深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1041	2025-03-27	Predicting response to neoadjuvant chemotherapy in muscle-invasive bladder cancer via interpretable multimodal deep learning 2025-Mar-22, NPJ digital medicine IF:12.4Q1 DOI:10.1038/s41746-025-01560-y PMID:40121304	研究论文	开发了一种可解释的基于图的多模态晚期融合深度学习框架（GMLF），用于预测肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）对新辅助化疗的反应	结合组织病理学、细胞类型数据和基因表达谱，发现了新的组织病理学、细胞和分子决定因素，包括TP63、CCL5和DCN等关键基因特征	研究基于特定临床试验（SWOG S1314-COXEN）的数据，可能限制了结果的普遍性	提高肌肉浸润性膀胱癌患者对新辅助化疗反应的预测准确性，优化治疗策略	肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）患者	数字病理学	膀胱癌	RNA测序	GMLF（基于图的多模态晚期融合深度学习框架）	图像、基因表达数据	来自SWOG S1314-COXEN临床试验的数据（具体样本数量未提及）
1042	2025-03-27	Characterizing multivariate regional hubs for schizophrenia classification, sex differences, and brain age estimation using explainable AI 2025-Mar-04, medRxiv : the preprint server for health sciences DOI:10.1101/2025.02.28.25323105 PMID:40093221	research paper	该研究利用结构MRI、人口统计学和可解释人工智能（AI）技术，探索精神分裂症分类、性别差异和脑年龄的多变量区域模式	结合深度学习模型与SHAP方法，识别与精神分裂症分类、性别差异及脑年龄预测相关的个性化多变量脑区模式	未提及样本量是否足够大以覆盖不同亚组人群，以及模型在其他独立数据集上的验证情况	研究精神分裂症分类、性别差异和脑年龄预测的神经生物学机制	精神分裂症患者和健康对照者的脑结构MRI数据	digital pathology	schizophrenia	structural MRI, explainable AI	SVC, KNN, DL, LR, RR, SVR	image, demographics	NA
1043	2025-03-27	An integrative nomogram based on MRI radiomics and clinical characteristics for prognosis prediction in cervical spinal cord Injury 2025-Mar, European spine journal : official publication of the European Spine Society, the European Spinal Deformity Society, and the European Section of the Cervical Spine Research Society IF:2.6Q1 DOI:10.1007/s00586-024-08609-8 PMID:39672993	研究论文	基于MRI影像组学和临床特征构建预测颈脊髓损伤患者预后的列线图模型	结合手动定义的影像组学特征和通过深度学习迁移学习方法提取的特征，构建了一个综合预测模型	样本量相对较小（168例患者），且仅使用了T1WI和T2WI两种MRI序列	预测颈脊髓损伤患者的预后	168名颈脊髓损伤患者	数字病理学	颈脊髓损伤	MRI影像组学分析，深度学习迁移学习	Lasso回归，深度学习模型	MRI图像（T1WI和T2WI），临床数据	168名颈脊髓损伤患者
1044	2025-03-27	Deep learning model for automated detection of fresh and old vertebral fractures on thoracolumbar CT 2025-Mar, European spine journal : official publication of the European Spine Society, the European Spinal Deformity Society, and the European Section of the Cervical Spine Research Society IF:2.6Q1 DOI:10.1007/s00586-024-08623-w PMID:39708132	研究论文	开发了一种深度学习系统，用于在胸腰椎CT上自动分割压缩性骨折椎体并区分新鲜和陈旧性骨折	使用3D V-Net进行图像分割，结合ResNet和DenseNet模型进行分类，能够自动且准确地识别和分类椎体骨折	样本量相对较小，外部验证和前瞻性验证的样本数量有限	开发一种自动化系统，辅助临床医生识别和分类胸腰椎压缩性骨折	胸腰椎骨折患者	计算机视觉	骨科疾病	CT成像	3D V-Net, ResNet, DenseNet	医学影像	训练数据集238个椎体，内部验证59个，外部验证34个，前瞻性验证48个
1045	2025-01-30	Correction: Deep learning model for automated detection of fresh and old vertebral fractures on thoracolumbar CT 2025-Mar, European spine journal : official publication of the European Spine Society, the European Spinal Deformity Society, and the European Section of the Cervical Spine Research Society IF:2.6Q1 DOI:10.1007/s00586-024-08636-5 PMID:39875623	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1046	2025-03-27	Comparative Analysis of MaxEnt and Deep Learning Approaches for Modeling Humpback Whale Distribution in North Iceland 2025-Mar, Ecology and evolution IF:2.3Q2 DOI:10.1002/ece3.71099 PMID:40109551	research paper	本研究比较了MaxEnt和深度学习方法在冰岛北部座头鲸分布建模中的应用	首次比较了传统MaxEnt与深度学习方法在座头鲸分布建模中的表现，并展示了深度学习在预测未来分布中的优势	输入数据分辨率低、存在空间偏差、无法完全捕捉自然过程的复杂性	比较不同建模方法在海洋哺乳动物分布预测中的效果	冰岛北部Skjálfandi湾的座头鲸	machine learning	NA	卫星遥感数据采集	MaxEnt, 深度学习	物种出现数据、环境数据	2018年至2021年的月度观测数据
1047	2025-03-27	Ensemble approach to deep learning seabed classification using multichannel ship noisea) 2025-Mar-01, The Journal of the Acoustical Society of America IF:2.1Q1 DOI:10.1121/10.0036221 PMID:40135961	研究论文	本研究利用合成数据训练神经网络，通过多通道水听器声谱图预测海底类型，并应用于实际测量数据	采用集成建模和多通道数据处理技术提高预测性能，并量化多通道数据对神经网络训练的影响	实验中水声速仅轻微向上折射，预期在更复杂声速剖面下多通道的优势会更明显	开发一种基于深度学习的海底分类方法	海底类型	机器学习	NA	多通道水听器声谱图分析	ResNet-18	声谱图	SBCEX 2017实验测量数据
1048	2025-03-26	Deep-Learning-Assisted Understanding of the Self-Assembly of Miktoarm Star Block Copolymers 2025-Mar-25, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.5c00811 PMID:40074545	research paper	该研究应用深度学习技术解析了AB型星形嵌段共聚物PEO-PS在蒸发诱导自组装系统中的相行为	首次将深度学习技术应用于复杂拓扑结构嵌段共聚物的自组装行为研究，成功预测了三维合成场图并揭示了参数与结构之间的关联	研究仅针对特定类型的星形嵌段共聚物(PEO-PS)，结论可能不适用于其他拓扑结构的共聚物	探索复杂拓扑结构嵌段共聚物的自组装行为规律	AB型星形嵌段共聚物PEO-PS	soft matter science	NA	deep learning	neural network	experimental data	包含两种聚合物特性和三种合成条件参数的数据集
1049	2025-03-26	From 1-D to 3-D: LIBS Pseudohyperspectral Data Cube Deep Learning Mechanism Used in Nuclear Metal Materials Classification 2025-Mar-25, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c05707 PMID:40085530	研究论文	提出一种名为LIBS伪高光谱数据立方体的新光谱数据机制，将1-D LIBS光谱转化为3-D数据立方体，以提高核金属材料分类的准确性	引入两个额外维度捕捉光谱变化信息，使LIBS系统在处理不稳定光谱时更加稳健，并充分利用深度学习算法	未明确提及具体局限性	提高核电站中不稳定光谱的分类准确性	核金属材料	机器学习	NA	LIBS（激光诱导击穿光谱）	深度学习算法（含注意力机制）	光谱数据	NA
1050	2025-03-26	Leveraging Deep Learning for Urban Health Insights: Transforming Street-Level Imagery into Cardiovascular Risk Indicators 2025-Mar-25, European journal of preventive cardiology IF:8.4Q1 DOI:10.1093/eurjpc/zwaf148 PMID:40130376	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1051	2025-03-26	DASNet: A Convolutional Neural Network with SE Attention Mechanism for ccRCC Tumor Grading 2025-Mar-24, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00693-8 PMID:40126867	research paper	该研究提出了一种名为DASNet的卷积神经网络，结合SE注意力机制，用于通过CT图像对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进行分级	引入了Domain Adaptive Squeeze-and-Excitation Network (DASNet)，结合SE注意力机制和域对抗神经网络（DANNs）来提高分类准确性和模型的泛化能力	未提及具体的数据集规模或潜在的过拟合问题	开发一种非侵入性且高效的ccRCC分级方法，以促进早期检测和治疗干预	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的CT图像	digital pathology	renal cell carcinoma	Computed Tomography (CT), deep learning, machine learning	CNN, EfficientNet, RegNet, DANN	image	NA
1052	2025-03-26	Effectiveness Evaluation for Clinical Depression Detection Using Deep Learning Based Synthetic House-Tree-Person Test 2025-Mar-24, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1 DOI:10.1109/JBHI.2025.3553502 PMID:40126963	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的合成屋树人测试（S-HTP）的抑郁症检测方法DeHTP，旨在减少诊断过程中的主观影响	提出了一种无需人际互动的灵活便捷的抑郁症检测方法DeHTP，其性能优于传统的人工S-HTP分析，并揭示了22个与抑郁症相关的绘图特征	方法的有效性可能受到分析师专业能力的限制	开发一种基于深度学习的抑郁症检测方法，以减少诊断过程中的主观影响	抑郁症患者	数字病理学	抑郁症	深度学习	DeHTP	图像	基于先前研究中与抑郁症相关的50个结论的指南
1053	2025-03-26	Deep Learning-Assisted Diagnosis of Placenta Accreta Spectrum Using the DenseNet-121 Model: A Multicenter, Retrospective Study 2025-Mar-24, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01475-w PMID:40128503	研究论文	探讨基于MRI的深度学习成像在预测高风险孕妇胎盘植入谱（PAS）中的诊断价值	使用DenseNet-121模型进行深度学习辅助诊断，与传统临床模型或机器学习放射组学模型相比表现出更好的性能	研究为回顾性设计，样本量相对较小（263例患者）	评估深度学习模型在预测胎盘植入谱（PAS）中的诊断效能	高风险孕妇中的疑似胎盘植入患者	数字病理	胎盘植入谱（PAS）	MRI成像	DenseNet-121, SVM, KNN, RF, LGBM	医学影像	263例患者（170例训练集，93例外部验证集）
1054	2025-03-26	Augmenting atmospheric turbulence effects on thermal-adapted deep object detection models 2025-Mar-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86830-1 PMID:40121214	research paper	本文探讨了大气湍流图像增强技术在提高热适应和基于深度学习的物体检测模型在大气湍流条件下的准确性和鲁棒性方面的有效性	研究了三种不同的基于近似的湍流模拟器（几何、Zernike-based和P2S）生成的湍流训练和测试数据集，并评估了三种最先进的深度学习物体检测模型（RTMDet-x、DINO-4scale和YOLOv8-x）在这些数据集上的性能	NA	提高物体检测模型在大气湍流条件下的准确性和鲁棒性	热适应和基于深度学习的物体检测模型	computer vision	NA	turbulence image augmentation techniques	RTMDet-x, DINO-4scale, YOLOv8-x	image	NA
1055	2025-03-26	High-resolution image reflection removal by Laplacian-based component-aware transformer 2025-Mar-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-94464-6 PMID:40121298	research paper	提出了一种基于Laplacian金字塔和transformer的高分辨率图像反射去除框架LapCAT	利用Laplacian金字塔网络去除高频反射模式，并通过反射感知的多头自注意力机制设计组件可分离transformer块（CSTB）	NA	解决高分辨率图像反射去除问题，提升照片拍摄质量和场景理解	高分辨率图像中的反射模式	computer vision	NA	Laplacian金字塔网络，transformer	transformer (CSTB)	image	多个基准数据集
1056	2025-03-26	4D-ONIX for reconstructing 3D movies from sparse X-ray projections via deep learning 2025-Mar-21, Communications engineering DOI:10.1038/s44172-025-00390-w PMID:40119014	research paper	提出了一种基于深度学习的4D-ONIX方法，用于从极少数X射线投影中重建3D电影	结合X射线与物质相互作用的计算物理模型和最先进的深度学习方法，能够从极少数投影中高质量重建4D信息	需要验证在更广泛实验条件下的适用性	解决从稀疏投影重建4D信息的挑战	水滴碰撞模拟和增材制造实验数据	计算机视觉	NA	X射线多投影成像	深度学习	X射线投影图像	模拟水滴碰撞和增材制造实验数据，每个时间戳仅2-3个投影
1057	2025-03-26	The artificial intelligence revolution in gastric cancer management: clinical applications 2025-Mar-21, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-025-03756-4 PMID:40119433	review	本文全面回顾了人工智能算法在胃癌管理中的最新研究现状和应用	人工智能技术，特别是机器学习和深度学习，在胃癌的诊断、治疗和预后评估中带来了前所未有的创新和突破	目前大多数基于AI的模型尚未在临床实践中广泛应用	探讨人工智能技术在胃癌临床管理中的应用及其潜力	胃癌	digital pathology	gastric cancer	machine learning, deep learning	NA	image, text	NA
1058	2025-03-26	Nomogram to predict 1-year cognitive decline after stent placement for unruptured intracranial aneurysms 2025-Mar-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.111839 PMID:40124476	研究论文	开发了一种深度学习放射组学列线图（DLRN）用于预测未破裂颅内动脉瘤支架置入术后1年认知功能下降	首次结合治疗后DWI和临床特征，利用深度学习放射组学方法构建预测模型	样本量相对有限（526例），且前瞻性队列样本量较小（108例）	预测未破裂颅内动脉瘤支架置入术后认知功能下降风险	接受支架置入术治疗的未破裂颅内动脉瘤患者	数字病理学	颅内动脉瘤	扩散加权磁共振成像（DWI）	深度学习放射组学列线图（DLRN）	医学影像	526例患者（训练队列251例，外部验证队列167例，前瞻性队列108例）
1059	2025-03-26	CSEA-Net: A channel-spatial enhanced attention network for lung tumor segmentation on CT images 2025-Mar-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.111974 PMID:40124480	研究论文	介绍了一种名为CSEA-Net的深度学习模型，用于在CT图像上自动分割肺结节	提出了结合双分支通道-空间特征增强网络和坐标注意力机制的深度学习架构，以提高对小且轮廓不清的肺结节的分割精度	未提及具体的数据集限制或模型在特定条件下的性能下降情况	提高肺结节分割的效率和准确性，以辅助肺癌的早期检测	CT图像中的肺结节	数字病理	肺癌	深度学习	CSEA-Net（结合双分支通道-空间特征增强网络和坐标注意力机制的CNN）	CT图像	多个公开数据集（未提及具体数量）
1060	2025-03-26	Inference for Log-Gaussian Cox Point Processes using Bayesian Deep Learning: Application to Human Oral Microbiome Image Data 2025-Mar-18, ArXiv PMID:40034134	研究论文	本文提出了一种基于贝叶斯深度学习的无似然推断方法，用于对数高斯考克斯点过程（LGCPs）的参数估计，并应用于人类口腔微生物图像数据分析	使用BayesFlow方法和可逆神经网络近似感兴趣参数的后验分布，实现了计算效率的大幅提升	方法在高维情况下可能仍面临计算挑战	开发一种计算高效的方法来量化空间点模式中的聚集现象	人类口腔微生物生物膜图像	机器学习	NA	BayesFlow方法	可逆神经网络	图像	两个不同的口腔微生物生物膜图像