深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1261	2025-01-22	A comprehensive review on genomic insights and advanced technologies for mastitis prevention in dairy animals 2025-Feb, Microbial pathogenesis IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.micpath.2024.107233 PMID:39694196	review	本文综述了基因组学及其相关技术在预防奶牛乳腺炎中的应用，包括全基因组学、表观遗传学、蛋白质组学和转录组学，并探讨了人工智能和CRISPR等先进技术在提高诊断、预防和治疗策略方面的潜力	整合了基因组学、人工智能和CRISPR等先进技术，提供了对乳腺炎流行病学、病原体进化的深入理解，并提出了更有效的诊断、预防和治疗策略	未提及具体的研究样本数量和数据来源，可能缺乏实证研究的支持	探讨基因组学和先进技术在预防奶牛乳腺炎中的应用，以提高牛奶产量和农场盈利能力	奶牛乳腺炎	基因组学	乳腺炎	全基因组学、表观遗传学、蛋白质组学、转录组学、CRISPR	CNN	基因组数据、蛋白质数据、转录组数据	NA
1262	2025-01-16	A survey on deep learning in medical image registration: New technologies, uncertainty, evaluation metrics, and beyond 2025-Feb, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2024.103385 PMID:39612808	综述	本文全面回顾了深度学习在医学图像配准领域的最新进展，包括网络架构、损失函数、不确定性估计方法及评估指标	深入探讨了深度学习在图像配准中的创新网络架构、特定于配准的损失函数以及配准不确定性估计方法	未提及具体的技术局限性	总结深度学习在医学图像配准领域的最新进展，并探讨其未来发展方向	医学图像配准技术	计算机视觉	NA	深度学习	U-Net	医学图像	NA
1263	2025-01-16	Money plant disease atlas: A comprehensive dataset for disease classification in ornamental horticulture 2025-Feb, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111216 PMID:39811518	研究论文	本文介绍了一个用于观赏园艺中疾病分类的综合数据集，重点关注金钱植物的疾病	提供了一个全面的金钱植物疾病图像数据集，支持深度学习在观赏园艺中的应用	数据集仅限于金钱植物的疾病，未涵盖其他植物种类	提高观赏园艺中植物疾病的诊断准确性	金钱植物（Epipremnum aureum）	计算机视觉	植物疾病	图像处理	深度学习	图像	224 × 224像素的图像数据集
1264	2025-01-15	Deep learning in disease vector image identification 2025-Feb, Pest management science IF:3.8Q1 DOI:10.1002/ps.8473 PMID:39422093	综述	本文探讨了深度学习在病媒图像识别中的巨大潜力，并全面总结了当前深度学习在病媒识别中的应用现状	结合深度学习与病媒识别，自动化病媒识别过程，减少对专家的依赖	未提及具体的技术实现细节和实验结果的局限性	探索深度学习在病媒识别中的应用，以提升疾病控制效率	病媒图像	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA
1265	2025-01-15	Drone imagery dataset for early-season weed classification in maize and tomato crops 2025-Feb, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111203 PMID:39802837	研究论文	本文介绍了一个用于早期季节杂草分类的无人机图像数据集，专注于玉米和番茄作物	提供了一个包含两个作物生长阶段的RGB图像数据集，旨在提高早期杂草分类的准确性	数据集中未明确提及杂草种类的具体名称，可能影响特定杂草分类的研究	推动基于无人机的杂草检测和映射技术，促进精准农业的发展	玉米和番茄作物中的杂草	计算机视觉	NA	无人机成像	CNN, ViT	图像	67,558张标记图像（31,002张来自早期生长阶段，36,556张来自更高级生长阶段）
1266	2025-01-15	A dataset of blood slide images for AI-based diagnosis of malaria 2025-Feb, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111190 PMID:39802838	研究论文	本文介绍了一个用于基于AI的疟疾诊断的血涂片图像数据集	提供了一个包含厚薄血涂片图像的基准数据集，支持使用卷积神经网络构建计算模型	数据集仅来自乌干达的几家医院，可能不具有全球代表性	提高疟疾筛查的效率和准确性	疟疾诊断	数字病理学	疟疾	显微镜检查	CNN	图像	3000张厚血涂片图像和1000张薄血涂片图像
1267	2025-01-14	Applications of MRI in Schizophrenia: Current Progress in Establishing Clinical Utility 2025-Feb, Journal of magnetic resonance imaging : JMRI IF:3.3Q1 DOI:10.1002/jmri.29470 PMID:38946400	综述	本文综述了MRI在精神分裂症中的临床应用进展，包括其在筛查高风险个体、预测疾病发作、症状及治疗结果方面的潜力	整合机器学习和深度学习技术，开发智能诊断和预后工具，利用提取或选择的影像特征	MRI研究发现与实际临床应用之间存在差距	探讨MRI在精神分裂症中的临床应用潜力	精神分裂症患者	数字病理学	精神分裂症	MRI	机器学习和深度学习	影像数据	NA
1268	2025-01-13	Computational pathology applied to clinical colorectal cancer cohorts identifies immune and endothelial cell spatial patterns predictive of outcome 2025-Feb, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6378 PMID:39788558	研究论文	本研究通过计算病理学方法，分析了三个临床结直肠癌队列中的肿瘤微环境，识别出预测预后的免疫和内皮细胞空间模式	使用深度学习细胞分类器对H&E染色切片中的八种细胞类型进行检测，并量化了这些细胞类型的空间组织和共定位，揭示了肿瘤微环境中与治疗反应相关的重要因素	研究结果基于特定分子亚型和治疗历史的患者队列，可能不适用于所有结直肠癌患者	研究结直肠癌肿瘤微环境在肿瘤进展中的作用，并识别预测预后的生物标志物	三个临床结直肠癌队列中的肿瘤微环境	数字病理学	结直肠癌	深度学习细胞分类器	深度学习	图像	375例临床注释的结直肠癌患者
1269	2025-01-12	Deep Learning Reconstruction of Prospectively Accelerated MRI of the Pancreas: Clinical Evaluation of Shortened Breath-Hold Examinations With Dixon Fat Suppression 2025-Feb-01, Investigative radiology IF:7.0Q1 DOI:10.1097/RLI.0000000000001110 PMID:39043213	研究论文	本研究评估了一种新型深度学习重建算法在胰腺MRI检查中的应用，旨在缩短屏气时间并提高图像质量	首次在临床环境中评估了深度学习重建算法在胰腺病理学背景下的加速MRI检查中的应用，并显著缩短了屏气时间	研究为单中心研究，样本量较小（32名参与者），且仅使用了1.5 T MRI扫描仪	评估深度学习重建算法在胰腺MRI检查中的性能，包括缩短屏气时间、提高图像质量和诊断信心	患有各种胰腺疾病的患者	医学影像	胰腺疾病	深度学习重建算法，Dixon脂肪抑制技术	深度学习模型	MRI图像	32名参与者（平均年龄62±19岁，20名男性）
1270	2025-01-12	Artificial T1-Weighted Postcontrast Brain MRI: A Deep Learning Method for Contrast Signal Extraction 2025-Feb-01, Investigative radiology IF:7.0Q1 DOI:10.1097/RLI.0000000000001107 PMID:39074258	研究论文	本研究比较了两种重新实现的最先进深度学习方法与一种提出的对比信号提取方法，用于从非对比和低剂量图像合成人工T1加权全剂量图像	提出了一种新的对比信号提取方法，显著改善了合成后对比图像的质量	在现有剂量下，仍有相当比例的图像与参考图像的可互换性不足	比较不同深度学习方法在合成人工T1加权全剂量图像中的性能	213名接受脑部磁共振成像的参与者	医学影像	NA	磁共振成像	深度学习方法	图像	213名参与者，其中50名作为测试集
1271	2025-01-12	Trap colour strongly affects the ability of deep learning models to recognize insect species in images of sticky traps 2025-Feb, Pest management science IF:3.8Q1 DOI:10.1002/ps.8464 PMID:39377441	研究论文	本研究探讨了粘虫板颜色和成像设备对深度学习模型在粘虫板上分类害虫性能的影响	首次深入研究了粘虫板颜色对深度学习模型分类害虫性能的影响，并提出了使用透明粘虫板作为训练数据以提高模型准确性的方法	研究仅使用了MobileNetV2架构，未探索其他深度学习模型的效果	研究粘虫板颜色和成像设备对深度学习模型分类害虫性能的影响	粘虫板上的害虫	计算机视觉	NA	深度学习	MobileNetV2	图像	NA
1272	2025-01-12	Bioimaging and the future of whole-organismal developmental physiology 2025-Feb, Comparative biochemistry and physiology. Part A, Molecular & integrative physiology DOI:10.1016/j.cbpa.2024.111783 PMID:39581226	评论	本文探讨了生物成像在整体生物发育生理学研究中的重要性及其未来潜力	强调了图像分析，特别是深度学习方法，在推动对发育动物生长和功能理解方面的潜力，并探讨了计算机视觉在不同物种、生命阶段和实验中的可转移性	未具体提及研究的局限性	评估成像作为测量整体生物发育生理学手段的重要性，并探索计算机视觉在该领域的应用	发育中的动物	计算机视觉	NA	生物成像	深度学习	图像	NA
1273	2025-01-12	Stress testing deep learning models for prostate cancer detection on biopsies and surgical specimens 2025-Feb, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.6373 PMID:39660731	研究论文	本文研究了深度学习模型在前列腺癌检测中的应用，特别是在活检和手术标本上的表现差异	探讨了样本处理差异对深度学习模型性能的影响，并提出了需要针对不同样本类型（活检和手术标本）定制机器学习模型的必要性	研究仅基于特定数据集（宾夕法尼亚大学和NRG/RTOG 0521临床试验），可能无法完全代表所有临床环境	研究样本处理差异对深度学习模型在前列腺癌检测中性能的影响	前列腺癌的活检和手术标本	数字病理学	前列腺癌	深度学习	CNN (DenseNet)	图像	1,000个样本（包括100个手术标本和50个活检标本），以及来自NRG/RTOG 0521临床试验的750个活检标本
1274	2025-01-12	Unveiling the power of artificial intelligence for image-based diagnosis and treatment in endodontics: An ally or adversary? 2025-Feb, International endodontic journal IF:5.4Q1 DOI:10.1111/iej.14163 PMID:39526945	综述	本文综述了人工智能在牙髓病学中的应用，评估了其在2D和3D成像中的使用，并探讨了其作为有益工具或潜在挑战的角色	本文详细探讨了人工智能在牙髓病学中的创新应用，特别是在2D和3D成像中的诊断和治疗规划方面的显著提升	一些研究指出，AI模型的训练依赖于体外或离体数据集，这些数据集无法复制临床环境的复杂性，可能影响AI应用的可靠性	评估人工智能在牙髓病学中的应用，特别是在2D和3D成像中的使用，并探讨其作为有益工具或潜在挑战的角色	牙髓病学中的2D和3D成像数据	计算机视觉	牙髓病	深度学习算法	卷积神经网络（CNN）	2D和3D图像	NA
1275	2025-01-07	Optical coherence tomography: implications for neurology 2025-Feb-01, Current opinion in neurology IF:4.1Q2 DOI:10.1097/WCO.0000000000001340 PMID:39704153	综述	本文探讨了光学相干断层扫描（OCT）在神经学实践中的作用，特别是在诊断和监测视乳头水肿、视神经炎和视网膜动脉阻塞等疾病中的应用	OCT作为一种非侵入性工具，能够有效检测和监测视觉通路中的神经轴索损伤，结合深度学习算法提高了诊断准确性和预测能力	NA	探讨OCT在神经学中的应用，特别是在诊断和监测视觉通路相关疾病中的作用	视乳头水肿、视神经炎、视网膜动脉阻塞等疾病患者	数字病理学	神经系统疾病	光学相干断层扫描（OCT）	深度学习算法	图像	NA
1276	2025-01-07	Artificial intelligence and stroke imaging 2025-Feb-01, Current opinion in neurology IF:4.1Q2 DOI:10.1097/WCO.0000000000001333 PMID:39760722	综述	本文探讨了人工智能在卒中影像学中的应用及其潜力	提出了深度学习技术在卒中影像学中的高保真预测、描述和推理工具的应用，并探讨了生成模型在解决当前障碍中的潜力	尽管人工智能在卒中影像学中的潜力巨大，但在实际临床应用中仍面临数据噪声、不完整、偏见和小规模数据的挑战	探讨人工智能在卒中影像学中的应用，以实现个体化精准医疗	卒中影像学数据	医学影像	卒中	深度学习	生成模型	影像数据	NA
1277	2025-01-06	Incorporating dynamic drainage supervision into deep learning for accurate real-time flood simulation in urban areas 2025-Feb-15, Water research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.watres.2024.122816 PMID:39612812	研究论文	本研究提出了一种结合动态排水监督的深度学习模型（UDFM），用于城市区域的实时洪水模拟	UDFM模型通过结合物理和深度学习排水模型，将一维排水溢出过程转换为高分辨率的时空二维洪水过程，更全面准确地反映了排水系统在城市洪水动态中的作用	研究仅应用于深圳的一个高度城市化区域，未在其他城市或区域进行验证	提高城市洪水模拟的准确性和实时性，以支持快速洪水预警和风险管理	城市洪水过程，特别是排水系统和地表洪水淹没	机器学习	NA	深度学习，降维算法	UDFM（结合深度学习和降维算法的混合模块）	时空数据	深圳的一个高度城市化区域
1278	2025-01-03	DeepPhoPred: Accurate Deep Learning Model to Predict Microbial Phosphorylation 2025-Feb, Proteins IF:3.2Q2 DOI:10.1002/prot.26734 PMID:39239684	研究论文	本文介绍了一种名为DeepPhoPred的深度学习工具，用于预测微生物的磷酸化位点	DeepPhoPred采用了一种双头卷积神经网络架构，结合了挤压和激励模块，能够从肽的结构和进化信息中联合学习重要特征，以预测磷酸化位点	NA	开发一种低成本、高速度的计算方法来预测微生物的磷酸化位点	微生物的磷酸化位点	机器学习	NA	深度学习	CNN	肽的结构和进化信息	NA
1279	2025-01-01	An attention 3DUNET and visual geometry group-19 based deep neural network for brain tumor segmentation and classification from MRI 2025-Feb, Journal of biomolecular structure & dynamics IF:2.7Q2 DOI:10.1080/07391102.2023.2283164 PMID:37979152	研究论文	本文提出了一种基于注意力3DUNET和视觉几何组-19的深度神经网络，用于从MRI图像中进行脑肿瘤分割和分类	提出了一种新颖的深度学习系统，结合了空间和通道注意力机制的三维U形网络（SC3DUNet）和基于扩张卷积的视觉几何组-19（DCVGG-19），用于脑肿瘤的分割和分类	该方法主要针对3D脑MRI图像，未涉及其他类型的医学影像	提高脑肿瘤的早期检测和分类准确率	脑肿瘤	数字病理学	脑肿瘤	深度学习	SC3DUNet, DCVGG-19	3D MRI图像	BraTS2020数据集
1280	2024-12-28	Low Skeletal Muscle Radiodensity Predicts Response to CDK4/6 Inhibitors Plus Aromatase Inhibitors in Advanced Breast Cancer 2025-Feb, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle DOI:10.1002/jcsm.13666 PMID:39686815	研究论文	本研究探讨了CT衍生的身体成分指数与激素受体阳性、HER2阴性晚期乳腺癌患者在接受内分泌治疗加CDK4/6抑制剂治疗时的治疗反应之间的关系	首次发现低骨骼肌放射密度（SMD）与接受CDK4/6抑制剂加芳香化酶抑制剂治疗的晚期乳腺癌患者的不良治疗结果相关	研究为回顾性设计，样本量相对较小，且仅来自单一中心	探讨CT衍生的身体成分指数与晚期乳腺癌患者治疗反应的关系	激素受体阳性、HER2阴性晚期乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	CT扫描	深度学习软件	图像	247名女性患者