（ELA）	Transformer	数值特征	数百万个随机生成的优化问题
1131	2025-02-06	A novel cross-modal data augmentation method based on contrastive unpaired translation network for kidney segmentation in ultrasound imaging 2025-Feb-04, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17663 PMID:39904615	研究论文	本文提出了一种基于对比无配对翻译网络的新型跨模态数据增强方法，用于提高基于深度学习的肾脏超声图像分割性能	采用对比无配对翻译网络（CUT）从标记的腹部CT数据和无标记的肾脏超声图像中低成本获取模拟的标记肾脏超声图像，并提出了一种实例加权训练策略	需要依赖标记的CT数据和无标记的超声图像，且模拟图像的质量可能影响最终分割效果	提高基于深度学习的肾脏超声图像分割模型的准确性和泛化能力	肾脏超声图像	计算机视觉	肾脏疾病	对比无配对翻译网络（CUT）	U-Net	图像	4418张标记的CT切片和4594张无标记的超声图像用于生成网络训练，4594张模拟和100张真实的肾脏超声图像用于分割网络训练，20张用于验证，169张用于测试
1132	2025-02-06	Patient- and fraction-specific magnetic resonance volume reconstruction from orthogonal images with generative adversarial networks 2025-Feb-04, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.17668 PMID:39904621	研究论文	本文开发了一种基于生成对抗网络（GAN）的2D到3D条件模型，用于从正交2D MR图像重建合成3D MR体积，以实现在线剂量适应	采用患者和分次特定的微调工作流程，提高了在有限数据情况下的模型准确性	需要更多的患者数据来进一步验证模型的泛化能力	开发个性化深度学习模型，用于从2D MR图像重建3D MR体积	43名患者的2473个3D MR体积	计算机视觉	前列腺癌	生成对抗网络（GAN）	条件生成对抗网络（GAN）	图像	43名患者的2473个3D MR体积
1133	2025-02-06	The Dipeptidyl Peptidase-4 Inhibitor Saxagliptin as a Candidate Treatment for Disorders of Consciousness: A Deep Learning and Retrospective Clinical Analysis 2025-Feb-04, Neurocritical care IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12028-025-02217-0 PMID:39904872	研究论文	本研究利用深度学习模型筛选FDA批准的药物，发现二肽基肽酶-4抑制剂沙格列汀可能作为治疗意识障碍的新药物，并通过回顾性临床分析验证其效果	首次使用深度学习模型预测现有药物的觉醒效果，并发现沙格列汀在急性及长期意识障碍中的潜在治疗作用	研究为回顾性分析，需进一步的前瞻性临床试验验证沙格列汀的疗效和安全性	探索现有FDA批准药物在治疗意识障碍中的新用途	4047名因创伤、血管性或缺氧性脑损伤导致的昏迷患者	机器学习	意识障碍	深度学习	深度学习模型	临床数据	4047名患者
1134	2025-02-06	Comparative Analysis of U-Net and U-Net3 + for Retinal Exudate Segmentation: Performance Evaluation Across Regions 2025-Feb-04, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01419-4 PMID:39904940	研究论文	本研究比较了U-Net和U-Net3+在视网膜渗出物分割中的性能，评估了它们在不同区域的检测效果	首次在不同视网膜区域（如血管周围与血管外区域、黄斑周围与黄斑外区域）对U-Net和U-Net3+模型进行了详细的性能评估	研究仅基于U-Net3+模型的结果进行评估，未进一步探讨其他深度学习模型的表现	评估深度学习模型在视网膜渗出物检测中的性能，以提高糖尿病视网膜病变的诊断准确性和效率	糖尿病视网膜病变患者的眼底图像	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	深度学习	U-Net, U-Net3+	图像	NA
1135	2025-02-06	Preoperatively Predicting PIT1 Expression in Pituitary Adenomas Using Habitat, Intra-tumoral and Peri-tumoral Radiomics Based on MRI 2025-Feb-04, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01376-4 PMID:39904941	研究论文	本研究旨在利用基于MRI的生境、瘤内和瘤周放射组学模型预测垂体腺瘤中垂体转录因子1（PIT1）的表达	创新点在于结合了生境、瘤内和瘤周放射组学特征，并构建了深度学习放射组学列线图（DLRN）用于个体预测	研究样本量相对较小，且为回顾性研究，可能存在选择偏倚	预测垂体腺瘤中PIT1的表达	129名垂体腺瘤患者	数字病理学	垂体腺瘤	MRI	logistic regression (LR), support vector machines (SVM), multilayer perceptron (MLP), deep learning radiomics nomogram (DLRN)	图像	129名患者（训练集103名，测试集26名）
1136	2025-02-06	Learning Phenotype Associated Signature in Spatial Transcriptomics with PASSAGE 2025-Feb-04, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202401451 PMID:39905872	研究论文	本文介绍了一种名为PASSAGE的深度学习框架，用于在空间转录组学中有效表征与表型相关的特征	PASSAGE框架通过图嵌入方法，能够在多个异质性空间切片中有效表征与表型相关的特征，超越了传统的无监督方法	NA	研究目的是开发一种能够利用样本特征（如生理/病理状态）来识别空间转录组学中表型相关特征的计算工具	空间转录组学数据	数字病理学	NA	空间转录组学	深度学习	空间转录组数据	NA
1137	2025-02-06	Online and Cross-User Finger Movement Pattern Recognition by Decoding Neural Drive Information from Surface Electromyogram 2025-Feb-04, International journal of neural systems IF:6.6Q1 DOI:10.1142/S0129065725500145 PMID:39907499	研究论文	本文提出了一种新的肌电识别方法，通过结合神经解码方法和无监督域适应学习，解决了跨用户变异性导致的肌电控制系统性能下降问题	提出了一种结合神经解码和无监督域适应学习的新方法，能够在细粒度运动单元（MU）水平上进行肌电模式识别	NA	解决跨用户变异性对肌电控制系统性能的影响，提高肌电模式识别的准确性和鲁棒性	手指运动模式	神经接口与假肢控制	NA	表面肌电图（SEMG）分解	深度学习模型	表面肌电图（SEMG）信号	15名受试者的手指伸肌SEMG信号
1138	2025-02-06	Functional feature extraction and validation from twelve-lead electrocardiograms to identify atrial fibrillation 2025-Feb-02, Communications medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1038/s43856-025-00749-2 PMID:39894874	研究论文	本文提出了一种非参数特征提取方法，用于识别与心房颤动发展相关的特征	与深度学习方法相比，本文提出的特征直观且能提供个体水平上心房颤动发展前的纵向心电图变化洞察	方法仍需要进一步验证以确认其广泛适用性	识别与心房颤动发展相关的心电图特征	慢性肾功能不全队列研究中的参与者	机器学习	心血管疾病	功能主成分分析	Cox比例风险模型	心电图数据	慢性肾功能不全队列研究中的参与者（2003-2008年和2013-2015年）
1139	2025-02-06	Deep learning and explainable artificial intelligence for investigating dental professionals' satisfaction with CAD software performance 2025-Feb, Journal of prosthodontics : official journal of the American College of Prosthodontists DOI:10.1111/jopr.13900 PMID:39010644	研究论文	本研究利用深度学习和可解释人工智能技术，调查了牙科专业人员对CAD软件性能的满意度	结合深度学习和可解释人工智能技术，首次在牙科领域进行用户满意度分析	样本仅限于436名牙科专业人员，可能无法完全代表所有用户群体	探讨牙科专业人员对CAD软件性能的满意度及其影响因素	牙科学生、牙医和牙科技师	机器学习	NA	深度学习、可解释人工智能	多层感知器人工神经网络（MLP-ANN）	行为数据	436名牙科专业人员
1140	2025-02-06	Structure-based computational design of antibody mimetics: challenges and perspectives 2025-Feb, FEBS open bio IF:2.8Q3 DOI:10.1002/2211-5463.13855 PMID:38925955	review	本文综述了基于结构的计算方法在抗体模拟物设计中的应用及其挑战与前景	整合机器学习和深度学习方法到设计框架中，增强了设计流程	高通量计算机设计与实验实现之间的挑战尚未完全解决	探讨抗体模拟物的计算设计及其在生物技术中的应用	抗体模拟物	生物信息学	NA	结构基于的计算方法	机器学习和深度学习	NA	NA